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3DMCAP documentation: release 1.0. Infoteca-e
SANTOS, T. T..
This document is the user manual of a tool, 3DMCAP, developed by our Automation Group for photogrammetry using a single camera and a notebook computer. Our staff was able to use it to recover the three-dimensional structure of plants in greenhouses and in open fields, including vines, coffee trees, maize, sunflower, soybean eucalyptus trunks.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Manual do usuário; Ferramenta 3DMCAP; Imagem digital; Visão computacional; Fotogrametria; Photogrammetry; Digital images; Image analysis; Computer vision.
Ano: 2018 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1102027
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4領域に分割された牛ロース芯の画像解析形質に関する品種間比較 OAK
村澤, 七月; 中橋, 良信; 浜崎, 陽子; 堀, 武; 加藤, 貴之; 口田, 圭吾; Murasawa, Nazuki; Nakahashi, Yoshinobu; Hori, Takeshi; Kato, Takayuki; Kuchida, Keigo.
Palavras-chave: Image analysis; Marbling arrangement; Quadrant; Rib eye.
Ano: 2009 URL: http://ir.obihiro.ac.jp/dspace/handle/10322/2448
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Age estimation in common sole Solea solea larvae: validation of daily increments and evaluation of a pattern recognition technique ArchiMer
Lagardere, Françoise; Troadec, Herve.
Close similarities have been found between the otoliths of sea-caught and laboratory-reared larvae of the common sole Solea solea (L.), given appropriate temperatures and nourishment of the latter. But from hatching to mouth formation. and during metamorphosis, sole otoliths have proven difficult to read because the increments may be less regular and low contrast. In this study, the growth increments in otoliths of larvae reared at 12 degrees C were counted by light microscopy to test the hypothesis of daily deposition, with some results verified using scanning electron microscopy (SEM), and by image analysis in order to compare the reliability of the 2 methods in age estimation. Age was first estimated (in days posthatch) from light micrographs of whole...
Tipo: Text Palavras-chave: Larval sole; Solea solea; Otolith; Daily increment; Validation; Image analysis.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00337/44785/44488.pdf
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Análise da castanha do cajueiro por tomografia de ressonância magnética. Repositório Alice
PAIVA, J.R. de; BISCEGLI, C.I.; LIMA, A.C..
O objetivo deste trabalho foi avaliar a técnica de tomografia de ressonância magnética na análise de castanhas de cajueiro, em relação ao método tradicional, visando sua aplicação na seleção de clones. Amostras de castanhas de 40 clones de cajueiro comum, colhidas na safra de 2002, foram analisadas por ambos os métodos. Pelo método tradicional, a maioria dos clones apresentou altos e médios valores dos indicadores industriais massa de castanha, massa de amêndoa e rendimento industrial e baixos índices de quebra das amêndoas. Pela tomografia, a maioria dos clones apresentou castanhas com espaços vazios entre a amêndoa e o endocarpo, que podem proteger a amêndoa durante a decorticação. Os resultados dos dois métodos foram complementares, e a tomografia, além...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Anacardium occidentale; Seleção; Clone; Análise de imagens; Selection; Clones; Image analysis.
Ano: 2004 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/113122
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Analysis of trophic responses in lesioned brain: focus on basic fibroblast growth factor mechanisms BJMBR
Chadi,G.; Fuxe,K..
The actions of fibroblast growth factors (FGFs), particularly the basic form (bFGF), have been described in a large number of cells and include mitogenicity, angiogenicity and wound repair. The present review discusses the presence of the bFGF protein and messenger RNA as well as the presence of the FGF receptor messenger RNA in the rodent brain by means of semiquantitative radioactive in situ hybridization in combination with immunohistochemistry. Chemical and mechanical injuries to the brain trigger a reduction in neurotransmitter synthesis and neuronal death which are accompanied by astroglial reaction. The altered synthesis of bFGF following brain lesions or stimulation was analyzed. Lesions of the central nervous system trigger bFGF gene expression by...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Radioautography; In situ hybridization; Basic fibroblast growth factor; FGF receptor; Astrocyte; Image analysis; Central nervous system; Brain lesion.
Ano: 1998 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-879X1998000200007
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Annotated plant pathology databases for image-based detection and recognition of diseases. Repositório Alice
BARBEDO, J. G. A.; KOENIGKAN, L. V.; HALFELD-VIEIRA, B. de A.; COSTA, R. V. da; NECHET, K. de L.; GODOY, C. V.; LOBO JUNIOR, M.; PATRÍCIO, F. R. A.; TALAMINI, V.; CHITARRA, L. G.; OLIVEIRA, S. A. S. de; ISHIDA, A. K. N.; FERNANDES, J. M. C.; SANTOS, T. T.; CAVALCANTI, F. R.; TERAO, D.; ANGELOTTI, F..
