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Especies novedosas de champiñones (Agaricus) con propiedades funcionales antioxidantes y antimicrobianas, aisladas de zonas rurales de México. Colegio de Postgraduados
Cruz Romero, Elizabeth.
México cuenta con una gran diversidad biológica, sin embargo, poco se han aprovechado los recursos genéticos nativos para la producción comercial de hongos comestibles. Los champiñones, son los hongos comestibles más comercializados en el mercado mexicano para lo cual se usan cepas extranjeras. La presente investigación se inició con el estudio preliminar de 15 cepas nativas de México de Agaricus spp. Dado que la investigación requería de biomasa micelial, al final solo se trabajó con dos cepas de Agaricus spp. (CP-83 y CP-89). Al micelio de estas cepas se les determinaron antioxidantes y pruebas antimicrobianas. Estas pruebas se realizaron de macerados y extractos acuosos y etanólico. La prueba antimicrobiana se realizo con una cepa de E. coli (CPB-8). En...
Palavras-chave: Agaricus; Micelio; Cultivo de hongos comestibles; Antioxidantes; Antimicrobianos; E. coli; Agaricus mycelia; Cultivation of edible mushrooms; Antimicrobials; EDAR; Estrategias para el Desarrollo Agrícola Regional; Maestría; Antioxidants.
Ano: 2012 URL: http://hdl.handle.net/10521/675
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An improved system for competent cell preparation and high efficiency plasmid transformation using different Escherichia coli strains Electron. J. Biotechnol.
Tu,Zhiming; He,Guangyuan; Li,Kexiu X.; Chen,Mingjie J.; Chang,Junli; Chen,Ling; Yao,Qing; Liu,Dongping P.; Ye,Huan; Shi,Jiantao; Wu,Xuqian .
This paper describes an efficient bacterial transformation system that was established for the preparation of competent cells, plasmid preparation, and for the storage in bacterial stocks in our laboratory. Using this method, a number of different plasmids have been amplified for further experiments. Competent cells for bacterial transformation were prepared by the calcium chloride method with an optimum concentration of 75 mM. Three different strains of Escherichia coli that were tested are DH5α, TG1 and XL1 blue, and the most efficient strain being XL1 blue. The optimal optical density (OD600) range for competent cell preparation varied for each of the strains investigated, and for XL1 blue it was 0.15-0.45; for TG1 it was 0.2-0.5; and for...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Competent cells; E. coli; Plasmid; Storage; Transformation.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582005000100014
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New ammonia lyases and amine transaminases: Standardization of production process and preparation of immobilized biocatalysts Electron. J. Biotechnol.
Casablancas,Antoni; Cárdenas-Fernández,Max; Álvaro,Gregorio; Benaiges,Maria Dolors; Caminal,Glòria; Mas,Carles de; González,Glòria; López,Carmen; López-Santín,Josep.
Background: New enzymes for biotransformations can be obtained by different approaches including directed mutagenesis and in vitro evolution. These mutants have to be efficiently produced for laboratory research on bioreactions as well as for process development. In the framework of a European ERA-IB project, two different types of enzymes (ammonia lyases and aminotransferases) have been selected as biocatalysts for the synthesis of industrially relevant amines. New mutant enzymes have been obtained: a) aspartases able to recognize β-amino acids; b) ω-transaminases with improved activity. The objectives are to find out a common operational strategy applicable to different mutants expressed in E. coli with the same initial genetic...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Amine transaminases; Ammonia lyases; E. coli; Fed-batch; Immobilized biocatalysts.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582013000300004
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Human sulfatase transiently and functionally active expressed in E. coli K12 Electron. J. Biotechnol.
Poutou-Piñales,Raúl A; Vanegas Niño,Adriana; Landázuri,Patricia; Sáenz,Homero; Lareo,Leonardo; Echeverri Peña,Olga Yaneth; Barrera Avellaneda,Luis A.
