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| Registros recuperados: 57 | |
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| Suquet, Marc; Agogue, Julie; Brizard, Raphael; Haffray, Pierrick; Labbe, Catherine; Le Coz, Jean-rene; Pepin, Jean-francois; Rault, Paul; Saulnier, Denis. |
| Ce rapport fait état d'une étude réalisée au laboratoire de Génétique et Pathologie de l'IFREMER dans le cadre de l'analyse d'épisodes de mortalité anormale survenue en écloserie privée de crevettes pénéides. Plusieurs hypothèses ont été avancées. La présence de Vibrio harveyi a amené à constituer une collection de 40 souches à partir desquelles une identification bactériologique a été effectuée. Elle montre en effet une dominance de souches appartenant à un groupe homogène de Vibrio harveyi. La technique de ribotypage (digestion d'ADN génomique, transfert de Southem-blot et hybridation avec une sonde spécifique) est alors mise en place. Plusieurs difficultés techniques ont ralenti l'analyse et n'ont donc pas permis d'avoir des résultats assez avancés pour... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Huître creuse; Crassostrea gigas; Tétraploïdes; Sperme; Conservation; Diagnostic zoo-sanitaire; Flore bactérienne; Herpès virus.. |
| Ano: 2007 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00304/41554/40762.pdf |
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| Coeurdacier, Jean-luc; Breuil, Gilles; Pepin, Jean-francois; Mouchel, Olivier; Fauvel, Christian; Laporte, Florent; Thiery, Richard; Castric, J; Raymond, Jean-christophe; Baudin Laurencin, Félix. |
| Ce rapport clôture une collaboration, entreprise courant 97, entre l’Agence Nationale pour la Valorisation de la Recherche (ANVAR), l’Agence Française de Sécurité Sanitaire des Aliments(AFSSA), le Syndicat National des Aquaculteurs Marins (SFAM) et l’Institut Français de Recherche pour l’Exploitation de la Mer (IFREMER). Deux lignées de nodavirus infectant le bar ont été mises en évidence avec une pathogénie variable selon l'âge et les facteurs extérieurs. Ce virus s’est montré d’une résistance exceptionnelle aux facteurs tant physiques que chimiques. Les diagnostics existants ont été adaptés ou réabordés sous un angle différent. Une étude épidémiologique a été réalisée chez les producteurs. La vaccination par peptides synthétiques a permis de sélectionner... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2002 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00167/27874/26120.pdf |
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| Cochennec-laureau, Nathalie; Baud, Jean-pierre; Pepin, Jean-francois; Benabdelmouna, Abdellah; Soletchnik, Patrick; Lupo, Coralie; Garcia, Celine; Arzul, Isabelle; Boudry, Pierre; Huvet, Arnaud; Pernet, Fabrice; Bachere, Evelyne; Bedier, Edouard; Petton, Bruno; Gaussem, Florian; Stanisiere, Jean-yves; Degremont, Lionel. |
| Depuis 2008, la filière ostréicole française doit faire face à des surmortalités exceptionnelles des naissains d’huîtres creuses, Crassostrea gigas, (huîtres de moins d’un an) comprises entre 60 et 90% dans tous les sites d’élevage. Des cas de mortalité similaires ont été décrits en Irlande, dans les îles anglo-normandes, au Portugal en 2009 et au Royaume-Uni en 2010. Récemment deux épisodes de mortalité, associés à la présence d’un virus OsHV1 μvar (ou un variant très proche) ont été également décrits en Nouvelle Zélande (décembre 2010) et en Australie (janvier 2011) soulignant la vulnérabilité de la filière ostréicole dans le monde. L’objectif de ce document est de faire un point sur les recherches menées depuis l’apparition de ce phénomène et de... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2011 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14423/11719.pdf |
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| Guesdon, Stephane; Travers, Marie-agnes; Hervio Heath, Dominique; Derrien, Annick; Genauzeau, Sylvie; Schmitt, Anne; Quintric, Laure; Leroi, Laura; Pepin, Jean-francois. |
| Since the spring of 2014, the mussel farming of Charente-Maritime and Vendée (French Atlantic coast) has experienced an unprecedented crisis. Mass mortality events of blue mussel (M. edulis) have affected livestock areas, decimating up to 100% of production in some farming areas. Investigation for infectious agents in moribund mussels revealed presence of bacteria capable of inducing mortalities. In this context, the MORBLEU research project (DPMA-Ifremer agreement) was initiated to explore potentially aggravating factors, associated or correlated with mortality of mussels. The aim of the present study is to support the hypothesis that these mortality episodes can be linked to an evolution of microbial communities. Based on historical data from Ifremer... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2017 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00415/52696/53566.pdf |
