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Absolute quantification of viruses by TaqMan real-time RT-PCR in grapevines. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; VANNI, M. F.; NICKEL, O..
ABSTRACT: The absolute quantification determines the absolute amount of a targeted nucleic acid expressed as a copy number or concentration. The knowledge of virus concentrations in commercial crops possesses high relevance to ensure a reliable diagnosis. The objective of this study was to perform an absolute quantification of five viruses in infected grapevines (Vitis spp.). Different known amounts of the standard sample (cloned viral cDNA or in vitro transcribed viral RNA) were quantified by TaqMan RT-qPCR. Based on these data, standard curves were generated plotting Ct values (threshold cycle) against the log of the standard sample amount. Infected grapevine samples were evaluated to determine virus titers, which were highly variable. This result may...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: RT-qPCR; GRSPaV; GVA; GVD; GLRaV-3; Videira; Uva; Virus.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1069291
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Detecção de Closterovirus em videira e caracterização parcial de um isolado do Grapevine leafroll-associated virus 3 Trop. Plant Pathol.
FAJARDO,THOR V.M.; KUHN,GILMAR B.; EIRAS,MARCELO; NICKEL,OSMAR.
O enrolamento da folha da videira (Vitis spp.) é uma doença causada por até oito vírus, Grapevine leafroll-associated virus (GLRaV) 1 a 8, sorologicamente distintos e associados ao floema de videiras infetadas. Neste trabalho, foram detectados GLRaV-1 e -3 por DAS-ELISA em 6,9 e 14,7% das amostras analisadas, respectivamente, e provenientes de duas importantes regiões vitícolas do Brasil (Serra Gaúcha e Vale do São Francisco). Os GLRaV-2, -5 e -7 não foram detectados. O GLRaV-3 também foi detectado por dot-ELISA e western blot, observando-se a provável proteína capsidial com cerca de 36 kDa. Um fragmento de 340 pb, compreendendo o terminal 3' do gene da polimerase viral de GLRaV-3, foi amplificado por PCR e seqüenciado. As seqüências de nucleotídeos e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Vitis; GLRaV-1; GLRaV-3; Sorologia; RT-PCR; RNA polimerase.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582002000100009
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Detecção e identificação molecular de vírus associados a videiras sintomáticas e assintomáticas. Repositório Alice
BASSO, M. F.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; AYUB, R. A.; NICKEL, O..
A propagação vegetativa da videira favorece infecções virais múltiplas, com expressão diferencial de sintomas em função da combinação da cultivar ou espécie da hospedeira com a espécie viral. Os objetivos deste trabalho foram detectar e identificar as espécies virais presentes em duas espécies/cultivares de videira: uma sintomática e outra assintomática. DsRNA de ambas as amostras foi submetido à RT-PCR com 17 pares de oligonucleotídeos específicos para a detecção de Grapevine virus A (GVA), Grapevine virus B (GVB), Grapevine virus D (GVD), Grapevine fleck virus (GFkV), Grapevine fanleaf virus (GFLV), Arabis mosaic virus (ArMV), Grapevine chrome mosaic virus (GCMV), Rupestris stem pitting-associated virus (RSPaV), Grapevine leafroll-associated virus 1 a 4...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Identificação; Diagnose; RSPaV; GLRaV-2; GLRaV-3; Variabilidade; Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/871826
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Embrapa vai produzir mudas de videiras livres de vírus Infoteca-e
MELO, N. F. de.
A infecção de plantas por vírus é um dos problemas mais sérios que afetam a produtividade dos parreirais nos quatro cantos do planeta. Responsável por perdas que podem chegar a 100%, preocupa agricultores e pesquisadores de especialidades e de lugares diversos. No Submédia do Vale do rio São Francisco, a Embrapa Semiárido e a Cooperativa Agrícola de Juazeiro (CAJ) firmaram convênio para contornar esse problema, produzindo mudas isentas desses microrganismos. Análises recentes feitas em variedades
Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) Palavras-chave: Uvas sem sementes; Thompson; Superior; Crimson Seedless; GLRaV-3; Enrolamento das folhas; Muda; Uva; Doença; Virus; Biotecnologia; Grapes.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1059076
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Expression of grapevine leafroll-associated virus 3 coat protein gene in Escherichia coli and production of polyclonal antibodies. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; BARROS, D. R.; NICKEL, O.; KUHN, G. B.; ZERBINI, F. M..
bitstream/item/195981/1/expression.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Proteína recombinate; Sorologia; Enrolamento da videira; GLRaV-3; Anticorpo; Doença de Planta; Uva; Vírus; Viticultura.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/542502
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Variation over time in the prevalences of three viruses of the grapevine leafroll complex in a commercial vineyard in south-central Chile Ciencia e Investigación Agraria
Mujica,María Valentina; Mora,Roxana; Rosales,Marlene; Sandoval,Claudio.
A vineyard in south-central Chile was surveyed during five growing seasons to analyze the increase over time in the number of plants infected with Grapevine leafroll-associated virus-1, -2 and -3. At the end of the study, GLRaV-3 was found to be the most prevalent virus, with 46% of plants infected by this pathogen. GLRaV-2 infected 13% of plants, and GLRaV-1 infected 12%. Considering all three viruses together, the prevalence of infection increased exponentially from 14% of the plants at the beginning of the study period to 68% at the end. The patterns of the spread of GLRaV-2 and GLRaV-3 were mostly along the rows, whereas the pattern of spread for GLRaV-1 could not be determined.
Tipo: Journal article Palavras-chave: Field transmission; Grapevine leafroll-associated virus; GLRaV-1; GLRaV-2; GLRaV-3; Virus diagnosis.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0718-16202013000100012
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