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Peternelli,Luiz Alexandre; Ferreira,Fábio Medeiros; Rocha,Rodrigo Barros; Barros,Willian Silva; Barbosa,Márcio Henrique Pereira. |
São poucos os softwares disponíveis para a análise de parentesco e, até a presente data, nenhum pode realizar a análise de parentesco para organismos poliplóides, com número par (2k) de cromossomos. Implementou-se junto ao programa R uma rotina capaz de executar a análise de parentesco para qualquer nível 2k de ploidia, número de indivíduos (ou populações) e número de gerações envolvidas na árvore genealógica. A função principal, calc.rxy() calcula o coeficiente de endogamia (F X) de cada indivíduo; coeficientes de parentesco (rXY) entre dois indivíduos quaisquer; e coeficiente de parentesco médio, variância, mínimo e máximo, para cada indivíduo. Ela pode mostrar a matriz completa de parentesco ou uma submatriz pré-definida de indivíduos selecionados.... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Genética de populações; Poliplóides; Análise de pedigree. |
Ano: 2009 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052009000400004 |
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Ribas,Rodolfo Gustavo Teixeira; Santos,Ricardo Henrique Silva; Siqueira,Rosileyde Gonçalves; Diniz,Ellen Rúbia; Peternelli,Luiz Alexandre; Freitas,Gilberto Bernardo de. |
As leguminosas possibilitam a incorporação biológica de nitrogênio aos sistemas de produção. Contudo, existe pouco conhecimento sobre a decomposição, liberação e volatilização de nitrogênioassociados à diferentes doses de seus resíduos. Objetivouse, neste trabalho avaliar a decomposição, a liberação e a volatilização de nitrogênio de diferentes doses de mucuna-cinza (Mucuna cinerea Piper & Tracy). O experimento constou de tratamentos com 12 (C12) ou 25 (C25) Mg ha-1 de composto orgânico: C12AV0 (sem leguminosa); C12AV4 (4 Mg ha-1 de resíduo); C12AV8 (8 Mg ha-1); C12AV12 (12 Mg ha-1); C25; AV12 (12 Mg ha-1) e testemunha absoluta. Adotou-se o delineamento de blocos casualizados e cinco repetições. Foram determinadas as taxas de decomposição do adubo... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Adubação verde; N-mineral; N-NH3. |
Ano: 2010 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542010000400012 |
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Maia,Emanuel; Siqueira,Dalmo Lopes de; Carvalho,Sérgio Alves de; Peternelli,Luiz Alexandre; Latado,Rodrigo Rocha. |
Em experimentos de competição de cultivares de citros, geralmente são utilizados muitos tratamentos, o que requer o emprego de grandes blocos e parcelas com poucas plantas. Tem sido debatido que, nessas condições, pode ocorrer a correlação entre parcelas vizinhas, violando assim a pressuposição de erros independentes da análise de variância. O presente trabalho teve por objetivo avaliar diferentes parametrizações de modelos, considerando ou não a dependência espacial entre parcelas, em dois experimentos de competição de clones de laranjeira Pêra (Citrus sinensis L. Osbeck). Foi utilizada a estrutura auto-regressiva separável de primeira ordem (AR1 x AR1) como modelo de dependência espacial entre os erros. Os resultados encontrados apontam que a modelagem... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Citrus sinensis; Produtividade; Volume de copa; Autocorrelação espacial; Modelos auto-regressivos; Melhoramento de plantas. |
Ano: 2013 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782013000100002 |
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Espósito,Deiciana Pagano; Peternelli,Luiz Alexandre; Paula,Thiago Otávio Mendes de; Barbosa,Márcio Henrique Pereira. |
O objetivo deste trabalho foi investigar o uso de valores fenotípicos e genotípicos na análise de trilha envolvendo características agronômicas em cana-de-açúcar, nos estágios de cana-planta e cana-soca. Sob esses dois enfoques, foram computados os efeitos diretos e indiretos dos componentes de produção - número de colmos por parcela, diâmetro médio de colmos e altura média de colmos - sobre a produtividade de colmos por hectare. Para garantir uma melhor consistência nos resultados, os dados foram obtidos em dois experimentos, no delineamento em blocos casualizados com cinco repetições. Os experimentos foram alocados no Centro de Experimentação em cana-de-açúcar da UFV, em Oratórios, MG, Brasil. Cada experimento foi constituído de 22 famílias de irmãos... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Correlação; Seleção precoce; Seleção indireta. |
Ano: 2012 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782012000100007 |
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Peternelli,Luiz Alexandre; Tomaz,Flávia Sílvia Corrêa; Bernardes,Diego Paiva; Silva,Gilson Fernandes da; Lacerda,Fabricia Gonçalves. |
