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Identificando Pockets na superfície protéica usando o Java Protein Dossier - JPD. Infoteca-e
YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; HIGA, R. H.; SANTOS, E. H. dos; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G..
Pockets. Identificando e visualizando pockets através do JPD. Aplicações. Conclusões.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Pockets; Superfície protéica; Java Protein Dossier; JPD; Estrutura de proteínas; Função de proteínas.
Ano: 2005 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/9102
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Incorporação das propriedades rotâmeros e ocupância em métodos de análise estrutural de proteínas. Infoteca-e
FALCAO, P. R. K.; BAUDET, C.; HIGA, R. H.; NESHICH, G..
Conformação das cadeias laterais (rotâmeros); Dupla ocupância; Java Protein Dossier.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Proteínas; Análise estrutural de proteínas; Propriedades rotâmeros; Cadeias laterais; Bioinformática; Ocupância.
Ano: 2002 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/8636
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Metodologia para estimativa de conforto térmico bovino utilizando dados de cabresto inteligente e estações agrometeorológicas. Infoteca-e
LIMA, H. P. de; OLIVEIRA, C. C. de; HIGA, R. H.; SPERANZA, E. A.; CARROMEU, C..
Este trabalho explora um dos aspectos ainda pouco manejados, mas com influência tanto na produtividade quanto na qualidade: o conforto térmico animal na pecuária de corte extensiva, onde o ambiente não é controlado. É proposta uma metodologia para avaliação de conforto térmico animal por meio de dispositivos conectados à internet, que monitoram variáveis fisiológicas e meteorológicas.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Selo ODS 8; Bovino de corte; Conforto térmico; Gado Nelore.
Ano: 2022 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1149714
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Metodologias para estimativa de peso de bovinos Nelore em sistemas extensivos a partir de pesagens diárias. Infoteca-e
HIGA, R. H.; VAZ, G. J.; MANCINI, A. L.; OLIVEIRA, C. C. de; SOUZA, K. X. S. de; VECHINI, G. C.; SPERANZA, E. A..
As principais contribuições deste documento estão relacionadas ao uso de diferentes abordagens presentes na literatura para estimar o peso futuro dos animais. Os resultados ainda são preliminares, mas mostram que é possível estimar o peso futuro dos bovinos com boa acurácia, desde que os dados fornecidos sejam confiáveis e representem a realidade que ocorre em campo.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Bovino de corte; Peso de animais; Gado Nelore; Pesagem.
Ano: 2022 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1151152
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Modelagem molecular da proteína small heat shock de Xylella fastidiosa. Infoteca-e
FALCAO, P. R. K.; TADA, S. F. de S.; SOUZA, A. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; FILETO, R.; HIGA, R. H.; NESHICH, G..
Este documento descreve o modelo molecular da proteína XF2234 e a análise preliminar da sua estrutura. O modelo foi construído por modelagem por homologia (ou modelagem comparativa) com a estrutura cristalográfica de uma proteína small heat shock de Triticum aestivum (trigo). A análise da estrutura tridimensional da proteína XF2234 tem o objetivo de contribuir para aumentar o conhecimento sobre o papel biológico das smHSPs, necessário para o combate à CVC.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Modelagem molecular; Heat shock; Proteínas celulares; Proteína; Xylella Fastidiosa.
Ano: 2004 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1372
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Predição da resistência genética ao carrapato de bovinos Braford e Hereford a partir de um painel denso de marcadores moleculares. Infoteca-e
CARDOSO, F. F.; GULIAS GOMES, C. C.; OLIVEIRA, M. M. de; ROSO, V. M.; PICCOLI, M. L.; BRITO, F. V.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R.; SILVA, M. V. G. B.; REGITANO, L. C. de A.; CAETANO, A. R.; AGUILAR, I..
O problema do carrapato bovino; A alternativa da seleção genômica; Resultados experimentais; Procedimentos para aplicação prática; Considerações finais.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Boophilus microplus; Gado de corte.
Ano: 2011 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/950709
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Primeiro curso STING Millennium Suite Chemogenomics: ferramentas para analisar estruturas macromoleculares e aplicações em chemogenomics. Infoteca-e
FALCAO, P. R. K.; SIQUEIRA NETO, J. L. de; HERNANDEZ FERNANDEZ, J.; HIGA, R. H.; BAUDET, C.; NESHICH, G..
O objetivo do curso foi familiarizar pesquisadores de áreas de biotecnologia, como genética, bioquímica, biologia molecular e bioinformática, com as novas ferramentas disponíveis para a análise de estruturas macromoleculares, juntamente com a explificação de novas abordagens e metodologias para o estudo das macromoléculares.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Bioinformática.
Ano: 2002 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/8680
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Proposta de adaptação do processo de construção de roadmap para uso na gestão do arranjo de projetos DataExp. Infoteca-e
HIGA, R. H.; BAMBINI, M. D.; SANTOS, A. D. dos; ALENCAR, J. R. de; PESSOA, J. D. C..
Considerações sobre a metodologia de construção de roadmaps e gestão de arranjos. Processo adaptado para construção de roadmap. Fase de Preparação. Fase de Construção. Camada de Mercado/Negócio. Camada de Produtos/Serviços. Camada de Tecnologia/Recursos.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Arranjo de projetos; Tecnologia roadmap; Planejamento estratégico; Adoção de inovações; Innovation adoption.
