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Desenvolvimento de teste de genotipagem em bovinos para o SNP A1/A2 do gene da beta caseína, usando a técnica de tetra-primer ARMS-PCR. Repositório Alice
MALUF, V. H. H. K.; LIMA, T. R. de; CAMPOS, R. A.; SOARES, I. K. de A.; PEREIRA, H. P.; DOMINGUES, R.; REIS, D. R. de L.; MARTINS, M. F.; PANETTO, J. C. do C.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A..
O leite é um alimento rico em nutriente e proteínas, sendo um alimento muito importante na saúde humana. A beta caseína é uma das proteínas mais abundantes no leite bovino, e 12 variantes já foram descritas na literatura. As mais encontradas são as variantes A1 e A2, que diferem entre si por uma troca de nucleotídeo (SNP), que acarreta uma troca de aminoácido. A digestão da beta caseína A1 no trato gastrintestinal humano tem como um de seus produtos finais um peptídeo bioativo denominado beta casomorfina 7, que foi relacionado a várias doenças em humanos. Amostras de DNA de touros da raça Girolando, previamente genotipados para este SNP, foram usados para o desenvolvimento de uma metodologia de genotipagem por tetra-primer ARMS-PCR. Após várias...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Beta-caseína; A1A2; Genotipagem; ARMS-PCR; Bovino.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1134696
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Calcium partition in Minas Padrão cheese and its bioaccessibility during ripening time. Repositório Alice
PEREIRA, J. P. F.; MAGESTE, A. C.; CAMPOS, N. DA S.; SOUSA, R. A. DE; FRANCISQUINI, J. A.; PERRONE, I. T.; CARVALHO, A. F. DE; NUNES, R. M.; MARTINS, M. F.; SILVA, P. H. DA F. DA.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Minerals; Cheeses; Calcium.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1118149
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Comparação de parâmetros bioquímicos e celulares de bezerros taurinos e zebuínos ao nascimento: implicações clínicas e associação com fenótipos de resistência contra carrapatos. Repositório Alice
LOURES, C.; SOARES, G.; SOARES, I. K. de A.; CUNHA FILHO, J. A. da; DOMINGUES, R.; GASPAR, E. B.; REIS, D. R. de L.; CAMPOS, M. M.; MARTINS, M. F.; PRATA, M. C. de A.; MACHADO, M. A.; CARVALHO, W. A..
Bovinos taurinos e zebuínos apresentam respostas fenotípicas contrastantes de resistência à endo e ectoparasitas, como o carrapato Rhipicephalus microplus. Para caracterização da resposta imune que medeia esses fenótipos antes da exposição ao carrapato bovino foram feitas análises dos parâmetros celulares e bioquímicos em neonatos holandeses (taurino) e Gir (zebuíno), antes do recebimento de colostro. O hematócrito, volume globular, hemoglobina e leucometria global apresentaram-se significativamente diminuídos em animais holandeses. Esses mesmos bezerros também apresentaram número maior de picos febris, indicativo de inflamação sistêmica, quando comparados aos animais Gir, sugerindo que a rusticidade de animais zebuínos pode ser inata e estar associada com...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Resposta imune; Parâmetro bioquímico; Gado Gir; Gado Holandês; Bezerro; Rhipicephalus microplus.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1134687
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Comparação de parâmetros celulares e bioquímicos de sangue periférico de vacas taurinas (Holandês) e zebuínas (Gir) no pós-parto imediato. Repositório Alice
SOARES, G.; LOURES, C.; SOARES, I. K. de A.; CUNHA FILHO, J. A. da; DOMINGUES, R.; GASPAR, E. B.; REIS, D. R. de L.; MARTINS, M. F.; PRATA, M. C. de A.; MACHADO, M. A.; CARVALHO, W. A.; CAMPOS, M. M..
