| Registro completo |
| Provedor de dados: |
Acta biol.Colomb.
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| País: |
Colombia
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| Título: |
ANÁLISIS in silico Y EXPRESIÓN GÉNICA DEL FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN TgNACO1 IMPLICADO EN XILOGÉNESIS Y ESTRÉS ABIÓTICO EN Tectona grandis.
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| Autores: |
CAMEL PAUCAR,Vladimir
GALEANO,Esteban
CARRER,Helaine
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| Data: |
2017-12-01
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| Ano: |
2017
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| Palavras-chave: |
Estructura proteíca
Expresión génica
Factor de transcripción
Método de espectro de la información
Xilema secundario
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| Resumo: |
RESUMEN El xilema secundario es el componente más abundante de la biomasa vegetal. Por tanto, conocer los genes que regulan su formación ayudaría a diseñar estrategias para el mejoramiento genético de la madera. Así, el objetivo de este trabajo fue realizar el análisis computacional de la estructura primaria y secundaria del factor de transcripción (FT) TgNACO1 de Tectona grandis, además de evaluar su historia evolutiva, dominios conservados y expresión génica en tejidos lignificados de árboles de 12 y 60 años. Para ello, se realizó una evaluación del potencial de interacción ion-electrón (PIIE), mediante el método del espectro de la información (MEI) utilizando la librería SFAPS de R-Project, seguido del modelamiento estructural utilizando el software MODELLER y visualizado mediante PyMol. Además, el análisis de alineamiento de secuencia múltiple y filogenia fue mediante el software Bioedit y MrBayes respectivamente. También se evaluó los niveles de síntesis del FT TgNACO1 mediante qRT-PCR. Como resultados, se evidenció que el FT mantiene una estructura (3-hoja antiparalela retorcida, que se compacta contra una a-hélice en la región N-terminal, teniendo así tres dominios a hélice y siete dominios (3 plegada. Asimismo, mediante el MEI se demostró que tiene alrededor de cinco funciones biológicas y mutaciones sobre los aminoácidos con mayor PIIE, lo que conlleva a evoluciones sobre las redes de regulación genética. Finalmente, el FT TgNACO1 podría presentar un papel fundamental en la organización y desarrollo de las partes que componen la albura, como las células radiales de la zona cambial, los vasos, fibras y los anillos de crecimiento.
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| Tipo: |
Info:eu-repo/semantics/article
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| Idioma: |
Espanhol
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| Identificador: |
http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2017000300359
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| Editor: |
Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología
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| Relação: |
10.15446/abc.v22n3.62164
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| Formato: |
text/html
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| Fonte: |
Acta Biológica Colombiana v.22 n.3 2017
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| Direitos: |
info:eu-repo/semantics/openAccess
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