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| GIRALDO RAMÍREZ,Susana; SIERRA MEJÍA,Andrea; OSPINA ORTIZ,María Isabella; HIGUITA VALENCIA,Mónica; GALLO GARCÍA,Yuliana; GUTIÉRREZ SÁNCHEZ,Pablo Andrés; MARÍN MONTOYA,Mauricio. |
| RESUMEN La papa criolla es uno de los principales productos agrícolas de la región Andina de Colombia. Este cultivo es afectado por diferentes enfermedades de origen viral, siendo los virus PYVV, PVS, PLRV y PVV algunos de los agentes causales más importantes. Con el fin de aportar nueva información al conocimiento del viroma de la papa criolla en Colombia, en este estudio se utilizó secuenciación de alto rendimiento (HTS) y RT-PCR cuantitativa (RT-qPCR) para la detección y caracterización molecular del Potato virus B (PVB), a partir de muestras de tejido foliar de plantas procedentes de diferentes lotes de papa criolla en Antioquia. Mediante análisis bioinformáticos fue posible el ensamblaje de la mayor parte del genoma de PVB, consistente de dos... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Fitopatología; Nepovirus; Secuenciación de nueva generación; PCR en tiempo real; Virus de plantas. |
| Ano: 2022 |
URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2022000200258 |
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| GARCÍA RUÍZ,Daniela; GUTIÉRREZ SÁNCHEZ,Pablo; MARÍN MONTOYA,Mauricio. |
| En este estudio se determinaron las relaciones filogenéticas y los niveles de variación de aislamientos de PVX obtenidos en tejidos foliares de plantas de Solanum tuberosum subsp. andigena var. Diacol-Capiro y S. phureja var. Criolla Colombia en Antioquia, utilizando métodos de secuenciación de nueva generación (NGS) y de Sanger. Inicialmente, se detectó el PVX mediante DAS-ELISA (Agdia-PSA10000), confirmándose su presencia en ocho de las muestras por Inmunocaptura-RT-PCR en tiempo real (IC-RT-qPCR). Los resultados de las pruebas serológicas indicaron la infección de PVX en 14,7 % y 13,3 % de las muestras de Diacol-Capiro y Criolla Colombia, respectivamente. Su identidad fue confirmada por IC-RT-qPCR, con valores de ciclo umbral (Ct) de 15,04 a 27,59 y dos... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: DAS-ELISA; NGS; Potexvirus; RT-qPCR; Solanum spp; Variantes. |
| Ano: 2016 |
URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2016000100011 |
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| GALLO GARCÍA,Yuliana; SIERRA MEJIA,Andrea; DONAIRE SEGARRA,Livia; ARANDA,Miguel A.; GUTIERREZ,Pablo Andrés; MARÍN MONTOYA,Mauricio. |
| RESUMEN Las enfermedades virales son uno de los principales problemas fitopatológicos de la papa. Con el fin de determinar los virus más prevalentes en cultivos de papa var. Diacol Capiro en el oriente Antioqueño (Colombia), se evaluó mediante RT-qPCR la presencia de diez virus de ARN (PVY, PVA, PVV, TaLMV, PVS, PLRV, PYVV, PVX, ToRSV y PMTV) en 36 muestras de tejido foliar. Los resultados indicaron la ocurrencia de cinco de los diez virus evaluados, con niveles de prevalencia de 88,9 %, 75 %, 75 %, 41,7 % y 25 % para PVY, PVX, PYVV, PLRV y PVS, respectivamente. Con fines comparativos, cuatro virus también se evaluaron mediante ELISA, siendo detectados PVS (80,5 %), PVY (55 %) y PLRV (5,5 %); mientras que PVX no fue encontrado con esta prueba. La... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: ELISA; RT-qPCR; Secuenciación de nueva generación (NGS); Solanaceae; Virus de ARN. |
| Ano: 2019 |
URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2019000300546 |
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