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Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos R. Bras. Zootec.
Silva,Marcos Vinicius G. Barbosa da; Martinez,Mário Luiz; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Euclydes,Ricardo Frederico; Pereira,Carmen Silva; Machado,Marco Antônio; Arbex,Wagner.
O procedimento de mapeamento por intervalo baseado em modelo aleatório foi aplicado para estudar sua robustez e propriedades no mapeamento de dois QTLs, em populações constituídas de famílias de meios-irmãos. Sob o modelo aleatório, a localização e os componentes de variância foram estimados usando o método da máxima verossimilhança. A estimação dos parâmetros foi baseada na metodologia de pares de irmãos. As proporções de genes idênticos por descendência (IBD) dos QTLs foram estimadas a partir das proporções IBD de dois marcadores flanqueadores. As estimativas dos parâmetros dos QTLs (localizações e componentes de variância) e do poder de detecção, em uma característica com h² = 0,25, foram obtidas usando dados simulados, variando-se o número de famílias,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Mapeamento por intervalo; Marcador genético; Método dos pares de irmãos; Modelo aleatório; QTL.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982005000100009
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Genome association study through nonlinear mixed models revealed new candidate genes for pig growth curves Scientia Agricola
Silva,Fabyano Fonseca e; Zambrano,Maria Fernanda Betancur; Varona,Luis; Glória,Leonardo Siqueira; Lopes,Paulo Sávio; Silva,Marcos Vinícius Gualberto Barbosa; Arbex,Wagner; Lázaro,Sirlene Fernandes; Resende,Marcos Deon Vilela de; Guimarães,Simone Eliza Facioni.
ABSTRACT: Genome association analyses have been successful in identifying quantitative trait loci (QTLs) for pig body weights measured at a single age. However, when considering the whole weight trajectories over time in the context of genome association analyses, it is important to look at the markers that affect growth curve parameters. The easiest way to consider them is via the two-step method, in which the growth curve parameters and marker effects are estimated separately, thereby resulting in a reduction of the statistical power and the precision of estimates. One efficient solution is to adopt nonlinear mixed models (NMM), which enables a joint modeling of the individual growth curves and marker effects. Our aim was to propose a genome association...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: SNP markers; Body weight; Longitudinal data.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162017000100001
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