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Recherche des Escherichia coli vérotoxiques (VTEC) dont E. coli O157 : H7 dans l'environnement marin (coquillages) ArchiMer
Gourmelon, Michele; Montet, Mp; Loaec, Solen; Le Mennec, Cecile; Pommepuy, Monique; Vernoy-rozand, C.
La qualité sanitaire du milieu marin côtier est influencée par la présence de rejets urbains ou de rejets diffus d'origine agricole. Ces effluents sont riches en bactéries ou virus d'origine fécale, dont certains ont été mis en cause dans des pathologies humaines (Beeching, 1997 ; Feldhusen, 2000 ; Lipp et Rose, 1997 ; Yam et al., 1999). Parmi les microorganismes pouvant présenter un danger pour l'homme, certains, pathogènes émergents ces dernières années, n'ont été que récemment recherchés dans l'environnement : on peut citer les Cryptosporidium et les Giardia pour les parasites, les norovirus pour les virus et les Escherichia coli vérotoxiques (VTEC) pour les bactéries. Ces derniers ne sont connus que depuis 1982, date à laquelle E. coli 0157 : H7 a été...
Tipo: Text
Ano: 2003 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00106/21697/19276.pdf
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Detection of cytotoxin-hemolysin mRNA in nonculturable populations of environmental and clinical Vibrio vulnificus strains in artificial seawater ArchiMer
Fischer Le Saux, Marion; Hervio Heath, Dominique; Loaec, Solen; Colwell, Rita; Pommepuy, Monique.
The objective of this study was to develop a molecular detection method that better estimates the potential risk associated with the presence of Vibrio vulnificus. For that purpose, we applied seminested reverse transcription-PCR (RT-PCR) to viable but nonculturable (VBNC) populations of V. vulnificus and targeted the cytotoxin-hemolysin virulence gene vvhA. Three strains, two environmental, IF Vv10 and IF Vv18, and one clinical, C7184, were used in this study. Artificial seawater, inoculated with mid-log-phase cells, was maintained at 4degreesC. VBNC cells resulted after 3, 6, and 14 days for C7184, IF Vv18, and IF Vv10, respectively. Our data indicate that seminested RT-PCR is sensitive for the detection of vvhA mRNA in artificial seawater when...
Tipo: Text Palavras-chave: Artificial seawater; Reverse transcription PCR; Cytotoxin Hemolysin; Molecular detection method; Vibrio vulnificus.
Ano: 2002 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/2002/publication-1269.pdf
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Dénombrement des coliformes thermotolérants ou des Escherichia coli dans des sédiments côtiers vaseux ArchiMer
Gourmelon, Michele; Derrien, A.; Crenn, Isabelle; Loaec, Solen.
Des bactéries fécales telles que les Escherichia coli ou les coliformes thermotolérants ont été recherchées dans des sédiments côtiers vaseux (prélevés sur deux sites différents: Morlaix et St Pol de Léon; Finistère). Ces vases, sous influence de rejets polluants, de par leur richesse en matière organique et en particules de faible taille sont susceptibles d'héberger ces bactéries. Une partie de l'étude a consisté à comparer différentes techniques de relargage des bactéries des particules de sédiment décrites dans la littérature.
Tipo: Text
Ano: 2002 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00081/19213/16808.pdf
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MRNA detection by reverse transcription-PCR for monitoring viability and potential virulence in a pathogenic strain of Vibrio parahaemolyticus in viable but nonculturable state ArchiMer
Coutard, Francois; Pommepuy, Monique; Loaec, Solen; Hervio Heath, Dominique.
Aims: This work investigates the maintenance of viability and potential virulence of Vibrio parahaemolyticus in a viable but nonculturable population (VBNC) state by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). Methods and Results: Housekeeping genes, 16S-23S rDNA and rpoS, as well as virulence genes, tdh1 and tdh2, were selected and detected by PCR in a pathogenic strain of V. parahaemolyticus (Vp4). Their expression was then studied by RT-PCR in V. parahaemolyticus Vp4 cultivated in rich medium at 37degreesC. The 16S-23S rDNA and rpoS, tdh1, tdh2 genes were transcripted at the mid-logarithmic, stationary and late stationary phases, corresponding to various physiological states. The expression of these genes was also studied by RT-PCR in a...
Tipo: Text Palavras-chave: Vibrio parahaemolyticus; Viable but nonculturable state; Tdh2; Tdh1; RT PCR; RpoS; Environment; 16S 23S rDNA.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/publication-1098.pdf
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Le bassin versant du Bélon : vers une restauration durable de la qualité bactériologique des eaux estuariennes ArchiMer
Monfort, Patrick; Hervio Heath, Dominique; Caprais, Marie-paule; Pommepuy, Monique; Annezo, Jean-pierre; Loaec, Solen; Le Mennec, Cecile; Guillerm, Emmanuelle; Boulben, Sylviane; Bilien, Gwenael; Bonsor, Robert; Porter, Jonathan; Pickup, Roger.
Le projet européen Cycleau, initié à l'échelle locale sur la problèmatique de l'envasement et de l'ensablement de l'estuaire du Bélon, y a également intégré un volet bactériologique en raison des contraintes fortes que faisaient peser les pics conjoncturels de contamination sur la profession conchylicole (fermetures temporaires, déclassement éventuel) mais plus largement sur l'image du territoire (impact touristique) et en définitive sur son développement durable. Pour satisfaire la restauration de la qualité des eaux estuariennes, l'IFREMER a fait appel à un certain nombre d'outils susceptibles de contribuer à la formulation d'un diagnostic pertinent et ainsi de répondre aux préoccupations des acteurs du littoral. Pour ce faire, nous avons créé un réseau...
Tipo: Text Palavras-chave: Bassin versant; Contamination fécale; Escherichia coli; Flux bactériens; Bactériophages; SIG; Évaluation.
Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00200/31077/29490.pdf
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