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Provedor de dados:  PFB - Pesquisa Florestal Brasileira
País:  Brazil
Título:  Genome wide selection (GWS) and maximization of the genetic improvement efficiency
Seleção genômica ampla (GWS) e maximização da eficiência do melhoramento genético
Autores:  Resende, Marcos Deon Vilela de
Lopes, Paulo Sávio
Silva, Rogério Luíz da
Pires, Ismael Eleotério
Data:  2010-03-22
Ano:  2010
Palavras-chave:  Genomic selection linkage disequilibrium analysis fine mapping genetic markers. Seleção genômica
Análise de desequilíbrio de ligação
Mapeamento fino
Marcadores moleculares
Resumo:  Genetic selection has been practiced by the best linear unbiased prediction (BLUP) method using phenotypic records. A first proposal for enhancement of the efficiency of this procedure was the marker assisted selection (MAS). Later, another method called genome wide selection - GWS was reported, which presents high accuracy for the selection based exclusively on markers, after predicting their genetic effects from phenotypic data in a sample of the population of selection. GWS is excellent for low heritable traits, while MAS is not. This paper presents the GWS methodology and simulates a case of its application, aiming at emphasizing its advantages over MAS. The relation between traditional BLUP and genomic BLUP is also detailed as well as the sample size required for precise estimation of the genetic values of the markers. Results revealed that the GWS can be worthy for genetic improvement. Practical experience is much needed to infer about its effectiveness.

A seleção genética tem sido praticada pelo procedimento BLUP, usando dados fenotípicos avaliadosa campo. Uma primeira proposição realizada para aumentar a eficiência desse procedimento, baseado em dadosfenotípicos, foi a seleção auxiliada por marcadores (MAS) moleculares, a qual usa simultaneamente dadosfenotípicos e moleculares. Posteriormente, foi proposto um novo método de seleção denominado seleção genômicaampla (genome wide selection – GWS), o qual apresenta alta acurácia seletiva para a seleção, baseadaexclusivamente em marcadores, após terem seus efeitos genéticos estimados a partir de dados fenotípicos emuma amostra da população de seleção. A GWS é excelente para caracteres de baixa herdabilidade, ao contrário daMAS, que não é útil para caracteres de baixa herdabilidade. O presente trabalho tem como objetivos apresentara metodologia GWS e simular um caso de aplicação da mesma, visando enfatizar as suas vantagens sobre aMAS. Objetiva também demonstrar a relação entre o BLUP tradicional e o BLUP genômico associado à GWS.Adicionalmente, discute aspectos referentes ao tamanho amostral adequado para estimação dos efeitosgenotípicos dos marcadores. Os resultados revelam que a GWS poderá ter grande utilidade ao melhoramentogenético. No entanto, é preciso adquirir experiência prática com a GWS, visando inferir sobre sua efetividade.
Tipo:  Info:eu-repo/semantics/article
Idioma:  Português
Identificador:  http://pfb.cnpf.embrapa.br/pfb/index.php/pfb/article/view/63
Editor:  Embrapa Florestas
Relação:  http://pfb.cnpf.embrapa.br/pfb/index.php/pfb/article/view/63/65
Formato:  application/pdf
Fonte:  Brazilian Journal of Forestry Research; n. 56 (2008); 63

Pesquisa Florestal Brasileira; n. 56 (2008); 63

1983-2605

1809-3647
Direitos:  Direitos autorais 2015 Pesquisa Florestal Brasileira

http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0
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