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A gene-transcription factor network associated with residual feed intake based on SNVs/InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds. Repositório Alice
VERARDO, L. L.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; ZERLOTINI NETO, A.; CHUD, T. C. S.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B..
The aim of this study was to analyze whole-genome re-sequencing data focusing on SNVs and InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds related to RFI. Thus, genes showing SNVs/InDels in TF binding sites (5' UTR variants) were used to search for TF related to feed intake and to generate a gene-TF network for RFI across two purebred and one admixed dairy cattle breeds. Moreover, we were able to perform a comparative analysis accessing similarities and dissimilarities at the genomic level across these breeds.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sequência de dados; Single Nucleotide Variations (SNVs); Insertions/deletions (InDels); Whole-genome; Whole-genome re-sequencing data; Gado de Corte; Bos Indicus; Variação Genética; Cattle breeds.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1105518
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A host specialized form of Ceratocystis fimbriata causes seed and seedling blight on native Carapa guianensis (andiroba) in Amazonian rainforests. Repositório Alice
VALDETARO, D. C. O. F.; HARRINGTON, T. C.; OLIVEIRA, L. S. S.; GUIMARÃES, L. M. S.; MCNEW, D. L.; PIMENTA, L. V. A.; GONCALVES, R. C.; SCHURT, D. A.; ALFENAS, A. C..
Ceratocystis fimbriata Ellis & Halsted recently was recorded causing seed and seedling blight on Carapa guianensis Aubl. (andiroba), a tree species native to the Amazon Rainforest and prized for its valuable timber and medicinal seed oil. C. fimbriata more commonly causes wilt type diseases in woody hosts, especially on non-native host trees. However, on andiroba the disease occurs on seedlings and seeds, affecting the species regeneration. We studied 73 isolates of C. fimbriata on andiroba from three regions of the Amazon Basin to see if they represented natural or introduced populations. Analysis of ITS rDNA sequences and phylogenetic analysis of mating type genes revealed new haplotypes of C. fimbriata from the Latin American Clade that were closely...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Produto florestal não madeireiro (PFNM); Enfermedades fungales de las plantas; Plantas de semilleros; Semillas; Variación genética; Repeticiones de microsatélite; Marcador microssatélite; Stem blight; Tizón del tallo; Andiroba; Carapa Guianensis; Doença Fúngica; Fungo; Ceratocystis Fimbriata; Plântula; Semente; Variação Genética; Marcador Genético; Nontimber forest products; Fungal diseases of plants; Seedlings; Seeds; Genetic variation; Genetic markers; Microsatellite repeats.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107239
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Análise da diversidade e estrutura genética de acessos de coqueiro anão. Repositório Alice
SANTOS, C. T. de J.; CORREIA, Q. C. S.; ARCHIMINIO, R. S.; COSTA, T. S.; RAMOS, S. R. R.; DINIZ, L. E. C..
bitstream/item/186089/1/Analise.pdf
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coco; Genética Vegetal; Variação Genética; Coconuts; Plant genetics.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1099473
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Avaliação da resistência de genótipos de maracujazeiro azedo a bacteriose sob condições de campo. Repositório Alice
DUARTE, J. L. P.; FERREIRA, C. C.; PEIXOTO, J. R.; VILELA, M. S.; PIRES, M. de C.; FALEIRO, F. G..
bitstream/item/171222/1/Anais-Simposio-p55.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Maracujá; Passiflora edulis; Variação Genética; Doença de Planta; Bacteriose.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1085619
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Avaliação da transferibilidade para Euterpe precatoria de marcadores microssatélites desenvolvidos para Euterpe edulis. Repositório Alice
AZEVEDO, H. S. F. da S.; RUFINO, P. B.; CAVALCANTE, L. do N.; AZEVEDO, J. M. A. de; WADT, L. H. de O.; CAMPOS, T. de.
