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Observer, Analyser et Gérer la variabilité de la reproduction et du recrutement de l’huître creuse en France : Le Réseau Velyger. Rapport annuel 2014 ArchiMer
Pouvreau, Stephane; Petton, Sebastien; Queau, Isabelle; Haurie, Axel; Le Souchu, Pierrick; Alunno-bruscia, Marianne; Palvadeau, Hubert; Auby, Isabelle; Maurer, Daniele; D'Amico, Florence; Passoni, Sarah; Barbier, Claire; Tournaire, Marie-pierre; Rigouin, Loic; Rumebe, Myriam; Fleury, Elodie; Fouillaron, Pierre; Bouget, Jean-francois; Pepin, Jean-francois; Robert, Stephane; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Chabirand, Jean-michel; Le Moine, Olivier; Guesdon, Stephane; Lagarde, Franck; Mortreux, Serge; Le Gall, Patrik; Messiaen, Gregory; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle; Quemener, Loic; Repecaud, Michel; Mille, Dominique; Geay, Amelie; Bouquet, Anne-lise.
La conchyliculture, et principalement l’élevage de l’huître creuse, Crassostrea gigas, constitue la principale activité aquacole française. Cette activité repose, en grande partie, sur le recrutement naturel de l’espèce qui assure 70% des besoins en jeunes huîtres (naissain) : cette activité de collecte s’appelle le captage. Les deux principaux centres de captage en France sont les bassins d’Arcachon et de Marennes-Oléron. Or, depuis une dizaine d'années, sur le bassin d'Arcachon, le captage devient très variable: à des années de captage nul (par exemple les années 2002, 2005, 2007) ou faible (2009, 2010, 2011) succèdent des années excellentes voire pléthoriques (les années 2003, 2006, 2008, 2012, 2013). A Marennes-Oléron, cette variabilité existe, mais...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Naissain; Recrutement; Captage; Larves; Cycle de reproduction; Changement climatique; Pacific oyster; Spat; Recruitment; Spat collecting; Larvae; Reproductive cycle; Climate change.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00279/38990/37561.pdf
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First record of the successful invader Palaemon macrodactylus in Arcachon Bay and Charente estuary (SW France) ArchiMer
Lavesque, Nicolas; Bachelet, Guy; Blanchet, Hugues; Moderan, Julien; Sauriau, Pierre-guy; Duquesne, Elise; Auby, Isabelle; Sorbe, Jean-claude.
Tipo: Text
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00181/29214/27623.pdf
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Protocoles de suivi stationnel des herbiers à zostères pour la Directive Cadre sur l’Eau (DCE), Zostera marina, Zostera noltii ArchiMer
Auby, Isabelle; Dalloyau, Sébastien; Hily, Christian; Oger-jeanneret, Helene; Plus, Martin; Sauriau, Pierre-guy; Trut, Gilles.
Tipo: Text
Ano: 2013 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00072/18368/15941.pdf
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Suivi stationnel des herbiers de zostères (Zostera noltei et Zostera marina) et calcul de l’indicateur « angiospermes» de la Masse d'eau côtière FRFC06 – Arcachon amont - Bassin Hydrographique Adour-Garonne - 2006-2014 ArchiMer
Auby, Isabelle; Trut, Gilles; Rigouin, Loic; Ganthy, Florian; Oger-jeanneret, Helene; Heroin, Debora; Gouriou, Laure; Bujan, Stephane; Devaux, Ludovic.
La Directive Cadre sur l’Eau 2000/60/CE établit un nouveau cadre pour une politique communautaire dans le domaine de l’eau. Elle fixe comme objectif général d’atteindre, à l’horizon 2015, un bon état écologique et chimique des masses d’eau souterraines et de surface, ces dernières incluant les eaux côtières (MEC) et les eaux de transition (MET). Dans ce cadre, un certain nombre d'éléments de qualité sont suivis, dont l'élément de qualité "Angiospermes" dans les masses d'eau où les herbiers de zostères sont présents. Ce rapport contient les résultats du suivi mis en oeuvre entre 2007 et 2014 et son classement écologique au sens de la DCE pour cet élément de qualité dans la masse d'eau « Arcachon amont ».
Tipo: Text
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00274/38540/37058.pdf
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Caractérisation de la qualité biologique des Masses d'Eau Côtières : Cartographie des herbiers à Zostera noltii et Zostera marina du Lac d'Hossegor. MEC FRFC09 ArchiMer
Trut, Gilles; Dalloyau, Sebastien; Auby, Isabelle.
