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| Registros recuperados: 52 | |
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| Neaud-masson, Nadine; Lefebvre, Alain; Belin, Catherine; Soudant, Dominique. |
| This deliverable contains the work that was carried out in 2014 for the FlowCAM / ZooPhytoImage tool actually becomes a usable operational tool in the REPHY, and as such, can provide results supplying the assessments of WFD phytoplankton indicator. This deliverable is complementary to the deliverable 1, provided for the same action, entitled « Evolutive version of the operational tool for digitization and semi-automated analysis of phytoplankton images, using the FlowCAM device and the Zoo/PhytoImage software. New perspectives » This deliverable has five parts whose content is summarized below. 1. Work done for operational implementation in 2014 under the REPHY. These tasks affect either the scanning operations of the phytoplankton images by FlowCAM, or... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: FlowCAM; ZooPhytoImage; REPHY; Observation phytoplancton; Set d’apprentissage; Littoral français.; FlowCAM; ZooPhytoImage; REPHY; Phytoplankton observation; Training set; French coast.. |
| Ano: 2015 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00361/47262/47227.pdf |
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| Derolez, Valerie; Soudant, Dominique; Richard, Marion; Lagarde, Franck; Chiantella, Claude; Malet, Nathalie. |
| Thau lagoon (south of France) is one of the largest Mediterranean coastal lagoons (Fig. 1). It supports many ecosystem services such as shellfish farming, whose production reaches 10 000 tons a year. Since the 1960s, the increase of anthropogenic inputs, linked to the exponential growth of human population (Fig. 2), have resulted in contaminations of shellfish farming and the eutrophication of Thau lagoon, with significant ecological and socio-economic impacts (Mongruel et al. 2013). Since the 1970s and the late 2000s, the considerable efforts made to water depuration systems on the watershed have induced a significant decrease of nutrient inputs (Fig. 2), and have gradually led to a good environmental status of the lagoon according to the Water Framework... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2017 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00406/51794/52394.pdf |
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| Soudant, Dominique; Belin, Catherine. |
| La Directive Cadre sur l’Eau (DCE 2000/60/CE) du 23 octobre 2000 définit un cadre pour la gestion et la protection des eaux par grand bassin hydrographique au plan européen. Elle fixe un objectif de bon état écologique et chimique pour les eaux superficielles. La Directive s’appuie sur l’évaluation d’un certain nombre d’éléments de qualité pour définir l’état global d’une masse d’eau. La liste des éléments de qualité à prendre en compte varie selon la catégorie d’eau superficielle. Le phytoplancton figure parmi les éléments de qualité biologiques retenus pour la classification de l'état écologique des masses d’eaux littorales, c’est à dire les eaux côtières et de transition. Il est évalué à partir de trois composantes : biomasse, abondance et composition... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2009 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00015/12586/9461.pdf |
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| Daniel, Anne; Soudant, Dominique. |
| Le bilan d'oxygène figure parmi les éléments de qualités physico-chimiques retenus par la DCE pour la classification de l'état écologique des masses d'eaux littorales. Le présent document est un premier essai d'évaluation réalisées sur les masses d'eaux retenues au titre du contrôle de surveillance, à partir des données disponibles dans Quadrige² sur la période 2003-2008. |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2009 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00019/12992/9967.pdf |
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| Daniel, Anne; Soudant, Dominique. |
| Les nutriments figurent parmi les éléments de qualité physico-chimiques retenus par la DCE pour la classification de l'état écologique des masses d’eaux littorales. Le présent document est un premier essai d’évaluation réalisée sur les masses d’eaux retenues au titre du contrôle de surveillance (hors lagunes méditerranéennes), à partir des données disponibles dans Quadrige² sur la période 2003-2008. |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2010 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00019/12991/9966.pdf |
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| Ratmaya, Widya; Soudant, Dominique; Salmon-monviola, Jordy; Plus, Martin; Cochennec-laureau, Nathalie; Goubert, Evelyne; Andrieux, Francoise; Barillé, Laurent; Souchu, Philippe. |
| The evolution of eutrophication (i.e., phytoplankton biomass) during recent decades was examined in the coastal waters of Vilaine Bay (VB, France) in relation to those in their main external nutrient sources, the Loire and Vilaine Rivers. Dynamic Linear Models, corroborated by the Mann-Kendall test, were used to study long-term trends and seasonality of dissolved inorganic nutrient and chlorophyll a concentrations (Chl a) in rivers and coastal waters between 1980 and 2013. The reduction in dissolved riverine inorganic phosphorus concentrations (DIP) from the early 1990s led to the decrease in their Chl a levels. However, dissolved inorganic nitrogen concentrations (DIN) decreased only slightly in the Vilaine and actually increased in the Loire, especially... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2019 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00461/57244/59248.pdf |
