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	Provedor de dados Repositório Alice (79) Autor MUDADU, M. de A. (79) REGITANO, L. C. de A. (65) HIGA, R. H. (27) COUTINHO, L. L. (26) TIZIOTO, P. C. (26) ALENCAR, M. M. de (25) MOKRY, F. B. (24) TULLIO, R. R. (23) MOURÃO, G. B. (16) NICIURA, S. C. M. (16) MALAGO JUNIOR, W. (14) MEIRELLES, S. L. C. (14) ROSA, A. do N. (14) NASSU, R. T. (13) LIMA, A. O. de (11) SOMAVILLA, A. L. (11) THOLON, P. (11) OLIVEIRA, P. S. N. de (10) SILVA, M. V. G. B. (10) SIQUEIRA, F. (10) Mais... Palavra-chave Beef cattle (16) Bos Indicus (11) Single nucleotide polymorphism (9) Bos Indicus. (8) Gado de Corte. (6) Gado de corte (6) Bioinformatics (5) Bioinformática (5) Cattle (5) Desequilíbrio de ligação (5) Linkage disequilibrium (5) Polimorfismo de nucleotídeo único (5) Candidate gene (4) Feed efficiency (4) Gado Nelore (4) Nellore (4) QTL (4) Shear force (4) Bovino (3) Expressão gênica (3) Mais... Tipo do documento Separatas (31) Artigo de periódico (29) Anais e Proceedings de eventos (12) Parte de livro (5) Palestras Institucionais (1) Resumo em anais e proceedings (1) Mais... Ano 2023 (1) 2021 (1) 2020 (3) 2019 (5) 2018 (4) 2017 (5) 2016 (8) 2015 (3) 2014 (20) 2013 (17) 2012 (11) 2011 (1) Mais... País Brazil (79) Idioma Inglês (43) Português (36)		Ordenar por:  Relevância Autor Título Ano Registros recuperados: 79 Primeira ... 1 2 3 4 ... Última Mineração de dados para identificar atributos genéticos associados à características de interesse econômico à pecuária. Repositório Alice GONZAGA, A. DOS S.; MUDADU, M. de A.; HIGA, R. H.; HRUSCHKA, E. R.. Pesquisadores da área de melhoramento genético possuem cada vez mais acesso a dados genéticos e genômicos e demandam por um método ou ferramenta robusta que atendam às suas necessidades na descoberta de conhecimento. Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Mineração de dados; Economia; Genética; Identificação; Pecuária. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1014978 Genome scan for meat quality traits in Nelore beef cattle. Repositório Alice TIZIOTO, P. C.; DECKER, J. E.; TAYLOR, J. F.; SCHNABEL, R. D.; MUDADU, M. de A.; MOURAO, G. B.; COUTINHO, L. L.; THOLON, P.; SONSTEGARD, T. S.; ROSA, A. do N.; ALENCAR, M. M. de; TULLIO, R. R.; MEDEIROS, S. R. de; NASSU, R. T.; FEIJO, G. L. D.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SIQUEIRA, F.; HIGA, R. H.; REGITANO, L. C. de A.. Meat quality traits are economically important because they affect consumers' acceptance, which, in turn, influences the demand for beef. However, selection to improve meat quality is limited by the small numbers of animals on which meat tenderness can be evaluated due to the cost of performing shear force analysis and the resultant damage to the carcass. Genome wide-association studies for Warner-Bratzler shear force measured at different times of meat aging, backfat thickness, ribeye muscle area, scanning parameters [lightness, redness (a*), and yellowness] to ascertain color characteristics of meat and fat, water-holding capacity, cooking loss (CL), and muscle pH were conducted using genotype data from the Illumina BovineHD BeadChip array to identify... Tipo: Separatas Palavras-chave: GWAS; QTL; Beef cattle; Zebu. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/982207 Linkage disequilibrium and haplotype block structure in a composite beef cattle breed. Repositório Alice MOKRY, F. B.; BUZANSKAS, M. E.; MUDADU, M. de A.; GROSSI, D. do A.; HIGA, R. H.; VENTURA, R. V.; LIMA, A. O. de; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C.; SCHENKEL, F. S.; SILVA, M. V. G. B.; NICIURA, S. C. M.; ALENCAR, M. M. de; MINARI, D. P.; REGITANO, L. C. de A.. Abstract. Background: The development of linkage disequilibrium (LD) maps and the characterization of haplotype block structure at the population level are useful parameters for guiding genome wide association (GWA) studies, and for understanding the nature of non-linear association between phenotypes and genes. The elucidation of haplotype block structure can reduce the information of several single nucleotide polymorphisms (SNP) into the information of a haplotype block, reducing the number of SNPs in a coherent way for consideration in GWA and genomic selection studies. Results: The maximum average LD, measured by r2 varied between 0.33 to 0.40 at a distance of < 2.5 kb, and the minimum average values of r2 varied between 0.05 to 0.07 at distances... Tipo: Separatas Palavras-chave: Composite; Desequilíbrio de ligação; Genome wide association studies; Halplotype block; Linjage disequilibirium; Polimorfismo de nucleotídeo único.; Gado de corte.; Beef cattle; Linkage disequilibrium; Single nucleotide polymorphism.. