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Análise de polimorfismos do GH em bovinos da raça Canchim. Repositório Alice
SILVEIRA, L. G. G.; SUGUISAWA, L.; MARTINS, C. L.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; FURLAN, L. R.; OLIVEIRA, H. N..
2003
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bovinos; Gene candidato; GH; Gado de corte; Polimorfismo.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/46681
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Análise haplotípica do gene ASAP1 associado com maciez de carne em bovinos da raça Nelore. Repositório Alice
TIZIOTO, P. C.; THOLON, P.; MUDADU, M. de A.; BRESSANI, F. A.; REDE BIFEQUALI; REGITANO, L. C. de A..
A maciez da carne tem impacto importante na satisfação dos consumidores, portanto, o conhecimento da variação desta característica, assim como a prospecção de genes ou segmentos genômicos que influenciem a mesma, pode ajudar no desenvolvimento de critérios quantitativos e moleculares para seleção de bovinos de corte. A análise haplotípica com os SNPs do gene ASAP1 representados no Illumina BovineHD BeadChip mostram que estes marcadores estão associados com força de cisalhamento medida após 7 dias de maturação da carne nessa população da raça Nelore. A validação desses resultados em outras populações poderá contribuir para inclusão desses marcadores em programas de melhoramento da raça Nelore.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gene candidato; Força de cisalhamento; Bos indicus.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/943060
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Análises da expressão gênica por PCR quantitativo em tempo real (QPCR) de genes candidatos para a tolerância à seca em cafeeiro. Repositório Alice
VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; VIEIRA, N. G.; FREIRE, L. P.; HEIMBECK, I. G. R.; FERRÃO, R. G.; FONSECA, A. F. A. da; FERRAO, M. A. G.; SILVA, V. A.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C..
A seca é uma das principais limitações climáticas à produção do cafeeiro. A importância dessa limitação deve aumentar, em função das mudanças reconhecidas no clima global e, também, porque a cafeicultura vem sendo expandida para regiões marginais onde a baixa pluviosidade e temperaturas desfavoráveis se constituem grandes limitações à produção do café. A seca induz diversas respostas fisiológicas e moleculares nas plantas, incluindo alterações da expressão gênica, visando atingir ajuste osmótico, a indução de reparadores de sistemas moleculares e a expressão de diversas proteínas protetoras. Existem diversas formas de se avaliar a expressão gênica em plantas submetidas ao estresse hídrico. Uma técnica amplamente utilizada nos últimos anos, para a análise...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coffea canephora; Expressão gênica; Gene candidato; Seca; Coffea canephora; Candidate genes; Drought; Gene expression.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/903864
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Candidate SNPs for carcass and meat traits in Nelore animals and in their crosses with Bos taurus Repositório Alice
CURI, R. A.; KRAUSKOPF, M. K.; HADLICH, J. C.; FORTES, M. R. S.; VANKAN, D. M.; SILVA, J. A. V.; OLIVEIRA, H. N. de; MOTA, M. D. S. da.
The objective of this work was to evaluate the effects of single?nucleotide polymorphisms (SNPs) in the genes IGF1 (AF_017143.1:g.198C>T), MSTN (AF_320998.1:g.433C>A), MYOD1 (NC_007313:g.1274A>G) and MYF5 (NC_007303:g.1911A>G) on carcass and meat traits in Nelore (Bos indicus) and Nelore x B. taurus. A total of 300 animals were genotyped and phenotyped for rib eye area (REA), backfat thickness (BT), intramuscular fat (IF), shear force (SF) and myofibrillar fragmentation index (MFI). The effects of allele substitution for each SNP were estimated by regression of the evaluated phenotypes on the number of copies of a particular allele using the general linear model. The polymorphism at IGF1 was non?informative in Nelore animals. In crossbred...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Maciez da carne; Gene candidato; Gado nelore; Carcaça; Zebu; Bos taurus; Meat quality.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/931238
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Comparison of sequence variants in the PDK4 and COX4I2 genes between racing and cutting lines of quarter horses and associations with the speed index. Repositório Alice
PEREIRA, G. L.; MATTEIS, R. de; MEIRA, C. T.; REGITANO, L. C. de A.; SILVA, J. A. II V.; CHARDULO, L. A. L.; CURI, R. A..