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| Soudant, Dominique. |
| L'objectif de ce travail était de mettre en place un outil mathématique permettant de prévoir les concentrations en Dinophysis cf. acuminata, micro-algue toxique. Nous avons décidé d'utiliser des méthodes dynamiques de prévision bayésienne : modèles polynomiaux du premier, second et troisième ordre, modèle polynomial du premier ordre avec intervention, et modèle de régression multilinéaire. Les modèles polynomiaux du premier, second et troisième ordre se sont avérés inadaptés. Le modèle de régression multilinéaire a été testé avec les variables concentrations en phosphate (PO4) et en nitrate (NO3). Ce modèle est insatisfaisant du fait de l'inconstance des relations entre la concentration en Dinophysis cf. acuminata et les régresseurs. Le modèle polynomial... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Modèle dynamique bayésien; Prévision; Séries chronologiques; Dinophysis; Antifer. |
| Ano: 1993 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00430/54178/55519.pdf |
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| Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Barbier, Claire; Maurer, Daniele; Gouriou, Laure; Plus, Martin; Rigouin, Loic; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Trut, Gilles; Oger-jeanneret, Helene; Derrien, Annick; Genauzeau, Sylvie; Schmitt, Anne; Charpentier, Gabriel; Seugnet, Jean-luc; Grizon, James; Geairon, Philippe; Guilpain, Patrice; Thomas, Gerard; Guesdon, Stephane; Chabirand, Jean-michel; Soudant, Dominique; Lamoureux, Alice; Llevot, Gerard; Beaugrand, Philippe; Michel, Valérie; Petrau, Christian; Bariou, Jean; Landier, Pascal; Miguel, Valérie. |
| Ce rapport rend compte des résultats acquis entre 2007 et 2012 sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton, dans le cadre des réseaux REPHY et ARCHYD (pour les points du Bassin d’Arcachon), et celui du contrôle de surveillance des masses d'eau du district Adour-Garonne qui ne faisaient pas l’objet de suivi avant la mise en œuvre de la DCE. Ce document contient des résultats concernant les éléments de qualité physico-chimique (oxygène dissous et nutriments pour les deux types de masses d’eau, température et transparence pour les masses d’eau côtières exclusivement) selon des méthodes présentées dans quatre documents (Daniel, 2009 a et b ; Daniel et Soudant, 2010, 2011), qui sont rapportées dans une annexe de ce rapport. Sont également inclues dans... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2013 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00152/26281/24364.pdf |
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| Belin, Catherine; Soudant, Dominique; Amzil, Zouher. |
| In France, REPHY (Observation and Surveillance Network for Phytoplankton and Hydrology in coastal waters) and REPHYTOX (Monitoring Network for Phycotoxins in marine organisms) have been contributing to long-term time series on ocean health for more than 30 years. The aim of this paper is to describe these networks and to highlight their key results. Over the last 20 years, phytoplankton flora analysis on French coasts from the Channel to Mediterranean has shown that the five “emblematic” taxa are Chaetoceros, Skeletonema, Cryptophyceae, Leptocylindrus and Pseudo-nitzschia. The latter, together with the taxa of interest Dinophysis + Phalacroma, Alexandrium, and Karenia, have been consistently recorded along the entire French coastline. However, when taking... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Monitoring network; Phytoplankton time-series; Dominant species; DST-Diarrheic; Shellfish Toxins; PST-Paralytic Shellfish Toxins; AST-Amnesic Shellfish Toxins. |
| Ano: 2021 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00617/72948/72699.pdf |
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| Daniel, Anne; Soudant, Dominique. |
| La salinité figure parmi les éléments de qualité physico-chimiques retenus par la DCE pour la classification de l'état écologique des masses d’eaux littorales. Le présent document est un premier essai d’évaluation réalisée sur les masses d’eaux retenues au titre du contrôle de surveillance, à partir des données disponibles dans Quadrige² sur la période 2004-2009. |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2011 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00037/14779/12089.pdf |
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| Derolez, Valerie; Bec, Béatrice; Munaron, Dominique; Foucault, Elodie; Fiandrino, Annie; Ouisse, Vincent; Messiaen, Gregory; Hatey, Elise; Connes, Coralie; Soudant, Dominique; Brun, Melanie; Fortune, Martine; Mortreux, Serge; Serais, Ophelie; Crottier, Anais; Malet, Nathalie. |
| Cette étude est réalisée dans le cadre du projet OBSLAG (OBServatoire des LAGunes) et porte sur les 10 masses d’eau lagunaires méditerranéennes situées à l’aval des cours d’eau suivis depuis 2015 par le « réseau flux » de l'Agence de l’Eau Rhône Méditerranée Corse. Le rapport correspond aux actions réalisées en 2018 dans le cadre du volet « eutrophisation » d’OBSLAG, répondant aux objectifs suivants : (1) réaliser un suivi estival en 2018 du phytoplancton et de la physico-chimie de l’eau et évaluer l’état DCE de ces compartiments pour la période 2013-2018 sur les 10 masses d’eau lagunaires du suivi « réseau flux », regroupant 13 lagunes poly-euhalines. Ce suivi permet de renforcer la fréquence des suivis DCE sur la colonne d’eau et le phytoplancton, qui ne... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Directive Cadre sur l’Eau (DCE); Lagunes; Masses d’eau de transition; Eutrophisation; Phytoplancton; Confiance; Précision; Tendance.. |