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1006604 Genomic structure and marker-derived gene networks for growth and meat quality traits of Brazilian Nelore beef cattle. Repositório Alice MUDADU, M. de A.; PORTO-NETO, L. R.; MOKRY, F. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; NICIURA, S. C. M.; THOLON, P.; ALENCAR, M. M. de; HIGA, R. H.; ROSA, A. do N.; FEIJO, G. L. D.; FERRAZ, A. L. J.; SILVA, L. O. C. da; MEDEIROS, S. R. de; LANNA, D. P.; NASCIMENTO, M. L.; CHAVES, A. S.; SOUZA, A. R. D. L.; PACKER, I. U.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SIQUEIRA, F.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REVERTER, A.; REGITANO, L. C. de A.. Nelore is the major beef cattle breed in Brazil with more than 130 million heads. Genome-wide association studies (GWAS) are often used to associate markers and genomic regions to growth and meat quality traits that can be used to assist selection programs. An alternative methodology to traditional GWAS that involves the construction of gene network interactions, derived from results of several GWAS is the AWM (Association Weight Matrices)/PCIT (Partial Correlation and Information Theory). With the aim of evaluating the genetic architecture of Brazilian Nelore cattle, we used high-density SNP genotyping data (~770,000 SNP) from 780 Nelore animals comprising 34 half-sibling families derived from highly disseminated and unrelated sires from across Brazil.... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Genome-wide association studies; Association Weight Matrices; Partial Correlation and Information Theory; Gene; Genética; Gado Nelore; Gado de corte; Genótipo; Genotyping; Genotype; Nellore; Beef cattle; Genetic resources. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1059898 Validação de um SNP associado à área de olho de lombo em uma população de animais Canchim Repositório Alice LIMA, B. L.; LIMA, A. O. de; MOKRY, F. B.; BRESSANI, F.; MALAGO JUNIOR, W.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Separatas Palavras-chave: SNP; Validação; Olho de lombo.; Gado de Corte.. Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/946176 Allelic and parental-specific expression on the KCNJ11 gene in cattle. Repositório Alice SOUZA, M.; NICIURA, S. C. M.; TIZIOTO, P.; IBELLI, A. M. G.; GASPARIN, G.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; BARIONI JUNIOR, W.; COUTINHO, L.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Separatas Palavras-chave: KCNJ11; Gene; Cattle. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/980666 Genome-enabled prediction of breeding values for feedlot average daily weight gain in nelore cattle. Repositório Alice SOMAVILLA, A. L.; REGITANO, L. C. de A.; ROSA, G. J. M.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; SOUZA, M. M. de; COUTINHO, L. L.; MUNARI, D. P.. Nelore is the most economically important cattle breed in Brazil, and the use of genetically improved animals has contributed to increase beef production efficiency. The Brazilian beef feedlot industry has grown considerably in the last decade, so the selection of animals with higher growth rates on feedlot has become quite important. Genomic selection could be used to reduce generation intervals and improve the rate of genetic gains. The aim of this study was to evaluate the prediction of genomic estimated breeding values for average daily gain in 718 feedlot-finished Nelore steers. Analyses of three Bayesian model specifications (Bayesian GBLUP, BayesA, and BayesC&#960;) were performed with four genotype panels (Illumina BovineHD BeadChip, TagSNPs,... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Genomic selection; Bos taurus indicus; Growth. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1070097 Linkage disequilibrium and haplotype block structure in a composite beef cattle breed. Repositório Alice MOKRY, F. B.; BUZANSKAS, M. E.; MUDADU, M. de A.; GROSSI, D. do A.; HIGA, R. H.; VENTURA, R. V.; LIMA, A. O. de; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C.; SCHENKEL, F. S.; SILVA, M. V. G. B. da; NICIURA, S. C. M.; ALENCAR, M. M. de; MINARI, D. P.; REGITANO, L. C. de A.. Abstract. Background: The development of linkage disequilibrium (LD) maps and the characterization of haplotype block structure at the population level are useful parameters for guiding genome wide association (GWA) studies, and for understanding the nature of non-linear association between phenotypes and genes. The elucidation of haplotype block structure can reduce the information of several single nucleotide polymorphisms (SNP) into the information of a haplotype block, reducing the number of SNPs in a coherent way for consideration in GWA and genomic selection studies. Results: The maximum average LD, measured by r2 varied between 0.33 to 0.40 at a distance of < 2.5 kb, and the minimum average values of r2 varied between 0.05 to 0.07 at distances... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Genome wide association studies; Desequilíbrio de ligação; Gado de corte; Beef cattle; Single nucleotide polymorphism; Linkage disequilibrium. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1003463 Genetics mechanisms of resistance and response to tick infestation in Hereford cattle: a global view. Repositório Alice MORÉ, D. D.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; ZERLOTINI NETO, A.; GULIAS-GOMES, C. C.; IBELLI, A. M. G.; CATOIA, V.; CARDOSO, F. F.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Genetics mechanisms; Tick infestation; Hereford cattle. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/988787 Genome-wide association study of weight gain in feedlot Nellore cattle: comparison of single nucleotide polymorphism and haplotype blocks approaches. Repositório Alice SOMAVILLA, A. L.; MOTA, M. D. S.; ALENCAR, M. M. de; ROSA, A. do N.; COUTINHO, L. L.; TULLIO, R. R.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Growth; QTL; SNP; Bos Indicus; Beef cattle. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/963137 Caracterização de haplótipos e identificação de assinaturas de seleção em bovinos da raça Nelore. Repositório Alice SOMAVILLA, A. L.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.. A identificação de regiões do genoma que controlam características de interesse econômico e que estejam sob seleção é possível por conta da disponibilidade da genotipagem em plataformas de altas densidades de polimorfismos de único nucleotídeo (SNPs). A busca por assinaturas de seleção avalia, principalmente, altas e não usuais frequências alélicas dos loci adjacentes às mutações favoráveis. Com o objetivo de detectar evidências de assinaturas de seleção recente no genoma de bovinos da raça Nelore, foram genotipados 796 indivíduos com o chip Illumina BovineHD BeadChip, que possui mais de 777 mil SNPs e, posteriormente, inferida a fase de ligação dos SNPs e a reconstrução dos blocos de desequilíbrio de ligação (haplótipos). A detecção de assinaturas de... Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Desequilíbrio de ligação; Genotipagem.; Bos Indicus.; Zebu; Genotype; Single nucleotide polymorphism; Linkage disequilibrium. Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/946719 Análise haplotípica do gene ASAP1 associado com maciez de carne em bovinos da raça Nelore. Repositório Alice TIZIOTO, P. C.; THOLON, P.; MUDADU, M. de A.; BRESSANI, F. A.; REDE BIFEQUALI; REGITANO, L. C. de A.. A maciez da carne tem impacto importante na satisfação dos consumidores, portanto, o conhecimento da variação desta característica, assim como a prospecção de genes ou segmentos genômicos que influenciem a mesma, pode ajudar no desenvolvimento de critérios quantitativos e moleculares para seleção de bovinos de corte. A análise haplotípica com os SNPs do gene ASAP1 representados no Illumina BovineHD BeadChip mostram que estes marcadores estão associados com força de cisalhamento medida após 7 dias de maturação da carne nessa população da raça Nelore. A validação desses resultados em outras populações poderá contribuir para inclusão desses marcadores em programas de melhoramento da raça Nelore. Tipo: Separatas Palavras-chave: Gene candidato; Força de cisalhamento.; Bos Indicus.. Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/943060 An overview of Phoneutria nigriventer spider venom using combined transcriptomic and proteomic approaches. Repositório Alice DINIZ, M. R. V.; PAIVA, A. L. B.; GUERRA-DUARTE, C.; NISHIYAMA JÚNIOR, M. Y.; MUDADU, M. de A.; OLIVEIRA, U. de; BORGES, M. H.; YATES, J. R.; JUNQUEIRA-DE-AZEVEDO, I. de. Abstract. Phoneutria nigriventer is one of the largest existing true spiders and one of the few considered medically relevant. Its venom contains several neurotoxic peptides that act on different ion channels and chemical receptors of vertebrates and invertebrates. Some of these venom toxins have been shown as promising models for pharmaceutical or biotechnological use. However, the large diversity and the predominance of low molecular weight toxins in this venom have hampered the identification and deep investigation of the less abundant toxins and the proteins with high molecular weight. Here, we combined conventional and next-generation cDNA sequencing with Multidimensional Protein Identification Technology (MudPIT), to obtain an in-depth panorama of... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Proteômica; Transcriptoma; Phoneutria nigriventer; Proteomics; Transcriptomics. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102272 Single nucleotide polymorphisms in candidate genes associated with gastrointestinal nematode infection in goats. Repositório Alice BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; GIGLIOTI, R.; MEIRELLHES, S. L. C.; COUTINHO, L. L.; BENVENUTI, C. L.