Different selection objectives within the Quarter Horse breed led to the formation of groups with distinct skills, including the racing and cutting lines. With a smaller population size in Brazil, but of great economic representativeness, the racing line is characterized by animals that can reach high speeds over short distances and within a short period of time. The cutting line is destined for functional tests, exploring skills such as agility and obedience. Although the athletic performance of horses is likely to be influenced by a large number of genes, few genetic variants have so far been related to this trait and this was done exclusively in Thoroughbreds, including the g.38973231G>A singlenucleotide polymorphism in the PDK4 gene and the...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Gene candidato; Polimorfismo; QTL; Equino; Horses.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1055100
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Frequência Alélica do Gene HSF1 associado à termotolerância em bovinos. Repositório Alice
SUNIGA, P. A. P.; EGITO, A. A. do.
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Estrese térmico; Fator de transcriçãoheat-shock; Gene candidato; Mudanças climáticas; Tolerancia ao calor.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1027321
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Genotipagem por PCR-RFLP de um polimorfismo no gene CAST em bovinos da raça Canchim. Repositório Alice
SOUSA, I. I.; BLECHA, I. M. Z.; MACIEL, S. da S.; FERREIRA, A. B. R.; FEIJO, G. L. D.; SANTIAGO, G. G.; FAVERO, R.; SIQUEIRA, F..
Objetivou-se avaliar o marcador molecular do tipo SNP (Single-nucleotide Polymorphism) A2959G (AF159246) do gene bovino da calpastatina (CAST) em animais da raça Canchim provenientes das Provas Canchim de Avaliação de Desempenho dos anos de 2011 e 2012. As genotipagens foram realizadas por PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism). As frequências alélicas e genotípicas foram comparadas pelo teste Qui-quadrado. Os desvios de frequências observadas em relação às esperadas para o Equilíbrio de Hardy-Weinberg foram analisados a 5% de significância e os dados obtidos foram submetidos à ANOVA utilizando o PROC GLM (SAS). Não foram encontradas associações significativas do marcador com as características área de olho de lombo...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gene candidato; SNP; Candidate gene; Gado de corte; Beef cattle; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1077313
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Novos marcadores para fins de mapeamento e localização de QTLs a partir de PCR-RFLP de genes de genoma café brasileiro. Repositório Alice
COLOMBO, C. A.; YAMAMOTO, P. Y.; RAMOS, L. C. S.; MAZZAFERA, P.; GALLO, P. B.; VILELLA, O. T.; LANNES, S. D.; POT, D.; FERREIRA, L. P.; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, L. F. P..
O mapeamento genético é uma das estratégias mais visadas para fins de melhoramento genético e ganha maior importância a partir do surgimento de marcadores do tipo SNPs ou INDELs, facilitado pelos projetos genomas, sobretudo de ESTs. Assim, análises in silico de busca de polimorfismo SNPs em seqüências relacionadas com qualidade de bebida e derivadas de C.arabica e C.canephora foram analisadas e o polimorfismo entre as duas espécies validado para seis genes (quatro proteases e dois de sacarose) a partir de estudos de laboratório utilizando a técnica PCR-RFLP. Para tanto, após confirmação do polimorfismo nas duas espécies parentais, foram genotipadas 90 plantas F2 derivadas da autofecundação de um híbrido interespecífico de Coffea arabica e C. canephora 4x....
