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A transcriptional approach for identifying genes related to drought stress. Repositório Alice
MARTINS, A. C. Q.; MORGANTE, C. V.; SANTOS, C. M. R.; SILVA, F. R. da; ARAÚJO, A. C. G.; BERTIOLI, D. J.; BERTIOLI, S. C. de M. L.; GUIMARAES, P. M.; BRASILEIRO, A. C. M..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Estresse hídrico; Diversidade genética; Marcador molecular; Planta; Amendoim.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/903303
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Acurácia da imputação de marcadores SNPs em bovinos das raças Hereford e Braford. Repositório Alice
MILANO, J. N.; CARVALHO, H. G. de; SOLLERO, B. P.; YOKOO, M. J. -I.; CARDOSO, F. F..
Devido ao alto custo que as genotipagens em larga escala apresentam para estudos na área de genômica, fazem-se necessárias estratégias que viabilizem a genotipagem de forma menos onerosa.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Predição; Marcador molecular; Método de melhoramento; Gado de corte.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1027902
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Aferição dos métodos de avaliação da pureza genética através do peso de 500g e número de sementes em soja. Repositório Alice
ANDREOLI, C.; OLIVEIRA, A. C..
O uso de diferentes metodos para determinacao da pureza varietal em sementes de soja tem ocasionado conflitos entre laboratorios e na comercializacao interestadual de sementes de soja. O objetivo deste trabalho foi testar a afericao de dois metodos de analise de pureza, peso de 500 gramas e 1000 sementes, em dois lotes de soja. No experimento I, as amostras foram enviadas a 10 laboratorios, e no experimento II, o ensaio foi conduzido em 07 laboratorios. Oito amostras constituidas de 998 gramas de sementes puras e duas gramas de sementes de outra cultivar foram preparadas pelos laboratorio. O numero de sementes atipicas variou de 10 a 18 entre os laboratorios no Experimento I e de 11 a 13 sementes no Experimento II, sendo as amostras A1 e A2 de facil...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Mistura varietal; Contaminante; Marcador molecular.
Ano: 1996 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/480578
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Alchemy Web: uma proposta de interface gráfica para o Sistema Alchemy. Infoteca-e
NARCISO, M. G.; VALDISSER, P. A. M. R.; BENÍCIO, C. G.; BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
A Embrapa Arroz e Feijão utiliza a plataforma de genotipagem BeadXpress Reader (Illumina), que utiliza a fluorescência como método de detecção. A interface gráfica foi construída utilizando-se a linguagem JavaScript. Para exemplificar o acesso e o uso do Alchemy Web, foram utilizados dados obtidos em feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.), no Laboratório de Biotecnologia da Embrapa Arroz e Feijão, através da plataforma BeadXpress (Illumina).
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Software; Interface gráfica; Marcador molecular.
Ano: 2014 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/984524
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Allelic variation in HCT1 gene expression is associated with lignin content in sorghum. Repositório Alice
LIVIO, D. F.; DINIZ, M. N.; BARROS, B. A.; SOUZA, V. F. de; PASTINA, M. M.; NODA, R. W.; DAMASCENO, C. M. B..
bitstream/item/164586/1/Allelic-variation.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Marcador molecular; Lignina; Bioenergia.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076585
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Análise comparativa da estabilidade do DNA de Dalbulus maidis (DeLong & Wolcott) (Hemiptera: Cicadellidae) sob diferentes métodos de preservação para uso em RAPD-PCR Neotropical Entomology
OLIVEIRA,CHARLES M.; FUNGARO,MARIA H.P.; CAMARGO,LUÍS E.A.; LOPES,JOÃO R.S..