The recombinant human iduronate 2-sulfate sulfatase (hrIDS) was transiently and functionally active expressed in E. coli K12. The enzyme activity (crude extract) at 100 ml and 400 ml oscillated between 0.25 and 10.58 nmol h-1 mg-1. The wide Western-blot peptide profile suggest that hrIDS is proteolitically processed “randomly” which agrees with the ultrafiltration assay in which the hrIDS activity was found in all fractions (<30kDa, 30-100kDa and >100kDa). No glycation sites were found by computer analysis of the hIDS sequence; discarding the possibility of marks for glycation and proteolytic processing.
Tipo: Journal article Palavras-chave: E. coli; Glycation; Human sulfatase; Transient expression.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582010000300005
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Sanitary quality of broiler litter reused REA
Vieira,Maria de F. A.; Tinoco,Ilda de F. F.; Santos,Bernadete M. dos; Inoue,Keles R. A.; Mendes,Múcio A. dos S. A..
ABSTRACT Considering the importance of the substrate to bedding in the poultry industry in Brazil, and the enormous pressure on environmental management as to the correct use and management of the waste generated by the production sector, this study aimed to analyze the effect of reuses of two types of litter on sanitary qualities and productive performance of broilers. The study was conducted with litter from 32 different broiler houses, two types of substrates and four cycles of reuses. The litter sanitary quality was verified by the identification of the presence of Escherichia coli and Salmonellaspp. and the incidence of footpad dermatitis. It was observed that the coffee hulls litter presented a reduction of 28.61 percentage points in the probability...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Salmonella spp.; E. coli; Footpad; Productive performance.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-69162015000500800
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Clustering of water bodies in unpolluted and polluted environments based on Escherichia coli phylogroup abundance using a simple interaction database Genet. Mol. Biol.
Stoppe,Nancy de Castro; Silva,Juliana Saragiotto; Torres,Tatiana Teixeira; Carlos,Camila; Hachich,Elayse Maria; Sato,Maria Inês Zanoli; Saraiva,Antonio Mauro; Ottoboni,Laura Maria Mariscal.
Different types of water bodies, including lakes, streams, and coastal marine waters, are often susceptible to fecal contamination from a range of point and nonpoint sources, and have been evaluated using fecal indicator microorganisms. The most commonly used fecal indicator is Escherichia coli, but traditional cultivation methods do not allow discrimination of the source of pollution. The use of triplex PCR offers an approach that is fast and inexpensive, and here enabled the identification of phylogroups. The phylogenetic distribution of E. coli subgroups isolated from water samples revealed higher frequencies of subgroups A1 and B2(3) in rivers impacted by human pollution sources, while subgroups D1 and D2 were associated with pristine sites, and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: E. coli; Phylogenetic groups; Pollution sources; Interaction networks; Social network analysis.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572014000500012
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicoles. Région Corse. Edition 2018 ArchiMer
Orsoni, Valerie.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel de la Région Corse. Il présente l’ensemble des résultats obtenus entre 2014 et 2017, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées : les étangs de la plaine orientale de la Corse.
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Région Corse.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00441/55305/56820.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole - Département d'Ille et Vilaine - Edition 2017 ArchiMer
Cheve, Julien; Le Noc, Sandrine.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique des zones de production conchylicoles (REMI) et du réseau d’observation de la contamination chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département de l’Ille-et-Vilaine (35). Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées.Pour la troisième année consécutive, les résultats du suivi microbiologique sont globalement bons dans le département d’Ille-et-Vilaine. Les alertes sanitaires ont été quasiment absentes, il n’y a eu qu’une alerte préventive qui n’a pas donné de...
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département 35..
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00388/49909/50481.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département du Finistère. Edition 2017 ArchiMer
Boulben, Sylviane.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département du Finistère. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité des zones de production de coquillages classées et l’évolution de leur qualité. Pour quelques zones, le classement en vigueur est discordant avec l’estimation de la qualité. En décembre 2016, l’arrêté préfectoral portant classement sanitaire des zones de production de coquillages vivants dans le Finistère a été révisé et a permis le classement de quatre zones B en A.
