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Registros recuperados: 51 | |
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Remize, Marine; Planchon, Frederic; Loh, Ai Ning; Le Grand, Fabienne; Bideau, Antoine; Le Goic, Nelly; Fleury, Elodie; Miner, Philippe; Corvaisier, Rudolph; Volety, Aswani; Soudant, Philippe. |
The present study sought to characterize the synthesis pathways producing the essential polyunsaturated fatty acid (PUFA) 20:5n-3 (EPA). For this, the incorporation of 13C was experimentally monitored into 10 fatty acids (FA) during the growth of the diatom Chaetoceros muelleri for 24 h. Chaetoceros muelleri preferentially and quickly incorporated 13C into C18 PUFAs such as 18:2n-6 and 18:3n-6 as well as 16:0 and 16:1n-7, which were thus highly 13C-enriched. During the experiment, 20:5n-3 and 16:3n-4 were among the least-enriched fatty acids. The calculation of the enrichment percentage ratio of a fatty acid B over its suspected precursor A allowed us to suggest that the diatom produced 20:5n-3 (EPA) by a combination between the n-3 (via 18:4n-3) and n-6... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: Synthesis pathway; Diatom; 20:5n-3 (EPA); Chaetoceros muelleri; Acyl-editing mechanism; Compound-specific isotope analysis. |
Ano: 2020 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00630/74257/73887.pdf |
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Pouvreau, Stephane; Bellec, Gwenael; Le Souchu, Pierrick; Queau, Isabelle; Talarmain, Eric; Alunno-bruscia, Marianne; Auby, Isabelle; Maurer, Daniele; Barbier, Claire; Tournaire, Marie-pierre; D'Amico, Florence; Rumebe, Myriam; Fleury, Elodie; Langlade, Aime; Bouget, Jean-francois; Collin, Karine; Fortune, Mireille; Hitier, Benoist; Bedier, Edouard; Robert, Stephane; Guilpain, Patrice; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Guesdon, Stephane; Lagarde, Franck; Le Gall, Patrik; Messiaen, Gregory; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle; Gohin, Francis; Bryere, Philippe; Quemener, Loic; Repecaud, Michel; Bucas, Karenn; Barbot, Stephane; Guillemot, Anne; Nonnotte, Lidwine; Duros, Wenceslas; Bonnat, Armel; Tarot, Stephane; Mille, Dominique; Geay, Amelie; Bouquet, Anne-lise. |
La conchyliculture, et principalement l’élevage de l’huître creuse, Crassostrea gigas, constitue la principale activité aquacole française. Cette activité repose, en grande partie, sur le recrutement naturel de l’espèce qui assure 70% des besoins en jeunes huîtres (naissain) : cette activité de collecte s’appelle le captage. Les deux principaux centres de captage en France sont les bassins d’Arcachon et de Marennes-Oléron. Or, depuis une dizaine d'années, sur le Bassin d'Arcachon, le captage devient très variable: à des années de captage nul (par exemple les années 2002, 2005, 2007) ou faible (2009, 2010, 2011) succèdent des années excellentes voire pléthoriques (les années 2003, 2006, 2008, 2012). A Marennes-Oléron, cette variabilité existe, mais s’avère... |
Tipo: Text |
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Ano: 2013 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00135/24648/22681.pdf |
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Osta Amigo, Axel; Robert, Stephane; Fleury, Elodie; Lupo, Coralie; Garcia, Celine; Geairon, Philippe. |
Ce document compile l’ensemble des bulletins de la surveillance de la santé des mollusques marins émis au cours de l’année 2015 par le réseau REPAMO. Ces bulletins, édités à fréquence mensuelle, relatent les événements de mortalité notifiés au réseau ainsi que les résultats des analyses effectuées lors des prélèvements d’animaux réalisés sur les lieux des mortalités. Les bulletins sont diffusés aux instances professionnelles concernées (CRC, CNC, CDPMEM, CNPMEM, centres techniques), à la DGAL, à la DPMA, aux laboratoires d’analyses, à Ifremer ainsi que sur le site internet du REPAMO. Ils ont pour objectif de tenir les destinataires informés des épisodes de mortalités anormales de mollusques marins rencontrés sur le littoral français métropolitain et corse. |
Tipo: Text |
Palavras-chave: REPAMO; Surveillance zoosanitaire; Mollusques marins; Mortalités. |
Ano: 2018 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00480/59205/61897.pdf |
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Prieto, Daniel; Markaide, Pablo; Urrutxurtu, Iñaki; Navarro, Enrique; Artigaud, Sebastien; Fleury, Elodie; Ibarrola, Irrintzi; Urrutia, Miren Bego. |
The molecular basis underlying the mechanisms at the origin of growth variation in bivalves is still poorly understood, although several genes have been described as upregulated in fast-growing individuals. In the present study, we reared mussel spat of the species Mytilus galloprovincialis under diets below the pseudofaeces threshold (BP) and above the pseudofaeces threshold (AP). After 3 months, F and S mussels from each condition were selected to obtain 4 experimental groups: FBP, SBP, FAP and SAP. We hypothesized that the nurturing conditions during the growing period would modify the molecular basis of their growth rate differences. To decipher the molecular mechanisms underlying the growth variation, the gill transcriptomes for the four mussel groups... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: Fast-growing; Mussel; Gill; Transcriptome. |
