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Can plant DNA barcoding be implemented in species-rich tropical regions? A perspective from São Paulo State, Brazil Genet. Mol. Biol.
Lima,Renato A. Ferreira de; Oliveira,Alexandre Adalardo de; Colletta,Gabriel Dalla; Flores,Thiago Bevilacqua; Coelho,Rubens L. Gayoso; Dias,Pedro; Frey,Gabriel Ponzoni; Iribar,Amaia; Rodrigues,Ricardo Ribeiro; Souza,Vinícius Castro; Chave,Jérôme.
Abstract DNA barcoding helps to identify species, especially when identification is based on parts of organisms or life stages such as seeds, pollen, wood, roots or juveniles. However, the implementation of this approach strongly depends on the existence of complete reference libraries of DNA sequences. If such a library is incomplete, DNA-based identification will be inefficient. Here, we assess if DNA barcoding can already be implemented in species-rich tropical regions. We focus on the tree flora of São Paulo state, Brazil, which contains more than 2000 tree species. Using new DNA sequence data and carefully assembled GenBank accessions, we assembled 12,113 sequences from ten different regions. The ITS, rbcL, psbA-trnH, matK and trnL regions were better...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Biodiversity assessment; Plant barcoding; Species conservation; Tree species.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572018000400661
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Estrutura e regeneração de clareiras em florestas pluviais tropicais Rev. Bras. Bot.
Lima,Renato A. Ferreira de.
Este trabalho apresenta uma revisão crítica do conhecimento disponível sobre a estrutura e regeneração de clareiras naturais em Florestas Pluviais Tropicais. Separada em diferentes temas como tamanho de clareiras, tipos de queda, ambiente físico, fontes de regeneração e grupos ecológicos, cada tema é explorado em detalhe através dos trabalhos publicados mais relevantes. Assim, conceitos antigos são expostos e discutidos, e as lacunas de conhecimento são destacadas para enriquecer e embasar novos trabalhos. Como resultado, observou-se que apesar de mais de três décadas de estudo e do grande número de trabalhos envolvendo estrutura e regeneração de clareiras, a pesquisa científica no tema ainda possui muitas perguntas a serem respondidas. Ela também possui...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Colonização de clareiras; Floresta pluvial tropical; Grupos ecológicos; Regeneração de clareiras.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-84042005000400002
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Canopy gap colonization in the Atlantic Montane Rain Forest BABT
Lima,Renato A. Ferreira de; Moura,Leila Cunha de.
In the Atlantic Montane Rain Forest of South-eastern Brazil, a study was carried out to describe and evaluate canopy gap colonization. Gap composition by herb species was assessed through their soil coverage and woody species by measuring and identifying all individuals taller than one meter. Gap structure (gap size, number and diameter of treefalls), topographic position and surrounding vegetation were also measured. Two genera of Marantaceae were markedly frequent and abundant inside gaps. The more abundant and frequent woody species were shade tolerant. Species-rich families found inside gaps did not differ from the forest as a whole. Results revealed that direct and indirect influences of topography were important to determine gap composition of woody...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Gap floristics; South-eastern Brazil; Marantaceae species; Montane rain forest; Topography.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132006000700013
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