| Registro completo |
| Provedor de dados: |
Bragantia
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| País: |
Brazil
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| Título: |
Análise dos coeficientes de endogamia e de parentesco para qualquer nível de ploidia usando o pacote estatístico R
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| Autores: |
Peternelli,Luiz Alexandre
Ferreira,Fábio Medeiros
Rocha,Rodrigo Barros
Barros,Willian Silva
Barbosa,Márcio Henrique Pereira
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| Data: |
2009-01-01
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| Ano: |
2009
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| Palavras-chave: |
Genética de populações
Poliplóides
Análise de pedigree
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| Resumo: |
São poucos os softwares disponíveis para a análise de parentesco e, até a presente data, nenhum pode realizar a análise de parentesco para organismos poliplóides, com número par (2k) de cromossomos. Implementou-se junto ao programa R uma rotina capaz de executar a análise de parentesco para qualquer nível 2k de ploidia, número de indivíduos (ou populações) e número de gerações envolvidas na árvore genealógica. A função principal, calc.rxy() calcula o coeficiente de endogamia (F X) de cada indivíduo; coeficientes de parentesco (rXY) entre dois indivíduos quaisquer; e coeficiente de parentesco médio, variância, mínimo e máximo, para cada indivíduo. Ela pode mostrar a matriz completa de parentesco ou uma submatriz pré-definida de indivíduos selecionados. Adicionalmente, foram incluidas funções que servem para identificar erros de redundância dos dados originais (checar.nomes()) e para identificar os pares de indivíduos com rXY superior a certo limite especificado pelo pesquisador (corte.rxy()). Essas funções podem ser usadas na análise de pedigrees com um número elevado de indivíduos e poderão ser utilizadas pela comunidade científica livremente, sem restrições à plataforma operacional utilizada. Destaca-se a vantagem em se poder trabalhar com qualquer nível 2k de ploidia, mesmo quando existe a possibilidade de certo indivíduo ser oriundo de autofecundação, aspecto comum em várias espécies vegetais.
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| Tipo: |
Info:eu-repo/semantics/article
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| Idioma: |
Português
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| Identificador: |
http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052009000400004
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| Editor: |
Instituto Agronômico de Campinas
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| Relação: |
10.1590/S0006-87052009000400004
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| Formato: |
text/html
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| Fonte: |
Bragantia v.68 n.4 2009
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| Direitos: |
info:eu-repo/semantics/openAccess
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