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Aplicación del análisis de rango reescalado R/S para la predicción de genes en el genoma vegetal Acta Agron. (Palmira)
Almanza Pinzón,Martha Isabel; López López,Karina; Téllez Villa,Carlos Eduardo.
La predicción de genes es en la actualidad uno de los principales desafíos de la genómica. La predicción permite realizar experimentos con alta probabilidad de encontrar genes de interés y comparar regiones de ADN de importancia agronómica entre genomas; además, ayuda a restringir los espacios de búsqueda en las bases de datos. Un procedimiento estadístico con base en el análisis R/S y el coeficiente de Hurst fue desarrollado para caracterizar y predecir genes y los componentes estructurales de estos (exones e intrones) en los genomas eucariotas completos de Arabidopsis thaliana, Oriza sativa y Mus musculus. Algoritmos en lenguaje de programación Python fueron desarrollados para extraer, filtrar y modelar más del 80% de las secuencias de genes registradas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genómica comparativa; Predicción de genes; Análisis R/S; Coeficiente de Hurst; Arabidopsis thaliana; Oryza sativa; Mus musculus..
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122010000400012
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