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Bilan sur les principales pressions pesant sur les lagunes méditerranéennes et leurs liens avec l’état DCE ArchiMer
Derolez, Valerie; Fiandrino, Annie; Munaron, Dominique; Cadoret, Marine.
L’objectif de cette étude est de mettre en évidence et de hiérarchiser les pressions anthropiques ayant le plus d’impact sur les éléments de qualité DCE sur les lagunes méditerranéennes et de consolider ainsi les liens état/pressions. Il s’agit également de mettre en évidence des groupes de masses d’eau homogènes en termes de pressions. Ce travail s’appuie sur les précédentes études menées sur le sujet (Battut, 2010 ; Bouchoucha et al., 2010 ; Meinesz et al., 2013) et vise à les compléter grâce : • à la mise en œuvre d’une approche descriptive multidimensionnelle qui permet de mettre en évidence les interactions entre les différentes métriques de pression et d’état et de regrouper les masses d’eau similaires, • à l’intégration de données de pression et...
Tipo: Text Palavras-chave: Lagunes; Pressions anthropiques; État DCE.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00254/36574/35112.pdf
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Suivi estival des lagunes méditerranéennes françaises - Bilan des résultats 2014 ArchiMer
Derolez, Valerie; Oheix, Jocelyne; Ouisse, Vincent; Munaron, Dominique; Fiandrino, Annie; Messiaen, Gregory; Hubert, Clarisse; Lamoureux, Alice; Malet, Nathalie; Fortune, Martine; Berard, Lucas; Mortreux, Serge; Guillou, Jean-louis.
Le Réseau de Suivi Lagunaire (RSL), qui permettait d’évaluer l’état vis-à-vis de l’eutrophisation des lagunes du Languedoc-Roussillon, a pris fin en 2013. Une campagne DCE d’évaluation de l’état des masses d’eau côtières et de transition de la façade méditerranéenne est programmée en 2015. Ce rapport rend compte des suivis réalisés par Ifremer en 2014 sur 22 masses d’eau lagunaires du bassin Rhône-Méditerranée et Corse (financement AERMC). Un diagnostic de l’état des masses d’eau, intégrant l’état physico-chimique de la colonne d’eau et l’état du phytoplancton est établi pour les 22 masses d’eau (dont 4 oligo-mésohalines), à partir des données acquises sur la période 2009-2014, selon les critères et les grilles DCE. Trois masses d’eau (Thau,...
Tipo: Text Palavras-chave: Directive Cadre sur l’Eau (DCE); Lagunes; Masses d’eau de transition; Phytoplancton; Macrophytes; Sédiments..
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00273/38461/36864.pdf
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Evidence of the presence of viral shellfish contamination in shellfish after short rainfall events ArchiMer
Le Saux, Jean-claude; Serais, Ophelie; Krol, Joanna; Parnaudeau, Sylvain; Salvagnac, P.; Delmas, G.; Cicchelero, V.; Claudet, J.; Pothier, P.; Balay, K.; Fiandrino, Annie; Pommepuy, Monique; Le Guyader, Soizick.
Infectious diseases linked to the consumption of raw shellfish have long been identified. Over the past century, various strategies have been set up in shellfish growing areas throughout the world to guarantee the sanitary quality of shellfish and to protect consumers. However despite sanitary improvements, human enteric viruses - especially Hepatitis A virus and norovirus– have been found to be associated with shellfish outbreaks. A recent example demonstrated the impact of storm events. Following heavy rain and sewage overflow, shellfish beds were contaminated and the shellfish from them were marketed after depuration. However, since viruses persist longer than fecal contamination indicator bacteria, several clusters of gastroenteritis cases were...
Tipo: Text Palavras-chave: Virus; Shellfish; Contamination events.
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00066/17736/15257.pdf
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Estimation des échanges entre la mer et la lagune de Biguglia : Utilisation de la méthode d’estimation des volumes d’eau échangés entre la mer et les lagunes par différence de hauteurs d’eau. ArchiMer
Tunin-ley, Alina; Malet, Nathalie; Fiandrino, Annie; Orsoni, Valerie; Baldi, Yoann.
Le projet a pour objectif premier de disposer d'un modèle hydrodynamique opérationnel (modèle MARS) sur la lagune de Biguglia et de le valider sur la base de paramètres mesurés in situ (hauteurs d'eau, salinité, température, débits échangés avec la mer). Cela permettra ensuite de caractériser le fonctionnement physique de la lagune à l'aide de descripteurs hydrodynamiques (influence relative des différents forçages, temps de résidences...) puis d'en dégager une typologie saisonnière. Cette étude préliminaire a pour but d’estimer les volumes journaliers entrants et sortants à partir des données de hauteurs d’eau de part et d’autre des graus. Cette étude a été menée sur la lagune de Biguglia grâce à la méthode développée au LER-LR sur différents étangs du...