Bovinos taurinos e zebuínos apresentam características de resistência a endo e ectoparasitas e estresse térmico distintas em cada raça, estando altamente correlacionado com a evolução das espécies em regiões europeias e tropicais, respectivamente. O desenvolvimento de resposta imune, com participação de células e fatores bioquímicos, medeia alterações metabólicas e fisiológicas que refletem nos fenótipos apresentados, sendo de extrema importância caracterizar esses fenômenos imunológicos. Nesse sentido, foram comparados parâmetros celulares e bioquímicos de sangue periférico de vacas taurinas (Holandês) e zebuínas (Gir) no pós-parto imediato. Foram detectadas diferenças significativas na concentração de hemoglobina corpuscular média (CHCM), no número de...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Raça taurina; Raça zebuína; Resposta imune; Carrapato; Raça; Gado Holandês; Gado Gir.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1134691
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Detecção de células viáveis de Salmonella spp. em queijo Coalho pela técnica de PCR em Tempo Real. Repositório Alice
VIEIRA, F. de O.; MENDONÇA, J. F. M. de; FONSECA, I.; ARCURI, E. F.; RIBEIRO, J. B.; MARTINS, M. F..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: EMA-PCR; Metodologias moleculares; Segurança do alimento.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1033998
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Gene expression profile in zebu dairy cows (Bos taurus indicus) with mastitis caused by Streptococcus agalactiae. Repositório Alice
FONSECA, I.; CARDOSO, F. F.; HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; BRANDAO, H. de M.; BRITO, M. A. V. P. e; FERREIRA, M. B. D.; GUIMARÃES, S. E. F.; MARTINS, M. F..
Mastitis is an inflammatory response in the mammary gland caused by an influx of somatic cells, composed mainly of neutrophils, macrophages and lymphocytes. The speed and efficacy of the host?s immune response to the invasive pathogen affects the establishment, persistence and severity of the infection. To characterize the gene expression and response mechanism to infection by Streptococcus agalactiae (S. agalactiae) in zebu dairy cows of the Gyr breed, we carried out a transcriptome study of the cells present in the milk from 17 animals.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Mamite; Gado leiteiro; Gado zebu; Glândula mamária.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1024996
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DNA proviral do Vírus da Artrite Encefalite Caprina (CAEV) em sêmen durante infecção aguda e crônica. Repositório Alice
SOUZA, K. C.; ANDRIOLI, A.; PINHEIRO, R. R.; SIDER, L. H.; MARTINS, M. F.; MOTTA, I. G. B.; PEIXOTO, R. M.; TEIXEIRA, M. F. S..
Resumo: Sabe-se que o Vírus da Artrite Encefalite Caprina (CAEV) é transmitido pela via reprodutiva, portanto, faz-se necessário um entendimento da dinâmica do CAEV no sêmen de reprodutores tanto na infecção aguda como em infecção crônica. Para a previsão da magnitude do CAEV no sêmen e o tempo de máximo risco da transmissão sexual do lentivírus. Para tanto, 11 reprodutores caprinos (n = 5) recentemente infectados e (n = 6) em fase crônica da infecção tiveram sêmen coletado ao longo de três meses. O DNA das amostras foi extraído utilizando QIAamp DNA mini kit (QIAgen, USA) de acordo com as instruções do fabricante. Dois rounds da reação em cadeia da polimerase nested (nPCR) foram realizados para amplificar um fragmento de 185pb do DNA proviral do CAEV com...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Gag gene; Provirus; Recent infection; Caprino; Transmissão de Doença; Caprine arthritis encephalitis virus; Sexually transmitted diseases.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107403
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Comparação dos métodos manual e automatizado de extração de DNA no Laboratório de Genética Molecular. Repositório Alice
MARTINS, S. A. V.; FONSECA, I.; VIEIRA, F. de O.; MENDONÇA, J. F. M. de; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Material genético; Método automatizado.; Qualidade..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1042766
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Single nucleotide variants and InDels identified from whole-genome re-sequencing of Guzerat, Gyr, Girolando and Holstein cattle breeds. Repositório Alice
STAFUZZA, N. B.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B. da.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Molecular mechanisms; Raças bovinas; Genomic markers; Sires.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1069769
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Tick saliva promotes alterations on cell cycle phases of PMA-stimulated lymphocytes: implications on bovine immunity to other diseases. Repositório Alice
CUNHA FILHO, J. A. da; SOARES, I. K. de A.; SOARES, G. O.; LOURES, C. de O.; DOMINGUES, R.; GASPAR, E. B.; REIS, D. R. de L.; MARTINS, M. F.; PRATA, M. C. de A.; MACHADO, M. A.; CAMPOS, M. M.; CARVALHO, W. A..