| Ano: 2019 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00507/61862/65959.pdf |
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| Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Meteigner, Claire; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Rigouin, Loic; Gouriou, Laure; Lissardy, Muriel; Sanchez, Florence; De Casamajor, Marie-noelle; Morandeau, Gilles; Ganthy, Florian; Trut, Gilles; Trut, Florence; Caill-milly, Nathalie; Antajan, Elvire; Guesdon, Stephane; Chabirand, Jean-michel; Morin, Dimitri; Genauzeau, Sylvie; Piraud, Aude; Geairon, Philippe; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Thomas, Gerard; Bruneau, Audrey; Soudant, Dominique; Gautier, Emeric; Michel, Valérie; Dupin, Michel. |
| Ce rapport rend compte des résultats sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton acquis dans le cadre de la DCE (contrôle de surveillance entre 2014 et 2019), dans les masses d’eau côtières et de transition du bassin Adour-Garonne |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Directive Cadre sur l’Eau; Hydrologie; Phytoplancton. |
| Ano: 2020 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00653/76529/77618.pdf |
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| Soudant, Dominique. |
| Le Dinophysis est une microalgue toxique à l’origine d’epidémies diarrhéiques. En dépit de nombreuses études, l’écologie et la biologie de ce genre phytoplanctonique restent mal connues. Afin de déterminer les conditions d’apparition de Dinophysis cf. acuminata sur le site d’Antifer (Normandie, France), des prélèvements d’eau de mer ont été effectués quasi-journellement pendant les périodes estivales des années 1987 à 1993. Les séries temporelles résultantes concernent la concentration de la microalgue et les facteurs chimiques, physiques et météorologiques. L’analyse de ces données à l’aide d’outils sta- tistiques classiques (e.g. régression) s’est avérée difficile (e.g. instabilité temporelle des résultats). Une caractéristique commune de ces méthodes... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Modélisation; Statistique; Dynamique; Séries temporelles; Bayésien; Dinophysis; Baie de Seine. |
| Ano: 1997 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00015/12576/9446.pdf |
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| Hernandez Farinas, Tania; Bacher, Cedric; Soudant, Dominique; Belin, Catherine; Barille, Laurent. |
| Relating environmental factors to species occurrence is a fundamental step in a better understanding of the community structure, the spatial and temporal dynamics of populations and how species may respond to environmental changes. In this paper, we used phytoplankton occurrence data, from a French national phytoplankton monitoring network, and environmental variables with the aim of characterizing the realized ecological niches of phytoplankton groups. We selected 35 phytoplankton taxa representing the most important taxa in terms of occurrence frequency and abundance along the French coast of the eastern English Channel, the Southern Bight of the North Sea and the Atlantic Ocean. We show that environmental variables such as nutrient concentration, water... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Phytoplankton; Environment; Niche position; Tolerance; Kernel density; Outlying mean index. |
| Ano: 2015 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00255/36627/35263.pdf |
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| Soudant, Dominique; Belin, Catherine. |
| La Directive Cadre sur l’Eau (DCE 2000/60/CE) du 23 octobre 2000 définit un cadre pour la gestion et la protection des eaux par grand bassin hydrographique au plan européen. Elle fixe un objectif de bon état écologique et chimique pour les eaux superficielles. La Directive s’appuie sur l’évaluation d’un certain nombre d’éléments de qualité pour définir l’état global d’une masse d’eau. La liste des éléments de qualité à prendre en compte varie selon la catégorie d’eau superficielle. Le phytoplancton figure parmi les éléments de qualité biologiques retenus pour la classification de l'état écologique des masses d’eaux littorales, c’est à dire les eaux côtières et de transition. Il est évalué à partir de trois composantes : biomasse, abondance et composition... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2009 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00015/12589/9465.pdf |
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| Derolez, Valerie; Soudant, Dominique; Fiandrino, Annie; Cesmat, Ludovic; Serais, Ophelie. |
| Aims The Thau lagoon shellfish are regularly impacted by microbial pollution of faecal origin, which cause European health standards to be exceeded and closure of the shellfish harvest. The aims of this study were to investigate the impact of weather and hydrological conditions on Escherichia coli (E. coli) accumulation factor (AF) between water and oysters and to evaluate the relevance of the use of this ratio for the purpose of sanitary risk assessment. Methods and results Water and oysters (Crassostrea gigas) were sampled simultaneously in situ during 18 months in periods of dry weather and after rainfall events. Shellfish sanitary thresholds were exceeded in both periods. The E. coli AFs measured after rainfall (median = 6) were lower than in dry... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: E; Coli; Environmental health; Food safety; Shellfish; Water quality. |
| Ano: 2013 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00119/23049/22503.pdf |
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| Registros recuperados: 52 | |
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