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	Provedor de dados ArchiMer (1) Autor Chabert, D. (1) Vicente, N. (1) Palavra-chave Heavy metals (1) Lagoon Mediterranean sea (1) Lagune (1) Méditerranée (1) Métaux lourds (1) Pollution (1) Mais... Tipo do documento Text (1) Ano 1979 (1) País France (1) Idioma Francês (1)		Ordenar por:  Relevância Autor Título Ano Registros recuperados: 51 Primeira ... 1 2 3 ... Última Note de synthèse des résultats obtenus concernant l'étude du virus de type herpès et la mise au point de méthodes de diagnostic de l'infection - Avril-Mai 1996 ArchiMer Renault, Tristan; Lipart, Cecile; Le Deuff, Rose-marie; Chollet, Bruno; Haffner, Philippe. Cette note de synthèse des travaux réalisés au laboratoire de Génétique, Aquaculture et Pathologie de la station IFREMER de La Tremblade dans le cadre de l'étude du virus de type herpès et de la mise au point de méthodes de diagnostic fait suite à la précédente note du 16 avril 1996. Les résultats obtenus concernant les analyses protocolaires et hors protocoles, ainsi que les résultats expérimentaux déjà disponibles sont donnés et commentés en sept points. 1- Analyses Pays de Loire 2 - Bilan des analyses réalisées dans le cadre du protocole IFREMER BOUIN/IFREMER ARGENTON/SODABO 3 - Bilan global des analyses Pays de Loire et Bouin-Argenton-SODABO 4 - Analyses effectuées en PCR pour la recherche de virus de type herpès sur des lots prélevés en 1996, dans le... Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Virus; Herpès virus; Diagnostic; Huître creuse; Crassostrea gigas. Ano: 1996 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15499/12867.pdf Herpèsvirus infectant les bivalves marins : détection, génome et transmission ArchiMer Arzul, Isabelle. Since 1991, high mortality rates of larvae and juveniles of different bivalve mollusc species associated with herpesvirus infections have been reported in different countries. The aim of this study was to determine if more than one helpesvirus species was responsible for these infections or just one species exhibiting polymorphism. The investigations concentrated on the analysis of the virus genome, studies of virus transmission in different mollusc species and on the potential role of bivalve adults in the occurrence of infections. The analysis of various target sequences within the virus genome present in infected larvae samples demonstrated the presence of polymorphism. More notably a variant of the virus was identified and the variation appears... Tipo: Text Palavras-chave: Herpèsvirus; Bivalves; Transmission; Polymorphisme; OsHV-1; Diagnostic; Herpesviruses; Bivalvia; Transmission; Polymorphism; OsHV-1; Diagnostic. Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00105/21675/19253.pdf Contribution à l'étude de virus de mollusques marins apparentés aux Iridoviridae et aux Herpesviridae ArchiMer Le Deuff, Rose-marie. Among the marine molluscs, Pacific oyster, Crassostrea gigas, is actually the most reared species in the world. Noticeably in France, where it was imported between 1960 and 1970, and replaced Portuguese oyster, Crassostrea angulata. Intensification of breeding and the associated introductions of new species may be hazardous. Indeed, they might be responsible for the appearance and the dissemination of new diseases in bivalve molluscs. In addition to these observations, the quasi monobreeding of C. gigas in France enhances the necessity to develop research concerning the diagnosis of pathologies affecting this species, namely the diagnosis of viral diseases. Several families of viruses have been described within marine bivalves molluscs. The purpose of this... Tipo: Text Palavras-chave: Mollusques bivalves; Crassostrea gigas; Huître japonaise; Pathologie; Iridovirus; Herpèsvirus; Diagnostic; Bivalve molluscs; Crassostrea gigas; Pacific oyster; Pathology; Iridovirus; Herpesvirus; Diagnosis. Ano: 1995 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00107/21792/19367.pdf Réseau de Suivi Lagunaire du Languedoc-Roussillon. Bilan des résultats 2002 ArchiMer Laugier, Thierry; Fiandrino, Annie; Souchu, Philippe; Benau, Laurent. The numerous coastallagoons lining the Languedoc-Roussillon mediterranean coast undergone high anthropic pressure. The Lagoon Monitoring Network as a result of partnership between Ifremer, the Languedoc- Roussillon Regional Council and the Rhône Méditerranée Corse Water Agency, apply to provide yearly a diagnostic of the environmental quality of21lagoons. This network has two main goals: • The monitoring of the state of the lagoon with regards to eutrophication and sorne specifie survey in coordination with local managers. • Management support (model simulation, synthetic