| Registro completo |
| Provedor de dados: |
ArchiMer
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| País: |
France
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| Título: |
Première évaluation de la diversité des communautés microbiennes planctoniques au cours d'épisodes de mortalité des moules bleues en France : utilisation de l'approche de métabarcoding pour l'analyse de l'ADN environnemental
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| Autores: |
Pepin, Jean-francois
Bouget, Jean-francois
Chabirand, Jean-michel
Chasselin, Leo
Costes, Louis
Grizon, James
Lejolivet, Aurore
Le Noc, Sandrine
Palvadeau, Hubert
Schmitt, Anne
Seugnet, Jean-luc
Soletchnik, Patrick
Travers, Marie-agnes
Tourbiez, Delphine
Guesdon, Stephane
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| Data: |
2019
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| Ano: |
2019
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| Palavras-chave: |
MORBLEU
Moules
Mortalité
ADN environnemental
EDNA
Metabarcoding
Communautés microbiennes
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| Resumo: |
Since 2014 in France, in Charente maritime and Vendée, farmed and stocks of blue mussels experienced strong mortality events. In this context, the « MORBLEU » research project (DPMA-Ifremer agreement) was initiated to explore potentially aggravating factors, associated or correlated with mortality of mussels. Here, the work is to study biotic factors in mussels environment, looking for describe diversity and evolution of microbial communities (water column) before, during and after mortality events using NGS technology (metabarcoding) for environmental DNA analysis. We present, sampling strategy used from 2015 to 2018, Material & Methods and some preliminary results.
Dans le cadre d’une étude associée aux épisodes de mortalité des moules bleues en France, visant à décrire et comprendre les facteurs qui peuvent favoriser ces mortalités, un panel de paramètres biotiques et abiotiques ont été suivis sur différents sites entre 2015 et 2018. Ce projet a été cofinancé par Ifremer et la DPMA (étude MORBLEU, MORtalité des moules BLEUes). Parmi les facteurs biotiques évalués, une approche basée sur l’ADN environnemental de la colonne d’eau a permis de décrire dans l’espace et dans le temps l’évolution de la dynamique et de la diversité des communautés microbiennes planctoniques, procaryotes et eucaryotes (NGS, metarbarcoding). Nous détaillons la stratégie d’échantillonnage utilisée, les matériels et méthodes mis en œuvre au cours du projet, du prélèvement au séquençage ADNe et quelques résultats préliminaires.
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| Tipo: |
Text
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| Idioma: |
Francês
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| Identificador: |
https://archimer.ifremer.fr/doc/00505/61664/65579.pdf
https://archimer.ifremer.fr/doc/00505/61664/
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| Editor: |
Journées scientifiques et techniques Mer " (JST) : Journées de partage entre les experts de la biodiversité marine, AFB - Agence Française pour la Biodiversité. 11-12 juin 2019, Océanopolis Brest, France
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| Formato: |
application/pdf
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| Direitos: |
info:eu-repo/semantics/openAccess
restricted use
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