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Mise en œuvre opérationnelle de l’outil FlowCAM / ZooPhytoImage dans le cadre de la surveillance REPHY. Action 9 - FlowCAM / ZooPhytoImage - Livrable 2. Rapport final, mars 2015. ArchiMer
Neaud-masson, Nadine; Lefebvre, Alain; Belin, Catherine; Soudant, Dominique.
This deliverable contains the work that was carried out in 2014 for the FlowCAM / ZooPhytoImage tool actually becomes a usable operational tool in the REPHY, and as such, can provide results supplying the assessments of WFD phytoplankton indicator. This deliverable is complementary to the deliverable 1, provided for the same action, entitled « Evolutive version of the operational tool for digitization and semi-automated analysis of phytoplankton images, using the FlowCAM device and the Zoo/PhytoImage software. New perspectives » This deliverable has five parts whose content is summarized below. 1. Work done for operational implementation in 2014 under the REPHY. These tasks affect either the scanning operations of the phytoplankton images by FlowCAM, or...
Tipo: Text Palavras-chave: FlowCAM; ZooPhytoImage; REPHY; Observation phytoplancton; Set d’apprentissage; Littoral français.; FlowCAM; ZooPhytoImage; REPHY; Phytoplankton observation; Training set; French coast..
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00361/47262/47227.pdf
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Évaluation DCE décembre 2008, Éléments d’expertise - Élément de qualité : phytoplancton, Agence de l’eau : Loire-Bretagne ArchiMer
Soudant, Dominique; Belin, Catherine.
La Directive Cadre sur l’Eau (DCE 2000/60/CE) du 23 octobre 2000 définit un cadre pour la gestion et la protection des eaux par grand bassin hydrographique au plan européen. Elle fixe un objectif de bon état écologique et chimique pour les eaux superficielles. La Directive s’appuie sur l’évaluation d’un certain nombre d’éléments de qualité pour définir l’état global d’une masse d’eau. La liste des éléments de qualité à prendre en compte varie selon la catégorie d’eau superficielle. Le phytoplancton figure parmi les éléments de qualité biologiques retenus pour la classification de l'état écologique des masses d’eaux littorales, c’est à dire les eaux côtières et de transition. Il est évalué à partir de trois composantes : biomasse, abondance et composition...
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00015/12586/9461.pdf
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Traitement des données phytoplanctoniques et pigmentaires disponibles dans les DOMs. Analyse préliminaire des nouvelles données acquises et proposition de nouvelles acquisitions et approches complémentaires. Livrable 3 : Bilan de ce qui a été fait sur l’état des lieux et identification des besoins prioritaires dans chaque DOM. Proposition de stratégies à suivre (approches, techniques, etc.). Rapport final ArchiMer
Gailhard-rocher, Isabelle; Artigas, Luis Felipe; Belin, Catherine.
Missions, expertises, participations à des réunions et visio-conférences, travaux collaboratifs et échanges se sont succédé pendant l'année 2011 entre les experts de métropole et les correspondants dans les DOMs. Une mission, qui a eu lieu aux Antilles en mars 2011, ainsi que la participation aux COPILs de Guadeloupe et de Martinique fin 2011, ont permis d'échanger sur les résultats du suivi et des évaluations provisoires de l’état des masses d'eau, de proposer les ajustements nécessaires, et de préparer l'intégration des données DCE dans Quadrige². Une proposition écrite pour l'amélioration du plan de surveillance 2012 en Martinique a également été faite, suivie d'effet. A La Réunion, l'expertise étant assurée par la station Ifremer locale, les contacts...
Tipo: Text Palavras-chave: Outre mer; Martinique; Guadeloupe; La Réunion; Guyane Phytoplancton; Chlorophylle; Cytométrie en flux.
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00449/56063/57586.pdf
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Soutien technique aux DOM pour le suivi physico-chimique et phytoplancton de la DCE. ArchiMer
Daniel, Anne; Belin, Catherine.
Suite au soutien apporté à la mise en place du plan de surveillance DCE physico-chimique et phytoplancton en 2011 en Martinique et Guadeloupe, et en 2012 en Guyane, et de façon à poursuivre l’effort de fiabilisation des données acquises dans les DOM, une expertise technique est proposée à l’ensemble des prestataires intervenant dans les prélèvements et analyses des paramètres physico-chimiques. Il est également nécessaire de reconduire tous les ans les GT phyto-hydro DOM initiés depuis 2012 de façon à poursuivre le travail engagé sur les indicateurs phytoplancton et physico-chimiques dans les DOM.
