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Evaluation of different DNA-based fingerprinting methods for typing Photobacterium damselae ssp. piscicida Biol. Res.
MANCUSO,MONIQUE; AVENDAÑO-HERRERA,RUBÉN; ZACCONE,R; TORANZO,ALICIA E; MAGARIÑOS,BEATRIZ.
This study evaluates the effectiveness of three different molecular techniques, repetitive extragenic palindromic PCR (REP-PCR), enterobacterial repetitive intergenic consensus sequence PCR (ERIC-PCR) and the random amplified polymorphic DNA (RAPD-PCR) for rapid typing of Photobacterium damselae ssp. piscicida strains isolated from different species of marine fish and geographic areas. The results obtained by the three methods showed that RAPD and ERIC-PCR were more discriminative for suitable rapid typing of Ph. damselae ssp. piscicida than REP-PCR. The analysis of DNA banding patterns generated by both molecular methods (RAPD and ERIC-PCR) clearly separated the strains into two main groups that strongly correlated with their geographic origin. Moreover,...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Photobacterium damselae ssp; Piscicida; RAPD; ERIC-PCR; REP-PCR.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0716-97602007000100009
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