Over the last few years, considerable effort has been spent by Embrapa in the construction of a plant disease database representative enough for the development of effective methods for automatic plant disease detection and recognition. In October of 2016, this database, called PDDB, had 2326 images of 171 diseases and other disorders affecting 21 plant species. PDDB size, although considerable, is not enough to allow the use of powerful techniques such as deep learning. In order to increase its size, each image was subdivided according to certain criteria, increasing the number of images to 46,513. Both the original (PDDB) and subdivided (XDB)databases are now being made freely available for academic research purposes, thus supporting new studies and...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Patologia vegetal; Banco de dados; Aprendizagem profunda; Processamento de imagem; Deep learning; Doença de Planta; Plant pathology; Plant diseases and disorders; Databases; Image analysis.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1094883
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Aplicação de imagens hiperespectrais na detecção de fungos e na predição de micotoxinas em grãos de trigo. Infoteca-e
BARBEDO, J. G. A.; TIBOLA, C. S.; LIMA, M. I. P. M..
Estado da arte da detecção de doenças e micotoxinas em grãos de trigo utilizando imagens hiperespectrais. Métodos rápidos para detecção de giberela e predição do nível de DON. Discussão, tendências e perspectivas. Conclusões.
Tipo: Capítulo em livro técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Espectroscopia de infravermelho próximo; Deoxinivalenol; Doenças em trigo; Detecção de giberela; Processamento de imagem; Imagens hiperespectrais; Image processing; Trigo; Micotoxina; Doença de Planta; Near-infrared spectroscopy; Wheat; Mycotoxins; Image analysis; Plant diseases and disorders.
Ano: 2018 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1110202
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Aplicativo para captura de imagens de doenças em plantas. Repositório Alice
SANTOS, V. A.; BARBEDO, J. G. A..
RESUMO - O uso de detecção automática de doenças em plantações é promissor, mas para que cresça e seja mais eficiente é fundamental um grande volume de imagens de referência. Tentando resolver o problema da escassez desse tipo de imagens, a equipe composta por alunos do Instituto Federal de São Paulo (IFSP/Campinas) venceu o hackathon organizado pela Embrapa Informática Agropecuária. A ideia consiste de um aplicativo para smartphones em que o agricultor possa colaborar com fotos de plantas com sintomas de doenças, principalmente folhas, e tenha em troca um diagnóstico. Esse trabalho visa continuar o projeto de desenvolvimento do aplicativo em parceria com o IFSP/Campinas
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Aplicação mobile; Compartilhamento de imagens; Hackathon; Mobile application; Image sharing; Doença de planta; Plant diseases and disorders; Image analysis.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1077533
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Application of a digital pattern recognition system to Dinophysis acuminata and D-sacculus complexes ArchiMer
Truquet, Philippe; Lassus, Patrick; Honsell, Giorgio; Le Dean, Loic.
An image discrimination technique was developed to improve specific identification of some toxic Dinophysis cells (marine dinoflagellates involved in diarrhoeic shellfish poisoning), especially the ''acuminata'' and ''sacculus'' groups, which can be present at different ratios in natural sea-water samples collected during toxic episodes. This work was performed with image analysis software SAMBA (TITN Alcatel) using preserved cells directly observed through an inverted microscope and recorded with a video camera before further processing. All morphometric parameters used for discrimination of 7 different species or morphotypes of Dinophysis were tested with discriminant analysis. This study indicates that Dinophysis sp. and D. pavillardi seem well...
Tipo: Text Palavras-chave: Dinophysis sp.; Analyse d'image; Taxonomie; Phytoplancton; Dinophysis sp; Image analysis; Taxonomy; Phytoplankton.
Ano: 1996 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00188/29890/28337.pdf
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Aspectos introdutórios de um modelo baseado no indivíduo para estudo da dinâmica espacial do HLB do citros. Repositório Alice
SERVIDONE, G.; TERNES, S.; VILAMIU, R.; LARANJEIRA, F. F..
RESUMO - O Huanglongbing (HLB) é uma doença incurável que afeta plantas de citros em todo o país. Como o Brasil é um dos maiores produtores de citros do mundo, essa doença pode causar um grande impacto econômico na agricultura brasileira. Visando contribuir para novas estratégias de controle da doença, estão sendo realizados estudos focados na modelagem baseada no indivíduo (MBI) para avaliar a propagação espaço-temporal da doença em áreas de plantio com a presença de um novo hospedeiro alternativo mais atrativo. Este trabalho tem como objetivo desenvolver a estrutura computacional de um MBI, utilizando o software R e o pacote Shiny que possibilita executar as simulações via web, a partir de premissas e estudos biológicos prévios da doença. As simulações...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Modelagem baseada no indivíduo; Huanglongbing; Software R; R Shiny; Image recognition; Coffee production; Greening disease; Citrus; Artificial intelligence; Image analysis.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1055877
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Assessment of physiological conditions in e. Coli fermentations by epifluorescent microscopy and image analysis IPB - Escola Superior Agrária
Carneiro, Sónia; Amaral, António L.; Veloso, Ana C.A.; Dias, Teresa; Peres, António M.; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Isabel.