Tipo: Text
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00285/39649/38148.pdf
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DYNAPSE - DYNamiques des efflorescences et de la toxicité des espèces phytoplanctoniques nuisibles du genre PSEudo nitzschia en région Loire Bretagne ArchiMer
Belin, Catherine; Chapelle, Annie; Delmas, Daniel; Nezan, Elisabeth; Siano, Raffaele.
Les efflorescences de la diatomée Pseudo-nitzschia sont largement répandues sur les côtes Manche-Atlantique depuis une trentaine d’années (source Rephy). Depuis les années 2000 elles y sont parfois associées des événements toxiques du type ASP (Amnesic Shellfish Poisonning) qui perturbent grandement les pêcheries de coquillages et notamment celles de coquilles Saint Jacques. Les efflorescences et toxicités liées aux Pseudo-nitzschia sont des phénomènes en augmentation sur les côtes françaises mais aussi mondialement. Le genre Pseudo-nitzschia comprend plusieurs espèces très difficiles à identifier en routine or certaines sont toxiques et d’autres pas. Les facteurs environnementaux abiotiques et biotiques contrôlent à la fois la croissance des microalgues...
Tipo: Text Palavras-chave: Algues toxiques; Pseudo nitzschia; Toxicité des coquillages; Pêcheries; Facteurs environnementaux.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00189/30035/28521.pdf
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Etudes méthodologiques développées à l’échelle nationale. Action 5 bis. Bilan 2013 du GT experts Phytoplancton et hydrologie. Rapport annuel ArchiMer
Belin, Catherine; Miossec, Laurence.
The working group Phytoplankton – hydrology was established during the implementation of the Water Framework Directive (WFD) with Catherine Belin, Mireille Ryckaert and Anne Daniel (Ifremer) as leaders. It met several times at that time and then was reactivated in 2012. Discussions in the working group along the year 2013 have been reported in this document. They were related to class boundaries, turbid water in transitional waters and reference sites.
Tipo: Text Palavras-chave: Groupe de travail; Phytoplancton; Hydrologie; DCE; Grilles de qualité; Masses d’eau turbides; Sites de référence; Working group; Phytoplankton; Hydrology; WFD; Class boundaries; Turbid water; Reference sites.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00394/50493/51229.pdf
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Observation et Surveillance du Phytoplancton et de l’Hydrologie en France métropolitaine, dans le cadre du REPHY et des réseaux régionaux SRN, RHLN, ARCHYD et RSLHYD. Etat des lieux octobre 2016. ArchiMer
Belin, Catherine.
L’observation et la surveillance du phytoplancton et de l’hydrologie dans les eaux littorales françaises sont assurées à Ifremer par le REPHY sur l’ensemble du littoral, celui‐ci étant complété dans certaines régions par des réseaux régionaux : SRN Suivi Régional des Nutriments, en Artois Picardie, RHLN Réseau Hydrologique du Littoral Normand, ARCHYD Arcachon Hydrologie, RSLHYD/OBSLAG Observatoire Lagunes en Méditerranée. Le tome 1 décrit le format pour 2016-2017 de l’observation et de la surveillance du phytoplancton et des paramètres hydrologiques associés, dans le cadre des réseaux REPHY, SRN, RHLN, ARCHYD et RSLHYD. Il retrace l’historique de la restructuration du REPHY, qui a abouti à la définition des trois composantes (observation, surveillance,...
Tipo: Text
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00393/50391/51101.pdf
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Bilan des perturbations phytoplanctoniques observées sur les côtes françaises en 1985 ArchiMer
Berthome, Jean-paul; Belin, Catherine.
In 1985, twenty discolored waters have been observed with dinoflagellates as the most frequently encountered group. Shellfishes mortalities due to occurence of Gyrodinium spirale were observed in Etang de Thau. Likewise, the growth of molluscs juveniles was inhibited by a bloom of Gyrodinium aureolum (Tinduff area). At last, development of Dinophysis cf. acuminata in some coastal areas has caused provisional prohibition of shellfishes selling. However, economic consequences were less important than in 1984 and particularly with regard to 1983.
Tipo: Text
Ano: 1988 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00119/23024/20855.pdf
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Observation et Surveillance du Phytoplancton et de l’Hydrologie en France métropolitaine, dans le cadre du REPHY et des réseaux régionaux SRN, RHLN, ARCHYD et RSLHYD. Etat des lieux octobre 2016. ArchiMer
Belin, Catherine.
