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Identification of SNPs in RNA-seq data of two cultivars of Glycine max (soybean) differing in drought resistance Genet. Mol. Biol.
Vidal,Ramon Oliveira; Nascimento,Leandro Costa do; Maurício Costa Mondego,Jorge; Amarante Guimarães Pereira,Gonçalo; Falsarella Carazzolle,Marcelo.
The legume Glycine max (soybean) plays an important economic role in the international commodities market, with a world production of almost 260 million tons for the 2009/2010 harvest. The increase in drought events in the last decade has caused production losses in recent harvests. This fact compels us to understand the drought tolerance mechanisms in soybean, taking into account its variability among commercial and developing cultivars. In order to identify single nucleotide polymorphisms (SNPs) in genes up-regulated during drought stress, we evaluated suppression subtractive libraries (SSH) from two contrasting cultivars upon water deprivation: sensitive (BR 16) and tolerant (Embrapa 48). A total of 2,222 soybean genes were up-regulated in both...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Single nucleotide polymorphisms; Deep sequencing; Drought resistance.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572012000200014
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