Tipo: Text Palavras-chave: Echanges mer/lagune; Hauteur d’eau; Grau; Hydrodynamique; Biguglia (lagune Corse).
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00214/32525/31011.pdf
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Larval recruitement of Crassostrea gigas in a french Mediterranean lagoon ArchiMer
Lagarde, Franck; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle; Perignon, Adeline; Mortreux, Serge; Fuhrmann, Marine; Le Gall, Patrik; Leurion, Axel; Chiantella, Claude; Bec, Beatrice; Roques, Cecile; Bonnet, Delphine; Cochet, Helene; Boj, Marie; Gervasoni, Erika; Miron, Gilles; Fiandrino, Annie; Pouvreau, Stephane; Pernet, Fabrice.
We bring new items in connection with the origins of the natural recruitment variability of the Pacific oyster Crassostrea gigas in Thau lagoon. A poor relationship between " number of larvae" and "number of spat" in 2012 shows a biological lock around oysterculture areas during the metamorphosis in spite of better success of recruitment outside shellfish farming zone. A comprehensive analysis of environmental factors effects and the development of prognosis tools are planned to assist oysterfarmers in rationalization of natural oyster recruitment around Mediterranean lagoon.
Tipo: Text
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00165/27653/25822.pdf
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Wind and temperature controls on Alexandrium blooms (2000-2007) in Thau lagoon (Western Mediterranean) ArchiMer
Laanaia, Nabil; Vaquer, Andre; Fiandrino, Annie; Genovesi, Benjamin; Pastoureaud, Annie; Cecchi, Philippe; Collos, Yves.
Since 1998, blooms of Alexandrium catenella/tamarense in the lagoon of Thau developed regularly each autumn, reaching a maximum of several millions cells per liter in 2004. By contrast, spring blooms occurred only twice (in 2000 and 2007). During these periods, sea surface temperatures (SST) and the wind patterns appear to impact the bloom occurrences much more than the apparent limiting resources such as inorganic nutrients. The analysis of SST and wind from April to June and September to November (from 2000 to 2007) indicates first that there has to be an initial wind stress in order to resuspend the cysts buried in the sediment. Blooms then occur after a period of weak winds (<4 m s(-1)) and of stable SST close to 20 degrees C (+/- 2 degrees C)....
Tipo: Text Palavras-chave: Alexandrium catenella/tamarense; Wind stress; SST; Thau lagoon; Mediterranean.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00157/26790/24936.pdf
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Fonctionnement hydrodynamique de la lagune de Biguglia. Partie 1 : Mise en place de la modélisation numérique 3D ArchiMer
Dufresne, Christiane; Malet, Nathalie; Coudray, Sylvain; Fiandrino, Annie.
Le projet Interreg Retralags vise une gestion durable du patrimoine des lagunes, des lacs et des étangs et est développée afin de protéger et de valoriser le patrimoine écosystémique. Cette gestion intégrée s’appuie notamment sur des modèles de gestion des zones humides, qui permettent d’une part d’améliorer notre compréhension de leur fonctionnement et d’autre part, de tester des hypothèses par la simulation de scénarii. Les deux actions IFREMER sont : - La mise en place du modèle hydrodynamique de la lagune de Biguglia, développement d’indicateur hydrologiques opérationnels et test de scenarii hydrologiques et climatiques - La mise en place du modèle écosystémique sur la lagune de Biguglia, développement d’indicateur écologiques opérationnels et test de...
Tipo: Text Palavras-chave: Modèle hydrodynamique; MARS3D; Lagune; Biguglia.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00433/54453/55824.pdf
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REPHYTOX Leucate. Mise en forme des résultats sur la période 2014-2020 ArchiMer
Serais, Ophelie; Abadie, Eric; Hubert, Clarisse; Bellamy, Elise; Fiandrino, Annie; Lemoine, Maud; Neaud-masson, Nadine.
Ce rapport a été réalisé à la demande de la Direction Départementale de la Protection des Populations de l’Hérault (DDPP34). Les résultats en toxines lipophiles réglementées (Acide Okadaïque, Dinophysis toxines et Pectenotoxines uniquement) dans les moules et les huîtres prélevées au point « Parc Leucate 2 » dans le cadre du REPHYTOX, ainsi que les dénombrements du phytoplancton toxique du genre Dinophysis réalisés dans le cadre du REPHY dans la lagune de Leucate, sont présentés sur des graphiques permettant une visualisation temporelle des épisodes de contamination entre janvier 2014 et décembre 2020.
