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Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron, Baie de Bourgneuf et Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2011 ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Ollier, Simon; Maurouard, Elise; D'Amico, Florence; Seugnet, Jean-luc; Grizon, James.
Comme pour les années précédentes, le réseau biovigilance a réalisé en 2011 la caractérisation du niveau de ploïdie des naissains captés en 2010. Pour la première fois, en plus des deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon, un bassin additionnel (Vendée) a été prospecté via l'analyse de naissains sauvages captés en 2010 au niveau de la baie de Bourgneuf. Les échantillons des naissains sauvages issus du captage naturel ont été prélevés sur les sites de chaque bassin pour un total analysé de plus de 1800 animaux. En tenant compte de notre échantillonnage, nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l'absence d'animaux polyploïdes, triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les trois bassins prospectés. Cependant, les bassins de...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Ploïdie; Huître creuse; Crassostrea gigas; Naissain; Analyse cytométrique; Analyse statistique; Bassin de Marennes Oléron; Arcachon; Baie de Bourgneuf.
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00107/21837/19427.pdf
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Contribution à l'identification de l'impact des perceurs O. erinacea et O. inornata au cours de la campagne d'évalutation des stocks d'huîtres 2001 ArchiMer
Robert, Stephane; Le Moine, Olivier; Guilpain, Patrice; Soletchnik, Patrick; Faury, Nicole; Razet, Daniel; Geairon, Philippe; Goulletquer, Philippe; Seugnet, Jean-luc.
L' apparition de phénomène de prédation des huîtres par des bigorneaux perceurs n'est pas nouveau. Elle a été régulièrement constatée par la profession ostréicole. C'est ainsi qu 'on a pu enregistrer une destruction massive des bancs d'élevage de la baie de Bourgneuf en 1938. Des problèmes similaires ont été enregistrés dans la région de La Rochelle et à Arcachon en 1932, où des subventions on été allouées pour le ramassage d'Ocenebra erinacea. Ces phénomènes étaient alors liés à cette espèce Atlantique. L'apparition d'Ocenebrelilis inornatus, également connu sous le nom d'Ocenebra inornata, a été signalée en 1995 dans le bassin de Marennes Oléron par P.G. Sauriau comme nouvelle espèce de perceurs. Cette description a été concomitante avec l'augmentation...
Tipo: Text Palavras-chave: Ostréiculture; Impact; Bigorneaux perceurs; Ocenebra erinacea; Ocenebra inornata; Marennes Oléron; Charente-Maritime.
Ano: 2002 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00031/14233/11509.pdf
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Les mollusques invasifs des bassins conchylicoles du littoral Manche-Atlantique : diversité et structure génétiques des populations invasives, compétition avec les taxons indigènes, gestion du risque pour les écosystèmes et la conchyliculture ArchiMer
Bachelet, Pierrre; De Montaudouin, Xavier; Desclaux, C.; Mairesse, G.; Raigne, H.; Randriambao, K.; Garcia Meunier, Pascale; Martel, C.; Pascal, P. Y.; Sauriau, Pierre-guy; Simon-bouhet, Benoît; Robert, Stephane; Geairon, Philippe; Goulletquer, Philippe; Grangere, Karine; Guilpain, Patrice; Le Moine, Olivier; Rossi, Nadege; Seugnet, Jean-luc; Soletchnik, Patrick.
Shellfish areas usually receive a large number of introduced species. During the present project, we specially focused on 4 marine benthic molluscs introduced in shellfish areas along the Channel and Atlantic coasts of France: the gastropods Crepidula fornicata, Ocinebrellus inornatus and Cyclope neritea, and the bivalve Ruditapes philippinarum. Our study was conducted according to three main axes: (i) the characterization of introduction and expansion patterns of species within their newly colonized area. In the three invasive gastropods C. fornnicata, C. neritea and 0. inornatus, a high level of genetic diversity was detected in the French populations which indicated a complex process of introduction (with multiple population sources or secondary...
Tipo: Text Palavras-chave: Recommandations; Transfert; Ecosystèmes marins; Insularité; Expansion; Introduction espèces; Invasions biologiques; Mollusques.
Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/acte-3305.pdf
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Mortalité de Crassostrea gigas dans le bassin de Marennes Oléron. Etude physico chimique du sédiment. Etude du modèle de mortalité "plat-table" de C. gigas dans le bassin de Marennes Oléron. Etude "Dynamo" du projet MOREST ArchiMer
Soletchnik, Patrick; Bouchet, Vincent; Malestroit, Pascal; Seugnet, Jean-luc; Blouin, Frederic; Radford-knoery, Joël; Burgeot, Thierry; Sauriau, Pierre-guy.
In the scope of the study of the "on-bottom/off-bottom" mortality model in the south of the Marennes Oléron Bay, the result of the 2003 multidisciplinary study (Dynamor) appears to be the hypothesis of an acute stress, "ultimate" trigger of the mortality episodes in June. In 2004 we aim to look for the nature of this stress through the physico-chemical analysis of the sediment (Eh, pH, sulphides and ammoniacal nitrogen), the organic matter and chlorophyll load on the surface of the sediment between April and July. Herbicides are also measured in the water column, south of the bay (Seudre), during the same period. A "precocious" (around the first week of June) and "weak" (lower mortality rate on this working site since 1997) mortality peak happens when the...
Tipo: Text Palavras-chave: Bassin Marennes Oléron; Phytobenthos; Mortalité; Crassostrea gigas; Foraminiferes benthiques; Répartition verticale; Sédiment; Huître; Echantillonnage.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/rapport-3383.pdf
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Evaluation of mussels seed survival Mytilus edulis during early period of collection, development of a new tool and method ArchiMer
Pepin, Jean-francois; Robert, Stephane; Soletchnik, Patrick; Seugnet, Jean-luc; Morin, Dimitri; Chabirand, Jean-michel; Costes, Louis; Geairon, Philippe; Grizon, James.
In France, today, more than 80% of farmed blue mussel seed collection is based on larvae fixation on collector ropes. Mussels are traditionally grown on bouchot, which are rows of wooden poles placed perpendicularly to the shore, stuck in the ground within the gently sloping intertidal strip. Mussels are transferred either as seed attached on collecting ropes or as juveniles placed in net sockings and then wound up around the poles or suspended to longlines, where they will fatten and grow (Garen et al., 2004). In order to optimize seed collection and to limit unwanted biofouling on ropes, mussel growers local organizations identify best timing of seed collector ropes deployment by monitoring the number and size of planktonic mussel larvae from water...
Tipo: Text
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00455/56620/58332.pdf
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Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron et d'Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2010 ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Guyader, Tanguy; D'Amico, Florence; Cantin, Christian; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
Le réseau biovigilance a réalisé en 2010 la caractérisation du niveau de ploïdie des naissains captés en 2009 dans les deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon. Les échantillons des naissains sauvages issus du captage naturel ont été prélevés sur 4 sites dans chaque bassin et pour un total analysé de 1379 animaux. En tenant compte de notre échantillonnage, nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l'absence d 'animaux polyploïdes, triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les deux bassins prospectés. Cependant, les deux bassins de captage prospectés sont caractérisés par la présence de naissains affectés de diverses anomalies génomiques: cassures d 'ADN et Aneuploïdie (hypodiploïdie) ADN c à d une diminution de la taille du...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Reproduction; Captage; Ploïdie; Anomalie génomique; Aneuploïdie.
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00070/18124/15677.pdf
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Evolution des températures et des salinités de l'estuaire de la Charente au lieu- dit les Fontaines de Lupin - Année 2000 ArchiMer
Robert, Stephane; Razet, Daniel; Seugnet, Jean-luc; Geairon, Philippe; Guilpain, Patrice; Goulletquer, Philippe; Soletchnik, Patrick; Le Moine, Olivier; Faury, Nicole.
La présentation des mesures de salinités et de températures acquises au cours de l'an 2000, dans l'estuaire de la Charente s'inscrit dans la continuité de la campagne réalisée en 1999. L'objectif de cette surveillance est bien d'obtenir sur plusieurs années une évolution temporelle de ces paramètres afin 1) d'évaluer l'impact de la future retenue d'eau en amont de la Charente, 2) de caractériser les conditions température-salinité favorables (et défavorables) à la survie larvaire des huîtres en période estivale, 3) de disposer de données permettant de valider les modèles permettant de simuler les conditions trophiques des cheptels conchylicoles du Bassin de Marennes-Oléron. Ce travail s'inscrivant dans la durée, il est nécessaire dans un premier temps...
