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Registros recuperados: 56 | |
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SOTO SEDANO,Johana; MORA MORENO,Rubén Eduardo; CALLE,Fernando; LÓPEZ CARRASCAL,Camilo Ernesto. |
Cassava, Manihot esculenta Crantz, represents the main food source for more than one billion people. Cassava's production is affected by several diseases, one of the most serious is cassava bacterial blight (CBB) caused by Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). A quantitative trait loci (QTL) analysis for CBB resistance was performed under natural infection conditions, using a mapping population of 99 full-sibs genotypes highly segregant and a SNP-based high dense genetic map. The phenotypic evaluation was carried out in Puerto López, Meta, Colombia, during the rainy season in 2015. Both resistant and susceptible transgressive segregants were detected in the mapping population. Through a non-parametric interval mapping analysis, two QTL were detected,... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Cassava; Molecular marker; QTL; Resistance; SNPs; Xanthomonas axonopodis pv. manihotis. |
Ano: 2017 |
URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2017000100002 |
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Pires,A.V.; Lopes,P.S.; Guimarães,S.E.F.; Guimarães,C.T.; Peixoto,J.O.. |
Uma população de suínos, composta de 550 animais F2, foi produzida a partir do intercruzamento da geração F1, obtida pelo cruzamento divergente de dois machos da raça nativa brasileira Piau com 18 fêmeas comerciais. O objetivo do trabalho foi mapear locos de características quantitativas (QTL) associados a cortes de carcaça. Os animais foram genotipados para 13 marcadores microssatélites, distribuídos no cromossomo 6 de suínos. As características avaliadas foram: peso total do pernil, peso do pernil sem pele e sem capa de gordura, peso total da copa, peso da copa sem pele e sem capa de gordura, peso total da paleta, peso da paleta sem pele e sem capa de gordura, peso total do carré, peso do lombo, peso total do bacon, peso das costelas, peso total da... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Suíno; QTL; Cruzamento divergente; Composição de carcaça; Microssatélites. |
Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352008000300030 |
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Peixoto,M.G.C.D.; Martinez,M.L.; Teodoro,R.L.; Machado,M.A.; Carvalho,M.R.S.; Gomes,F.C.; Verneque,R.S.. |
O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência do método de regressão em detectar QTL com base na utilização de dados da estrutura de família (irmãos completos e meios-irmãos), como aqueles gerados em um núcleo MOET. Foram simulados dados fenotípicos e genotípicos em uma estrutura de núcleo MOET fechado de seleção. Três arquivos foram analisados, contendo: a) informações conjuntas de irmãos completos e meios-irmãos; b) apenas informações de irmãos completos e c) apenas informações de meios-irmãos. Verificou-se que o método da regressão, para dados discretos ou contínuos, foi capaz de detectar associações entre marcador e QTL em níveis bastante expressivos de significância (P<0.001 e P<0,0001), quando se utilizou o arquivo que continha informações... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: QTL; Poder de detecção; Marcador molecular; Estrutura de família. |
Ano: 2009 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352009000400024 |
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Jangarelli,M.; Euclydes,R.F.; Carneiro,A.P.S.; Cecon,P.R.; Cruz,C.D.. |
Foram simuladas diferentes estratégias de seleção para estimar o desempenho fenotípico e a endogamia média na seleção assistida por marcadores, em características quantitativas com valores de herdabilidade de 0,10; 0,40 e 0,70. O sistema de simulação genética (Genesys) foi utilizado para a simulação de três genomas (cada qual constituído de uma única característica cuja distinção estava no valor da herdabilidade), e das populações base e inicial. Cada população inicial foi submetida à seleção assistida por marcadores por 20 gerações consecutivas. Avaliaram-se estratégias de acasalamento entre os genitores selecionados, em diferentes intensidades de seleção (tamanhos populacionais), por meio do acasalamento seletivo entre os melhores e os piores,... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Herdabilidade; Seleção estratégica; Simulação; QTL. |
Ano: 2010 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352010000400028 |
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Silva,M.V.G.B; Martinez,M.L.; Torres,R.A.; Lopes,P.S.; Euclydes,R.F.; Machado,M.A.; Arbex,W.. |