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| Segarra, Amelie; Faury, Nicole; Haffner, Philippe; Pepin, Jean-francois; Tourbiez, Delphine; Trancart, Suzanne; Travers, Marie-agnes; Renault, Tristan. |
| Le premier cas d'infection à virus de type herpès a été rapporté en 1972, aux Etats Unis, chez l'huître américaine, Crassostrea virginica (Farley et al, 1972). A partir de 1991, des mortalités massives associées à la détection de virus de type herpes ont été observées chez plusieurs espèces de bivalves marins, à différents stades de développement (essentiellement chez les larves et le naissain) et dans différentes régions du monde. Sur la base d’observation en microscopie électronique à transmission, ces virus présentaient des caractéristiques morphologiques identiques à celles des Herpesvirus (Roizman, 1982). Les connaissances acquises concernant la taille, la structure et le séquençage du génome d’un virus infectant les larves d’huîtres creuses en... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Herpès virus OsHV-1; Expression gènes; Huître creuse; Crassostrea gigas. |
| Ano: 2012 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00195/30627/29076.pdf |
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| Pepin, Jean-francois; Riou, Antoine; Renault, Tristan. |
| Herpes and herpes-like virus infections have been reported in various marine mollusc species associated with high mortality rates. Following the characterisation and genome sequencing of ostreid herpesvirus 1 (OsHV-1), specific diagnostic tools have been developed based on conventional PCR techniques or in situ hybridisation. We have now developed a real-time PCR assay for rapid, sensitive and quantitative detection of OsHV-1, and compared it with a conventional PCR technique described previously. The new assay utilised SYBR® Green chemistry with specific primers C9/C10 targeting the C region. The melt curve analysis of OsHV-1 DNA or DNA extracted from infected material showed only one melting temperature peak (75.75 ± 0.1 °C). The assay had a detection... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: SYBR® Green; Real time PCR; Crassostrea gigas; Ostreid herpesvirus 1; Herpesvirus. |
| Ano: 2008 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/publication-3951.pdf |
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| Breuil, Gilles; Mouchel, Olivier; Fauvel, Christian; Pepin, Jean-francois. |
| Reproduction of nodavirus disease was performed by experimental infection of sea bass eggs during fertilization or at larval stage 4 with 2 genetically distinguishable nodavirus strains (Sb1 and Sb2) isolated from sea bass collected along the Atlantic and Mediterranean French coast. The pathogenicity of the virus strains was assigned after detection of the virus by ELISA and immunohistochemistry (IHC). The Atlantic (Sb1) strain was more pathogenic than the Mediterranean (Sb2) strain during the fertilization step whilst both strains were pathogenic following experimental exposure of 4 d old larvae. Virus lesions developed in the brain 4 to 6 d following experimental exposure. Experimental ELISA proved very sensitive for detecting the nodavirus in Sb1 or Sb2... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: ELISA; Nodavirus; Fish encephalopathy. |
| Ano: 2001 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/publication-814.pdf |
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| Pepin, Jean-francois. |
| Depuis 2014, des épisodes de mortalité massive notamment en Charente-Maritime et en Vendée, ont été rapportés sur la « moule bleue » élevée principalement sur bouchots (pieux en chêne plantés verticalement) ou sur filières (cordes verticales sous flotteurs). Ces épisodes affectent significativement l’économie des entreprises mytilicoles. Plusieurs hypothèses ont été émises pour expliquer ce phénomène : agents pathogènes, contamination environnementale notamment par des pesticides, «asphyxie» des moules par excès de matière en suspension, réchauffement climatique, acidificationdes eaux, baisse des ressources alimentaires, ou stress physiologique. etc.... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2019 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00503/61504/65336.pdf |
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| Nicolas, Jean-louis; Renault, Tristan; Gagnaire, Beatrice; Garcia, Celine; Le Roux, F; Miossec, Laurence; Pepin, Jean-francois; Saulnier, Denis. |