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; VIEIRA, L. S.; ZAROS, L. G.; CARRILHO, E.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Cytokine; Gastrointestinal infection.; Capra Hircus.; Single nucleotide polymorphism.. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1002812 A Genome-Wide Association Study of Meat Tenderness in Nelore Beef Cattle. Repositório Alice TIZIOTO, P.; DECKER, J.; TAYLOR, J.; SCHNABEL, R.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; SONSTEGARD, T.; ROSA, A. do N.; ALENCAR, M. M. de; TULLIO, R. R.; MEDEIROS, S. R.; NASSU, R. T.; FEIJO, G. L. D.; SIQUEIRA, F.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Genome map; Tagging; Characterization.; Cattle.. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/989023 The Bos taurus-Bos indicus balance in fertility and milk related genes. Repositório Alice KASARAPU, P.; PORTO NETO, L. R.; FORTES, M. R. S.; LEHNERT, S. A.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; GEORGE, A.; REVERTER, A.. Numerical approaches to high-density single nucleotide polymorphism (SNP) data are often employed independently to address individual questions. We linked independent approaches in a bioinformatics pipeline for further insight. The pipeline driven by heterozygosity and Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) analyses was applied to characterize Bos taurus and Bos indicus ancestry. We infer a gene co-heterozygosity network that regulates bovine fertility, from data on 18,363 cattle with genotypes for 729,068 SNP. Hierarchical clustering separated populations according to Bos taurus and Bos indicus ancestry. The weights of the first principal component were subjected to Normal mixture modelling allowing the estimation of a gene?s contribution to the Bos taurus-Bos... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Hardy-Weinberg equilibrium; Bos Indicus; Bos Taurus. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1074938 Effects of quantitative trait loci on iron content of bovine longissimus dorsi muscle. Repositório Alice TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; DECKER, J. E.; GROMBONI, C. F.; MUDADU, M. de A.; SCHNABEL, R. D.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; NASSU, R. T.; DONATONI, F. A. B.; THOLON, P.; SONSTEGARD, T. S.; ALENCAR, M. M. de; TULLIO, R. R.; REECY, J. M.; NOGUEIRA, A. R. de A.; REGITANO, L. C. de A.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Fe; GWAS.; Bos Indicus.. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/997999 Expression quantitative trait loci (eQTL) hotspot regions from whole genome analysis of Nellore steers. Repositório Alice CESAR, A. S. M.; REGITANO, L. C. de A.; LANNA, D. P. D.; POLETI, M. D.; KOLTES, J. E.; REECY, J. M.; FRITZ-WATERS, E.; KRAMER, L.; GARRICK, D.; MUDADU, M. de A.; TULLIO, R. R.; COUTINHO, L. L.. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Nelore.; Gado nelore; Gado de Corte.; Nellore. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1057056 Genome-wide association study for backfat thickness in Canchim beef cattle using Random Forest approach. Repositório Alice MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; LIMA, A. O. de; MEIRELLES, S. L. C.; SILVA, M. V. G. B.; CARDOSO, F. F.; OLIVEIRA, M. M. de; URBINATI, I.; NICIURA, S. C. M.; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.. Meat quality involves many traits, such as marbling, tenderness, juiciness, and backfat thickness, all of which require attention from livestock producers. Backfat thickness improvement by means of traditional selection techniques in Canchim beef cattle has been challenging due to its low heritability, and it is measured late in an animal?s life. Therefore, the implementation of new methodologies for identification of single nucleotide polymorphisms (SNPs) linked to backfat thickness are an important strategy for genetic improvement of carcass and meat quality. Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Machine learning; Tropical composition cattle; Bovino; Lipid metabolism; Subcutaneous fat. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/959968 Descriptive analysis of haplotypes in a population of Canchim beef cattle. Repositório Alice MOKRY, F. B.; LIMA, A. O.; MUDADU, M. de A.; HIGA, R. H.; MEIRELLES, S. L. C.; SILVA, M. V. G. B.; CARDOSO, F. F.; NICIURA, S. C. M.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Race Canchim.; Beef cattle; Haplotypes.. Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/946401 Registros recuperados: 79 Primeira ... 1 2 3 4 ... Última

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