Ano: 2017 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1084309
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Rotâmeros raros no Java Protein Dossier. Infoteca-e
YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; OLIVEIRA, S. R. de M.; HIGA, R. H.; SANTOS, E. H. dos; MAZONI, I.; VIEIRA, F. D.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G..
O objetivo deste trabalho é apresentar a metodologia usada para incorporar ao JPD a informação sobre os rotâmeros raros presentes em cada estrutura proteica.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Java Protein Dossier; Rotâmeros raros; Bioinformática.
Ano: 2006 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/3002
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Sistema de gerenciamento de campos experimentais - SiCamp. Infoteca-e
HIGA, R. H.; FARIA, C. M..
O mapa do campo experimental. Principais funcionalidades do sistema. Resultados parciais e trabalhos futuros.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Gerenciamento de campos experimentais; Software para Windows; Experimental fields; Computer software.
Ano: 1999 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/7515
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Sistema de gerenciamento de informações laboratoriais Infolab. Infoteca-e
CUNHA, L. M. S.; HIGA, R. H.; FERREIRA, J. R.; SPOSITO, G..
Requisitos do sistema InfoLab. Principais funcionalidades do InfoLab. Resultados e trabalhos futuros.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Gerenciamento de informação laboratorial; Laboratory information system; Laboratory management information systems; Information systems.
Ano: 1999 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/7519
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Sistema de Informação da Rede Genômica Animal - Sirga: manual do usuário. Infoteca-e
HIGA, R. H.; LONG, C. K..
O software Sirga baseia-se em uma plataforma de banco de dados relacional e acesso via web, tal que o sistema pode ser acessado de qualquer local que tenha acesso à internet. Este documento apresenta os pré-requisitos necessários para utilização do sistema e uma descrição de suas funcionalidades.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Software Sirga; Microarranjos; Biotecnologia; Computer software; Microarray technology; Biotechnology.
Ano: 2011 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/920174
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SMSLib - biblioteca C++ do Sting Millennium Suite. Infoteca-e
HIGA, R. H.; BAUDET, C.; MANCINI, A. L.; MATTIUZ, A. R.; FREITAS, E. M. de; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G..
Organização lógica do SMS. Descrição da SMSLib. Leitura de arquivos PDB. Leitura de arquivos HSSP. Leitura de arquivos com parâmetros simples. Cálculo e leitura de contatos. Cálculo e leitura de Dihedral Angels.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Sting Milleninum Suite; SMS; SMSLib; Biblioteca C++.
Ano: 2002 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/8637
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Tutorial: introdução ao software brblup. Infoteca-e
HIGA, R. H..
Este tutorial apresenta uma parte do resultado obtido até o presente momento no desenvolvimento do brbv e seus aplicativos. Trata-se de um passo a passo para iniciantes com a apresentação de diversos exemplos que ilustram tanto a forma de especificar uma gama de modelos utilizados na avaliação genética de animais como a utilização brblup para obtenção dos correspondentes valores genéticos.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Tutorial; Software; Software brblup; Computer software.
Ano: 2020 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1127935
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Um modelo orientado a objetos para o cálculo da estimativa da área acessível a solvente. Infoteca-e
MOURA, M. F.; HIGA, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B..
Neste trabalho é apresentada uma descrição do DCLM e uma possível solução de projeto orientada a objetos. Esta solução será codificada em C++, provendo uma nova implementação para o método de propriedade da Embrapa.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Bioinformática; Área acessível a solvente; Modelo orientado a objeto; Análise da estrutura de proteínas; Grid cúbico; Accessible Surface Area; Double Cubic Lattice Method.
Ano: 2004 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1706
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Uso de Filtro de Kalman para processamento de dados de pesagem diária para bovinos de corte. Infoteca-e
HIGA, R. H.; CARROMEU, C.; OLIVEIRA, C. C. de; ALMEIDA, R. G. de; SPERANZA, E. A..
Resumo - O presente estudo analisa a utilização de Filtros de Kalman (FK) para processamento de dados de pesagem diária de bovinos de corte utilizando um conjunto composto por pesagens diárias de 36 animais, coletados por 209 dias. Os resultados demonstram que o processamento de dados de pesagem diária com o Filtro de Kalman Polinomial (FKP) reduz o nível de ruído presente nos dados, viabiliza a extração do ganho de peso diário por animal, bem como torna factível a realização de predições do peso, por animal, 30 dias à frente. Adicionalmente, a utilização do FK não impacta a tomada de decisão no contexto do lote, uma vez que o peso médio dos animais no lote também não é afetado pelo FK.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Bovino de corte; Bovinos de corte; Filtro de Kalman; Pecuária de precisão; Ganho de peso diário; Kalman filter; Precision livestock farming; Daily weight gain; Gado Nelore; Peso; Beef cattle.
Ano: 2022 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1150330
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Utilização do software GRASP para gerar arquivo de coordenadas com valores de potencial eletrostático. Infoteca-e
FALCAO, P. R. K.; BAUDET, C.; MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; NESHICH, G..
Com o intuito de disponibilizar um banco de dados de valores de potencial eletrostático para todas as estruturas de proteínas depositadas no PDB, foi utilizado o programa GRASP (Graphical Representation and Analysis of Structural Properties) (Nicholls et al., 1991) para geração deste banco de dados.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Software GRASP; Graphical Representation and Analysis of Structural Properties; Sting.
Ano: 2002 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/8625
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