Euterpe precatoria, conhecido popularmente como açaí-solteiro apresenta potencial agronômico, tecnológico e econômico e vem ganhando destaque pela comercialização de seus frutos. A produção desse açaizeiro está baseada no extrativismo e por isso práticas de manejo têm sido recomendadas para uma coleta sustentável. Para se recomendar taxas sustentáveis de coleta dos frutos, é fundamental se ter informações sobre a variabilidade genética das populações naturais O açaizeiro apresenta grande importância, devido à crescente demanda por seus frutos nos mercados consumidores: local, regional e nacional. Esta crescente procura, faz com que seja incentivado estudos de diversidade e estrutura genética de populações de açaizeiros nativos, visando a conservação, uma...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Manejo sustentável; Agricultura sustentable; Variación genética; Repeticiones de microsatélite; Novo Segredo; Formoso; Terra Indígena Kaxinawá de Nova Olinda (TIKNO); Feijó (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Western Amazon; Amazonia Occidental; Melhoramento Genético Vegetal; Açaí; Euterpe Edulis; Variação Genética; Fruto; Marcador Genético; Sustainable agriculture; Plant breeding; Euterpe precatoria; Arecaceae; Genetic variation; Genetic markers; Microsatellite repeats.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107227
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Biometria e composição química de genótipos do café conilon irrigado no Cerrado do Planalto Central do Distrito Federal. Repositório Alice
SALA, P. I. A. L..
Resumo: O Cerrado tem se mostrado uma região ideal para o cultivo de grandes culturas e propícia à cultura do café, por ser plano permitindo o uso de máquinas. O conilon é uma variedade botânica dentro da espécie Coffea canephora Pierre ex Froehner que tem limitação nas baixas temperaturas em áreas de maior altitude, porém, apresenta grande diversidade genética e adaptação. Seu cultivo vem surgindo como uma nova opção para os produtores de café na região do Cerrado, Contudo, ainda não existem (variedades/clones) comerciais de conilon com qualidade superior de bebida. Nesse contexto busca-se, encontrar genótipos de cafés conilon com grande potencial para produção e melhor qualidade de bebida no intuito de auxiliar a seleção de genótipos promissores para...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Distrito Federal; Café; Cafeicultura; Coffea Canephora; Diversificação de Cultura; Variação Genética; Sistema de Cultivo; Cerrado.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1106818
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Capacidade de combinação em sete populações de melancia. Repositório Alice
FERREIRA, M. A. J. F.; BRAZ, L. T.; QUEIROZ, M. A. de; CHURATA-MASCA, M.G.C.; VENCOVSKY, R..
Este trabalho teve como objetivo estimar as capacidades geral (CGC) e específica (CEF) de combinação e os efeitos recíprocos (ER) em relação à precocidade, componentes de produção e características do fruto em sete populações de melancia. As populações foram intercruzadas em dialelo, incluindo os recíprocos. Todas as variáveis avaliadas, com exceção do número de frutos por planta, apresentaram efeitos da CGC, CEC e ER significativos. Efeitos gênicos aditivos foram importantes em relação ao número e peso de frutos por planta, assim como em relação à cor, espessura e teor de sólidos solúveis da polpa. Quanto ao número de dias para o aparecimento da primeira flor feminina e numero de sementes por fruto, ocorreu predominância de efeitos gênicos não-aditivos....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Diallel crossing; Methods; Fruit; Fruticultura; Citrullus Lanatus; Cruzamento Dialélico; Melancia; Melhoramento; Método; Variação Genética; Genetic variation; Plant breeding.
Ano: 2002 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/128688
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Caracterização botânica e agronômica da coleção de trabalho de mandioca da Embrapa Acre. Repositório Alice
SILVA, B. S. da.
