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Provedor de dados:  Genet. Mol. Biol.
País:  Brazil
Título:  Complete mitochondrial genome of the Florida manatee (Trichechus manatus latirotris, Sirenia)
Autores:  Vilaça,Sibelle T.
Santos,Fabricio R.
Data:  2019-01-01
Ano:  2019
Palavras-chave:  Trichechus manatus
Florida manatee
Amazonian manatee
Mitochondrial genome
Resumo:  Abstract The Florida manatee (Trichechus manatus latirostris) is an endangered subspecies of the West Indian manatee (T. manatus), which inhabits inland and marine waters of southeastern United States. In this study, we assembled the mitochondrial genome (mtDNA) of the Florida manatee from whole genome shotgun reads. As a result, we show that the currently annotated T. manatus mtDNA belongs to a different species, the Amazonian manatee (T. inunguis). The newly assembled Florida manatee mtDNA is 16,881 bp in length, with 13 protein-coding genes, two ribosomal RNAs (rRNAs), 22 transfer RNAs (tRNAs) and one non-coding control region (D-loop). Phylogenetic analysis based on the control region indicates the newly assembled mtDNA is haplotype A01, characteristic of T. m. latirostris, while the current mtDNA associated with the Florida manatee genome assembly has a Ti02 haplotype that is found in Amazonian manatees and hybrids.
Tipo:  Info:eu-repo/semantics/article
Idioma:  Inglês
Identificador:  http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572019000500201
Editor:  Sociedade Brasileira de Genética
Relação:  10.1590/1678-4685-gmb-2019-0210
Formato:  text/html
Fonte:  Genetics and Molecular Biology v.42 n.4 2019
Direitos:  info:eu-repo/semantics/openAccess
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