Ce rapport présente la carte des herbiers de zostères intertidales et subtidales du Lac d'Hossegor, établie en 2009.
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00181/29215/27626.pdf
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Suivi stationnel (2006-2016) des herbiers de zostères (Zostera noltei et Zostera marina) et calcul de l’indicateur « Angiospermes » (2016) dans la masse d'eau côtière FRFC06 – Arcachon amont - - Bassin Hydrographique Adour-Garonne - ArchiMer
Auby, Isabelle; Rigouin, Loic; Trut, Gilles; Oger-jeanneret, Helene; Ganthy, Florian; Cognat, Mathis; Gouriou, Laure; Bujan, Stéphane; Devaux, Ludovic; Dalloyau, Sébastien; Feigne, Claude; Pere, Caroline.
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00392/50384/51089.pdf
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Effect of plant photosynthesis, carbon sources and ammonium availability on nitrogen fixation rates in the rhizosphere of Zostera noltii ArchiMer
Welsh, Dt; Bourgues, S; Dewit, R; Auby, Isabelle.
Rates of nitrogen fixation (measured as acetylene reduction) in the rhizosphere of the seagrass Zostera noltii were highly dependent upon plant photosynthetic activity being significantly stimulated at elevated CO2 concentrations and by light, both in the short-term and over diurnal cycles. Stimulation by light became insignificant when 5 mM sucrose was added to the sediment porewater, indicating that in the absence of added carbon sources, light stimulation was due to direct inputs of plant photosynthate to the rhizosphere. Addition of a range of carbon sources to the rhizosphere sediment stimulated rates of acetylene reduction, with this stimulation being significant for sucrose and lactate. Surprisingly, whilst low additions of ammonium to the sediment...
Tipo: Text Palavras-chave: Acetylene reduction; Nitrogen fixation; Rhizosphere; Zostera noltii; Plant photosynthesis; Root exudates; Carbon sources; Ammonium.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00151/26266/24350.pdf
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Biomass and species composition of macrophytes in Arcachon Bay and Prevost lagoon, with a compilation of data of primary production in Arcachon Bay ArchiMer
Auby, Isabelle; Bachelet, Guy; Labourg, Pierre Jean.
Tipo: Text
Ano: 1993 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00259/37008/35505.pdf
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Etude de faisabilité d’opérations de ‘repeuplement orienté’ dans deux sites français de captage de l’huître creuse (Crassostrea gigas) ArchiMer
Bernard, Ismael; Lapegue, Sylvie; Dumas, Franck; Talarmain, Eric; Cornette, Florence; Degremont, Lionel; Chavanne, Herve; Pouvreau, Stephane; Auby, Isabelle; Maurer, Daniele; Plus, Martin; Le Moine, Olivier; Boudry, Pierre.
La forte augmentation des mortalités de juvéniles d’huître creuse depuis 2008 a relancé la problématique de l’approvisionnement en naissains de l’ostréiculture française. Dans ce contexte, cette étude a pour objectif d’étudier la faisabilité d’opérations de repeuplement en huîtres génétiquement plus résistantes, afin d’améliorer les performances de survie du naissain capté dans le milieu naturel. Cette étude s’est ainsi focalisée sur les deux bassins naisseurs historiques, Marennes-Oléron et Arcachon. Nous avons donc cherché à établir (1) une hiérarchie des bancs en fonction de l’expulsion de larves d’huître dans le bassin d’Arcachon, (2) une cartographie des liens en termes de connectivité entre les bancs des pertuis charentais et (3) la faisabilité du...
Tipo: Text
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00083/19410/17013.pdf
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Suivi hydrologie et phytoplancton des masses d'eau du bassin hydrographique Adour-Garonne en 2007 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Duval, Magali; Neaud-masson, Nadine; Plus, Martin; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Trut, Gilles; Ryckaert, Mireille; Derrien, Annick; Margat, Sylvie; Schmitt, Anne; Charpentier, Gabriel; Seugnet, Jean-luc; Thomas, Gerard; Llevot, Gerard; Beaugrand, Philippe; Carrere, Christian; Michel, Valerie; Petrau, Christian; Bariou, Jean; Debinski, Olivier; Le Mao, André.