The development of monitoring methods for assessing the physiological state of microorganisms during recombinant fermentation processes has been encouraged by the need to evaluate the influence of processing conditions in recombinant protein production. In this work, a technique based on microscopy and image analysis was developed that allows the simultaneous quantification of parameters associated with viability and fluorescent protein production in recombinant Escherichia coli fermentations. Images obtained from light microscopy with phase contrast are used to assess the total number of cells in a given sample and, from epifluorescence microscopy, both protein producing and injured cells are evaluated using two different fluorochromes: propidium iodide...
Tipo: Article Palavras-chave: Recombinant E. coli fermentations; Epifluorescent microscopy; Physiology assessment; Image analysis.
Ano: 2009 URL: http://hdl.handle.net/10198/3231
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Automated image analysis of seedlings for vigor evaluation of common bean seeds Agronomy
Gomes Junior, Francisco Guilhien; Universidade de São Paulo; Chamma, Helena Maria Carmignani Pescarin; Universidade de São Paulo; Cicero, Silvio Moure; Universidade de São Paulo.
Quickly and precise evaluations of the vigor of seeds are highly desirable for the success of quality control programs applied to the seed industry. The objective of this experiment was to determine the number of days necessary to calculate the vigor index of common bean seeds using an automated system of seedling images (SVIS®), and compare its results with the traditional tests of seed vigor. Samples of five seed lots of the IAC Carioca cultivar were submitted to germination, accelerated aging, seedling emergence in sand and electrical conductivity tests. The parameters measured by the Seed Vigor Imaging System (SVIS®) were mean seedling length, growth (ratio of the actual seedling growth to the maximum possible growth), uniformity of growth and the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Phaseolus vulgaris L.; Image analysis; Quality control.
Ano: 2014 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/21957
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Automatic classification of soybean diseases based on digital images of leaf symptoms. Repositório Alice
BARBEDO, J. G. A.; GODOY, C. V..
This paper presents an algorithm for automatic classification of diseases that produce symptons in soybean leaves.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Imagem digital; Processamento de imagens digitais; Classificação de doenças; Folhas de soja; Transformação de cor; Disease classification; Soybean leaves; Color transformation; Doença de planta; Digital images; Image analysis; Soybeans; Plant diseases and disorders.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1027254
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Automatic image-based detection and recognition of plant diseases - a critical view. Repositório Alice
BARBEDO, J. G. A..
This paper presents a critical analysis of the current state and future perspectives for the use of digital images applied to plant pathology. The differences between the processes of automatic detection and recognition of diseases in plants are presented, with emphasis on the respective current challenges and difficulties. Some of the limitations intrinsic to the use of digital images for detection and recognition of diseases are discussed. Because some of those limitations are mostly inevitable, they may require the use of ancillary data, which may not always be obtained automatically. As a result, depending on the application, the development of completely automatic diagnosis methods may be unfeasible. Thus, the main objective of this paper is to show...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Processamento de imagem; Diagnóstico de doenças; Fitopatologia; Image analysis; Disease diagnosis; Plant pathology.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1083285
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Avaliação da expansão da agricultura anual no Estado do Mato Grosso a partir de imagens multitemporais de NDVI/MODIS. Repositório Alice
PINTO, D. X.; ESQUERDO, J. C. D. M.; COUTINHO, A. C..
Uma das atividades conduzidas no projeto Metodologia para Mapeamento da Agricultura Brasileira (Mapagri), executado pela Embrapa Informática Agropecuária em parceria com diversas instituições de ensino e pesquisa no Brasil, é a geração de metodologias para a elaboração das chamadas "máscaras de agricultura", ou mapas com a localização geográfica das culturas agrícolas anuais no território nacional. Neste projeto estão em desenvolvimento metodologias mais eficazes, menos subjetivas e de rápida execução para a geração desses mapas a partir da abordagem espectro-temporal, que considera o padrão espectral observado ao longo do ciclo produtivo. Assim, um método baseado no comportamento temporal do índice de vegetação Normalized Difference Vegetation Index...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Projeto Mapagri; Índice de vegetação NDVI; Processamento de imagens; Image analysis.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/954536
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Biological characteristics of a hydrothermal edifice mosaic community ArchiMer
Sarrazin, Jozee; Juniper, Sk.