O conhecimento das características botânicas e agronômicas de um germoplasma de mandioca é de suma importância para seleção de cultivares promissores, a eliminação de duplicatas, obtenção da divergência genética sendo indispensável para programas de melhoramento da cultura. A combinação de caracteres agronômicos em um cultivar de mandioca que tenha boa produtividade, alto teor de amido e resistência à podridão das raízes é um desafio aos melhoristas da cultura. Este trabalho tem como objetivo caracterizar botânica e agronomicamente os cultivares de mandioca da coleção de trabalho de mandioca da Embrapa Acre. O trabalho foi realizado no Campo Experimental da Embrapa Acre (CTMEA) sendo avaliados 103 cultivares de mandioca dos quais 61% coletadas no Acre. O...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Conservación del germoplasma; Composición botánica; Variación genética; Embrapa Acre; Rio Branco (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Western Amazon; Amazonia Occidental; Mandioca; Manihot Esculenta; Banco de Germoplasma; Composição Botânica; Características Agronômicas; Variação Genética; Cassava; Germplasm conservation; Botanical composition; Agronomic traits; Genetic variation.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/737056
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Caracterização da diversidade genética de acessos do banco de germoplasma de seringueira. Repositório Alice
SOUZA, C. S. de.
A seringueira (Hevea brasiliensis) é uma planta popularmente conhecida por ser a principal fonte de borracha natural. Assim, é fundamental que este recurso genético esteja devidamente avaliado e caracterizado. O objetivo desse trabalho foi caracterizar por meio de marcadores microssatélites a diversidade genética de acessos do banco de germoplasma de seringueira da Embrapa Amazônia Ocidental, Embrapa Amazônia Oriental e Embrapa Cerrados. Foram amostrados 318 acessos, pertencentes às espécies Hevea brasiliensis, Hevea pauciflora, Hevea rigidifolia e híbridos interespecíficos. Foram testados 10 marcadores microssatélites. Os produtos amplificados foram genotipados em sequenciador automático. As estimativas genéticas estimadas foram: heterozigosidade esperada...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Marcador microssatélite; Ruber tree; Árbol de goma; Hevea pauciflora; Hevea rigidifolia; Fitomejoramiento; Variación genética; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite; Seringueira; Hevea Brasiliensis; Melhoramento Genético Vegetal; Variação Genética; Marcador Genético; Genótipo; Polimorfismo Genético; Plant breeding; Genetic variation; Genetic markers; Genotype; Genetic polymorphism; Microsatellite repeats.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1091127
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Conservação e uso de recursos genéticos de camu-camu (Myrciaria dubia). Repositório Alice
SOUSA, N. R.; SOUZA, A. das G. C. de; SILVA, S. E. L. da.
Coleta de germoplasma visando a implantacao de um Banco Ativo de Germoplasma de camu-camu (Myrciaria dubia), com o objetivo de aproveitamento da variabilidade genetica natural da especie para selecao de variedades adaptadas a solos de terra firme no estado do Amazonas.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Camu-camu; Brasil; Amazonas; Manaus; Selection; Germoplasma; Myrciaria Dubia; Seleção; Variação Genética; Genetic variation; Germplasm.
Ano: 1997 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/667563
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Correlação entre descritores multicategóricos e marcadores ISSR em acessos do banco de germoplasma de seringueira da Embrapa. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. da S.; FALEIRO, F. G.; LIMA, W. A. A. de; FIALHO, J. de F.; VEIGA, A. D.; BRAGA, M. F.; PEREIRA, A. V..
bitstream/item/168107/1/Paginas-72-de-V-Congresso-Brasileiro-de-Heveicultura-l-20175.pdf
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Embrapa; Caracterização molecular; Diversidade genética; Seringueira; Hevea brasiliensis; Banco de Germoplasma; Marcador Molecular; Variação Genética.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1081417
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Descritores foliares e diversidade de genótipos de seringueira. Repositório Alice
LIMA, W. A. A. de; FIALHO, J. de F.; FALEIRO, F. G.; PEREIRA, A. V.; VEIGA, A. D.; BRAGA, M. F.; JUNQUEIRA, N. T. V.; OLIVEIRA, J. da S..
bitstream/item/168128/1/Paginas-62-de-V-Congresso-Brasileiro-de-Heveicultura-l-20173.pdf
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Embrapa Cerrados; Seringueira; Hevea; Fenótipo; Características Agronômicas; Parâmetro Genético; Variação Genética; Banco de Germoplasma; Melhoramento Genético Vegetal.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1081233
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Desenvolvimento vegetativo de clones de seringueira. Repositório Alice
GONÇALVES, P. de S.; VASCONCELOS, M. E. da C.; SILVA, E. B. da.