| L'un des objectifs principaux des travaux en pathologie des mollusques est d'identifier et d'étudier des agents infectieux capables d'induire des maladies et des mortalités chez les coquillages, en particulier, chez I'huître creuse, Crassostrea gigas, espèce principalement exploitée en France. Ces travaux semblent d'autant plus indispensables qu'il n'existait pas, jusqu'à ces dernières années, de maladies identifiées chez I'huître creuse en Europe excepté le virus herpès suspecté dès 1995 de provoquer des mortalités de naissain (Renault et al, 1995). Les principales maladies des espèces proches sont dues à des parasites comme Haplosporidium nelsoni (Ford et Heskin, 1987) et Perkinsus marinus Olivier et al, 1 998) pour Crassostrea virginica, Marteilia... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2006 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00304/41535/40743.pdf |
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| Pernet, Fabrice; Barret, Jean; Le Gall, Patrik; Corporeau, Charlotte; Degremont, Lionel; Lagarde, Franck; Pepin, Jean-francois; Keck, Nicolas. |
| Experiments were conducted to investigate the effects of farming sites, seeding date, age of oysters, ploidy level and rearing structures on mortality, pathogens and energetic reserves of oysters Crassostrea gigas. Mortality of oysters coincided with infections involving, primarily, the ostreid herpesvirus OsHV-1 and, secondarily, bacteria of the group Vibrio splendidus, when seawater temperature was between 17 and 24°C. Mortality started in early May and lasted until late September, with an interruption in July and August when seawater temperatures rose above 24°C. Mortality varied with farming site: oysters maintained in the open Mediterranean Sea showed no mortality and OsHV-1 was occasionally detected at a low level only, while oysters maintained in... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Pacific oyster; Mortality; Disease; Farming practices; Hydrodynamics; Energetic. |
| Ano: 2012 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00086/19739/17379.pdf |
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| Pepin, Jean-francois; Solliec, Gaelle; Vigneron, Vassilia; Thebault, Anne; Lamothe, Julien; Renault, Tristan. |
| The presence of a herpes-type virus has been demonstrated in various species of marine shellfish (bivalves and gastropoda) throughout different regions of the world (Europe, North and South America, Asia, Australia), and is frequently associated with high mortality levels. Nevertheless, apart from the sanitary monitoring in mollusc farming, very little data is available about the detection of this type of virus in the natural populations of bivalves and about the persistence of such viruses in sea water. Various diagnostic tools have been developed in order to detect the oyster herpes virus (Ostreid herpesvirus, OsHV). The presence of this virus has been looked for by PCR in marine water samples coming from fattening ponds, in order to precise the natural... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Levures; Eau de mer; Diagnostic; Huîtres; Mollusques; OsHV; Herpèsvirus. |
| Ano: 2008 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/acte-3716.pdf |
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| Guichard, Benjamin; Francois, Cyrille; Joly, Jean-pierre; Garcia, Celine; Saulnier, Denis; Pepin, Jean-francois; Arzul, Isabelle; Omnes, Emmanuelle; Tourbiez, Delphine; Faury, Nicole; Haffner, Philippe; Chollet, Bruno; Robert, Maeva; Renault, Tristan; Rauflet, Fabienne; Le Gagneur, Eric; Ropert, Michel; Mouillard, Gilbert; Gerla, Daniel; Annezo, Jean-pierre; Le Gal, Dominique; Langlade, Aime; Bedier, Edouard; Brerette, Stéphane; Chabirand, Jean-michel; Grizon, James; Robert, Stephane; Courtois, Olivier; Rumebe, Myriam; Cantin, Christian. |
| Créé en 1992, le réseau REPAMO (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s’inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l’introduction et la propagation d’organismes pathogènes, en particulier ceux à déclaration obligatoire et de surveiller l’évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font parties des missions institutionnelles de l’IFREMER. La surveillance assurée par le réseau vise en premier lieu les infections à déclaration obligatoire présentes en France, la bonamiose à Bonamia ostreae chez l’huître plate Ostrea edulis et la marteiliose à Marteilia refringens chez... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Réseau; Surveillance; Pathologie; Mollusques; Coquillages; Santé; Surveillance. |