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coffea spp; Qualidade de bebida; Seleção assistida; Enzimas de restrição; ESTs; Gene candidato.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/903748
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Obtenção de marcadores moleculares por meio de PCR-RFLP de genes relacionados com qualidade em café. Repositório Alice
VILELLA, O. T.; LANNES, S. D.; POT, D.; FERREIRA, L. P.; PRIOLLI, R. H. G.; RAMOS, L. C. S.; COLOMBO, C. A.; VIEIRA, L. G. E..
A qualidade de bebida do café é fator fundamental para sua comercialização, pois agrega valor ao produto, garantindo maior competitividade e melhores preços no mercado. A composição química do café é um dos fatores que determinam a qualidade da bebida. Seu sabor e seu aroma são resultantes da presença combinada de vários constituintes, dentre os quais os ácidos clorogênicos, os diterpenos e os açúcares. O objetivo deste trabalho foi buscar polimorfismos a partir de PCR-RFLP utilizando primers baseados em sequências ESTs de genes relacionados com a qualidade de bebida. Para isso foi utilizado o DNA de uma população F2 formada a partir da autofecundação de um híbrido interespecífico de Coffea arabica e C. canephora. Os resultados revelaram um total de doze...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coffea spp; Composto químico; Enzima de restrição; ESTs; Gene candidato; Qualidade de bebida.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/903598
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Prospecção de SNPs no gene calbidina e distribuição genotípica do polimorfismo CALB A>G em uma linhagem de frangos de corte. Repositório Alice
MARCHESI, J. A. P.; NEIS. K. L.; FORNARI, M. B.; IBELLI, A. M. G.; PANDOLFI, J. R. C.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O..
2012
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genética; Polimorfismo; Frango de corte; Gene candidato; Integridade óssea; SNP.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/946045
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Prospecção de SNPs no gene TNFa e sua possível associação à verminose gastrintestinal em caprinos. Repositório Alice
BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; VIEIRA, L.; ZAROS, L.; MEIRELLES, S. L.; REGITANO, L. C. de A..
O objetivo desse estudo foi investigar a associação entre marcadores moleculares do tipo SNP (Polimorfismo de base única) prospectados no gene TNFa (fator de necrose tumoral alfa) e resistência à verminose gastrintestinal em caprinos. Para isso, foram produzidos 229 caprinos a partir de animais das raças Saanen, raça considerada susceptível a endoparasitas gastrintestinais e Anglo-nubiana, raça considerada resistente. Para a prospecção de SNPs, foram sequenciados 44 animais extremos para OPG (contagem de ovos por grama de fezes) escolhidos a partir dos resíduos obtidos através do modelo estatístico usado para corrigir os dados fenotípicos para as variações ambientais. O sequenciamento inclui quatro regiões do gene TNFa. Nestas regiões, foram encontrados...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Marcador molecular; Gene candidato; OPG; Caprinos.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/943107
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Prospecção de SNPs no gene TNFa e sua possível associação à verminose gastrintestinal em caprinos. Repositório Alice
DONATONI, F. A. B.; TIZIOTO, P. C.; VIEIRA, L. da S.; ZAROS, L. G.; MEIRELLES, S. L.; REGITANO, L. C. de A..
Resumo: O objetivo desse estudo foi investigar a associação entre marcadores moleculares do tipo SNP (Polimorfismo de base única) prospectados no gene TNFa (fator de necrose tumoral alfa) e resistência à verminose gastrintestinal em caprinos. Para isso, foram produzidos 229 caprinos a partir de animais das raças Saanen, raça considerada susceptível a endoparasitas gastrintestinais e Anglo-nubiana, raça considerada resistente. Para a prospecção de SNPs, foram sequenciados 44 animais extremos para OPG (contagem de ovos por grama de fezes) escolhidos a partir dos resíduos obtidos através do modelo estatístico usado para corrigir os dados fenotípicos para as variações ambientais. O sequenciamento inclui quatro regiões do gene TNFa. Nestas regiões, foram...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Nematódeo gastrintestinal; OPG; Gene candidato; SNPs; TNFa; Caprino; Verminose; Marcador molecular.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/939173
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