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MUDADU, M. de A.; ZERLOTINI NETO, A.. |
Abstract. Background: Genome projects and multiomics experiments generate huge volumes of data that must be stored, mined, and transformed into useful knowledge. All this information is supposed to be accessible and, if possible, browsable afterwards. Computational biologists have been dealing with this scenario for more than a decade and have been implementing software and databases to meet this challenge. The GMOD?s (Generic Model Organism Database) biological relational database schema, known as Chado, is one of the few successful open source initiatives; it is widely adopted and many software packages are able to connect to it. Findings: We have been developing an open source software package named Machado, a genomics data integration framework... |
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) |
Palavras-chave: Dados genômicos; Multiomics; Chado; Base de Dados; Python; Genomics. |
Ano: 2020 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125289 |
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COUTINHO, P. A. Q.; DOMPIERI, M. H. G.; SILVEIRA, H. L. F. da; MARTINHO, P. R. R.; DALTIO, J.; BALAN, M.. |
Por meio do emprego de técnicas e processos relacionados à manipulação de bases massivas de dados, houve o tratamento de dados/metadados advindos de cenas orbitais e de três grandes complexos agropecuários: algodão herbáceo, milho e soja, com o objetivo de se eleger as cenas mais adequadas para o estudo. A delimitação da base político-administrativa municipal a partir do limite natural do bioma permitiu a seleção das janelas de cultivos em função da latitude dos municípios para as cadeias supracitadas, com base nas recomendações técnicas de plantio do Zoneamento Agrícola do Risco Climático (ZARC). Posteriormente, procedeu-se com operações de filtragem de metadados de cenas orbitais (Landsat8-OLI/TIRS). Foram utilizados os softwares ArcGis 10.6, R... |
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) |
Palavras-chave: Landsat-8; Big-Data; Python. |
Ano: 2019 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1108729 |
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