| Ano: 2011 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00059/17050/14599.pdf |
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| Pepin, Jean-francois; Riou, Antoine; Renault, Tristan. |
| Herpes and herpes-like virus infections have been reported in various marine mollusc species associated with high mortality rates. Following the characterisation and genome sequencing of ostreid herpesvirus 1 (OsHV-1), specific diagnostic tools have been developed based on conventional PCR techniques or in situ hybridisation. We have now developed a real-time PCR assay for rapid, sensitive and quantitative detection of OsHV-1, and compared it with a conventional PCR technique described previously. The new assay utilised SYBR® Green chemistry with specific primers C9/C10 targeting the C region, which is present in two copies in the OsHV-1 genome and encodes two proteins of unknown function. The assay was applied successfully to rapid diagnosis (100 minutes)... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Crassostrea gigas; PCR; Oyster; OsHV 1; Detection; Herpes virus 1. |
| Ano: 2007 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/acte-3653.pdf |
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| Degremont, Lionel; Lamy, Jean-baptiste; Pepin, Jean-francois; Travers, Marie-agnes; Renault, Tristan. |
| The Pacific oyster, Crassostrea gigas, is the most important commercial oyster species cultivated in the world. Meanwhile, the ostreid herpesvirus 1 (OsHV-1) is one of the major pathogens affecting the Pacific oyster, and numerous mortality outbreaks related to this pathogen are now reported worldwide. To assess the genetic basis of resistance to OsHV-1 infection in spat C. gigas and to facilitate breeding programs for such a trait, if any exist, we compared the mortality of half- and full-sib families using three field methods and a controlled challenge by OsHV-1 in the laboratory. In the field, three methods were tested: (A) one family per bag; (B) one family per small soft mesh bag and all families inside one bag; (C) same as the previous methods but... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2015 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00269/38066/36178.pdf |
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| Pepin, Jean-francois; Robert, Stephane; Soletchnik, Patrick; Seugnet, Jean-luc; Morin, Dimitri; Chabirand, Jean-michel; Costes, Louis; Geairon, Philippe; Grizon, James. |
| In France, today, more than 80% of farmed blue mussel seed collection is based on larvae fixation on collector ropes. Mussels are traditionally grown on bouchot, which are rows of wooden poles placed perpendicularly to the shore, stuck in the ground within the gently sloping intertidal strip. Mussels are transferred either as seed attached on collecting ropes or as juveniles placed in net sockings and then wound up around the poles or suspended to longlines, where they will fatten and grow (Garen et al., 2004). In order to optimize seed collection and to limit unwanted biofouling on ropes, mussel growers local organizations identify best timing of seed collector ropes deployment by monitoring the number and size of planktonic mussel larvae from water... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2018 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00455/56620/58332.pdf |
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| Cochennec-laureau, Nathalie; Baud, Jean-pierre; Bedier, Edouard; Boudry, Pierre; Huvet, Arnaud; Nicolas, Jean-louis; Pepin, Jean-francois; Petton, Bruno. |
| Ce bilan comprend deux parties : la première est dédiée à une synthèse des travaux présentés lors des journées « Surmortalités des huîtres creuses, Crassostrea gigas » les 8 et 9 décembre 2009 et, la seconde partie, à une proposition d'un projet de recherche spécifique 2010-2012 en complément des propositions de « sortie de crise ». Contexte Les mortalités estivales de l'huître creuse, Crassostrea gigas, sont décrites depuis une vingtaine d'années en France mais également au Japon, en Corée, aux USA et en Australie. Ces phénomènes ou « syndrome des mortalités estivales » ont fait l'objet d'une étude pluridisciplinaire en France entre 2001 et 2006 (Défi MOREST). Toutefois, en 2008 et 2009, l'ostréiculture française a du faire face à deux épisodes de... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2010 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2010/acte-7393.pdf |
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| Registros recuperados: 57 | |
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