This work aims to evaluate the use of parametric models instead of a nonparametric procedure to adjust survival curves related to different treatments, and to verify the equivalence among treatments by the multivariate method of cluster analysis. The dataset used to validate the method was obtained from a laboratory experiment with cutting ants. Eight colonies of cutting ants were used, each one receiving different treatments. The exponential, Weibull, log-normal, and logistic models were adjusted for each treatment, along with the usual Kaplan-Meier adjustment. The logistic model used was the best option for evaluating the survival of the ants. Therefore, this model was adjusted for each treatment. The estimates of the parameters of each adjusted model... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Logrank test; Cluster analysis; Curves comparison. |
Ano: 2013 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782013000900004 |
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Azevedo,Camila Ferreira; Silva,Fabyano Fonseca e; Rezende,Marcos Deon Vilela de; Peternelli,Luiz Alexandre; Guimarães,Simone Eliza Facione; Lopes,Paulo Sávio. |
A principal contribuição da genética molecular é a utilização direta das informações de DNA no processo de identificação de indivíduos geneticamente superiores. Sob esse enfoque, idealizou-se a seleção genômica ampla (Genome Wide Selection - GWS), a qual consiste na análise de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) amplamente distribuídos no genoma. Devido a esse grande número de SNPs, geralmente maior que o número de indivíduos genotipados, e à alta colinearidade entre eles, métodos de redução de dimensionalidade são requeridos. Dentre estes, destaca-se o método de regressão via Quadrados Mínimos Parciais (Partial Least Squares - PLS), que além de solucionar tais problemas, permite uma abordagem multivariada, considerando múltiplos fenótipos.... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Seleção genômica; Redução de dimensionalidade; Análise multivariada. |
Ano: 2013 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782013000900017 |
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Furtado,Marcos Ribeiro; Cruz,Cosme Damião; Cardoso,Antônio Américo; Coelho,Antônio Daniel Fernandes; Peternelli,Luiz Alexandre. |
Realizou-se análise de trilha do rendimento de grãos (variável básica) vs. seus componentes primários (variáveis explicativas), em monocultivo e em consórcio com a cultura do milho. De modo geral, os resultados foram semelhantes nos dois sistemas de cultivo. Das três variáveis explicativas envolvidas no estudo, o número de vagens por parcela foi a única que apresentou boa combinação de coeficiente de trilha e correlação, ambos altos, tanto no monocultivo como no consórcio. Concluiu-se que o caráter número de vagens por parcela tem influência marcante na produção de grãos, podendo ser de grande valor nos progressos genéticos deste caráter, via seleção indireta. |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Phaseolus vulgaris L.; Correlações; Melhoramento genético; Sistemas de cultivo. |
Ano: 2002 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782002000200006 |
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Acunha,Jefferson Gonçalves; Oliveira,Ricardo Augusto de; Zeviani,Walmes Marques; Peternelli,Luiz Alexandre; Bespalhok Filho,João Carlos; Daros,Edelclaiton. |
Para a avaliação de experimentos com cana-de-açúcar, tem-se recomendado a colheita total de parcelas, algo que, devido aos seus custos, tem se mostrado inexequível. Alternativamente, pode-se estimar a produção com base na tomada de amostras que representem as parcelas. O objetivo deste trabalho foi estudar a suficiência amostral em cana-de-açúcar para a estimação da massa dos colmos de parcelas experimentais. Reamostragens com reposição subsidiaram o uso dos modelos da curva potencial, linear e quadrático segmentados com resposta platô e do modelo do coeficiente de variação relativo. Também foram realizados estudos simulados de análise de variância. Os resultados indicaram que amostras de 20 colmos coletados aleatoriamente na parcela experimental permitem... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Tamanho da amostra; Suficiência amostral; Melhoramento da cana-de-açúcar; Saccharum spp. |
Ano: 2014 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782014001001747 |
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Santos,Manoel Xavier dos; Pollak,Linda Maria; Pacheco,Cleso Antônio Patto; Guimarães,Paulo Evaristo Oliveira; Peternelli,Luiz Alexandre; Parentoni,Sidney Netto; Nass,Luciano Lourenço. |
Maize breeders frequently wish to use exotic germplasm in their breeding programs without losing specific characteristics of their adapted material. The objective of this study was to determine the optimal proportions of exotic germplasm to incorporate into adapted populations (F2 = 50% exotic, BC1 = 25% exotic, BC2 = 12.5% exotic and BC3 = 6.25% exotic) to form the initial foundation population and to determine the heterosis between adapted x exotics. We used six exotic populations of different origins and two adapted populations representing a Brazilian heterotic pattern. In 1993-94 and 1994-95, the parents, F1, F2, BC1, BC2, BC3 and four checks were evaluated in six environments in central Brazil using an 8 x 9 simple rectangular lattice design. Higher... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