A preservação adequada do DNA de um determinado organismo é fundamental para o sucesso no uso de técnicas moleculares como RAPD-PCR. O objetivo deste trabalho foi comparar métodos simples de preservação de espécimes de Dalbulus maidis (DeLong & Wolcott) (Hemiptera: Cicadellidae) quanto à quantidade e qualidade do DNA para uso em RAPD-PCR, após períodos sucessivos de armazenamento. Avaliaram-se oito métodos: congelamento (-20ºC); álcool etílico 70% (-20ºC e temperatura ambiente); álcool etílico absoluto (-20ºC e temperatura ambiente); secagem ao ar; e preservação em tampão de extração (inseto inteiro e macerado). A intervalos de 10-30 dias, o DNA foi extraído, quantificado e amplificado via RAPD-PCR pelo oligonucleotídeo OPA-04. A qualidade do DNA...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Insecta; Cigarrinha-do-milho; Marcador molecular; Conservação de DNA; Técnica de armazenamento.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1519-566X2002000200008
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Análise comparativa entre estudos de associação genômica em bovinos das raças Hereford e Braford para resistência ao carrapato. Repositório Alice
OLIVEIRA, K. da S. V.; JUNQUEIRA, V. S.; CARDOSO, F. F.; SOLLERO, B. P..
O presente trabalho visou comparar avaliações de associação genômica ampla (GWAS) entre 652 animais da raça Hereford e 2.803 animais Braford, genotipados para 41.045 SNPs, via inferência bayesiana para a característica de resistência ao carrapato.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gado de corte; Marcador molecular; Genética animal.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1058955
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Análise comparativa para a produtividade em arroz por populações segregantes de Epagri 108 x Irat 122 avançadas por Bulk e SSD. Repositório Alice
RAMOS, M. R. F.; MENDONÇA, J. A.; MOURA NETO, F. P.; BRONDANI, C..
O objetivo desse trabalho, portanto, foi comparar a produtividade das linhagens avançadas por SSD (F8) com a produtividade das linhagens avançadas por Bulk (F7: 8). Adicionalmente, todas as linhagens estão sendo analisadas por marcadores SNPs, obtidos pela técnica de DArTseq, o que possibilitará inferir a distância genética entre elas e comparar o percentual da variação fenotípica explicada pelos QTLs para produtividade identificados nos dois conjuntos de linhagens (derivadas dos métodos Bulk e SSD).
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Melhoramento genético vegetal; Marcador molecular.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084439
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Análise da diversidade genética de acessos componentes da Coleção Nuclear de Feijão da Embrapa. Repositório Alice
CIESLAK, J. F.; VIANELLO, R. P.; OLIVEIRA, J. P. de; COSTA, J. G. C. da; MELO, L. C.; DEL PELOSO, M. J.; BORBA, T. C. de O..
O objetivo deste trabalho foi caracterizar, através de marcadores microssatélites, os acessos da CONFE (Coleção Nuclear de Feijão da Embrapa).
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Diversidade genética; Coleção nuclear; Feijão; Phaseolus vulgaris; Marcador molecular.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/941647
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Análise da diversidade genética de cornichão com o uso de marcadores microssatélites R. Bras. Zootec.
Santos,Armando Martins dos; Agnol,Miguel Dall'; Janke,Aline; Bortolini,Fernanda; Huber,Kátia Graziela Costa.