Foi realizado um estudo por meio de simulação para avaliar a eficiência e o poder dos modelos aleatórios na estimação da localização e dos componentes de variância relativos a dois QTLs presentes no mesmo cromossomo, posicionados no mesmo intervalo, em intervalos adjacentes ou não. Admitiram-se diferentes tamanhos e números de famílias de irmãos completos e variâncias dos QTLs, em característica com herdabilidade igual a 0,25. A estimação dos parâmetros foi obtida por meio do método da máxima verossimilhança, baseado no quadrado da diferença de pares de irmãos, sob mapeamento por intervalo. As proporções de genes idênticos por descendência (IBD) dos QTLs foram estimadas a partir da proporção IBD de dois marcadores flanqueadores. Os fatores que mais... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Mapeamento por intervalo; Marcador genético; Método dos pares de irmãos; Modelo aleatório; QTL. |
Ano: 2004 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352004000200014 |
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Pires,A.V.; Lopes,P.S.; Guimarães,S.E.F.; Guimarães,C.T.; Gomide,L.A.M.; Benevenuto Júnior,A.A.; Carmo,F.M.S.. |
The current study was carried out to perform QTL mapping on swine chromosome 6 (SSC6) associated to meat quality traits. The F2 population was produced by outbreed crossing using two native Brazilian breed Piau boars and 18 commercial sows. A total of 557 F2 animals were genotyped for 13 microsatellite markers. The traits evaluated on the F2 population were: pH measured 45 minutes and 24 hours post mortem (pH 45, pH24, respectively), drip loss (DL), cooking loss (CL), total loss (TL), intramuscular fat content (IMF), objective tenderness (OT), lightness (L), redness (A), yellowness (B), hue angle (h) and chrome (c). Data were analyzed by multiple regression developed for analysis of outbreed line crosses, using the QTL Express Software. Significant QTL... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: QTL; Outbreed cross; Genetic; Molecular marker; Animal breeding. |
Ano: 2005 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352005000500006 |
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Jangarelli,M.; Euclydes,R.F.. |
Foram utilizados diferentes níveis de significância genômica na seleção assistida por marcadores para estimar a endogamia média e o limite de seleção, assim como os valores fenotípicos, em características quantitativas de baixa, média e alta herdabilidade. Uma comparação entre os níveis de 1%, 5%, 10% e 20% foi realizada por meio do sistema computacional de simulação genética (GENESYS), utilizado para a simulação de três genomas (cada qual constituído de um único caráter de baixa, média ou alta herdabilidade), e das populações base e inicial. Os resultados indicaram superioridade dos níveis de significância de maior magnitude (10% e 20%) com relação aos valores fenotípicos, resultante de menor média endogâmica, além de menor limite de seleção ao longo das... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Herdabilidade; Nível de significância; Simulação; QTL. |
Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352008000600028 |
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Carneiro,Monalisa Sampaio; Vieira,Maria Lucia Carneiro. |
Ao lado dos projetos de seqüenciamento e das análises do cariótipo pelas técnicas de hibridização in situ, o desenvolvimento de mapas genéticos fundamentados em marcadores de DNA tem propiciado consideráveis avanços à genômica de plantas. Esta revisão aborda as premissas básicas utilizadas para o mapeamento genético e suas principais aplicações, especialmente para o melhoramento vegetal. Fundamentos teóricos sobre segregação, recombinação e ligação são considerados e relacionados à construção de mapas genéticos com marcas moleculares. Apresentam-se informações sobre tipos de marcadores, populações de mapeamento, cálculo da freqüência de recombinação, distorções da segregação, estabelecimento dos grupos de ligação e da ordenação dos marcadores. Discute-se,... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/other |
Palavras-chave: Mapas de ligação; Marcadores moleculares; QTL; Mapeamento comparativo. |
Ano: 2002 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052002000200002 |
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Montaldo,Hugo H.. |
This paper discusses the use of genetic engineering applications in animal breeding, including a description of the methods, their potential and current uses and ethical issues. Genetic engineering is the name of a group of techniques used to identify, replicate, modify and transfer the genetic material of cells, tissues or complete organisms. Important applications of genetic engineering in animal breeding are: 1) Marker-assisted selection (MAS). The objective of this technology is to increase disease resistance, productivity and product quality in economically important animals by adding information of DNA markers to phenotypes and genealogies for selection decisions. 2) Transgenesis, the direct transfer of specific genes/alleles between individuals,... |
