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Evaluation of MC1R high-throughput nucleotide sequencing data generated by the 1000 Genomes Project Genet. Mol. Biol.
Marano,Leonardo Arduino; Marcorin,Letícia; Castelli,Erick da Cruz; Mendes-Junior,Celso Teixeira.
Abstract The advent of next-generation sequencing allows simultaneous processing of several genomic regions/individuals, increasing the availability and accuracy of whole-genome data. However, these new approaches may present some errors and bias due to alignment, genotype calling, and imputation methods. Despite these flaws, data obtained by next-generation sequencing can be valuable for population and evolutionary studies of specific genes, such as genes related to how pigmentation evolved among populations, one of the main topics in human evolutionary biology. Melanocortin-1 receptor (MC1R) is one of the most studied genes involved in pigmentation variation. As MC1R has already been suggested to affect melanogenesis and increase risk of developing...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Melanocortin-1 Receptor; The 1000 Genomes Project; Next-generation sequencing.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572017000300530
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Characterization of Brazilian soybean cultivars using microsatellite markers Genet. Mol. Biol.
Priolli,Regina Helena Geribello; Mendes-Junior,Celso Teixeira; Arantes,Neylson Eustáquio; Contel,Eucleia Primo Betioli.
Microsatellite markers or SSR (Simple Sequence Repeats) have proved to be an excellent tool for cultivar identification, pedigree analysis and the evaluation of genetic distance among organisms. Soybean cultivars have been characterized mainly by morphological and biochemical traits. However, these traits have not been sufficient to characterize the large number of cultivars eligible to receive protection under the Brazilian Cultivar Protection Act. In order to define new soybean cultivar markers, the alleles of twelve SSR loci of 186 Brazilian soybean cultivars were studied by estimating the variation in their size range and their respective frequencies. On average, 5.3 alleles per locus were detected, with a mean genetic diversity of 0.64 ± 0.12. These...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Glycine max (L.) Merrill; Simple sequence repeat; Microsatellites; Molecular markers; Soybean elite cultivars.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572002000200012
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Y-STR diversity and ethnic admixture in White and Mulatto Brazilian population samples Genet. Mol. Biol.
Ferreira,Luzitano Brandão; Mendes-Junior,Celso Teixeira; Wiezel,Cláudia Emília Vieira; Luizon,Marcelo Rizzatti; Simões,Aguinaldo Luiz.
We investigated 50 Mulatto and 120 White Brazilians for the Y-chromosome short tandem repeat (Y-STR) markers (DYS19, DYS390, DYS391, DYS392 and DYS393) and found 79 different haplotypes in the White and 35 in the Mulatto sample. Admixture estimates based on allele frequencies showed that the admixture of the white sample was 89% European, 6% African and 5% Amerindian while the Mulatto sample was 93% European and 7% African. Results were consistent with historical records of the directional mating between European males and Amerindian or African females.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Brazil; Mulatto; White; Y-STR.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572006000400004
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Diversidade genética da soja entre períodos e entre programas de melhoramento no Brasil PAB
Priolli,Regina Helena Geribello; Mendes-Junior,Celso Teixeira; Sousa,Sandra Mara Bispo; Sousa,Neylson Eustáquio Arantes; Contel,Eucleia Primo Betioli.
O objetivo deste trabalho foi detectar os efeitos do melhoramento sobre a diversidade do germoplasma da soja cultivada nas três ultimas décadas, por meio da comparação de seis programas de melhoramento e períodos de lançamento de cultivares, utilizando locos microssatélites. Em relação aos programas de melhoramento, todos os locos apresentaram diferenças significativas em suas distribuições alélicas. Alguns locos eram compostos de alelos exclusivos em alguns programas de melhoramento, enquanto outros foram compostos sempre dos mesmos alelos em maior freqüência para todos os programas. A AMOVA indicou maior porção da variância devido a cultivares dentro de programas e somente 5,3% (p<0,05) devido à diferença entre programas. Quando comparados os...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Glycine max; SSR; Germoplasma; Erosão genética.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2004001000004
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