O objetivo neste trabalho foi analisar a diversidade genética de 14 materiais de Lotus corniculatus L. por meio de marcadores microssatélites. Foram analisados quatro cultivares e uma população de L. corniculatus e seus respectivos genótipos selecionados visando tolerância e sensibilidade ao alumínio. Foram utilizados 17 pares de primers que detectaram 36 alelos nos 17 locos microssatélites, com média de 2,25 alelos por loco. O resultado da análise de agrupamento com base nos índices de similaridade mostrou a formação de três grupos: um englobando germoplasmas e genótipos selecionados para sensibilidade ao alumínio e outros dois formados por genótipos selecionados visando tolerância ao alumínio tóxico. A análise molecular foi eficiente para detectar e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Alumínio tóxico; Cornichão; Marcador molecular; Variabilidade genética.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982011000600005
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Análise da diversidade genética de variedades tradicionais de feijoeiro comum utilizando marcadores microssatélites. Repositório Alice
PRADO, G. S.; COELHO, G. R. C.; MENEZES, I. P. P. de; OLIVEIRA, J. P. de; COSTA, J. G. C. da; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
No Brasil, foi estabelecida, a partir da década de 70, uma rede de pesquisa com ênfase na conservação e uso dos recursos genéticos do feijoeiro comum. O banco de germoplasma da Embrapa Arroz e Feijão detém aproximadamente 17.345 acessos, dos quais 4.325 são variedades tradicionais (VTs). Esses acessos representam uma rica fonte de genes que conferem adaptação a diferentes ambientes, resistência a doenças e propriedades agronômicas diferenciadas que podem ser exploradas por meio de técnicas moleculares que fornecem medidas bastante eficientes e diretas da variabilidade genética existente dentro e entre os acessos. Esse estudo teve como objetivo a avaliação da variabilidade genética de VTs de feijoeiro comum utilizando marcadores microssatélites (SSRs).
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Marcador molecular.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/984476
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Análise da diversidade genética dos acessos componentes da coleção nuclear de feijão da Embrapa através de marcadores SSR. Repositório Alice
CIESLAK, J. F.; BORBA, T. C. de O.; MELO, L. C.; OLIVEIRA, J. P. de; DEL PELOSO, M. J.; COSTA, J. G. C. da.
O objetivo deste trabalho foi caracterizar acessos componentes da Coleção Nuclear de Feijão através de marcadores SSR fluorescentes.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Diversidade genética; Coleção nuclear; Feijão; Phaseolus vulgaris; Marcador molecular.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/912303
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Análise da diversidade genética e estruturação populacional entre marcadores SSRs e SNPs em germoplasma de feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.). Repositório Alice
FARIA, B. M. S. de; MENEZES, I. P. P. de; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; VALDISSER, P. A. M. R.; COELHO, G. R. C.; BORBA, T. C. de O.; ABREU, A. G. de; BRONDANI, C.; BARROS, E. G. de; VIANELLO, R. P..
O objetivo desse estudo foi avaliar o poder de informação genética dos marcadores SSRs e SNPs para aplicações no melhoramento genético do feijoeiro comum.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento genético vegetal; Germoplasma; Marcador molecular.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/964150
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Análise da recuperação do genitor recorrente em maracujazeiro-azedo por meio de marcadores RAPD UnB - FAB
Fonseca, Kenia Gracielle da; Faleiro, Fábio Gelape; Peixoto, José Ricardo; Junqueira, Nilton Tadeu Vilela; Silva, Marília Santos; Bellon, Graciele; Junqueira, Keize Pereira; Vaz, Carolina de Faria.
O Brasil é o maior produtor mundial de maracujá, entretanto tem-se observado redução na produtividade do maracujazeiro nos últimos anos, devido, principalmente, a fatores fitossanitários. Na Embrapa Cerrados, a transferência de genes de resistência de espécies silvestres para as comerciais de maracujazeiro tem sido feita por meio de hibridações interespecíficas seguidas de um programa de retrocruzamentos auxiliados por marcadores moleculares. Este trabalho teve por objetivo verificar a recuperação do genoma recorrente nas plantas RC4 e RC5 [(Passiflora edulis x Passiflora setacea) x Passiflora edulis ] com base em marcadores RAPD. O estudo foi desenvolvido no Laboratório de Genética e Biologia Molecular da Embrapa Cerrados. Amostras de DNA de cada material...
Tipo: Article Palavras-chave: Genética vegetal; Marcador molecular; Genoma vegetal; Passiflora edulis; Passiflora setacea; Maracujá.
