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Les surmortalités des naissains d’huîtres creuses, Crassostrea gigas : acquis des recherches en 2010 ArchiMer
Cochennec-laureau, Nathalie; Baud, Jean-pierre; Pepin, Jean-francois; Benabdelmouna, Abdellah; Soletchnik, Patrick; Lupo, Coralie; Garcia, Celine; Arzul, Isabelle; Boudry, Pierre; Huvet, Arnaud; Pernet, Fabrice; Bachere, Evelyne; Bedier, Edouard; Petton, Bruno; Gaussem, Florian; Stanisiere, Jean-yves; Degremont, Lionel.
Depuis 2008, la filière ostréicole française doit faire face à des surmortalités exceptionnelles des naissains d’huîtres creuses, Crassostrea gigas, (huîtres de moins d’un an) comprises entre 60 et 90% dans tous les sites d’élevage. Des cas de mortalité similaires ont été décrits en Irlande, dans les îles anglo-normandes, au Portugal en 2009 et au Royaume-Uni en 2010. Récemment deux épisodes de mortalité, associés à la présence d’un virus OsHV1 μvar (ou un variant très proche) ont été également décrits en Nouvelle Zélande (décembre 2010) et en Australie (janvier 2011) soulignant la vulnérabilité de la filière ostréicole dans le monde. L’objectif de ce document est de faire un point sur les recherches menées depuis l’apparition de ce phénomène et de...
Tipo: Text
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14423/11719.pdf
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Single or dual experimental infections with Vibrio aestuarianus and OsHV-1 in diploid and triploid Crassostrea gigas at the spat, juvenile and adult stages ArchiMer
Azema, Patrick; Travers, Marie-agnes; Benabdelmouna, Abdellah; Degremont, Lionel.
French production of the Pacific cupped oyster, Crassostrea gigas, is currently threatened by two pathogens, OsHV-1 and V. aestuarianus. While oysters selected for their higher resistance to OsHV-1 are now available for the industry, the impact of V. aestuarianus on such oysters is unknown, especially for triploids. In addition, experimental infection has used the virus or the bacteria alone, but there have been no investigations of dual exposure to these pathogens. This study is the first report of single or dual exposure in spat (Spat1 and Spat2), juvenile and adult naïve oysters. For each of the two stocks evaluated, unselected oysters and oysters selected for their higher resistance to OsHV-1 infection were tested, as well as their triploid siblings of...
Tipo: Text Palavras-chave: Vibrio aestuarianus; OsHV-1; Dual exposure; Ploidy; Selection; Crassostrea gigas.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00347/45835/45918.pdf
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Double résistance aux infections dues aux organismes pathogènes Vibrio aestuarianus et OsHV-1 chez l’huître creuse Crassostrea gigas – DORE. Rapport scientifique final de l’étude DORE, convention DPMA-Ifremer 2016 ArchiMer
Degremont, Lionel; Maurouard, Elise; Godfrin, Yoann; Travers, Marie-agnes; Morga, Benjamin; Lamy, Jean-baptiste; Benabdelmouna, Abdellah.
Depuis 2012, le nombre de cas de mortalités d’huîtres creuses adultes (Crassostrea gigas) rapportés dans le cadre des réseaux de surveillance de l’Ifremer, et dans lesquels la bactérie Vibrio aestuarianus a été isolée, a fortement augmenté. Les objectifs de cette étude étaient (1) d’étudier la sensibilité des huîtres C. gigas à une infection à V. aestuarianus pour des lots diploïdes et triploïdes et (2) déterminer la réponse à la sélection pour une meilleure résistance à V. aestuarianus pour des huîtres C. gigas. Neuf stocks ont été utilisés, répartis en trois niveaux de sélection, chacun étant donc répliqué par trois pontes. Pour chaque stock, un lot diploïde (2n), un lot triploïde (3n_chim) produit par la rétention d’un globule polaire, et trois lots...