Ce rapport rend compte des résultats acquis en 2007 sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton, dans le cadre des réseaux REPHY et ARCHYD (pour les points du Bassin d’Arcachon), et celui du contrôle de surveillance des masses d'eau du district Adour-Garonne qui ne faisaient pas l’objet de suivi avant la mise en œuvre de la DCE. Ce document contient des résultats concernant les éléments de qualité physico-chimique (oxygène dissous et nutriments pour les deux types de masses d’eau, température et turbidité pour les masses d’eau côtières exclusivement). Sont également inclues dans ce document les données d'évaluation de la qualité des masses d'eau vis-à-vis de l'indicateur « phytoplancton » calculées par Soudant et Belin (2009), sur la base des...
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00214/32569/31036.pdf
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Cyanobactéries dans le Lac d’Hossegor en 2013 ArchiMer
Rumebe, Myriam; Auby, Isabelle; Chomerat, Nicolas; Amzil, Zouher; Costa, Magali; Arrue, François.
Cette note concerne une efflorescence de cyanobactéries du genre Planktothrix dans le Lac marin d'Hossegor, en janvier 2013. La provenance de ces microalgues a été identifiée et leur innocuité démontrée grâce aux résultats d'analyses des phycotoxines.
Tipo: Text
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00167/27834/26040.pdf
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Suivi « hydrologie » et « phytoplancton » des masses d'eau du bassin hydrographique Adour-Garonne en 2008-2013 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Barbier, Claire; Ganthy, Florian; Maurer, Daniele; Gouriou, Laure; Rigouin, Loic; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Trut, Gilles; Oger-jeanneret, Helene; Robert, Serge; Guesdon, Stephane; Derrien, Annick; Chabirand, Jean-michel; Charpentier, Gabriel; Genauzeau, Sylvie; Schmitt, Anne; Geairon, Philippe; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Thomas, Gerard; Bechemin, Christian; Soudant, Dominique; Lamoureux, Alice; Llevot, Gerard; Beaugrand, Philippe; Michel, Valerie; Dupin, Michel; Bariou, Jean; Landier, Pascal; Miguel, Véronique.
Ce rapport rend compte des résultats acquis entre 2008 et 2013 sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton, dans le cadre des réseaux REPHY et ARCHYD (pour les points du Bassin d’Arcachon), et celui du contrôle de surveillance des masses d'eau du district Adour-Garonne qui ne faisaient pas l’objet de suivi avant la mise en œuvre de la DCE. Ce document contient des résultats concernant les éléments de qualité physico-chimique (oxygène dissous et nutriments pour les deux types de masses d’eau, température et transparence pour les masses d’eau côtières exclusivement) selon des méthodes présentées dans une annexe de ce rapport. Sont également inclues dans ce document les données d'évaluation de la qualité des masses d'eau vis-à-vis de l'indicateur «...
Tipo: Text
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00225/33615/32015.pdf
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Incertitudes des méthodes d’évaluation « eaux littorales » : utilisation de modèles linéaires dynamiques pour l’évaluation des incertitudes (chlorophylle a, phytoplancton) ArchiMer
Soudant, Dominique; Miossec, Laurence; Neaud-masson, Nadine; Auby, Isabelle; Maurer, Daniele; Daniel, Anne.
L’incertitude associée à une mesure a pour origine d’une part la variabilité environnementale et d’autre part l’ensemble du processus d’acquisition depuis le prélèvement jusqu’à la saisie de la donnée dans une base. L’estimation de l'ensemble de cette variabilité est un exercice complexe à réaliser dans le cadre d’un plan d’expérience. En revanche, les séries temporelles présentent la caractéristique d’intégrer toutes les variabilités et ainsi l’analyse de ces séries en terme de signal et bruit doit permettre de quantifier l’amplitude des incertitudes. Toutefois, les séries temporelles d’observation présentent un ensemble de caractéristiques les rendant difficiles à analyser. Les modèles linaires dynamiques constituent une approche adaptée à ces données...
Tipo: Text Palavras-chave: Incertitude; Chlorophylle a; Abondance phytoplanctonique; Modèle linaire dynamique; Arcachon; REPHY..
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00345/45594/45206.pdf
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Suivi stationnel (2007-2014) de l'herbier de zostères naines (Zostera noltei) et calcul de l’indicateur « Angiospermes » (2014) dans la masse d'eau côtière FRFC09 – Lac d'Hossegor ArchiMer
Auby, Isabelle; Rigouin, Loic; Ganthy, Florian; Heroin, Debora; Sanchez, Florence.