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; Classement sanitaire des zones de production conchylicole; Département du Finistère..
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00393/50403/51117.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de la Vendée (85). Edition 2020. ArchiMer
Gervais, Hugo; Gautier, Emeric; Grizon, James; Morin, Dimitri; Soletchnik, Patrick; Piquet, Jean-come; Bruneau, Audrey.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d'interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport décrit le programme annuel du département de la Vendée. Il présente l'ensemble des résultats obtenus sur la période 2017-2019, en particulier l'estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées.  
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Vendée (85); LERPC.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00632/74397/74099.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département : Charente-Maritime. Edition 2019 ArchiMer
Morin, Dimitri.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport décrit le programme annuel du département de la Charente-Maritime. Il présente l’ensemble des résultats obtenus sur la période 2016-2018, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées.
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Charente Maritime (17); LERPC..
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00487/59911/63097.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conhylicoles. Département du Finistère. Edition 2018 ArchiMer
Boulben, Sylviane.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département du Finistère. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité des zones de production de coquillages classées et l’évolution de leur qualité. En 2017, pour quelques zones, le classement en vigueur est discordant avec l’estimation de la qualité. C’est le cas, pour la qualité microbiologique des fouisseurs de l’anse de Penfoul, les niveaux en plomb des moules en rade de Brest, partie sud-est qui sont très mauvais.
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; Classement sanitaire des zones de production conchylicole; Département du Finistère.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00441/55269/56763.pdf
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Etude sanitaire de la zone 22.02.10 – Baie de la Fresnaie Groupe III. Rapport d’étude. Département des Côtes d’Armor ArchiMer
Cheve, Julien; Le Noc, Sandrine.
Ce rapport final présente l’évaluation de la qualité microbiologique et chimique de la zone 22.02.10 (baie de la Fresnaie) pour le groupe III en vue de sa sectorisation. L’étude s’est déroulée entre novembre 2015 et février 2017, avec l’obtention de 48 résultats microbiologiques (dénombrement des E. coli dans 100 g de CLI) en deux points : « Fresnaie f3 - 023-P- 004 » et « Fresnaie f4 - 023-P-005 » et la recherche de molécules chimiques (Pb, Hg, Cd, par kg de chair humide), au point « Baie de la Fresnaie - 023-P-014 ». Les résultats du suivi sanitaire ont confirmé les conclusions de l’étude de dossier et des anciennes données REMI. Il existe une différence de contamination entre les secteurs Est et Ouest de la zone de production conchylicole en baie de la...
Tipo: Text Palavras-chave: Etude sanitaire; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; Contaminants chimiques; Milieu marin; Qualité microbiologique et chimique des zones de production; Département 22; Côtes d’Armor; Baie de la Fresnaie; Groupe III.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00375/48586/48909.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole - Département des LANDES - Edition 2013 ArchiMer
Barbier, Claire; Auby, Isabelle.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département des Landes. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2010-2012. La qualité a pu être estimée pour la zone de production conchylicole. Suivant les seuils microbiologiques du règlement (CE) n° 854/2004, la zone suivie sur le Lac d’Hossegor est estimé de qualité B pour le groupe 3. L’étude des tendances met en évidence une augmentation de la contamination...
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département des Landes.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00151/26270/24354.pdf
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Journées Rémi des 23 et 24 novembre 1998 - Réseau de contrôle microbiologique (Rémi) et surveillance microbiologique ArchiMer
Catherine, Martial.
Ce document est un rapport de synthèse des présentations faites lors des journées REMI, tenues à Nantes les 23 et 24 novembre 1998. Les exposés de la première journée sont principalement destinés aux actions visant à améliorer le fonctionnement du réseau REMI. Ils concernent les sujets suivants : bilan de la mise en oeuvre du réseau de contrôle REMI en 1998 (nouvelle version), bilan de l'état d'avancement du plan qualité surveillance microbiologique et du programme Malthus (méthodologie, normalisation), approches préliminaires pour la détermination des fréquences d'échantillonnage en vue de la surveillance régulière des zones de production classées. La seconde journée est dédiée aux études conduites par les laboratoires côtiers, dont les procédures sont...