Tipo: Text Palavras-chave: Vibrio aestuarianus; OsHV-1; Sélection; Résistance; Triploïdes; Huître creuse; Crassostrea gigas; Vibrio aestuarianus; OsHV-1; Selective breeding; Disease resistance Pacific oyster; Crassostrea gigas; Triploids.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00404/51530/52140.pdf
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CAPRETAR : Etude comparative des caractéristiques cytogénétiques et des performances de survie de naissains sauvages issus du CAPtage PREcoce ou TARdif ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Hemissi, Issam; Bodin, Stephane; Robert, Stephane; Ledu, Christophe; Laporte, Philippe.
L'action de recherche CAPRETAR (CAptage PREcoce ou TARdif: 2009-2010) a été réalisée dans le cadre du Contrat de Plan Etat Région - Poitou Charentes (CPER-PC 2007- 2013) développement durable des Pertuis Charentais. Cette action, s 'inscrit dans le cadre d 'un lien direct qui existerait entre la nature précoce/tardive d 'un captage naturel et la qualité des naissains de l'huître creuse C. gigas qui en sont issus (qualité génétique : « R » résistante ou « S » sensible et qualité génomique : taux des aneuploïdies et des dommages à l'ADN). L'objectif de cette action vise à estimer durant l 'année (2010) les performances relatives de survie de naissains issus d 'un captage précoce ou tardif réalisé l'année précédente (2009). Les résultats escomptés visent à...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Cytogénétique; Captage; Reproduction; Huîtres creuses; Crassostrea gigas.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00062/17283/14794.pdf
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Parental exposure to the herbicide diuron results in oxidative DNA damage to germinal cells of the Pacific oyster Crassostrea gigas ArchiMer
Barranger, Audrey; Heude-berthelin, Clothilde; Rouxel, Julien; Adeline, Beatrice; Benabdelmouna, Abdellah; Burgeot, Thierry; Akcha, Farida.
Chemical pollution by pesticides has been identified as a possible contributing factor to the massive mortality outbreaks observed in Crassostrea gigas for several years. A previous study demonstrated the vertical transmission of DNA damage by subjecting oyster genitors to the herbicide diuron at environmental concentrations during gametogenesis. This trans-generational effect occurs through damage to genitor-exposed gametes, as measured by the comet-assay. The presence of DNA damage in gametes could be linked to the formation of DNA damage in other germ cells. In order to explore this question, the levels and cell distribution of the oxidized base lesion 8-oxodGuo were studied in the gonads of exposed genitors. High-performance liquid chromatography...
Tipo: Text Palavras-chave: Crassostrea gigas; Oxidative stress; DNA damage; Germ cell; Pesticides.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00295/40655/39753.pdf
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Les pratiques culturales peuvent-elles permettre de réduire la surmortalité du naissain d'huîtres creuses? Récapitulatif des essais d'élevage et expérimentations zootechniques menés sur le territoire français entre 2008 et 2010 ArchiMer
Soletchnik, Patrick; Mazurie, Joseph; Allain, Gwenhael; Bedier, Edouard; Benabdelmouna, Abdellah; Blin, Jean-louis; Bouquet, Anne-lise; Cochet, Hélène; Degremont, Lionel; Gaussem, Florian; Gervasoni, Erika; Glize, Philippe; Petton, Bruno; Roussel, Pierre-yves; Pernet, Fabrice.
This paper summarizes knowledge about relations between husbandry practices and oyster spat mortalities since 2008 in France. These relations are strictly analyzed from a panel of experiments set on the shore (in outdoor experiments) by Ifremer teams and technical institutes all over French coasts. Results show some practices are able to reduce spat mortality with some influencing factors relevant of spat quality (sanitary status, natural or genetic selection) or husbandry practices. Spat “free” of virus is able to survive up to 90% when it is isolated and confined in ponds or nursery, during an epidemic crisis. When outbreaks occurred in oyster beds, natural or nursery spat died in almost same proportions. In 2010, some studies conducted in Mediterranean...
