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Development and molecular characterizationof a rice mapping populationfor blast resistance. Repositório Alice
ABREU, A. G.; DUITAMA, J.; BORBA, T. C. O.; RODRIGUES, L. A.; COSTA, S. P. P.; MELLO, R. N..
Blast, caused by the fungus Magnaporthe oryzae, is the most damaging disease in rice. The use of resistance genes in crop breeding programs has been the major, and most sustainable, means for disease control. To identify new resistance genes or alleles to be introduced in breeding lines, a mapping population was developed crossing BRS Esmeralda, an upland cultivar, and Três Marias, a Brazilian landrace internationally recognized as blast resistant.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Arroz; Oryza Sativa; Brusone; Marcador Molecular; Gene; Resistência Genética.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1111871
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Estudo da variabilidade genética de acessos asiáticos de Oryza sativa L. do Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa. Repositório Alice
BENICIO, C. G.; BORBA, T. C. O.; BRONDANI, R. P. V.; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar a variabilidade genética de um conjunto de acessos provenientes do International Rice Research Institute (IRRI).
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Marcadores SSR; Coleção nuclear; Arroz; Oryza sativa; Banco de germoplasma; Variação genética; Marcador molecular; Recurso genético.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/866741
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Caracterização molecular de linhagens e cultivares da coleção nuclear brasileira do arroz por marcadores SSR. Repositório Alice
BORBA, T. C. O.; BRONDANI, C.; BRONDANI, R. P. V.; RANGEL, P. H. N..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Marcador; SSR.; Arroz; Linhagem; Oryza Sativa..
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/192769
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Genetic diversity by molecular markers in lines of phaseolus vulgaris from VCU experiments at Embrapa Rice and Beans breeding program. Repositório Alice
BORBA, T. C. O.; VEIGA, M. M. A.; MENEZES, I. P. P.; PEREIRA, H. S.; BRONDANI, C.; BRONDANI, R. P. V..
This study aimed to characterize the diversity and to determine the genetic differentiation within lines and cultivars from VCU 2009/2010, based on a set of SSR markers. Twenty-three lines (10 from ?Preto?, 12 from ?Carioca? and one from special grains group) and nine cultivars (four from ?Preto? and five from ?Carioca? group) comprised VCU from 2009/2010.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Diversidade genética; Feijão; Phaseolus vulgaris; Marcador molecular; Melhoramento genético vegetal.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/888954
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Validação do QTL PUP1 e diversidade genética em genótipos de arroz de terras altas. Repositório Alice
BORBA, T. C. O.; VIDOTTI, M. S.; CASCÃO, L. M.; COLOMBARI FILHO, J. M.; ABREU, A. G. de; MELLO, R. N. de.
O objetivo deste estudo foi caracterizar geneticamente as famílias S0:2 da população-base CNA9|3|1 e validar nestas a presença do QTL de maior efeito, Phosphorus uptake 1 (Pup1), responsável pelo aumento na eficiência de absorção de P.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Melhoramento genético vegetal; Genótipo.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1022466
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Determination of genetic variability of traditional varieties of Brazilian rice using microsatellite markers. Repositório Alice
BRONDANI, C.; BORBA, T. C. O.; RANGEL, P. H. N.; BRONDANI, R. P. V..
The rice (Oryza sativa) breeding program of the Rice and Bean research center of the Brazilian agricultural company Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) is well established and provides new cultivars every year to attend the demand for improved high yielding varieties with tolerance to biotic and abiotic stresses. However, the elite genitors used to compose new populations for selection are closely related, contributing to the yield plateau reached in the last 20 years. To overcome this limit, it is necessary to broaden the genetic basis of the cultivars using diverse germplasm such as wild relatives or traditional varieties, with the latter being more practical because they are more easily crossed with elite germplasm to accelerate the...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Microsatellite markers; Brasil.; Arroz; Oryza Sativa; Recurso Genético.; Rice..
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/214434
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Utilização de marcadores microssatélites no melhoramento populacional do arroz. Infoteca-e
BRONDANI, C.; BRONDANI, R. P. V.; BORBA, T. C. O.; BRUNES, T.; RANGEL, P. H. N.; GUIMARÃES, E. P..
