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Generalized composite interval mapping offers improved efficiency in the analysis of loci influencing non-normal continuous traits Ciencia e Investigación Agraria
Mora,Freddy; Scapim,Carlos Alberto; Baharum,Adam; Teixeira do Amaral Júnior,Antonio.
In genetic studies, most Quantitative Trait Loci (QTL) mapping methods presuppose that the continuous trait of interest follows a normal (Gaussian) distribution. However, many economically important traits of agricultural crops have a non-normal distribution. Composite interval mapping (CIM) has been successfully applied to the detection of QTL in animal and plant breeding. In this study we report a generalized CIM (GCIM) method that permits QTL analysis of non-normally distributed variables. GCIM was based on the classic Generalized Linear Model method. We applied the GCIM method to a F2 population with co-dominant molecular markers and the existence of a QTL controlling a trait with Gamma distribution. Computer simulations indicated that the GCIM method...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Bioinformatics; Generalized Linear Model; Molecular markers; Quantitative Trait Loci (QTL).
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0718-16202010000300007
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