Tipo: Text Palavras-chave: Surmortalité; Naissain; Huître creuse; OsHV-1; Pratiques culturales; Mortality; Spat; Cupped oyster; Crassostrea gigas; OsHV-1; Cultural practices.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14280/25847.pdf
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Effects of an environmentally relevant concentration of diuron on oyster genitors during gametogenesis: responses of early molecular and cellular markers and physiological impacts ArchiMer
Akcha, Farida; Barranger, Audrey; Bachere, Evelyne; Berthelin, C. Heude; Piquemal, D.; Alonso, P.; Sallan, R. Rondon; Dimastrogiovanni, G.; Porte, C.; Menard, Dominique; Szczybelski, A.; Benabdelmouna, Abdellah; Auffret, M.; Rouxel, Julien; Burgeot, Thierry.
Genitors of the Pacific oyster Crassostrea gigas were submitted during gametogenesis to a short pulse exposure to the herbicide diuron at a realistic environmental concentration. Histological analysis showed no effect of diuron on gametogenesis course, sex ratio and reproductive effort. A non-significant increase in testosterone and progesterone levels was observed in genitors exposed to the herbicide. At cell level, diuron exposure was shown to modulate the phagocytic activity of circulating hemocytes. The results of a transcriptional analysis showed that diuron affected the expression of genes belonging to functions known to play a major role during oyster gametogenesis such as gene transcription regulation, DNA replication and repair, DNA methylation...
Tipo: Text Palavras-chave: Oyster; Pesticide; Reproduction; Histology; Gene expression; RT-qPCR; Steroid; Immunity.
Ano: 2016 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00309/41983/83232.pdf
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Study of genetic damage in the japanese oyster induced by an environmentally-relevant exposure to diuron: evidence of vertical transmission of dna damage ArchiMer
Barranger, Audrey; Akcha, Farida; Rouxel, Julien; Brizard, Raphael; Maurouard, Elise; Pallud, Marie; Menard, Dominique; Tapie, N.; Budzinski, Helene; Burgeot, Thierry; Benabdelmouna, Abdellah.
Pesticides represent a major proportion of the chemical pollutants detected in French coastal waters and hence a significant environmental risk with regards to marine organisms. Commercially-raised bivalves are particularly exposed to pollutants, among them pesticides, as shellfish farming zones are subject to considerable pressure from agricultural activities on the mainland. The aims of this study were to determine (1) the genotoxic effects of diuron exposure on oyster genitors and (2) the possible transmission of damaged DNA to offspring and its repercussions on oyster fitness. To investigate these points, oysters were exposed to concentrations of diuron close to those detected in the Marennes-Oleron Basin (two 7-day exposure pulses at 0.4 and 0.6 μg...
Tipo: Text Palavras-chave: Herbicide; Diuron; Oyster; Genotoxicity; Comet assay; Cytogenetics.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00162/27311/25541.pdf
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Etude de la CINétique et DIffusion de la MORtalité (CINDIMOR) chez les juvéniles de l'huître creuse Crassostrea gigas ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Guyader, Tanguy; Ledu, Christophe; Laporte, Philippe; Degremont, Lionel.
Depuis son introduction en France, l’huître creuse du Pacifique Crassostrea gigas subit des épisodes répétés de mortalité estivale touchant principalement les juvéniles. A partir de 2008, un nouveau pallier a été franchi et ces épisodes de mortalité estivale se sont accrus en intensité, touchant jusqu’à 90% des lots. Actuellement, ces mortalités touchent l’ensemble des façades maritimes ainsi que plusieurs pays utilisant des naissains d’origine Française. L’ostréiculture Française est basée sur l’utilisation majoritaire de naissains sauvages issus d’un captage naturel (75 à 80%) réalisé au niveau des bassins d’Arcachon et de Marennes Oléron en complément avec l’utilisation de naissains, principalement triploïdes, produits par diverses écloseries privées...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Crassostrea gigas; Mortalité; Condition d'élevage; Historique des lots.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00063/17405/14910.pdf
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CARTAMO : CARTographie des Anomalies génomiques dans les gisements naturels d'huîtres creuses du bassin de Marennes Oléron ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Hemissi, Issam.