Introdução; Estudo de caso - análise molecular da cultivar Tio Taka por marcadores microssatélites; Análise dos genitores da população CNA-IRAT; Variabilidade genética do germoplasma de arroz; Escolha de genitores para a composição de novas populações de seleção recorrente; Considerações finais.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Melhoramento genético.; Arroz; Marcador Molecular; Oryza Sativa; Seleção Recorrente..
Ano: 2004 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/191516
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Genetic variability analysis of elite upland rice genotypes with SSR markers. Repositório Alice
BRONDANI, C.; CALDEIRA, K. da S.; BORBA, T. C. O.; RANGEL. P. N.; MORAIS, O. P. de; CASTRO, E. da M. de; RANGEL, P. H. N.; MENDONÇA, J. A.; BRONDANI, R. V..
Rice is one of the staple foods consumed worldwide, and rice breeding programmes have become important to warrant high yield levels and grain quality in upland rice. Laboratory experiments were conducted to study the genetic variation of 30 elite genotypes from a VCU trial, of the upland rice breeding programme of Embrapa, Brazil, using 25 SSR markers. A total of 131 alleles were obtained, with an average of 5.2 alleles per locus and a mean PIC equal to 0.61. Results indicated that genetically different elite parents from the breeding programme and selection in segregating families have given rise to broad-based rice genotypes. Based on the analysis of different combinations of 10 SSR markers, it was observed that the use of more informative markers is...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Marcador microssatélite; Distância genética; Microsatellite markers.; Arroz; Oryza Sativa; Recurso Genético.; Genetic distance; Genetic resources; Rice..
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/214369
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Caracterização agronômica da coleção nuclear brasileira do arroz. Repositório Alice
BRONDANI, C.; RANGEL, P. H. N.; BRONDANI, R. P. V.; BORBA, T. C. O.; MENDONÇA, J. A.; NETO, F. M.; FRANCO, D. F.; BASSINELLO, P. Z.; UTUMI, M. M.; PEREIRA, J. A.; CORDEIRO, A. C. C.; FONSECA, J. R..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Coleção nuclear.; Arroz; Oryza Sativa..
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/197709
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Estrutura genética de populações silvestres de Oryza glumaepatula em três biomas brasileiros utilizando marcadores microssatélites. Infoteca-e
BRONDANI, R. P. V.; RANGEL, P. H. N.; ZUCCHI, M. I.; MAGALHÃES, M. R.; BORBA, T. C. O.; VENCOVSKY, R.; BRONDANI, C..
Oryza glumaepatula, uma das 21 espécies silvestres do gênero Oryza, no qual está incluído o arroz cultivado (O. sativa), constitui uma valiosa fonte doadora de alelos favoráveis para características de interesse agronômico desta espécie. Diversas áreas de ocorrência natural de O. glumaepatula estão sob ameaça de devastação e, desta forma, a implementação de estratégias de conservação destes recursos genéticos a partir de estudos de genética de populações é de extrema relevância. Marcadores moleculares microssatélites, ou SSR, são uma ferramenta útil para investigar questões relacionadas ao sistema de cruzamento, fluxo gênico e estrutura genética das populações naturais de O. glumaepatula. Este trabalho objetivou caracterizar a variabilidade genética e...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Oryza glumaepatula; Silvestre; SSR; Variabilidade genética.; Arroz; Conservação; Marcador Molecular..
Ano: 2003 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/212641
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Avaliação genotípica de linhagens e cultivares brasileiras e introduzidas da coleção nuclear de arroz da Embrapa por meio da caracterização agronômica e molecular. Repositório Alice
BUENO, L. G.; BRONDANI, C.; COELHO, A. S. G.; BORBA, T. C. O.; OLIVEIRA, J. P..
Avaliar a diversidade genética de linhagens e cultivares brasileira e do exterior da CNAE, por meio de caracteres agronômicos e marcadores moleculares SSR.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Diversidade genética; Caracterização agronômica; Caracterização molecular; SSR; Arroz; Oryza sativa; Germoplasma.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/866754
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Discrimination of common bean cultivars using multiplexed microsatellite markers. Repositório Alice
CARDOSO, P. C. B.; BRONDANI, C.; MENEZES, I. P. P.; VALDISSER, P. A. M. R.; BORBA, T. C. O.; DEL PELOSO, M. J.; VIANELLO, R. P..