Tipo: Text Palavras-chave: REPHYTOX; REPHY; Leucate; Point Parc Leucate 2; Moules; Huîtres; Toxins lipophiles; Dinophysis; Graphiques; Période 2014-2020.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00662/77444/79099.pdf
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Why, how, and how far should microbiological contamination in a coastal zone be mitigated? An application of the systems approach to the Thau lagoon (France) ArchiMer
Mongruel, Remi; Vanhoutte-brunier, Alice; Fiandrino, Annie; Valette, Francois; Balle-beganton, Johanna; Perez Agundez, José A.; Gallai, Nicola; Derolez, Valerie; Roussel, Sebastien; Lample, Michel; Laugier, Thierry.
This paper describes the building of an integrated simulation tool based on a systems approach, and its contribution to local political discussion of the mitigation of microbiological contamination of the water in a coastal area. Local management schemes view water quality as a high-priority environmental objective. In practice, how far this objective is achieved depends on trade-offs between the costs of improved water treatment facilities and the acceptable impacts of water contamination. An in-the-field experiment in collaboration with local managers was carried out in the Thau lagoon on the French Mediterranean coast during the SPICOSA (Science and Policy Integration for Coastal System Assessment) project, from 2007 through 2011. It consisted of...
Tipo: Text Palavras-chave: Systems modeling; Integrated assessment; Microbiological contamination; Technical options; Strategic planning.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00136/24775/22959.pdf
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Expertise sur les mortalités constatées durant le mois d'août 2018 sur l'étang de Thau au moment de la canicule et de la malaïgue. ArchiMer
Richard, Marion; Fiandrino, Annie.
Tipo: Text
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00466/57776/79183.pdf
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Facteurs explicatifs de la dynamique spatio-temporelle des mortalités d’huîtres creuses Crassostrea gigas dans la lagune de Thau ArchiMer
Pernet, Fabrice; Lagarde, Franck; Cesmat, Ludovic; Jeannée, Nicolas; Barret, Jean; Le Gall, Patrik; Quere, Claudie; Fiandrino, Annie; Miguet, Marine; Boulet, Hélène; Keck, Nicolas; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle.
Cette étude avait pour objectif principal de déterminer les facteurs explicatifs de la dynamique spatio-temporelle des surmortalités d’huîtres creuses dans la lagune de Thau. Les facteurs étudiés étaient : la pathologie (détection d’ADN appartenant à l’Ostreid herpesvirus 1 OsHV-1 et au groupe bactérien Vibrio splendidus), l’état énergétique des huîtres (triglycérides, sucres totaux et acides gras comme marqueurs trophiques), les pratiques d’élevage et l’hydrodynamique. Afin de répondre à ces objectifs, nous avons suivi la mortalité d’un lot d’huîtres sentinelles, âgé de moins d’un an, maintenu indemne de mortalité, dans lequel on ne détectait pas d’ADN appartenant à OsHV-1. Le lot a été déployé mi-mars 2011 sur 106 stations dans la lagune de Thau, où les...
Tipo: Text
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00092/20355/18015.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole.Départements des Pyrénées orientales, de l’Aude, de l’Hérault et du Gard. Edition 2018 ArchiMer
Crottier, Anais; Abadie, Eric; Brun, Melanie; Piquet, Jean-come; Fiandrino, Annie.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats des réseaux de contrôle microbiologique (REMI) et de surveillance chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel des départements de l’Hérault, du Gard et de l’Aude. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2015-2017. Sur les 29 zones de production conchylicole classées et suivies en Occitanie, la qualité a pu être estimée pour 23 d’entre elles. Selon les critères réglementaires pris en compte (règlement CE n°854/2004, modifié par le règlement n°2285/2015), dans les départements de...
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de l’Hérault; Départemen tdu Gard; Département de l’Aude.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00445/55635/57280.pdf
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Etude sanitaire de la zone n° 34.39 "Lotissements conchylicoles de la lagune de Thau" Groupe III. Département de l'Hérault ArchiMer
Marzin, Anahita; Crottier, Anais; Piquet, Jean-come; Abadie, Eric; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle; Fiandrino, Annie.