Depuis son existence, le réseau biovigilance détecte des naissains sauvages issus du captage naturel atteints d'anomalies génomiques dont le taux varie en fonction des années et des sites de captage. Dans d'autres suivis, nous avons montré que ces anomalies génomiques affectant les naissains de C. gigas étaient négativement corrélées avec le niveau de survie des naissains. Dans le contexte des mortalités qui impactent lourdement depuis 2008 les naissains de C. gigas, et compte tenu du fait que les deux principaux bassins naisseurs français, étudiés dans le cadre du réseau Biovigilance, sont à la base de la fourniture de pratiquement les trois quarts des naissains annuellement utilisés, l'occurrence de ces anomalies génomiques mises en évidence dans le...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Anomalies génomiques; Huître creuse; Crassostrea gigas.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00062/17281/14793.pdf
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Parental exposure to environmental concentrations of diuron leads to aneuploidy in embryos of the Pacific oyster, as evidenced by fluorescent in situ hybridization ArchiMer
Barranger, Audrey; Benabdelmouna, Abdellah; Degremont, Lionel; Burgeot, Thierry; Akcha, Farida.
Changes in normal chromosome numbers (i.e. aneuploidy) due to abnormal chromosome segregation may arise either spontaneously or as a result of chemical/radiation exposure, particularly during cell division. Coastal ecosystems are continuously subjected to various contaminants originating from urban, industrial and agricultural activities. Genotoxicity is common to several families of major environmental pollutants, including pesticides, which therefore represent a potential important environmental hazard for marine organisms. A previous study demonstrated the vertical transmission of DNA damage by subjecting oyster genitors to short-term exposure to the herbicide diuron at environmental concentrations during gametogenesis. In this paper, Fluorescent in...
Tipo: Text Palavras-chave: Aneuploidy; FISH; Diuron; Crassostrea gigas.
Ano: 2015 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00238/34911/33216.pdf
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Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron et d'Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2009 ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Tourbiez, Delphine; D'Amico, Florence; Cantin, Christian; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
En 2009, La caractérisation du niveau de ploïdie des naissains captés en 2008 dans les deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon a été réalisée dans le cadre du réseau biovigilance. Les échantillons des naissains sauvages issus de ce captage naturel ont été prélevés sur 3 sites dans chaque bassin et pour un total analysé de 1121 animaux. En tenant compte de notre échantillonnage, nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l’absence d’animaux polyploïdes, triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les deux bassins prospectés. Cependant, les deux bassins de captage rospectés sont caractérisés par la présence accrue de naissains affectés de diverses anomalies génomiques (cassures d’ADN et diminution de la taille du génome,...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Crassostrea gigas; Génétique; Ploïdie; Naissain; Bassin Marennes Oléron; Charente-Maritime; Bassin d'Arcachon; Gironde.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14282/11559.pdf
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Plan de sauvegarde 2012, 3ème édition : synthèse des résultats 2012-2013 ArchiMer
Degremont, Lionel; Maurouard, Elise; Connes, Coralie; Ledu, Christophe; Benabdelmouna, Abdellah.
Depuis 2008 l’ostréiculture française subit des mortalités massives d'huîtres creuses, Crassostrea gigas, qui menacent les approvisionnements en naissains et, par voie de conséquence, fragilise la filière ostréicole. C’est dans ce contexte qu'a été mis en place à partir de 2010 une opération désignée sous le terme plan de sauvegarde. Cette opération sous forme contractuelle fait intervenir l'Ifremer, des écloseries privées, le Ministère en charge de l'Agriculture et le CNC. Le premier plan de sauvegarde (PS1) a été initié en 2010, suivi par un deuxième en 2011 (PS2), et un troisième en 2012 (PS3). L’objectif premier de ce plan est d’apporter une réponse temporaire au déficit de production grandissant en fournissant aux écloseries des animaux présentant une...