La Directive Cadre sur l’Eau 2000/60/CE établit un nouveau cadre pour une politique communautaire dans le domaine de l’eau. Elle fixe comme objectif général d’atteindre, à l’horizon 2015, un bon état écologique et chimique des masses d’eau souterraines et de surface, ces dernières incluant les eaux côtières (MEC) et les eaux de transition (MET). Dans ce cadre, un certain nombre d'éléments de qualité sont suivis, dont l'élément de qualité "Angiospermes" dans les masses d'eau où les herbiers de zostères sont présents. Ce rapport contient les résultats du suivi mis en oeuvre entre 2007 et 2014 et son classement écologique au sens de la DCE pour cet élément de qualité dans la masse d'eau « Lac d’Hossegor ».
Tipo: Text
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00274/38539/37057.pdf
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Classement des masses d’eau du littoral Manche-Atlantique sur la base de l’indicateur DCE «Angiospermes» (2012-2016) ArchiMer
Auby, Isabelle; Oger-jeanneret, Helene; Trut, Gilles; Ganthy, Florian; Rigouin, Loic; De Casamajor, Marie-noelle; Sanchez, Florence; Lissardy, Muriel; Fortune, Mireille; Manach, Soazig; Bizzozero, Lucie; Rollet, Claire; Lejolivet, Aurore; Desroy, Nicolas; Foveau, Aurelie; Le Mao, Patrick; Sauriau, P.g.; Aubert, A.; Cajeri, P.; Curti, C.; Duvard, A.; Latry, L.; Lachaussee, N.; Pineau, P.; Plumejeaud-perreau, C.; Aubin, S.; Droual, G.; Fournier, J.; Garcia, A; Guillaudeau, J.; Hubert, C.; Humbert, S.; Janson, A.l.; Masse, C.; Panizza, A.c.; Grall, J.; Maguer, M.; Hily, C.; Hacquebart, P.; Joncourt, Y.; Baffreau, A.; Timsit, O..
Certaines masses d’eau s’avérant parfois déclassées par cet élément de qualité, le groupe de travail DCE « Eaux Littorales » a sollicité de la part des scientifiques une réflexion sur les raisons de ce mauvais classement et les éventuelles actions de restauration ou d'amélioration de connaissances relatives aux herbiers de ces zones. L’objectif de cette expertise, soutenue par l’Agence Française pour la Biodiversité, et réalisée en collaboration avec les acteurs concernés par l’indicateur « angiospermes » sur les façades Manche-Atlantique, est d’identifier les pressions potentiellement responsables de cette situation (Tableau 1) en prenant également en compte l’effet des différentes métriques de l’indicateur sur les résultats obtenus.
Tipo: Text
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00427/53868/54918.pdf
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Évolution spatio-temporelle des herbiers de zostères du Bassin d'Arcachon ArchiMer
Dalloyau, Sebastien; Trut, Gilles; Plus, Martin; Kantin, Roger; Emery, Eric; Noël, Claire; Auby, Isabelle.
Dans le cadre de la DCE, et plus particulièrement de l’évaluation de l’état écologique des habitats benthiques, le laboratoire IFREMER d'Arcachon a réalisé la cartographie des herbiers de zostères du Bassin d’Arcachon en 2007-2008 et comparé leur extension avec les données antérieures (1988 pour Zostera marina - 1989 et 2005 pour Zostera noltii).
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00259/37009/35507.pdf
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Environmental factors controlling biomass development of seagrass meadows of Zostera noltei after a drastic decline (Arcachon Bay, France) ArchiMer
Cognat, Mathis; Ganthy, Florian; Auby, Isabelle; Barraquand, Frederic; Rigouin, Loic; Sottolichio, Aldo.
The relative impact of light, depth, hydrology, hydrodynamics, sediment and nutrients on growth of the seagrass Zostera noltei was investigated in Arcachon Bay, where the extent of seagrass beds has been decreasing for 20 years. A comprehensive multi-parameter survey of 9 sites was conducted monthly over one year. A three-parameter logistic growth model was fitted to biomass data to unravel the relative contributions of environmental factors on seagrass growth. The present study highlights the fact that, in addition to the dominant positive effect of light on plant growth, the hydrological and hydrodynamic parameters were important drivers for Z. noltei growth at the scale of the whole Bay. At the scale of individual sites, other factors such as macroalgal...