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; Réseau; Surveillance; Microbiologie; Quadrige; Assurance qualité; AFNOR; Impédancemétrie; Rejets agricoles; Station d'épuration; Bateaux de plaisance; Oiseaux; Huîtres; Moules; Tellines; Eaux littorales; Coliformes fécaux; E. coli; Streptocoques fécaux; Bactériophages.
Ano: 1999 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00040/15157/12493.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de la GIRONDE. Edition 2015 ArchiMer
Meteigner, Claire.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département de la Gironde. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2012-2014. La qualité a pu être estimée pour dix zones de production conchylicole. Suivant les seuils microbiologiques du règlement (CE) n° 854/2004, sur le Bassin d’Arcachon une zone suivie est estimée de qualité A pour le groupe 3, trois zones suivies sont estimées de qualité B pour le groupe 3 et...
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Gironde.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00275/38580/37104.pdf
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Modeling of Faecal Contamination in Water from Catchment to Shellfish Growing Area ArchiMer
Bougeard, Morgane; Le Saux, Jean-claude; Perenne, Nicolas; Le Guyader, Soizick; Pommepuy, Monique.
During rainstorms, watersheds can introduce large amounts of faecal pollution into the rivers and sea, leading to shellfish contamination. In this study, we assessed Escherichia coli fluxes from a catchment, and their impact on estuarine water quality, using two assembled models. For the catchment, the agro-hydrological model SWAT was implemented integrating land uses, soil, topography, rainfall and other climatic data on Daoulas watershed (France). Initially, the SWAT model was calibrated and validated for river flow rates, and results were found satisfactory. Subsequently, different faecal contamination sources were integrated into the model: point sources (WWTP discharges into rivers) and non-point sources (manure spreading on fields). During rainfall...
Tipo: Text Palavras-chave: Modeling; SWAT; MARS; E. coli; Shellfish; Catchment; Estuary.
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00066/17748/15270.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicoles . Départements des Bouches du Rhône, du Var et de la Haute Corse. Edition 2019 ArchiMer
Marco-miralles, Francoise; Brach-papa, Christophe.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI, ce rapport effectue un bilan national et décrit le programme annuel des départements des Bouches-du-Rhône, du Var et de la Haute-Corse. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité des zones de production de coquillages classées et l’évolution de leur qualité pour la période 2016-2018.
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; Classement sanitaire des zones de production; Région PACA (Provence-Alpes-Côte d’Azur)..
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00494/60524/63987.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de la Charente-Maritime (17). Edition 2020 ArchiMer
Ervais, Hugo; Gautier, Emeric; Grizon, James; Morin, Dimitri; Soletchnik, Patrick; Piquet, Jean-come; Bruneau, Audrey.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d'interprétation des résultats du reseau de contôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport décrit le programme annuel du département de la Charente-Maritime. Il présente l'ensemble des résultats obtenus sur la période 2017-2019, en particulier l'estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Charente Maritime (17); LERPC.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00631/74329/73967.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole.Départements des Pyrénées orientales, de l’Aude, de l’Hérault et du Gard. Edition 2018 ArchiMer
Crottier, Anais; Abadie, Eric; Brun, Melanie; Piquet, Jean-come; Fiandrino, Annie.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats des réseaux de contrôle microbiologique (REMI) et de surveillance chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel des départements de l’Hérault, du Gard et de l’Aude. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2015-2017. Sur les 29 zones de production conchylicole classées et suivies en Occitanie, la qualité a pu être estimée pour 23 d’entre elles. Selon les critères réglementaires pris en compte (règlement CE n°854/2004, modifié par le règlement n°2285/2015), dans les départements de...
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de l’Hérault; Départemen tdu Gard; Département de l’Aude.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00445/55635/57280.pdf
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