Tipo: Text Palavras-chave: Salinité; Température; Estuaire Charente; Variabilités; Marennes Oléron bassin; Charente-Maritime.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00031/14241/11516.pdf
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Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron et d'Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2009 ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Tourbiez, Delphine; D'Amico, Florence; Cantin, Christian; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
En 2009, La caractérisation du niveau de ploïdie des naissains captés en 2008 dans les deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon a été réalisée dans le cadre du réseau biovigilance. Les échantillons des naissains sauvages issus de ce captage naturel ont été prélevés sur 3 sites dans chaque bassin et pour un total analysé de 1121 animaux. En tenant compte de notre échantillonnage, nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l’absence d’animaux polyploïdes, triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les deux bassins prospectés. Cependant, les deux bassins de captage rospectés sont caractérisés par la présence accrue de naissains affectés de diverses anomalies génomiques (cassures d’ADN et diminution de la taille du génome,...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Crassostrea gigas; Génétique; Ploïdie; Naissain; Bassin Marennes Oléron; Charente-Maritime; Bassin d'Arcachon; Gironde.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14282/11559.pdf
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Bassin Adour-Garonne : Hydrologie et phytoplancton - Résultats 2015-2019 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Meteigner, Claire; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Rigouin, Loic; Gouriou, Laure; Lissardy, Muriel; Sanchez, Florence; De Casamajor, Marie-noelle; Morandeau, Gilles; Ganthy, Florian; Trut, Gilles; Trut, Florence; Caill-milly, Nathalie; Antajan, Elvire; Guesdon, Stephane; Chabirand, Jean-michel; Morin, Dimitri; Genauzeau, Sylvie; Piraud, Aude; Geairon, Philippe; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Thomas, Gerard; Bruneau, Audrey; Soudant, Dominique; Gautier, Emeric; Michel, Valérie; Dupin, Michel.
Ce rapport rend compte des résultats sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton acquis dans le cadre de la DCE (contrôle de surveillance entre 2014 et 2019), dans les masses d’eau côtières et de transition du bassin Adour-Garonne
Tipo: Text Palavras-chave: Directive Cadre sur l’Eau; Hydrologie; Phytoplancton.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00653/76529/77618.pdf
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Suivi « hydrologie » et « phytoplancton » des masses d'eau du bassin hydrographique Adour-Garonne sur la période 2010-2015 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Meteigner, Claire; Ganthy, Florian; Maurer, Daniele; Gouriou, Laure; Rigouin, Loic; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Trut, Gilles; Oger-jeanneret, Helene; Guesdon, Stephane; Derrien, Annick; Chabirand, Jean-michel; Genauzeau, Sylvie; Schmitt, Anne; Geairon, Philippe; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Thomas, Gerard; Bechemin, Christian; Soudant, Dominique; Lamoureux, Alice; Beaugrand, Philippe; Noureau, Bruno; Michel, Valérie; Dupin, Michel; Bariou, Jean; Landier, Pascal; Miguel, Véronique.
Tipo: Text
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00355/46583/46391.pdf
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Première évaluation de la diversité des communautés microbiennes planctoniques au cours d'épisodes de mortalité des moules bleues en France : utilisation de l'approche de métabarcoding pour l'analyse de l'ADN environnemental ArchiMer
Pepin, Jean-francois; Bouget, Jean-francois; Chabirand, Jean-michel; Chasselin, Leo; Costes, Louis; Grizon, James; Lejolivet, Aurore; Le Noc, Sandrine; Palvadeau, Hubert; Schmitt, Anne; Seugnet, Jean-luc; Soletchnik, Patrick; Travers, Marie-agnes; Tourbiez, Delphine; Guesdon, Stephane.
Since 2014 in France, in Charente maritime and Vendée, farmed and stocks of blue mussels experienced strong mortality events. In this context, the « MORBLEU » research project (DPMA-Ifremer agreement) was initiated to explore potentially aggravating factors, associated or correlated with mortality of mussels. Here, the work is to study biotic factors in mussels environment, looking for describe diversity and evolution of microbial communities (water column) before, during and after mortality events using NGS technology (metabarcoding) for environmental DNA analysis. We present, sampling strategy used from 2015 to 2018, Material & Methods and some preliminary results.  
Tipo: Text Palavras-chave: MORBLEU; Moules; Mortalité; ADN environnemental; EDNA; Metabarcoding; Communautés microbiennes.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00505/61664/65579.pdf
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