Analysis of DNA polymorphisms allows for the genetic identification and precise discrimination of species with a narrow genetic base such as common bean. The primary objectives of the present study were to molecularly characterize commercial common bean varieties developed at various research institutions using microsatellite markers and to determine the degree of genetic diversity among the bean varieties analyzed. Fifty cultivars representing 12 grain classes and 64 genitors, i.e., accessions used to develop these cultivars, were characterized. Based on an analysis of 24 simple sequence repeats, the estimates for the average number of alleles and genetic diversity were 8.29 and 0.646, respectively. The combined probability of identity was estimated at...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Diversidade genética; Feijão; Phaseolus vulgaris; DNA; Marcador molecular.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1085520
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Molecular characterization of high performance inbred lines of Brazilian common beans. Repositório Alice
CARDOSO, P. C. B.; VEIGA, M. M.; MENEZES, I. P. P. de; VALDISSER, P. A. M. R.; BORBA, T. C. O.; MELO, L. C.; DEL PELOSO, M. J.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
The identification of germplasm genetic variability in breeding programs of the common bean (Phaseolus vulgaris) is essential for determining the potential of each combination of parent plants to obtain superior genotypes. The present study aimed to estimated the extent of genetic diversity in 172 lineages and cultivars of the common bean by integrating five tests of value for cultivation and use (VCU) that were conducted over the last eight years by the breeding program of Embrapa Arroz e Feijão in Brazil. Nine multilocus genotyping systems composed of 36 fluorescent microsatellite markers distributed across 11 different chromosomes of the common bean were used, of which 24 were polymorphic in all trials. One hundred and eighty-seven alleles were...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Melhoramento genético.; Feijão; Phaseolus vulgaris; Variação genética.; Inbred lines; Genetic lines.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/953582
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Genetic diversity of high performance cultivars of upland and irrigated Brazilian rice. Repositório Alice
COELHO, G. R. C.; BRONDANI, C.; HOFFMANN, L. V.; VALDISSER, P. A. M. R.; BORBA, T. C. O.; MENDONÇA, J. A.; RODRIGUES, L. A.; MENEZES, I. P. P. de.
The objective of this study was to analyze the diversity and discrimination of high-performance Brazilian rice cultivars using microsatellite markers. Twenty-nine rice cultivars belonging to EMBRAPA Arroz e Feijão germplasm bank in Brazil were genotyped by 24 SSR markers to establish their structure and genetic discrimination. It was demonstrated that the analyzed germplasm of rice presents an expressive and significant genetic diversity with low heterogeneity among the cultivars. All 29 cultivars were differentiated genetically, and were organized into two groups related to their upland and irrigated cultivation systems. These groups showed a high genetic differentiation, with greater diversity within the group that includes the cultivars for irrigated...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Cultivar discrimination; Arroz; Oryza sativa; Variação genética; Recurso genético; Rice; Genetic variation; Genetic resources; Microsatellite repeats.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078383
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Seleção recorrente assistida por marcadores moleculares gera progênies de arroz resistentes à brusone. Repositório Alice
COLOMBARI FILHO, J. M.; AVOZANI, O. A.; MELLO, R. N.; FILIPPI, M. C. C.; LOBO, V. L. S.; BORBA, T. C. O.; ABREU, A. G.; RODRIGUES, L. A.; FONSECA, G. M.; FAVERO, D..
A principal doença da cultura do arroz é a brusone, causada porMagnaporthe oryzae,que requer o uso intensivo de fungicidas para o seu controle preventivo. Isto porque, apesar da resistência genética ser a estratégia de controle mais ecoeficiente e economicamente sustentável, existe a dificuldade desta ser completa em razão da alta variabilidade das populações desse patógeno. Já a resistência parcial, controlada pormúltiplos locos, é factível, porém a seleção com base no fenótipo é onerosa. Uma estratégia seria o auxílio de marcadores moleculares (MM)em seleção assistida. Nesse sentido, a equipe do Laboratório de Biotecnologia da Embrapa Arroz e Feijão validou e introduziu na sua rotina análises com MM para resistência a M. oryzae, associados a dois QTLs...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Arroz; Oryza Sativa; Seleção Recorrente; Marcador Molecular; Melhoramento Genético Vegetal; Brusone.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1111869
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Avaliação de marcadores moleculares diagnósticos de alelos de resistência a Magnaporthe oryzae em arroz (Oryza sativa). Repositório Alice
CRISPIM, B. C. F.; BORBA, T. C. O.; BRESEGHELLO, F.; FILIPPI, M. C. C.; MELLO, R. N..