Tipo: Text
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00229/34041/32448.pdf
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Procédures d'échantillonnage pour la conservation des espèces aquacoles dans la Cryobanque Nationale ArchiMer
Vandeputte, Marc; Labbe, Catherine; Suquet, Marc; Fauvel, Christian; Goardon, Lionel; Duclos, Delphine; Danchin-burge, Coralie; Vergnet, Alain; Rault, Paul; Degremont, Lionel; Benabdelmouna, Abdellah; Brizard, Raphael; Haffray, Pierrick.
Tipo: Text
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00098/20975/18597.pdf
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Chromosomal organization of simple sequence repeats in the Pacific oyster (Crassostrea gigas): (GGAT)(4), (GT)(7) and (TA)(10) chromosome patterns ArchiMer
Bouilly, Karine; Chaves, R.; Leitao, A.; Benabdelmouna, Abdellah; Guedes Pinto, H..
Chromosome identification is essential in oyster genomic research. Fluorescence in situ hybridization (FISH) offers new opportunities for the identification of oyster chromosomes. It has been used to locate satellite DNAs, telomeres or ribosomal DNA sequences. However, regarding chromosome identification, no study has been conducted with simple sequence repeats (SSRs). FISH was used to probe the physical organization of three particular SSRs, (GGAT)(4), (GT)(7) and (TA)(10) onto metaphase chromosomes of the Pacific oyster, Crassostrea gigas. Hybridization signals were observed in all the SSR probes, but the distribution and intensity of signals varied according to the oligonucleotide repeat. The intercalary, centromeric and telomeric bands were observed...
Tipo: Text Palavras-chave: Simple sequence repeats (SSRs); Mollusks; Fluorescence in situ hybridization (FISH); Crassostrea gigas; Chromosome identification.
Ano: 2008 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/publication-6132.pdf
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Plan de sauvegarde 2011 : synthèse de résultats 2011-2012 ArchiMer
Chavanne, Herve; Maurouard, Elise; Yonneau, Caroline; Heroin, Debora; Ledu, Christophe; Degremont, Lionel; Benabdelmouna, Abdellah.
Afin de permettre l’approvisionnement partiel des établissements ostréicoles en naissain « à survie améliorée », un protocole d’approvisionnement partiel de sauvegarde (PSI) a été mis en place en 2010 entre le CNC, les CRCs, les écloseurs et l’Ifremer afin de fournir aux ostréiculteurs du naissain présentant les meilleures chances de survie face aux mortalités estivales. Il avait ainsi été décidé que des écloseries privées produiraient du naissain triploïde « à survie améliorée » en 2010 à partir de géniteurs, femelles diploïdes et mâles tétraploïdes, sélectionnés et fournis par Ifremer. Sur la base notamment des recommandations des Assises de la Conchyliculture, l’opération a été reconduite en 2011 (PSII) et 2012 (PSIII). Suite aux productions réalisées...
Tipo: Text Palavras-chave: Mortalités; Crassostrea gigas; Huîtres creuses; Triploïde R; Sélection Génétique.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00143/25412/23563.pdf
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Niveau de ploïdie des huîtres des bassins de captage de Marennes Oléron et Arcachon (Campagne biovigilance 2007) ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Grouhel, Stephanie; Cantin, Christian; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
The monitoring of spat ploidy collected in the two main collection basins-Marennes Oléron and Arcachon-was realised through flow cytometry. Natural spat samples were collected on 3 sites in each basin and a total of 1 002 animals were analysed. Based on our samples, the results concluded that no polyploid, triploid or tetraploid animals were collected in the two investigated basins. These results comply with our provisions and do not bring any reason for a change in the practices used in triploid oyster culture. However, complementary studies on triploid residual gametogenesis, the nature of their gametes and that of their offsprings will have to be continued in order to fine-tune the estimates of the parameters on which the modeling scenarii of the...