Evento online. IMMUNO 2021.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Riphicephalus microplus; Ciclo celular; Bovino; Carrapato.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1139340
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Susceptibilidade de larvas de Spodoptera frugiperda de varias idades, a Bacillus thurigiensis sv. tolworthi. Repositório Alice
MARTINS, M. F.; VALICENTE, F. H.; PAIVA, E.; CARVALHO, C. H. S.; FIGUEIREDO, J. E. F..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Praga de planta.
Ano: 1994 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/487167
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Detection of potential genetic variants affecting gene function in Guzerat cattle. Repositório Alice
ZERLOTINI NETO, A.; STAFUZZA, N. B.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; SILVA, M. V. G. B..
Guzerat is a dual-purpose breed recognized for important traits to its adaptation to adverse tropical environments such as resistance to parasites, heat tolerance and ability to intake forage with low nutritional value. Once genetic variation responsible for this traits has so far not been well characterized, the aim of this study was to identity single nucleotide variants (SNVs) and insertion/deletions (Indels) in Guzerat cattle breed from whole genome re-sequencing in order to characterize loss-of-function variants which could be associated with complex traits in this cattle breed.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Bioinformática; Single nucleotide variants; Bioinformatics; Cattle.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1067540
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Genetic Parameters for Milk Yield and Lactation Persistency Using Random Regression Models in Girolando Cattle. Repositório Alice
CANAZA-CAYO, A. W.; LOPES, P. S.; SILVA, M. V. G. B.; TORRES, R. de A.; MARTINS, M. F.; ARBEX, W. A.; COBUCI, J. A..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Genetic Parameters; Lactation Persistency; Legendre's Polynomials; Random Regression Model.; Genetic trend.; Cattle.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1037164
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Expressed sequenced tags profiling of resistant and susceptible Gyr x Holstein cattle infested with the tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Repositório Alice
NASCIMENTO, C. S.; MACHADO, M. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; MARTINS, M. F.; PEIXOTO, J. de O.; FURLONG, J.; PRATA, M. C. de A.; VERNEQUE, R. da S.; TEODORO, R. L.; LOPES, P. S..
Tick resistance in cattle is mainly found in zebu (Bos indicus) animals, although it is also present in some taurine (B. taurus) breeds. In order to characterize functional genes involved in tick resistance/susceptibility in cattle, two cDNA libraries were generated using skin tissues of selected Holstein x Gyr animals. A total of 2700 high-quality reads from both resistant and susceptible cDNA were assembled into 458 sequences (contigs) and 834 singletons, with a mean size of 447.7 nucleotides. Assignment of homologous proteins by BLASTX revealed 790 (61.1%) and 300 (23.2%) hits in resistant and susceptible cDNA, respectively; 121 of these hits matched bovine proteins. A total of 502 (38.9%) unique sequences were found to have no significant homology with...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Bovino; Genética..
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/919920
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Spittle protein profile of Mahanarva spectabilis (Hemiptera: Cercopidae) fed various elephant grass genotypes. Repositório Alice
AUAD, A. M.; MARTINS, M. F.; FONSECA, I. A.; PAULA-MORAES, S. V. de.; KOPP, M. M.; CORDEIRO, M. C. R..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Forragem; Capim Elefante..