Ano: 2019 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00503/61490/65293.pdf |
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Normand, Julien; Dubroca, Laurent; Fleury, Elodie. |
As global change becomes a major concern, the need to contextualize discrete observations to highlight long-term evolutions also becomes more relevant. In response to this challenge, Marine Historical Ecology (MHE) has recently emerged as a new discipline within the marine sciences, dedicated to studying the relationship between long-term evolution of marine ecosystems and temporal variations of external predictors such as meteorological parameters, or descriptors of human activities. In recent years, therefore, considerable effort has been devoted to study long-term time series on fisheries and environmental data. This approach has increased our knowledge about natural variability and functioning of marine environments and has helped us to characterize... |
Tipo: Text |
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Ano: 2019 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00588/70003/67917.pdf |
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Boudry, Pierre; Huvet, Arnaud; Lapegue, Sylvie; Sauvage, Christopher; Tanguy, A.; Moraga, D.; Goostrey, A.; Prunet, P.; Boulo, Viviane; Gueguen, Y.; Moal, Jeanne; Fleury, Elodie; Samain, Jean-francois; Mathieu, M.; Favrel, P.. |
Rationale for EST and genome sequencing of the Pacific oyster: its membership of the Lophotrochozoa, an little studied branch of the Eukaryotes, its worldwide aquacultural importance (4.2 million metric tons, worth 3.5 billion US dollars), its high fecundity, with concomitantly high DNA polymorphism, its use as a biosensor of coastal pollution. In 2004, an international community of biologists, the Oyster Genome Consortium (OGC) led by D. Hedgecock (University of Southern California) and uniting 70 participants from 10 countries, first presented the Pacific oyster Crassostrea gigas as a genome-sequencing candidate to Joint Genome Institute (JGI, USA) (Hedgecock et al., 2005). Besides this project (that remains to be accepted), several EST... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: Characteristics; Genome size; Genome; Crassostrea gigas; Oyster; Genetic. |
Ano: 2007 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/acte-3414.pdf |
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Fleury, Elodie; Corporeau, Charlotte; Pouvreau, Stephane. |
Occupant une place de premier ordre dans nos paysages côtiers, l’ostréiculture est le premier contributeur de la filière aquacole française avec une production estimée à 85 000 tonnes ces dernières années. Véritable espèce ingénieur, l’huître creuse joue aussi un rôle essentiel sur le plan écologique dans les écosystèmes qui l’abritent. Pourtant, depuis plusieurs années, l’ostréiculture subie une baisse de production et les bancs naturels, garants de la diversité génétique, sont mis en danger. Ces phénomènes sont la conséquence directe de l’épizootie causée par OsHV-1 µVar frappant les naissains et des mortalités d’adultes associées à la bactérie Vibrio aestuarianus. Ces épisodes de mortalités accrues ne sont pas nouveaux mais leur récurrence et leur... |
Tipo: Text |
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Ano: 2017 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00433/54425/55774.pdf |
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Gourault, Melaine; Petton, Sebastien; Thomas, Yoann; Pecquerie, Laure; Marques, Goncalo M.; Cassou, Christophe; Fleury, Elodie; Paulet, Yves-marie; Pouvreau, Stephane. |
Identifying the drivers that control the reproductive success of a population is vital to forecasting the consequences of climate change in terms of distribution shift and population dynamics. In the present study, we aimed to improve our understanding of the environmental conditions that allowed the colonization of the Pacific oyster, Crassostrea gigas, in the Bay of Brest since its introduction in the 1960s. We also aimed to evaluate the potential consequences of future climate change on its reproductive success and further expansion. Three reproductive traits were defined to study the success of the reproduction: the spawning occurrence, synchronicity among individuals and individual fecundity. We simulated these traits by applying an individual-based... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: DEB model; IPCC scenarios; Reproductive traits; Crassostrea gigas; Bay of Brest. |