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Ano: 2000 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572000000200033 |
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Nascimento,Moysés; Cruz,Cosme Damião; Peternelli,Luiz Alexandre; Campana,Ana Carolina Mota. |
The efficiency of simulated annealing algorithms and rapid chain delineation in establishing the best linkage order, when constructing genetic maps, was evaluated. Linkage refers to the phenomenon by which two or more genes, or even more molecular markers, can be present in the same chromosome or linkage group. In order to evaluate the capacity of algorithms, four F2 co-dominant populations, 50, 100, 200 and 1000 in size, were simulated. For each population, a genome with four linkage groups (100 cM) was generated. The linkage groups possessed 51, 21, 11 and 6 marks, respectively, and a corresponding distance of 2, 5, 10 and 20 cM between adjacent marks, thereby causing various degrees of saturation. For very saturated groups, with an adjacent distance... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Better order; Genetic mapping; Genomic analyses; Stochastic optimization. |
Ano: 2010 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572010000200032 |
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Moreira,Gisele R.; Silva,Derly José H. da; Picanço,Marcelo C.; Peternelli,Luiz Alexandre; Caliman,Fabiano Ricardo B.. |
Neste trabalho estudou-se a divergência genética entre acessos de Lycopersicon spp. com relação à resistência a populações da traça-do-tomateiro, Tuta absoluta, e verificou-se a importância relativa dos caracteres da traça-do-tomateiro para a divergência. Foi conduzido experimento envolvendo quatro populações do inseto procedentes de Uberlândia (MG), Viçosa (MG), Camocim de São Félix (PE) e Santa Teresa (ES) e cinco acessos de tomateiro, 'Santa Clara', 'Moneymaker', TOM-601, PI 126445 (L. hirsutum f. typicum) e PI 134417 (L. hirsutum f. glabratum). Foram realizados testes de médias de Tukey e método de agrupamento de Tocher, e verificada a importância relativa dos caracteres da traça-do-tomateiro para a divergência entre acessos por meio do método de... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Lycopersicon spp.; Tuta absoluta; Recursos genéticos; Variabilidade genética; Melhoramento de plantas. |
Ano: 2005 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362005000400006 |
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Campos,Josmar Furtado de; Carneiro,Antonio Policarpo Souza; Peternelli,Luiz Alexandre; Carneiro,José Eustáquio de Souza; Silva,Michele Jorge da; Cecon,Paulo Roberto. |
Resumo: O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência da análise estatística espacial, em comparação a análises usuais em blocos ao acaso e em látice, na classificação de famílias de feijoeiro ( Phaseolus vulgaris), sob diferentes cenários de dependência espacial e de precisão experimental. Foram considerados 12 cenários, formados por quatro classes de dependência espacial entre erros (nula, baixa, média e alta) e três classes de precisão experimental (moderada, alta e muito alta). Para as três classes de precisão experimental, foram definidos os valores de acurácia seletiva de: 0,60, 0,80 e 0,95, respectivamente. Já as quatro classes de dependência espacial entre erros assumiram, respectivamente, os seguintes valores de alcance do modelo... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Phaseolus vulgaris; Acurácia seletiva; Análise espacial; Autocorrelação; Erros dependentes; Modelos geoestatísticos.. |
Ano: 2016 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2016000200105 |
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Souza,Emanuel Fernando Maia de; Peternelli,Luiz Alexandre; Barbosa,Márcio Henrique Pereira. |
The objective of this work was to compare the relative efficiency of initial selection and genetic parameter estimation, using augmented blocks design (ABD), augmented blocks twice replicated design (DABD) and group of randomised block design experiments with common treatments (ERBCT), by simulations, considering fixed effect model and mixed model with regular treatment effects as random. For the simulations, eight different conditions (scenarios) were considered. From the 600 simulations in each scenario, the mean percentage selection coincidence, the Pearsons´s correlation estimates between adjusted means for the fixed effects model, and the heritability estimates for the mixed model were evaluated. DABD and ERBCT were very similar in their comparisons... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Augmented design; Incomplete block; Selection; Heritability; Sugarcane; Stochastic simulation. |
Ano: 2006 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006000300001 |
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