Foram avaliados o desenvolvimento do tronco e a espessura da casca dos clones IAN 717, IAN 873 e Fx 3899. Os experimentos foram desenvolvidos em areas de Latossolo Amarelo, textura muito argilosa, e Latossolo Amarelo, textura media, que ocorrem no municipio de Manaus, AM. Foi utilizado o delineamento de parcelas inteiramente casualizadas com 100 plantas, no espaçamento de tres metros e afastamento entre as linhas de sete metros. Os resultados preliminares indicam que os clones, ate dois anos e meio de idade, nao mostraram um modelo bem definido de variacao.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Interacao genotipo x ambiente; Desenvolvimento vegetativo; Seringueira; Variação Genética; Clones.
Ano: 1979 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107146
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Diferentes métodos de estimação de componentes de variância em variedades crioulas de milho. Repositório Alice
FONTINELE, Y. da R.; BORGES, V. S.; LIMA, M. S. de; HAVERROTH, M.; FERREIRA, A. B.; SILVA, S. A. de A. e.
O melhoramento vegetal está em função da genética, do ambiente e da interação genética x ambiente, logo é importante ressaltar que o melhoramento de plantas é uma estratégia para aumentar a produção de alimentos, em relação à adaptação da planta ao ambiente e não do ambiente à planta e, com isso aumentar o potencial produtivo de espécies cultivadas. Portanto, é necessário estudo para que se conheça a variabilidade genética de milho crioulo, para viabilizar o seu uso futuro e originar populações com ganhos genéticos significativos, utilizados em programas de melhoramentos. Este trabalho objetivou-se estimar diferentes métodos de componentes de variância em variedades de milho crioulo.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Análise de variância; Variedade crioula; Fitomejoramiento; Maíz; Especies nativas; Nawa Sheki; Sheki Kui; Variación genética; Análisis de varianza; Universidade Federal do Acre; Terra Indígena Kaxinawá de Nova Olinda (TIKNO); Rio Branco (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Western Amazon; Amazonia Occidental; Melhoramento Genético Vegetal; Milho; Zea Mays; Variação Genética; Método Estatístico; Plant breeding; Corn; Indigenous species; Genetic variation; Analysis of variance.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102728
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Dissimilaridade genética entre linhagens de milho-pipoca para eficiência ao uso de fósforo. Repositório Alice
GERHARDT, I. F. S.; LEITE, J. T.; SANTOS, T. de O.; XAVIER, K. B.; PENA, G. F.; SILVA, R. M. da R.; GUIMARAES, L. J. M.; AMARAL JÚNIOR, A. T. do.
bitstream/item/182871/1/Dissimilaridade-genetica.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Capacidade de expansão; Variação Genética; Produtividade.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1095616
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Divergência genética e correlações entre variáveis agroindustriais da população de trabalho de cajuí da Embrapa Meio-Norte. Repositório Alice
MAIA, M. C. C.; OLIVEIRA, L. C. de; ALMEIDA, A. da S.; ARAÚJO, L. B. de; VASCONCELOS, L. F. L.; LACERDA, M. N. de.
