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A cooperative and specific DNA-binding mode of HIV-1 integrase depends on the nature of the metallic cofactor and involves the zinc-containing N-terminal domain ArchiMer
Carayon, Kevin; Leh, Herve; Henry, Etienne; Simon, Francoise; Mouscadet, Jean-francois; Deprez, Eric.
HIV-1 integrase catalyzes the insertion of the viral genome into chromosomal DNA. We characterized the structural determinants of the 3'-processing reaction specificity-the first reaction of the integration process-at the DNA-binding level. We found that the integrase N-terminal domain, containing a pseudo zinc-finger motif, plays a key role, at least indirectly, in the formation of specific integrase-DNA contacts. This motif mediates a cooperative DNA binding of integrase that occurs only with the cognate/viral DNA sequence and the physiologically relevant Mg(2+) cofactor. The DNA-binding was essentially non-cooperative with Mn(2+) or using non-specific/random sequences, regardless of the metallic cofactor. 2,2'-Dithiobisbenzamide-1 induced zinc ejection...
Tipo: Text
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00206/31773/30183.pdf
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