L’étude de zone des lotissements conchylicoles de la lagune de Thau (34.39) a été menée, à la demande du Comité Régional de la Conchyliculture en Méditerranée et du préfet de l’Hérault, pour étudier la possibilité de sectoriser la zone de production en sous-zones, au regard du risque microbiologiques (REMI). Une étude de dossier a été réalisée afin de recenser les principales sources de contamination. Celles-ci sont essentiellement d’origine anthropique et impactent différemment les secteurs envisagés. Des prélèvements de coquillages du groupe 3 ont été réalisés de mai 2017 à mai 2018 avec une fréquence bimensuelle. Au regard des critères du règlement (CE) n° 854/2004, les résultats des analyses microbiologiques (indicateur Escherichia coli) ont permis...
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Étude de zone; Lagune de Thau; Département de l’Hérault.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00459/57056/58965.pdf
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A box-model of carrying capacity of the Thau lagoon in the context of ecological status regulations and sustainable shellfish cultures ArchiMer
Pete, Romain; Guyondet, Thomas; Bec, Beatrice; Derolez, Valerie; Cesmat, Ludovic; Lagarde, Franck; Pouvreau, Stephane; Fiandrino, Annie; Richard, Marion.
The decrease of microbial and nutrient inputs from the watershed has long dominated lagoon ecosystem management objectives. Phytoplankton biomass and abundance have drastically decreased for more than a decade and Zostera meadow have gradually recovered, expressing lagoon ecosystem restoration such as Thau lagoon. Do the progressive achievement of the good ecological status of the Thau lagoon possibly threatens the shellfish industry in terms of production and oyster quality, by reducing the carrying capacity? To provide answers about the right balance to be achieved between conservation and exploitation, a new numerical tool was developed to help in decision-making. We hereby propose to incorporate a Dynamic Energy Budget type shellfish production model...
Tipo: Text Palavras-chave: Shellfish farming; Carrying capacity; Stakeholder implication; Nitrogen and phosphorus inputs; Water frame directive; Ecological indicators; Phytoplankton depletion; Coupled biogeochemical-deb model.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00622/73395/75312.pdf
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Hydrologie du Grand Etang de Miquelon. Estimation des flux et renouvellements ArchiMer
Le Moine, Olivier; Geairon, Philippe; Robert, Stephane; Coudray, Sylvain; Fiandrino, Annie; Goraguer, Herle; Goulletquer, Philippe.
This study aims to assess the hydrological fluxes between the ‘Grand Etang’ of Miquelon and the oceanic part. Bathymetric surveys and Doppler current meter data acquisitions were carried out from August 14th, to November 5th, 2014 and from April 1st, to end of July 2015 to allow the following estimates : Total area (227 Ha) and characteristics volumes (total : 6,7 106 m3; oscillating 2,8 106 m3 (40 %); half-tide 5,2 106 m3) Velocity Index of channel to evaluate the average current speed at cross-section channel Fluxes, on flood and ebb tide respectively : Instantaneous flow: maxima at 94,2 et 65 m3/s mean 37.2 et 24.5 m3/s. in 2014 and maxima 85,03 et 73,62 m3/s mean 26,22 et 28,20 m3/s in 2015. Circulating fluxes by tide : maxima 1,06 and 1,09 106 m3,...
Tipo: Text Palavras-chave: Flux hydrologiques; Courantométrie; Bathymétrie; Grand Etang Miquelon; Modélisation; Hydrological fluxes; Current meter data acquisition; Bathymetry; Grand Etang Miquelon; Modelling.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00332/44325/43904.pdf
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Rapport final du projet CHAMILA (Cartographie des habitats en milieu lagunaire méditerranéen) ArchiMer
Menu, Marion; Vaz, Sandrine; Bajjouk, Touria; Derolez, Valerie; Fiandrino, Annie; Giraud, Anais; Grillas, Patrick; Ouisse, Vincent.
Coastal Mediterranean lagoons are often defined as homogeneous ecosystems that home many migratory and sedentary species. They also host strong salinity gradients, depth variation and very diverse plant communities, which create small-scale heterogeneity within lagoons. This is why each lagoon must be described as an entity by itself made up of a multitude of homogeneous features, called habitats, which support specific ecological functions for organisms (nursery, feeding, protection against predators...). Although many studies have resulted in collecting high numbers of physical, chemical and biological data in coastal Mediterranean lagoons, there is currently a lack of knowledge of the spatial distribution of these habitats. In our project, we (1)...
Tipo: Text Palavras-chave: Habitat; Cartographie; Typologie; Lagune méditerranéenne; Habitat; Map; Typology; Mediterranean lagoons.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00593/70545/73353.pdf
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Fifty years of ecological changes: Regime shifts and drivers in a coastal Mediterranean lagoon during oligotrophication ArchiMer
Derolez, Valerie; Malet, Nathalie; Fiandrino, Annie; Lagarde, Franck; Richard, Marion; Ouisse, Vincent; Bec, Beatrice; Aliaume, Catherine.