Tipo: Text Palavras-chave: Physical parameters; Light; Hydrodynamics; Adaptation; Statistical growth model.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00451/56229/57789.pdf
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Etude de la fécondité de l’huître creuse dans le bassin d’Arcachon en 2013 en lien avec la qualité de l’eau. Compte-rendu final du programme FeLiBA ArchiMer
Bernard, Ismael; Allain, Gwenhael; Auby, Isabelle; Plus, Martin; Drean, Tugdual; Gasmi, Sonia; David, Valérie; Pouvreau, Stephane; Maurer, Daniele.
De 2009 à 2011, le captage à Arcachon fut particulièrement mauvais. Des pontes tardives associées à de faibles quantités de larves “petites” indiquaient un problème probablement au niveau de la maturation ou de la ponte. Le programme FéLiBA consiste en un zoom, pour l’année 2013, sur la Fécondité des huîtres creuses en Lien avec la qualité de l’eau du Bassin d’Arcachon. Ce programme s’est traduit par différentes actions de terrain. Tout d’abord, la maturation des huîtres issues du captage d’Arcachon ou de Marennes-Oléron a été suivie à Arcachon (site du Tès) et comparée avec celle de la Rade de Brest (pointe du Château) au cours de l’année 2013. Puis, un bilan de la maturation des huîtres sauvages d’Arcachon a été établi fin juin 2013. La ponte a également...
Tipo: Text
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00179/29002/27428.pdf
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Suivi « hydrologie » et « phytoplancton » des masses d'eau du bassin hydrographique Adour-Garonne sur la période 2009-2014 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Meteigner, Claire; Ganthy, Florian; Maurer, Daniele; Gouriou, Laure; Rigouin, Loic; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Trut, Gilles; Oger-jeanneret, Helene; Guesdon, Stephane; Derrien, Annick; Chabirand, Jean-michel; Charpentier, Gabriel; Genauzeau, Sylvie; Schmitt, Anne; Geairon, Philippe; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Thomas, Gerard; Bechemin, Christian; Soudant, Dominique; Lamoureux, Alice; Beaugrand, Philippe; Noureau, Bruno; Michel, Valérie; Dupin, Michel; Bariou, Jean; Landier, Pascal; Miguel, Véronique.
Ce rapport rend compte des résultats acquis entre 2009 et 2014 sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton, dans le cadre des réseaux REPHY et ARCHYD (pour les points du Bassin d’Arcachon), et celui du contrôle de surveillance des masses d'eau du bassin Adour-Garonne qui ne faisaient pas l’objet de suivi avant la mise en oeuvre de la DCE. Ce document contient des résultats concernant les éléments de qualité physicochimique (oxygène dissous pour les deux types de masses d’eau, azote inorganique dissous pour les masses d’eau côtières et les masses d’eau de transition peu turbides, température et transparence pour les masses d’eau côtières exclusivement) selon des méthodes présentées dans trois documents (Daniel, 2009 a et b ; Daniel et Soudant,...
Tipo: Text
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00280/39141/37696.pdf
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Directive Cadre sur l’Eau : Cartographie des herbiers de Zostera marina du Bassin d'Arcachon ArchiMer
Trut, Gilles; Auby, Isabelle; Rigouin, Loic; Oger-jeanneret, Helene; Ganthy, Florian; Cognat, Mathis; Noel, Claire; Marchetti, Simon; Bauer, Eric.
Ce document présente les résultats du suivi surfacique des herbiers infralittoraux de zostères marines du bassin d’Arcachon opéré en juin 2016. Comme en 2008 (Dalloyau et al., 2009), la méthode utilisée, dite DIVA (Détection & Inspection Verticale Acoustique), permet de générer une information de présence/absence, par superposition de signaux issus d’un sonar latéral GEOSWATH et d’un sondeur acoustique mono-faisceau de grande précision. Ces données sont couplées à des observations de terrain obtenues à l’aide de caméras vidéo sous-marines GoPro, reliées à un système de positionnement sub-métrique. Les opérations de terrain ont été réalisées en juin 2016. En outre, ce rapport traite de l'évolution temporelle de la surface occupée par les herbiers de...
Tipo: Text
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00444/55526/57114.pdf
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