L’observation et la surveillance du phytoplancton et de l’hydrologie dans les eaux littorales françaises sont assurées à Ifremer par le REPHY sur l’ensemble du littoral, celui‐ci étant complété dans certaines régions par des réseaux régionaux : SRN Suivi Régional des Nutriments, en Artois Picardie, RHLN Réseau Hydrologique du Littoral Normand, ARCHYD Arcachon Hydrologie, RSLHYD/OBSLAG Observatoire Lagunes en Méditerranée. Le tome 2 détaille les lieux de prélèvement du REPHY et des réseaux régionaux, avec des fiches par lieu et une cartographie simplifiée.
Tipo: Text
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00393/50392/51104.pdf
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Three decades of data on phytoplankton and phycotoxins on the French coast: Lessons from REPHY and REPHYTOX ArchiMer
Belin, Catherine; Soudant, Dominique; Amzil, Zouher.
In France, REPHY (Observation and Surveillance Network for Phytoplankton and Hydrology in coastal waters) and REPHYTOX (Monitoring Network for Phycotoxins in marine organisms) have been contributing to long-term time series on ocean health for more than 30 years. The aim of this paper is to describe these networks and to highlight their key results. Over the last 20 years, phytoplankton flora analysis on French coasts from the Channel to Mediterranean has shown that the five “emblematic” taxa are Chaetoceros, Skeletonema, Cryptophyceae, Leptocylindrus and Pseudo-nitzschia. The latter, together with the taxa of interest Dinophysis + Phalacroma, Alexandrium, and Karenia, have been consistently recorded along the entire French coastline. However, when taking...
Tipo: Text Palavras-chave: Monitoring network; Phytoplankton time-series; Dominant species; DST-Diarrheic; Shellfish Toxins; PST-Paralytic Shellfish Toxins; AST-Amnesic Shellfish Toxins.
Ano: 2021 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00617/72948/72699.pdf
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Évaluation DCE janvier 2010 - Élément de qualité : phytoplancton ArchiMer
Soudant, Dominique; Belin, Catherine.
Tipo: Text
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00030/14148/11400.pdf
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Nuisances et intoxications causées en France par le phytoplancton et les "efflorescences" marines - Synthèse préliminaire ArchiMer
Sournia, A.; Belin, Catherine; Berland, B.; Erard-le Denn, Evelyne; Grzebyk, Daniel; Marcaillou-le Baut, Claire; Lassus, Patrick; Partensky, F..
Les intoxications humaines résultant de la consommation de coquillages sont connues en France depuis plusieurs siècles. On peut supposer que la cause principale a d'abord été d'origine bactériologique, eu égard aux conditions de transport et à l'absence de contrôles de salubrité dans le passé. Quoi qu'il en soit, il faut compter aujourd'hui avec une autre origine, à savoir les proliférations de certaines algues unicellulaires planctoniques (phytoplancton), qui causent dans notre pays jusqu'à plusieurs milliers d'intoxications par an. Soulignons que la France a été jusqu'ici largement épargnée, puisque d'autres pays comptabilisent des dizaines ou centaines de décès depuis le début du siècle. On vient toutefois de découvrir la présence dans nos eaux côtières...
Tipo: Text
Ano: 1990 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00069/18017/15569.pdf
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Les communautés du phytoplancton. Sous-région marine Golfe de Gascogne. Evaluation initiale DCSMM. ArchiMer
Belin, Catherine; Haberkorn, Hansy; Ménesguen, Alain.
Tipo: Text Palavras-chave: Golfe de Gascogne; Phytoplancton; Communautés; Fréquence des blooms; Modélisation écologique.
Ano: 2012 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00329/44014/43586.pdf
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Document de prescription. Cahier de procédures et de programmation REPHY ArchiMer
Belin, Catherine.
Les modalités de la surveillance assurée par le REPHY sont détaillées dans ce Document de prescription qui rassemble les aspects institutionnels des prescriptions, et les aspects principaux de programmation. Il est complété chaque année par plusieurs documents, en particulier un inventaire cartographique des points de prélèvement, et des documents de méthodes.
Tipo: Text
Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00449/56075/57598.pdf
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Phycotoxin monitoring in France : risk-based strategy and main results (2006-2008) ArchiMer
Belin, Catherine; Amzil, Zouher.
