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Prediction of binding hot spot residues by using structural and evolutionary parameters Genet. Mol. Biol.
Higa,Roberto Hiroshi; Tozzi,Clésio Luis.
In this work, we present a method for predicting hot spot residues by using a set of structural and evolutionary parameters. Unlike previous studies, we use a set of parameters which do not depend on the structure of the protein in complex, so that the predictor can also be used when the interface region is unknown. Despite the fact that no information concerning proteins in complex is used for prediction, the application of the method to a compiled dataset described in the literature achieved a performance of 60.4%, as measured by F-Measure, corresponding to a recall of 78.1% and a precision of 49.5%. This result is higher than those reported by previous studies using the same data set.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Hot spots prediction; Protein structure; Hot spots.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572009000300029
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Descrição e discriminação de formas de nervuras foliares utilizando a representação polinomial cúbica de Hermite Acta Botanica
Brito Júnior,Agostinho de Medeiros; Tozzi,Clésio Luis; Tozzi,Ana Maria Goulart de Azevedo.
Este artigo descreve um método para caracterização de nervuras utilizando a representação polinomial cúbica de Hermite. Os elementos associados a esta representação são usados como descritores das nervuras e o potencial discriminatório é analisado com base na identificação de duas espécies de leguminosas (Lonchocarpus muehlbergianus Hassl. e L. subglaucescens Mart, ex Benth.). Os vetores de geometria de Hermite exercem influência sobre toda a extensão da curva modelada, permitindo a descrição global da nervura por um descritor de baixa dimensionalidade. Os resultados obtidos mostram que o método foi eficaz na separação das espécies analisadas e apresenta-se como uma opção adicional aos métodos para caracterização de nervuras usualmente utilizados em...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Lonchocarpus; Venação foliar; Descritores de forma; Classificação.
Ano: 1997 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-33061997000200007
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