Tipo: Journal article |
Palavras-chave: Adult mammalian cloning; Biotechnology; Gene mapping; GMOS; MAS; QTL; Transgenics. |
Ano: 2006 |
URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582006000200010 |
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Machado,Mariana B.B.; Alencar,Maurício M.; Pereira,Andréa P.; Oliveira,Henrique N.; Casas,Eduardo; Coutinho,Luis L.; Regitano,Luciana C.A.. |
The objective of this work was to identify QTLs for liveweight in a candidate region of bovine chromosome 5. Half-sib families from two lines, one traditional and the other new, of Canchim beef cattle (5/8 Charolais + 3/8 Zebu) were genotyped for four microsatellite markers, including the microsatellite in the IGF-1 (insulin-like growth factor-1) promoter region. Significant differences in allele distribution between the two lines were found for three markers. Interval mapping analyses in this region indicated the presence of a QTL controlling birth weight (p < 0.05) and of a QTL influencing breeding value for yearling weight (p < 0.01) in the newer line of the breed. The previously identified interaction between the IGF-1 genotype and genetic group... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: QTL; Growth traits; Microsatellite; Bovine. |
Ano: 2003 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572003000300008 |
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Bocianowski,Jan. |
Epistasis, an additive-by-additive interaction between quantitative trait loci, has been defined as a deviation from the sum of independent effects of individual genes. Epistasis between QTLs assayed in populations segregating for an entire genome has been found at a frequency close to that expected by chance alone. Recently, epistatic effects have been considered by many researchers as important for complex traits. In order to understand the genetic control of complex traits, it is necessary to clarify additive-by-additive interactions among genes. Herein we compare estimates of a parameter connected with the additive gene action calculated on the basis of two models: a model excluding epistasis and a model with additive-by-additive interaction effects.... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Additive gene action effect; Barley; Doubled haploid lines; Epistasis; QTL. |
Ano: 2013 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572013000100013 |
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Hameister,Thaïs M.; Izídio,Geison S.; Valiati,Victor H.; Ramos,André. |
The Floripa H and L rat lines, selected for high and low locomotion in the central aversive area of an open field, a widely used emotionality test, were proposed as a model for studying the genetic basis of anxiety. The present study aimed to verify if the QTL Ofil1, mapped to rat chromosome 4 and previously identified as being related to emotionality in another population of rats, contributes to the behavioral variability observed in the Floripa rat lines. To this purpose, rats of five generations of selective breeding were genotyped for two polymorphic markers, D4RAT59 and D4MGH27, flanking Ofil1. Changes in genotype and allele frequencies throughout generations were evaluated in both H and L lines, in order to assess if the bidirectional selection based... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: QTL; Emotionality; Rat lines; Behavior genetics; Open field. |
Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572008000500008 |
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Hidalgo,André M.; Lopes,Paulo S.; Paixão,Débora M.; Silva,Fabyano F.; Bastiaansen,John W.M.; Paiva,Samuel R.; Faria,Danielle A.; Guimarães,Simone E.F.. |
Fine mapping of quantitative trait loci (QTL) from previous linkage studies was performed on pig chromosomes 1, 4, 7, 8, 17, and X which were known to harbor QTL. Traits were divided into: growth performance, carcass, internal organs, cut yields, and meat quality. Fifty families were used of a F2 population produced by crossing local Brazilian Piau boars with commercial sows. The linkage map consisted of 237 SNP and 37 microsatellite markers covering 866 centimorgans. QTL were identified by regression interval mapping using GridQTL. Individual marker effects were estimated by Bayesian LASSO regression using R. In total, 32 QTL affecting the evaluated traits were detected along the chromosomes studied. Seven of the QTL were known from previous studies using... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Bayesian LASSO Piau breed pig genetics; QTL. |
Ano: 2013 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572013000400009 |
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