Ano: 2019 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00440/55188/56794.pdf |
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Huvet, Arnaud; Normand, Julien; Fleury, Elodie; Quillien, Virgile; Fabioux, Caroline; Boudry, Pierre. |
Summer mortality of the Pacific oyster Crassostrea gigas is the result of a complex interaction between oysters, their environment and their pathogens. The physiological status of an oyster, especially its reproductive status, is suspected to play a significant role in the outcome of this interaction. As genetic variability exists for susceptibility to summer mortality, resistant (R) and susceptible (S) oyster lines were produced using a divergent selection scheme. The present paper reports a histological study on gonad area, which is representative of reproductive effort, in randomly chosen five R and five S oyster lines. The R lines showed a significantly lower gonad area than the S lines (P<0.001). with an estimated mean difference of 12.5%, whereas,... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: Bivalve mollusc; Crassostrea gigas; Reproduction; Selected lines; Summer mortality. |
Ano: 2010 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00006/11766/8502.pdf |
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Pouvreau, Stephane; Petton, Sebastien; Queau, Isabelle; Haurie, Axel; Le Souchu, Pierrick; Alunno-bruscia, Marianne; Palvadeau, Hubert; Auby, Isabelle; Maurer, Daniele; D'Amico, Florence; Passoni, Sarah; Barbier, Claire; Tournaire, Marie-pierre; Rigouin, Loic; Rumebe, Myriam; Fleury, Elodie; Fouillaron, Pierre; Bouget, Jean-francois; Pepin, Jean-francois; Robert, Stephane; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Chabirand, Jean-michel; Le Moine, Olivier; Guesdon, Stephane; Lagarde, Franck; Mortreux, Serge; Le Gall, Patrik; Messiaen, Gregory; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle; Quemener, Loic; Repecaud, Michel; Mille, Dominique; Geay, Amelie; Bouquet, Anne-lise. |
La conchyliculture, et principalement l’élevage de l’huître creuse, Crassostrea gigas, constitue la principale activité aquacole française. Cette activité repose, en grande partie, sur le recrutement naturel de l’espèce qui assure 70% des besoins en jeunes huîtres (naissain) : cette activité de collecte s’appelle le captage. Les deux principaux centres de captage en France sont les bassins d’Arcachon et de Marennes-Oléron. Or, depuis une dizaine d'années, sur le bassin d'Arcachon, le captage devient très variable: à des années de captage nul (par exemple les années 2002, 2005, 2007) ou faible (2009, 2010, 2011) succèdent des années excellentes voire pléthoriques (les années 2003, 2006, 2008, 2012, 2013). A Marennes-Oléron, cette variabilité existe, mais... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: Huître creuse; Naissain; Recrutement; Captage; Larves; Cycle de reproduction; Changement climatique; Pacific oyster; Spat; Recruitment; Spat collecting; Larvae; Reproductive cycle; Climate change. |
Ano: 2015 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00279/38990/37561.pdf |
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Fleury, Elodie; Barbier, Pierrick; Petton, Bruno; Normand, Julien; Thomas, Yoann; Pouvreau, Stephane; Daigle, Gaétan; Pernet, Fabrice. |
Diseases pose an ongoing threat to aquaculture, fisheries and conservation of marine species, and determination of risk factors of disease is crucial for management. Our objective was to decipher the effects of host, pathogen and environmental factors on disease-induced mortality of Pacific oysters (Crassostrea gigas) across a latitudinal gradient. We deployed young and adult oysters at 13 sites in France and we monitored survival, pathogens and environmental parameters. The young oysters came from either the wild collection or the hatchery while the adults were from the wild only. We then used Cox regression models to investigate the effect of latitude, site, environmental factors and origin on mortality risk and to extrapolate this mortality risk to the... |
Tipo: Text |
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Ano: 2020 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00627/73915/73251.pdf |
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Pouvreau, Stephane; Fleury, Elodie; Petton, Sebastien; Corporeau, Charlotte; Lapegue, Sylvie. |
Occupant une place de premier ordre dans les paysages côtiers français, l’ostréiculture est le premier contributeur de la filière aquacole française avec une production estimée à 85 000 tonnes ces dernières années. Véritable espèce ingénieur, l’huître creuse, installée en France depuis plus de 50 ans, joue aussi un rôle essentiel sur le plan écologique dans les écosystèmes qui l’abritent. Pourtant, depuis plusieurs années, cette filière subie une baisse de production et les bancs naturels, garants de la diversité génétique, sont mis en danger. Ces phénomènes sont la conséquence directe de l’épizootie causée par OsHV-1 (sous sa forme µVar) affectant les naissains et des mortalités d’adultes associées à la bactérie Vibrio aestuarianus. Ces épisodes de... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: Huître creuse; Physiologie; Génétique; Ecologie; Réseau National. |