This study defines the composition and biomass characteristics of 5 of 6 previously described faunal assemblages that form a mosaic community on hydrothermal sulfide edifices of the Juan de Fuca Ridge (northeast Pacific). Quantitative samples of each assemblage were acquired during 'ROPOS' Remote Operated Vehicle (ROV) dive programs in 1994 and 1996. Total abundance, and species richness, as well as wet and dry weights, were calculated for each assemblage, and sampled surface area was measured directly or from scaled images of sample scars. These data were used to compare species composition, richness and biomass of the distinct assemblages and to estimate total biomass of a sulfide edifice. In addition to major compositional differences, we observed an...
Tipo: Text Palavras-chave: Vent ecology; Biomass; Faunal succession; Sulfide edifice; Assemblage characteristics; Image analysis; Juan de Fuca Ridge; Ecological model; Marine ecosystem biomass.
Ano: 1999 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00280/39114/37667.pdf
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BMSナンバーと牛ロース芯内脂肪面積比との関連性におよぼす品種の効果 OAK
口田, 圭吾; 小西, 一之; 鈴木, 三義; 三好, 俊三; KUCHIDA, Keigo; KONISHI, Kazuyuki; SUZUKI, Mitsuyoshi; MIYOSHI, Shunzo.
画像解析により算出された牛ロース芯面積に占める脂肪交雑の面積割合(脂肪面積比)と格付員によるBMSナンパーとの関連性におよぼす品種の効果を検討した。材料は黒毛和種32頭(以下,JB),アパディン・アンガス種5頭(AA),JB x ホルスタイン種7頭(BH),JB x AA11頭(BA)およびJB x マリーグレー種3頭(BM)である. 粒子面積階層別に脂肪交雑粒子の平均面積とその標準偏差および粒子数を算出した. さらに脂肪交雑の配置バランスを数値化した. 同ーのBMSナンパーにおいて, JBの脂肪面積比は,他に比較し低い値を示した(Pく0.05). 粒子の平均面積は,すべての粒子面積階層においてJB,AAならびにBMが, BAおよびBHに比較し小さい傾向にあった. JBの脂肪交雑粒子数は,すべての粒子面積階層において少ない傾向にあった.また,JBおよびBMの脂肪交雑は,他の品種に比較し,均一に配置していた. Effecs of breed on the relationship between Beef Marbling Standard (BMS) number by the examiners and ratio of fat area to ribeye area (RFA) calculated by image analysis were investigated. Pictures of the ribeye area of 32 Japanese Black(JB),5 Aberdeen Angus (AA),7 JB x Holstein (BH),11 JB x AA(BA) and 3 JB x Murray Grey (BM) were used. Averages and...
Palavras-chave: BMS number; Beef cattle; Image analysis; Marbling.
Ano: 1999 URL: http://ir.obihiro.ac.jp/dspace/handle/10322/703
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Caracterização de sistemas radiculares de leguminosas cultivadas sob irrigação no Vale do São Francisco: 1. Padrão de distribuição. Repositório Alice
SILVA, J.A.M. e; GOMES, T.C. de A.; SOARES, E.M.B.; SÁ, P.G. de; SILVA, M.S.L. da; FARIA, C.M.B. de..
2002
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sistema radicular; Leguminosa; Matéria orgânica; Irrigação; Análise de imagem; Rooting systems; Leguminosae; Organic matter; Image analysis.
Ano: 2002 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/131805
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Characterization of rough rice grain morphology using image analysis and pattern recognition techniques International Rice Research Institute
Guzman, Jose D..
xxi, 194 leaves : ill. Thesis (Ph.D.) -- University of the Philippines at Los Baños
Tipo: Thesis Palavras-chave: Rough rice; Grains; Anatomy and morphology; Image analysis; Discriminant analysis; Rice quality.
Ano: 2005 URL: http://hdl.handle.net/123456789/367
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Ciência de dados na era da agricultura digital: anais. Repositório Alice
CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROINFORMÁTICA, 11., 2017, Campinas..
Estes anais contêm o texto completo dos trabalhos apresentados no XI Congresso Brasileiro de Agroinformática (SBIAgro 2017), o qual foi promovido pela Embrapa Informática Agropecuária e pela Faculdade de Engenharia Agrícola, Instituto de Computação e pelo Centro de Pesquisas Meteorológicas e Climáticas Aplicadas à Agricultura da Universidade Estadual de Campinas (Unicamp). Esta edição do evento foi realizada no Centro de Convenções e na Casa do Lago da Unicamp, localizados na cidade de Campinas (SP). O propósito do evento foi o de reunir pesquisadores, professores, estudantes, empresários e funcionários de empresas para discutir o tema da informática aplicada à agricultura, além de promover um ambiente propício para o surgimento de novos relacionamentos,...
Tipo: Livro científico (ALICE) Palavras-chave: Agricultura digital; Ciência de dados; Internet das coisas; Processamento de imagem; Aplicativos móveis; Agricultura; Tecnologia da informação; Inovação; Agricultura de precisão; Agriculture; Image analysis; Innovation adoption.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1083271
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