O trabalho foi realizado na área experimental da Embrapa Meio-Norte, em Parnaíba, PI. A coleção de trabalho é constituída de 11 genótipos coletados em áreas de ocorrência natural da espécie no Estado do Piauí. O experimento foi delineado em blocos completos casualizados, com duas plantas por parcela e quatro repetições. As variáveis avaliadas foram: peso total do fruto, peso do pedúnculo, peso da castanha, diâmetros basal, diâmetro apical, comprimento, firmeza, vitamina C e sólidos solúveis totais. Utilizou-se a análise de agrupamento UPGMA para a separação dos genótipos. A análise da divergência genética permitiu separar os genótipos da coleção de trabalho do cajuí em três grupos geneticamente disjuntos e dentro destes grupos os genótipos: M28 e M21; M23...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Fitomejoramiento; Variacíón genética; Embrapa Meio-Norte; Teresina (PI); Piauí; Melhoramento Genético Vegetal; Cajuí; Variação Genética; Campo Experimental; Plant breeding; Anacardium; Genetic variation.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/941846
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Divergencia genetica em germoplasma de abobora procedente de diferentes areas do Nordeste. Repositório Alice
RAMOS, S. R. R.; QUEIROZ, M. A. de; CASALI, V. W. D.; CRUZ, C. D..
O trabalho foi conduzido na Estacao Experimental, da Embrapa Semi-Arido, em Juazeiro (BA), de agosto a dezembro de 1993. Objetivou-se avaliar, por meio de tecnicas de analise multivariada, o grau de similaridade genetica entre 40 acessos de abobora, coletados em tres areas distintas da regiao Nordeste. O delineamento experimental utilizado foi blocos ao acaso com tres repeticoes e parcela util composta por oito plantas. Avaliou-se o comprimento medio do internodio do peciolo e do limbo; diametro medio do caule; largura media do limbo foliar; numero medio de dias para antese da primeira flor masculina e da primeira flor feminina; localizacao do no da primeira flor masculina e da primeira flor feminina; peso medio, comprimento, diametro maior e diametro...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracteristica; Canonial variables; Plant; Seed characteristics; Abóbora; Cucúrbita Moschata; Fruto; Método Estatístico; Planta; Semente; Variação Genética; Fruits; Multivariate analysis; Pumpkins.
Ano: 2000 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/134116
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Diversidade e estrutura genética de Swietenia macrophylla King em floresta manejada na Amazônia sul-ocidental. Repositório Alice
OLIVEIRA, S. S. de.
Swietenia macrophylla King é uma espécie monoica, alógama, e ameaçada de extinção com alto valor econômico para a indústria madeireira. O objetivo desse estudo foi conhecer a diversidade e estrutura genética de Swietenia macrophylla King em floresta manejada na Amazônia Sul-Ocidental. Foram coletados material vegetal de 83 indivíduos adultos e 187 juvenis. Foram testatos 12 marcadores microssatélites para a caracterização da diversidade e estruturação genética espacial. Foi realizada a análise de parentesco pela determinação dos padrões de fluxo de pólen e distância de dispersão. Foi estimada a taxa efetiva de autofecundação, a taxa de cruzamento de indivíduos aparentados e não aparentados. Foi avaliado o sistema reprodutivo da espécie com base no método...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Fitomejoramiento; Variación genética; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite; Amazônia Sul-Ocidental; Melhoramento Genético Vegetal; Variação Genética; Endogamia; Mogno; Swietenia Macrophylla; Marcador Molecular; Plant breeding; Genetic variation; Inbreeding; Genetic markers; Microsatellite repeats.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110195
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Diversidade genética da comunidade de fungos micorrízicos arbusculares da rizosfera de genótipos de milho cultivados sob diferentes fontes e níveis de fósforo. Repositório Alice
CAMPOLINO, M. L.; LANA, U. G. de P.; COELHO, A. M.; GOMES, E. A.; SOUSA, S. M. de.
bitstream/item/184148/1/Diversidade-genetica-3.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Zea Mays; Fertilizante; Variação Genética.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1097128
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Diversidade genética de genótipos de maracujazeiro azedo selecionados no Distrito Federal. Repositório Alice
MORAIS, T. B. R. de; CAMPOS, A. V. S.; PEIXOTO, J. R.; FALEIRO, F. G.; VILELA, M. S.; PIRES, M. de C..
bitstream/item/171194/1/Anais-Simposio-p25.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: RAPD; Passiflora edulis; Maracujá; Melhoramento Genético Vegetal; Variação Genética.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1085579
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