Thau lagoon is a large Mediterranean coastal lagoons and it supports traditional shellfish farming activities. It has been subject to eutrophication leading to major anoxic events associated with massive mortalities of shellfish stocks. Since the 1970s, improvements have been made to wastewater treatment systems, which have gradually led to oligotrophication of the lagoon. The aim of our study was to determine how the decrease in nutrient inputs resulted in major ecological changes in Thau lagoon, by analysing five decades of time-series (1970–2018) of observations on pelagic and benthic autotrophic communities. We were able to identify two periods during the oligotrophication process. Period 1 (1970–1992) was considered a eutrophic period, characterised...
Tipo: Text
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00629/74068/73521.pdf
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OBSLAG 2018 - volet eutrophisation. Lagunes méditerranéennes (période 2013-2018). Etat DCE de la colonne d'eau et du phytoplancton, tendance et variabilité des indicateurs ArchiMer
Derolez, Valerie; Bec, Béatrice; Munaron, Dominique; Foucault, Elodie; Fiandrino, Annie; Ouisse, Vincent; Messiaen, Gregory; Hatey, Elise; Connes, Coralie; Soudant, Dominique; Brun, Melanie; Fortune, Martine; Mortreux, Serge; Serais, Ophelie; Crottier, Anais; Malet, Nathalie.
Cette étude est réalisée dans le cadre du projet OBSLAG (OBServatoire des LAGunes) et porte sur les 10 masses d’eau lagunaires méditerranéennes situées à l’aval des cours d’eau suivis depuis 2015 par le « réseau flux » de l'Agence de l’Eau Rhône Méditerranée Corse. Le rapport correspond aux actions réalisées en 2018 dans le cadre du volet « eutrophisation » d’OBSLAG, répondant aux objectifs suivants : (1) réaliser un suivi estival en 2018 du phytoplancton et de la physico-chimie de l’eau et évaluer l’état DCE de ces compartiments pour la période 2013-2018 sur les 10 masses d’eau lagunaires du suivi « réseau flux », regroupant 13 lagunes poly-euhalines. Ce suivi permet de renforcer la fréquence des suivis DCE sur la colonne d’eau et le phytoplancton, qui ne...
Tipo: Text Palavras-chave: Directive Cadre sur l’Eau (DCE); Lagunes; Masses d’eau de transition; Eutrophisation; Phytoplancton; Confiance; Précision; Tendance..
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00507/61862/65959.pdf
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Oyster (c. gigas) recruitment in Mediteranean lagoons ; new approaches for studying larval connectivity using MARS3D modeling tools ArchiMer
Ubertini, Martin; Fiandrino, Annie; Bernard, Ismael; Thomas, Yoann; Dumas, Franck; Pouvreau, Stephane; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle; Lagarde, Franck.
The Thau lagoon, located at the South of France, provides 10% of the French pacific oyster Crassostrea gigas production (Robert et al., 2013). Despite this intensive shellfish production, the larval recruitment of this species within the Thau lagoon is still misunderstood and spat collection remains highly variable; as a consequence, shellfish farmers rely mostly on hatchery's spat. In 2012, the PRONAMED II project was launched, aiming to improve our understanding of the C. gigas reproductive cycle within Mediterranean lagoons and to explore the feasibility for oyster-spat collecting. In addition to an extensive sampling work encompassing both spatial and temporal features of larval recruitment, we tried to understand the contribution of larval dispersal...
Tipo: Text
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00248/35905/34427.pdf
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Effect of environmental drivers on the reproduction of the pacific oyster Crassostrea gigas in the Mediterranean: The case of the Thau lagoon ArchiMer
Ubertini, Martin; Lagarde, Franck; Le Gall, Patrik; Mortreux, Serge; Pernet, Fabrice; Fiandrino, Annie; Pouvreau, Stephane; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle.
The aquaculture of the oyster Crassostrea gigas is largely based on natural recruitment of the species on spat collectors along the french Atlantic coast, the remaining spat being provided by hatcheries and nurseries. Due to an increase in the climate/meteorological variability, during the last twenty years, the natural spat collection has become variable, from null to overabundant depending on the year. Since 2008, the oyster spat mortalities worsen the situation, reducing the available spat and increasing the cost of the latter. However, the temporal variability of the natural recruitment modalities in the Mediterranean do not allow the aquaculture industry to rely on native spats, making the understanding of natural recruitment in the Mediterranean a...
Tipo: Text
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00248/35894/34422.pdf
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