Ano: 2018 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00449/56030/57556.pdf |
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Robert, Stephane; Bouget, Jean-francois; Fleury, Elodie; Chauvin, Jacky; Gagnery, Aline; Normand, Julien; Blin, Jean Louis; Cheve, Julien; Dagault, Francoise; Gerla, Daniel; Lejolivet, Aurore; Penot, Julia; Chabirand, Jean-michel; Genauzeau, Sylvie; Geairon, Philippe; Grizon, James; Le Moine, Olivier; Schmitt-gallotti, Anne; Seugnet, Jean-luc; Soletchnik, Patrick. |
Le réseau national Mytilobs est implanté dans les principales régions mytilicoles du littoral atlantique : Normandie, Bretagne Nord, Bretagne Sud, Pays de Loire et Poitou-Charentes. Les sites d’Agon (Ouest Cotentin), du Vivier (baie du Mont Saint-Michel), de Pont Mahé (baie de Vilaine), de l’Aiguillon (pertuis Breton), d’Yves (pertuis d’Antioche) représentent l'élevage sur bouchot du Nord au Sud. Le site Filière (pertuis Breton) représente l’élevage sur corde, en pleine eau. La mise à l’eau des cheptels sur l’ensemble des sites du réseau, en septembre 2013, s’est faite à partir d’un même lot de moules calibrées (23,97 +/- 0,7mm), captées sur corde dans le pertuis Breton. Les prélèvements de la campagne 2014 (septembre 2013-décembre 2014) sont trimestriels.... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: Mytilus edulis; Moule; Bouchot; Mortalité; Croissance; Température; Phytoplancton; Réseau; Biométrie; Environnement. |
Ano: 2015 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00270/38086/36231.pdf |
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Pernet, Fabrice; Fuhrmann, Marine; Petton, Bruno; Mazurie, Joseph; Bouget, Jean-francois; Fleury, Elodie; Daigle, Gaetan; Gernez, Pierre. |
Marine diseases have major impacts on ecosystems and economic consequences for aquaculture and fisheries. Understanding origin, spread and risk factors of disease is crucial for management, but data in the ocean are limited compared to the terrestrial environment. Here we investigated how the marine environment drives the spread of viral disease outbreak affecting The Pacific oyster worldwide by using a spatial epidemiology framework. We collected environmental and oyster health data at 46 sites spread over an area of 300 km2 along an inshore-offshore gradient during an epizootic event and conducted risk analysis. We found that disease broke out in the intertidal farming area and spread seaward. Mortalities and virus detection were observed in oysters... |
Tipo: Text |
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Ano: 2018 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00450/56130/57670.pdf |
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Pouvreau, Stephane; Petton, Sebastien; Queau, Isabelle; Bellec, Gwenael; Talarmain, Eric; Le Souchu, Pierrick; Alunno-bruscia, Marianne; Auby, Isabelle; Maurer, Daniele; D'Amico, Florence; Passoni, Sarah; Barbier, Claire; Tournaire, Marie-pierre; Rigouin, Loic; Rumebe, Myriam; Fleury, Elodie; Langlade, Aime; Bouget, Jean-francois; Collin, Karine; Fortune, Mireille; Palvadeau, Hubert; Bedier, Edouard; Robert, Stephane; Pepin, Jean-francois; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Chabirand, Jean-michel; Le Moine, Olivier; Guesdon, Stephane; Lagarde, Franck; Mortreux, Serge; Le Gall, Patrik; Messiaen, Gregory; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle; Quemener, Loic; Repecaud, Michel; Bucas, Karenn; Barbot, Stephane; Guillemot, Anne; Nonnotte, Lidwine; Duros, Wenceslas; Bonnat, Armel; Tarot, Stephane; Mille, Dominique; Geay, Amelie; Bouquet, Anne-lise. |
La conchyliculture, et principalement l’élevage de l’huître creuse, Crassostrea gigas, constitue la principale activité aquacole française. Cette activité repose, en grande partie, sur le recrutement naturel de l’espèce qui assure 70% des besoins en jeunes huîtres (naissain) : cette activité de collecte s’appelle le captage. Les deux principaux centres de captage en France sont les bassins d’Arcachon et de Marennes-Oléron. Or, depuis une dizaine d'années, sur le bassin d'Arcachon, le captage devient très variable: à des années de captage nul (par exemple les années 2002, 2005, 2007) ou faible (2009, 2010, 2011) succèdent des années excellentes voire pléthoriques (les années 2003, 2006, 2008, 2012, 2013). A Marennes-Oléron, cette variabilité existe, mais... |
Tipo: Text |
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Ano: 2014 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00200/31091/29499.pdf |
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Registros recuperados: 51 | |
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