Ano: 2009 URL: http://hdl.handle.net/10482/6771
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Análise da variabilidade genética de variedades tradicionais de arroz (Oryza sativa L.) através de marcadores moleculares microssatélites. Repositório Alice
BORBA, T. C. de O.; ZUCCHI, M. I.; BRONDANI, R. V.; RANGEL, P. H. N.; MAGALHÃES, M. R.; BRONDANI, C..
Este trabalho teve como objetivo avaliar a variabilidade genética através de marcadores moleculares SSR em uma amostra de variedades tradicionais oriundas de coletas, conduzidas entre os anos de 1978 e 1996, em lavouras de pequenos agricultores no Brasil.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coleção nuclear; Arroz; Oryza sativa; Recurso genético; Marcador molecular.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/936126
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Análise da variação genética entre progênies de Ilex paraguariensis St. Hil. utilizando marcadores RAPD. Repositório Alice
FRIEDRICH, J. C.; GONELA, A.; VIDIGAL, M. C. G.; VIDIGAL FILHO, P. S.; CARDOZO JUNIOR, E. L.; KVISTCHAL, M. V.; STURION, J. A..
2011
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Ilex paraguariensis; Erva mate; Marcador molecular; Diversidade genética.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/889409
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Análise de parentesco e estimativa de fluxo gênico em mamoeiro por meio de marcadores SSR. Repositório Alice
AMORIM, V. B. de O.; OLIVEIRA, E. J. de; DANTAS, J. L. L..
O mamoeiro é uma espécie que apresenta plantas femininas, masculinas e hermafroditas, sendo que nos plantios comerciais a preferência é por variedades ou híbridos hermafroditas. A quantidade de pólen produzida por plantas hermafroditas é bem menor que a produzida e dispersada por plantas masculinas e por esta razão a polinização cruzada natural em plantas hermafroditas ocorre em pequena escala, alcançando até 99% de autopolinização (Kee, 1970). De acordo com Badillo, (1971), a fecundação das flores de mamoeiro é feita pelo pólen disperso tanto por insetos quanto pelo vento, chegando a distâncias inferiores a 1 km. Nos estudos de fluxo gênico são consideradas duas abordagens: a ecológica e a genética, podendo esta última ser direta e indireta. Dentre a...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pólen; Mamão; Carica papaya; Marcador molecular; Reprodução vegetal.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/873175
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Análise de potencial de regeneração in vitro em plantas de guanandi por marcadores moleculares dominantes. Repositório Alice
SILVEIRA, S. S.; QUOIRIN, M. G. G.; SCHUHLI, G. S. e.
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Calophyllum brasiliense; Micropropagação; Marcador molecular.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/978976
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Análise de similaridade entre acessos de catingueira (Caesalpinia spp.) com base nos marcadores RAPD. Repositório Alice
MENDES, R. F. de M.; SANTOS, M. F. dos; ARAUJO NETO, R. B. de; NASCIMENTO, M. P. S. B. C. do; LIMA, P. S. da C..
2011
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Catingueira; Forragem; Marcador molecular.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/908334
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Análise de SSRs para retrocruzamento assistido visando introgressão do transgene de resistência ao VMDF. Repositório Alice
MOTA, A. P. S.; MENEZES, I. P. P. de; SOUZA, T. L. P. O. de; FARIA, J. C. de; VIANELLO, R. P..
O objetivo desse estudo foi o de identificar marcadores microssatélites (SSRs) polimórficos entre as cultivares Pérola e BRS Pontal, doadoras do evento 5.1, e as cultivares BRS Estilo, BRS Ametista, BRS Notável e BRS Esplendor, receptoras do transgene, bem como outras cultivares potenciais incluindo BRS Embaixador, Rudá, BRS Agreste, And 277, BRS MG Tesouro, BRSMG Realce, CNFP10729, BRS 9435 Cometa, BRS Horizonte e BRS Esteio.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Doença de planta; Virus; Marcador molecular.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/941377
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