O presente trabalho teve o objetivo de avaliar a capacidade de maracadores moleculares dos tipos SSR, SNP e InDel descritos na literatura em identificar alelos associados a resistência à M. oryzae.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Seleção assistida por marcadores.; Arroz; Oryza sativa; Marcador molecular; Brusone; Magnaporthe oryzae..
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/866749
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The characterization of a new set of EST-derived simple sequence repeat (SSR) markers as a resource for the genetic analysis of Phaseolus vulgaris. Repositório Alice
GARCIA, R. A. V.; RANGEL, P. N.; BRONDANI, C.; MARTINS, W. S.; MELO, L. C.; CARNEIRO, M. S.; BORBA, T. C. O.; BRONDANI, R. P. V..
Background: Over recent years, a growing effort has been made to develop microsatellite markers for the genomic analysis of the common bean (Phaseolus vulgaris) to broaden the knowledge of the molecular genetic basis of this species. The availability of large sets of expressed sequence tags (ESTs) in public databases has given rise to an expedient approach for the identification of SSRs (Simple Sequence Repeats), specifically EST-derived SSRs. In the present work, a battery of new microsatellite markers was obtained from a search of the Phaseolus vulgaris EST database. The diversity, degree of transferability and polymorphism of these markers were tested. Results: From 9,583 valid ESTs, 4,764 had microsatellite motifs, from which 377 were used to design...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Microssatélite; Análise genética; Feijão; Phaseolus vulgaris; Genética; Marcador molecular.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/894904
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Distribution of weedy red rice (Oryza sativa) resistant to Imidazolinone herbicides and its relationship to rice cultivars and wild Oryza species. Repositório Alice
GOULART, I. C. G. R.; BORBA, T. C. O.; MENEZES, V. G.; MEROTTO JUNIOR, A..
Several weedy red rice populations have evolved resistance to imidazolinone herbicides worldwide. The understanding of the factors related to the herbicide resistance in weedy red rice is important to prevent its occurrence in new areas where imidazolinone-resistant rice cultivars are being used, and to manage the new rice cultivars resistant to herbicides with modes of action other than the acetolactate synthase (ALS)-inhibitors that are being developed. The objectives of this study were to analyze the relationship of weedy red rice populations from southern Brazil with rice cultivars and wild Oryza species and to evaluate the occurrence of introgression from rice cultivars and seed migration as the origin of resistance to imidazolinone herbicides in...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Diversidade genetica; Arroz; Oryza Sativa; Herbicida; Resistência a Produtos Químicos.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1135016
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Análise da estrutura populacional e determinação do fluxo gênico entre populações de arroz vermelho. Repositório Alice
GOULART, I. C. G. R.; KUPAS, V.; DIAS, L. P.; ROSA, T. M.; BORBA, T. C. O.; MENEZES, V. G.; MEROTTO JUNIOR, A..
objetivo do trabalho foi caracterizar geneticamente populações de arroz vermelho do RS com suspeita de resistência aos herbicidas imidazolinonas e elucidar aspectos relacionados ao fluxo gênico de sementes entre diferentes locais.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Fluxo gênico; Arroz vermelho; Oryza sativa; Herbicida.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/899115
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Estrutura genética espacial em população natural de Annona crassiflora Mart. (Annonaceae) do cerrado. Repositório Alice
GOUVEIA, F. O.; COLLEVATTI, R. G.; TELLES, M. P. C.; BORBA, T. C. O.; SOARES, T. N..
O objetivo desse estudo foi estimar o nível de diversidade genética e estrutura genética espacial dentro de uma população de A. crassiflora.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Diversidade genética; Araticum; Annona crassiflora; Fruta tropical; Genética; Cerrado.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/857912
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