Toxin monitoring is carried out along the coasts of France by a national network, REPHY, which is the National Monitoring Network for Phytoplankton and Phycotoxins. Sampling strategy differs according to the type of zone coastal or offshore and to the family of toxins. For PSP and ASP toxins, monitoring is based on the detection of toxic phytoplankton species. For lipophilic toxins, a systematic analysis of toxins is performed in risk areas during high risk periods. Experimental monitoring for palytoxins has also been conducted along the Mediterranean coast since 2007. The total number of toxin analyses is in the order of 2500 to 3000 per year. The detailed results for each family of toxins showed that the most frequent toxic events for the period from...
Tipo: Text Palavras-chave: Monitoring; Phytoplankton; Toxin; Sampling; Shellfish; French coasts.
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00077/18821/16398.pdf
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Évaluation DCE janvier 2010 - Éléments d’expertise - Élément de qualité : phytoplancton, Agence de l’eau : Loire-Bretagne ArchiMer
Soudant, Dominique; Belin, Catherine.
Tipo: Text
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00030/14145/11396.pdf
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Surveillance des phycotoxines dans les coquillages ArchiMer
Nicolas, Marina; Belin, Catherine; Favre, Pauline; Rudloff, Laurence.
This paper presents the French national system for monitoring three groups of marine biotoxins regulated in shellfish, implemented firstly in marine production areas by the REPHY REPHYTOX network of IFREMER and secondly at distribution level through the network of laboratories accredited by the Directorate General for Food within the framework of official controls. The European regulations, the nature of the shellfish toxins, and analytical methods used are presented. The sampling procedures and strategy, as well as the results obtained by each of the two systems mentioned, are presented and discussed.
Tipo: Text Palavras-chave: Phycotoxines; Coquillages; Toxines lipophiles; ASP; PSP; Surveillance; Phycotoxins; Shellfish; Lipophilic toxins; ASP; PSP; Surveillance.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00393/50407/51123.pdf
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Echantillonnage des nutriments dans le cadre du REPHY Observation. Conclusions tenant compte de la visio‐conférence sur les nutriments du 15 mars 2016 et des échanges ultérieurs. ArchiMer
Belin, Catherine; Daniel, Anne; Neaud-masson, Nadine.
Dans le cadre du REPHY, les mesures de nutriments sont effectuées : (i) sur les lieux REPHY Surveillance (DCE) : une fois par mois entre novembre et février, (ii) sur les lieux du REPHY Observation, si possible une fois par quinzaine comme il est désormais demandé pour le phytoplancton, et sinon une fois par mois. Ce document ne concerne que les lieux du REPHY Observation à l’exclusion (i) des lieux du REPHY Surveillance, pour lesquels la fréquence d’échantillonnage minimale est imposée par la DCE, (ii) des lieux appartenant strictement à un réseau régional, pour lesquels les modalités d’échantillonnage des nutriments sont décrites dans les conventions concernées, (iii) des lieux du REPHY Etudes, pour lesquels les critères sont définis dans d’autres...
Tipo: Text
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00393/50421/51146.pdf
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Cahier de procédures REPHYTOX. Document de prescription. Version 2 ArchiMer
Neaud-masson, Nadine; Belin, Catherine.
L'objectif du réseau REPHYTOX est la recherche et le suivi des toxines réglementées d'origine phytoplanctonique susceptibles de s’accumuler dans les produits marins de consommation, en particulier les mollusques bivalves, présents dans les zones de production ou dans les gisements naturels exploités professionnellement. Les modalités de cette surveillance sont détaillées dans ce document de prescription qui rassemble les aspects institutionnels des prescriptions et les aspects principaux de programmation. Le présent document annule et remplace les prescriptions du Cahier de Procédures REPHYTOX version 1. Il implique tous les chefs des Laboratoires Environnement et Ressources (LERs), et leurs équipes ainsi que leurs partenaires intervenant dans ce cadre. Il...
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00399/50995/51776.pdf
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Communautés du phytoplancton. Sous-région marine Méditerranée occidentale. Evaluation initiale DCSMM. ArchiMer
Belin, Catherine; Baucour, Colombe; Bouchoucha, Marc; Ganzin, Nicolas.
Tipo: Text Palavras-chave: Méditerranée; Communautés du phytoplancton; Biocénoses; Modélisation écologique; Synthèse bibliographique.
Ano: 2012 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00331/44198/43767.pdf
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