Tipo: Text Palavras-chave: Reproduction; Captage; Arcachon; Marennes Oléron; Génétique; Crassotrea gigas; Huîtres; Naissain; Ploïde.
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/rapport-3905.pdf
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MYTILOBS Campagne 2018 - 2019, Réseau d'observation des moules d'élevage sur la côte Atlantique et dans la Manche ArchiMer
Normand, Julien; Benabdelmouna, Abdellah; Louis, Wilfried; Grizon, James.
La campagne 2018-2019 est la sixième campagne consécutive du MYTILOBS après stabilisation des procédures et des protocoles. Au cours de cette campagne, une action supplémentaire visant à caractériser la qualité cyto-génétique des cheptels a été adossée au réseau. Le suivi des 2 points de Roulières et de Boyard a dû être abandonné, et un lot de moules de 2 ans a été ajouté au cheptel sentinelle pour le suivi des mortalités qui l’ont affecté. Les résultats de l’action d’observation mettent en évidence des mortalités toujours très présentes sur les sites du réseau qui avaient été les plus affectés au cours des années précédentes (principalement, la Baie de Bourgneuf et les secteurs d’élevage des Pertuis Charentais). La croissance des moules s’est avérée...
Tipo: Text Palavras-chave: Moules; Mortalités; Observation; Variation spatio temporelle.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00653/76490/77570.pdf
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Mortalités de moules bleues dans les secteurs mytilicoles : description et étude des facteurs liés, action – MORBLEU-2018 ArchiMer
Pepin, Jean-francois; Benabdelmouna, Abdellah; Bierne, Nicolas; Chasselin, Leo; Degremont, Lionel; Guesdon, Stephane; Lamy, Jean-baptiste; Le Moine, Olivier; Normand, Julien; Robert, Stephane; Soletchnik, Patrick.
Depuis 2014, des épisodes de mortalité anormale affectent les cheptels mytilicoles tant adultes que juvéniles. Dès l’année 2015, une étude spécifique cofinancée par la DPMA et réalisée par l’Ifremer a été initiée, l’action de recherche MORBLEU (Mortalité des moules Bleues). Les années 2015- 2017 ont permis de dégager des éléments de connaissance et des pistes relatifs aux facteurs biotiques et abiotiques qui semblent intervenir dans le phénomène de hausse de mortalité des moules depuis 2014. Pour l’année 2018, les actions d’observation et de suivis du milieu et des moules ont été fortement réduites et trois axes principaux ont été poursuivis : i) l’étude de la relation entre l’évolution des équilibres microbiens planctoniques et l’apparition de mortalités...
Tipo: Text
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00588/70056/67999.pdf
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Ostreid herpesvirus type 1 replication and host response in adult Pacific oysters, Crassostrea gigas ArchiMer
Segarra, Amelie; Baillon, Laury; Tourbiez, Delphine; Benabdelmouna, Abdellah; Faury, Nicole; Bourgougnon, Nathalie; Renault, Tristan.
Since 2008, massive mortality outbreaks associated with OsHV-1 detection have been reported in Crassostrea gigas spat and juveniles in several countries. Nevertheless, adult oysters do not demonstrate mortality in the field related to OsHV-1 detection and were thus assumed to be more resistant to viral infection. Determining how virus and adult oyster interact is a major goal in understanding why mortality events are not reported among adult Pacific oysters. Dual transcriptomics of virus-host interactions were explored by real-time PCR in adult oysters after a virus injection. Thirty-nine viral genes and five host genes including MyD88, IFI44, IkB2, IAP and Gly were measured at 0.5, 10, 26, 72 and 144 hours post infection (hpi). No viral RNA among the 39...
Tipo: Text
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00213/32414/30887.pdf
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