infonnation, scientific support) towards local managers. This annual report gathers results of the actions planned in 2002 within the Network : • For each lagoon excosystem, results of... Tipo: Text Palavras-chave: Lagunes littorales; Méditerranée; Eutrophisation; Diagnostic; Surveillance; Gestion; Coastal lagoon; Mediterranean; Eutrophication; Diagnostic; Monitoring; Management. Ano: 2003 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00419/53085/54046.pdf Contrat de Plan Etat Région Poitou-Charentes 1994-1998. Convention 98 RPC R 7 - Programme Pathologie - Rapport Final année 1998 ArchiMer Renault, Tristan; Berthe, Franck; Thebault, Anne; Lipart, Cecile; Chollet, Bruno; Cochennec, Nathalie; Haffner, Philippe. Depuis 1991, des mortalités massives sporadiques sont rapportées, en France, de manière régulière chez des larves et des juvéniles de différentes espèces de mollusques bivalves marins. Certains de ces épisodes de mortalité ont pu être associés à la détection de virus. Ces derniers par leur morphologie, leur cycle de réplication et leur localisation ont été apparentés à la famille des Herpesviridae. Cependant, les outils de diagnostic disponibles jusqu'alors (histologie et microscopie électronique à transmission) n'étaient pas adaptés à l'étude de ces virus du fait de leur manque de spécificité et de la lourdeur de leur mise en oeuvre. Par ailleurs, se posait la question de l'implication des virus détectés dans les phénomènes de mortalité observés. En... Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Pathogènes; Virus; Herpès virus; Crassostrea gigas; Diagnostic; Herpesviridae. Ano: 1998 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15455/12830.pdf Etude de l'herpès virus de l'huître. Fonds d'Aide à la Recherche et à l'Innovation. Décision d'Aide à la Recherche n° 95-07-01 (Rapport intermédiaire) 1997 ArchiMer Renault, Tristan. Le Laboratoire de Génétique, Aquaculture et Pathologie (GAP) de la Station IFREMER de La Tremblade, se propose dans le présent projet d'étudier le virus de type herpès observée chez les huîtres (pouvoir pathogène, conditions d'expression de l'infection, transmission, etc ... ) et de développer des réactifs permettant de réaliser un diagnostic rapide, sensible et fiable de l'infection qu'il occasionne. Les diagnostics proposés seront basés sur la détection directe du virus, soit au moyen de réactifs immunologiques spécifiques des antigènes viraux, soit par des techniques de biologie moléculaire permettant de détecter l'ADN viral (hybridation de sondes nucléiques et réaction PCR : Polymerase Chain Reaction). Ce projet, proposé sur une durée de trois années... Tipo: Text Palavras-chave: Virus; Herpès virus; Crassostrea gigas; Pathogènes; Diagnostic; Herpesviridae. Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15448/12821.pdf Outils de dépistage des pathogènes - Contrat Région Poitou-Charentes 1999 - Convention 99/RPC-A-200 "Pathologie" ArchiMer Renault, Tristan; Cochennec, Nathalie. Le Laboratoire de Génétique et Pathologie (LGP) de la station IFREMER de La Tremblade (Charente Maritime) est impliqué aux plans national et international dans l'étude des maladies affectant les mollusques bivalves marins d' intérêt économique et plus particulièrement les huîtres. Des travaux concernant le développement, la validation et l'utilisation d'outils de diagnostic spécifiques d'agents infectieux propres aux coquillages y sont ainsi menés. Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Maladie; Mollusques bivalves; Diagnostic; Huître creuse; Crassostrea gigas. Ano: 2000 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15471/12850.pdf Synthèse des résultats obtenus concernant l'étude du virus de type herpès et la mise au point de méthodes de diagnostic de l'infection - Juin-Septembre 1996 ArchiMer Renault, Tristan; Le Deuff, Rose-marie; Lipart, Cecile; Chollet, Bruno; Haffner, Philippe. Cette note de synthèse des travaux réalisés au laboratoire de Génétique, Aquaculture et Pathologie de la station IFREMER de La Tremblade, dans le cadre de l'étude du virus de type . herpès et de la mise au point des méthodes de diagnostic fait suite à la précédente note (fin mai 1996). Les résultats obtenus concernant les analyses protocolaires et hors protocoles, ainsi que les résultats expérimentaux déjà disponibles sont données et commentés en quatre points. Cette étude est soutenue par la Région Poitou-Charente et la Région Pays de Loire. Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Virus; Herpès virus; Infection; Diagnostic; Huître creuse; Crassostrea gigas. Ano: 1996 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15503/12875.pdf Contrat de Plan Etat Région Poitou-Charentes 1994-1998. Convention 97 RPC R 58 - Programme Pathologie - Rapport Scientifique année 1997 ArchiMer Renault, Tristan; Berthe, Franck; Thebault, Anne; Lipart, Cecile; Chollet, Bruno; Haffner, Philippe; Cochennec, Nathalie. Le but de ce programme pathologie est de rechercher et d'étudier les agents pathogènes connus et inconnus chez les mollusques bivalves marins, plus particulièrement chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, afin d'identifier d'éventuels agents causant des mortalités, de proposer des mesures prophylactiques et de définir des conditions zootechniques permettant aux professionnels de limiter l'impact des maladies sur leur cheptel. La présence de maladies, chez les mollusques bivalves marins dont l'impact socio économique peut être catastrophique pour les productions conchylicoles, et l'accroissement des échanges de produits d'aquaculture entre les pays de la CEE et avec les pays tiers nécessitent le renforcement des recherches dans les domaines de la... Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Pathogènes; Virus; Herpès virus; Crassostrea gigas; Diagnostic; Herpesviridae. Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15454/12829.pdf Contribution à l'étude de vibrions pathogènes d'huîtres creuses Crassostrea gigas - Interactions hémocytes-vibrions et développement de tests de diagnostic d'intérêt taxonomique ArchiMer Duperthuy, Marylise. Les bactéries du genre Vibrio représentent le groupe le plus fréquemment associé à des maladies infectieuses chez les mollusques marins et notamment l'huître creuse Crassostrea gigas. A ce jour trois espèces de Vibrio pathogènes d'huîtres creuses V. splendidus, V. aestuarianus et récemment V. coralliitycus ont été identifiés en France. La prévention des mortalités associées à ces vibrioses repose sur une meilleure compréhension des interactions hôte-pathogène et sur l'utilisation de techniques de diagnostic rapides à mettre en oeuvre et fiables. Ce travail a permis d'une part de caractériser la dynamique de phagocytose de vibrions par les cellules immunocompétentes de l'huître, les hémocytes. La mise au point d'un protocole d'analyse en cytométrie de flux... Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Crassostrea gigas; Vibrio splendidus; Vibrio aestuarianus; Vibrio corralliitycus; Hémocytes; Phagocytose; Cytométrie de flux; Diagnostic; PCRq. Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14452/11753.pdf Session de formation à l'utilisation de la technique PCR pour le diagnostic de l'infection à Herpèsvirus chez les huîtres ArchiMer Renault, Tristan; Le Deuff, Rose-marie; Lipart, Cecile. Parmi les maladies infectieuses observées chez les mollusques bivalves marins, les viroses sont souvent mal connues, en raison d'une certaine inadéquation des techniques d'identification et de diagnostic généralement mises en oeuvre lors de phénomènes de mortalité. En effet, la microscopie photonique a été et reste encore, dans de nombreux laboratoires travaillant sur les pathologies des mollusques, la technique de base pour l'analyse des échantillons. Cette technique reste insuffisante en cas de pathologie d'origine virale si elle n'est pas complétée par d'autres approches (microscopie électronique à transmission, recherche d'effets cytopathogènes sur monocouches cellulaires et réactifs de diagnostic spécifiques). Aucune lignée de mollusques bivalves... Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Technique laboratoire; PCR; Diagnostic; Herpèsvirus; Huître creuse; Crassostrea gigas. Ano: 1996 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15501/12870.pdf Validation of in situ hybridisation and histology assays for the detection of the oyster parasite Marteilia refringens ArchiMer Thebault, Anne; Bergman, S; Pouillot, R; Le Roux, Frédérique; Berthe, Franck. An in situ hybridisation technique has been developed for the detection of infection in oysters with Marteilia refringens with particular emphasis on light infections or confirmation of suspected cases by means of histology. Although validation of new diagnostic methods is usually achieved by comparison with standard techniques, in our case the sensitivity and specificity of the standard (histology) had not previously been established. Another point to consider is that surveillance and monitoring frequently target populations displaying different levels of prevalence under different field conditions. The objective of our study was to evaluate the sensitivity and specificity values of in situ hybridisation and histology for the detection of M refringens,... Tipo: Text Palavras-chave: Ostrea edulis; Marteilia refringens; Latent models; Specificity; Sensitivity; Validation; Diagnostic. Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/publication-3624.pdf Evaluation du stock de coquilles Saint-Jacques de la Baie de Seine et du Proche Extérieur. COMOR 32 (8-23 juillet 2002) ArchiMer Foucher, Eric. Scientific scallop surveys called COMOR are carried out in the bay of Seine since 1976. Results are used by fishermen’ associations and by fishing administration to lead management measures. In this report, the scientific results of the survey COMOR 32 realised in July 2002 are described. Abundance and growth indices for scallop, by age and area, are presented. During these surveys, data about most abundant benthic species are also collected since 1998. A first assessment with five years data is made here. A global descriptive analysis is undertaken about all the species present on scallops grounds. A special zoom is applied on both species whitch could be exploited (whelk Buccinum undatum and queen scallop Aequipecten opercularis) and three competitive... Tipo: Text Palavras-chave: Coquille Saint-Jacques; Pecten maximus; Baie de Seine; Évaluation directe; Stock; Diagnostic; Scallop survey; Pecten maximus; Bay of Seine; Assessment; Stock. Ano: 2003 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00341/45178/44575.pdf Molecular identification of Vibrio tapetis, the causative agent of the brown ring disease of Ruditapes philippinarum ArchiMer Paillard, Christine; Gausson, Sabrina; Nicolas, Jean-louis; Le Pennec, Jean Paul; Haras, Dominique. Vibrio tapetis is the marine bacterium responsible for the brown ring disease (BRD) affecting die manila clam, Ruditapes philippinarum. Identification of V tapelis has been previously performed using biochemical criteria and serological procedures. All of these methods are time consuming and ill-adapted to individual screening. This study describes an oligonucleotidic probe (Vt446) and two PCR primers, deduced from the 16S rDNA sequence, allowing a fast and specific V tapetis identification using dot blot hybridisation and species-specific primed PCR (SSP-PCR). The probe and primers have been tested on 60 strains, including referenced Vibrio sp., Gram negative and positive bacteria, marine bacteria samples and isolated clam bacteria. For all the 19 V... Tipo: Text Palavras-chave: DOT BLOT hybridisation; SSP PCR; Vibriosis; Bivalve; Detection; Diagnostic. Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/publication-1692.pdf Pathologie des invertébrés marins d'intérêt aquacole. Contribution et stratégies de recherches ArchiMer Mialhe, Eric. Les productions d'invertébrés sont prépondérantes en aquaculture marine qui est économiquement très importate pour un grand nombre de pays, notamment de la zone Sud. Cette activité est confrontée à de nombreux problèmes des pathologie qui remettent en cause sa périnnité et son développment. Jusque dans les années quatre-vingt, les travaux relatifs à la pathologie des mollusques et des crevettes ont essentiellement porté sur la description des agents pathogènes. La création en 1985 par l'ISTPM/IFREMER d'un laboratoire pourvu de tous les équipements nécessaires aux techniques de pathologie a permis de mettre en place un programme de recherches orienté vers le contrôle des maladies. Une double stratégie de travail a été alors défine pour apporter  à... Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Immmunologie; Génétique; Mollusque; Crevette; Diagnostic; Epidémiologie; Traitement; Sélection; Transformation génétique. Ano: 1994 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00443/55479/57009.pdf Rapid PCR-based assay for Sclerotinia sclerotiorum detection on soybean seeds Scientia Agricola Grabicoski,Edilaine Mauricia Gelinski; Jaccoud Filho,David de Souza; Pileggi,Marcos; Henneberg,Luciane; Pierre,Marcelo Luiz Cunha; Vrisman,Cláudio Mauricio; Dabul,Audrei Nisio Gebieluca. Caused by Sclerotinia sclerotiorum, white mold is an important seed-transmitted disease of soybean (Glycine max). Incubation-based methods available for the detection and quantification of seed-borne inoculum such as the blotter test, paper roll and Neon-S assay are time-consuming, laborious, and not always sensitive. In this study, we developed and evaluated a molecular assay for the detection of S. sclerotiorum in soybean seeds using a species-specific PCR (polymerase chain reaction) primer set and seed soaking (without DNA extraction) for up to 72 h. The PCR products were amplified in all the samples infected with the pathogen, but not in the other samples of plant material or the other seed-borne fungi DNA. The minimum amount of DNA detected was 10 pg,... Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: White mold; Dissemination; Soaking seeds; Diagnostic. Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162015000100069 PET and PET/CT imaging for the earliest detection and treatment of colorectal carcinoma BABT Carter,Kevin; Kotlyarov,Eduard. Approximately 150,000 new cases of colorectal cancer are diagnosed each year with the life time risk of developing colon caner in developed nations being 4.6% in men and 3.2% in women. Screening patients is essential early detection of colon carcinoma to aid in complete resection. Unfortunately current screening methods carry with them poor patient compliance. PET and PET/CT may be a significant part of this screening solution. The authors reviewed and analyzed the English language articles and case reports identified on Medline during the last 10 years. PET and PET/CT results for colorectal carcinoma were tabulated and presented for the fifth Scientific Meeting of the Brazilian Society of Nuclear Biosciences. Though most studies have been retrospective... Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: PET and PET/CT; Colorectal cancer; Diagnostic. Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132005000700025 A Rapid and Reliable Method for Molecular Detection of Fusarium guttiforme, the Etiological Agent of Pineapple Fusariosis BABT Carnielli-Queiroz,Lorena; Fernandes,Patricia Machado Bueno; Fernandes,Antônio Alberto Ribeiro; Ventura,José Aires. Abstract Pineapple (Ananas comosus var. comosus) fusariosis is an economically important fungal disease affecting the plant and its fruit. A rapid and reliable diagnosis is the base of integrated disease management practices. Fusariosis has resulted in quarantines for pineapple products in Central America, Africa and Asia. Difficulties diagnosing and correctly identifying the fungus Fusarium guttiforme, agent of the pineapple fusariosis, have led to the search for new methodologies, and for this we developed a new reliable molecular method to detect it. For diagnostic purposes, real-time PCR of elongation factor gene 1-α (ef1) was used to rapidly, specifically and sensitively diagnose F. guttiforme. A pathogenicity test was conducted with slips of the... Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Diagnostic; Diseases; Quarantine; Real-time PCR. Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132019000100219 Development and Evaluation of an Indirect ELISA: Serological Survey to Detect Specific Antibodies to Bovine Herpesvirus 4 BABT Krüger,Ernesto Renato; Penha,Tânia Regina; Hummelgen,Fernanda Cristina; Agottani,Jorge Bacila; Reva,Demétrio; Gonçalves,Robson; Thomaz-Soccol,Vanete. ABSTRACTThe aim of this work was to develop and evaluate an indirect enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and made a serological screening for specific antibodies to BoHV-4. Bovine serum samples were collected from different Brazilian states and evaluated for the presence of antibodies for BoHV-4 and BoHV-1. The serological results obtained showed that the indirect ELISA assay could be applied for the detection of specific antibodies for BoHV-4. The ELISA test allowed concluding that BoHV-4 is present in bovines in every Brazilian state from which serum samples were collected. The ELISA assay here standardized proved to be useful for the epidemiological studies and showed a positivity range from 1.8 to 66% in Brazil. Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: BoHV-4; Serology; Diagnostic; Cattle; Epidemiology. Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132015000500725 Molecular epidemiology of the human group A rotavirus in the Paraná State, Brazil BABT Santos,Jucélia Stadinicki dos; Alfieri,Alice Fernandes; Leite,José Paulo Gagliardi; Skraba,Irene; Alfieri,Amauri Alcindo. From January/2000 to December/2003, 550 diarrheic fecal samples from the children and adults were collected in several geographical regions of Paraná State, Brazil. The enzyme immunoassay showed 120 (21.8%) samples positive for the group A rotaviruses. One hundred and fourteen samples were genotyped by multiplex-nested-PCR assay. The highest frequency (77.5%) of the positive samples (n=93) was observed in the children under 5 years old. Rotavirus diarrhea was more frequent in the cold and dry seasons of the four evaluated years. The most frequent genotypes were: G1 (50.9%), G4 (9.6%), G9 (7.0%), G2 (1.7%), G3 (0.9%), P[ 8] (71.9%), and P[ 4] (3.5%). The P[ 8] G1 (46.5%) and P[ 8] G4 (9.6%) were the main combinations found to P and G genotypes. The mixed... Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Diarrhea; Rotavirus; Diagnostic; PAGE; RT-PCR; Genotypes. Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132008000200008 Registros recuperados: 51 Primeira ... 1 2 3 ... Última

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