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/942246
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Single nucleotide variants and InDels identified from whole-genome re-sequencing of Guzerat, Gyr, Girolando and Holstein cattle breeds. Repositório Alice
STAFUZZA, N. B.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B..
Whole-genome re-sequencing, alignment and annotation analyses were undertaken for 12 sires representing four important cattle breeds in Brazil: Guzerat (multi-purpose), Gyr, Girolando and Holstein (dairy production). A total of approximately 4.3 billion reads from an Illumina HiSeq 2000 sequencer generated for each animal 10.7 to 16.4-fold genome coverage. A total of 27,441,279 single nucleotide variations (SNVs) and 3,828,041 insertions/deletions (InDels) were detected in the samples, of which 2,557,670 SNVs and 883,219 InDels were novel. The submission of these genetic variants to the dbSNP database significantly increased the number of known variants, particularly for the indicine genome. The concordance rate between genotypes obtained using the Bovine...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Single nucleotide variations; Important traits; Genetic variants; Gado; Variação genética; Genome; Single nucleotide polymorphism; Cattle breeds.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1086824
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Genetic association of variations in the kappa-casein and beta-lactoglobulin genes with milk traits in girolando cattle. Repositório Alice
BARBOSA, S. B. P.; ARAÚJO, Í. I. M. DE; MARTINS, M. F.; SILVA, E. C. DA; JACOPINI, L. A.; BATISTA, Â. M. V.; SILVA, M. V. G. B..
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: SNP genotyping; Milk protein; Quantitative traits; Dairy cattle; Milk proteins; Dairy industry.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1117889
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New single sucleotide polymorphisms in Guzerá breed revealed by whole-genome re-sequencing. Repositório Alice
CRUZ, I. R.; GERALDO, J. A.; OLIVEIRA, F. S. de; LEITE, L. R.; ARAÚJO, F.; ZERLOTINI, A.; LOPES, B. C.; ARBEX, W. A.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B.; COIMBAR, R. S.; CARVALHO, M. R. S.; OLIVEIRA, G..
The objective of our work was to sequence and assemble the Guzerá genome in order to identify race-­specific variations that might be used in breeding programs.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Criação de animais; Análise de sequência de genomas; Single nucleotide polymorphism; Animal breeding; Sequence analysis; Genomics.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/973157
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Análise eletroforética microluídica "Lab-on-a-chip" das proteinas do leite para detectar adulteração de leite bovino adicionado com soro. Repositório Alice
SANTOS, A. S. DE O; MEURER, V. M.; PINTO, I. S. B.; NASCIMENTO, L. S. DE Q.; BORGES, C. A. V.; EGITO, A. S. do; FURTADO, M. A. M.; MARTINS, M. F..
[Lab-on-a-chip microfluidic electrophoretic analisys of milk proteins to detect additional whey in bovine milk adulteration].
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Adulteração do leite; Métodos de análise; Identificação do leite; Milk protein.; Cow milk; Feed adulteration; Caprino; Leite de cabra; Adulteração; Eletroforese; Análise química; Proteína; Goat milk; Electrophoresis; Analytical methods..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1033593
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A gene-transcription factor network associated with residual feed intake based on SNVs/InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds. Repositório Alice
VERARDO, L. L.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; ZERLOTINI NETO, A.; CHUD, T. C. S.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B..
The aim of this study was to analyze whole-genome re-sequencing data focusing on SNVs and InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds related to RFI. Thus, genes showing SNVs/InDels in TF binding sites (5' UTR variants) were used to search for TF related to feed intake and to generate a gene-TF network for RFI across two purebred and one admixed dairy cattle breeds. Moreover, we were able to perform a comparative analysis accessing similarities and dissimilarities at the genomic level across these breeds.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Sequência de dados; Single Nucleotide Variations (SNVs); Insertions/deletions (InDels); Whole-genome; Whole-genome re-sequencing data; Gado de Corte; Bos Indicus; Variação Genética; Cattle breeds.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1105518
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