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Registros recuperados: 66 | |
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Acharya,Laxmikanta; Mukherjee,Arup Kumar; Panda,Pratap Chandra. |
Random amplified polymorphic DNA (RAPD), Inter simple sequence repeat (ISSR) and Amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers were used to verify the segregation of the genus Cassia L. senso lato into three distinct genera namely Chamaecrista Moench., Senna P. Mill. and Cassia L. sensostricto Eighteen representatives of the three taxa were characterized using the molecular markers. 25 RAPD, six ISSR primers and six AFLP primer combinations resulted in the amplification of 612, 115 and 622 bands (loci) respectively. Most of the loci are found to be polymorphic, showing high degrees of genetic diversity among the different taxa studied. The dendrogram constructed on the basis of the RAPD, ISSR and AFLP data using SHAN clustering, divided Cassia L.... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: AFLP; Cassia; ISSR; Molecular phylogeny; RAPD. |
Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-33062011000100026 |
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Aguirre,Carlos; Alvarado,Roberto; Hinrichsen,Patricio. |
Doce cultivares y líneas de arroz (Oryza sativa L.) desarrollados por el programa de fitomejoramiento del Instituto de Investigaciones Agropecuarias (INIA), Centro Regional de Investigación Quilamapu, fueron caracterizados genéticamente mediante amplificación de fragmentos polimórficos (AFLP). De 21 combinaciones ensayadas, sólo 16 fueron informativas, generando un total de 667 amplicones, 94 de ellos polimórficos (14,4%), con un rango entre 9 y 33% de polimorfismo por combinación. Esto indica que el material manejado por el programa de INIA presenta un bajo nivel de diversidad genética comparado tanto con germoplasma silvestre de la especie como con aquel usado por otros programas de fitomejoramiento de la especie. Los amplicones polimórficos detectados... |
Tipo: Journal article |
Palavras-chave: Diversidad genética; Fingerprinting; AFLP; Pedigrí; Cultivares chilenos de arroz. |
Ano: 2005 |
URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0365-28072005000400002 |
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Ercisli,Sezai; Kafkas,Ebru; Orhan,Emine; Kafkas,Salih; Dogan,Yildiz; Esitken,Ahmet. |
The Coruh Valley, located in Northeastern Turkey, is one of the most important centers of diversity in pomegranate in Turkey. In this study, we attempted to characterize 19 promising pomegranate genotypes originating from the Coruh Valley in using fluorescent dye AFLP markers and capillary electrophoresis. Four AFLP primer combinations were used, generating a total of 297 fragments, 213 of which were polymorphic (73.0%). Resolving powers of the AFLP primers ranged from 0.700 to 1.018, with a total of 3.440, while polymorphism information contents ranged from 0.707 to 0.837 with an average of 0.764. UPGMA clustering of the genotypes showed two major groups. Most of the fruit characteristics of the genotypes within the same group were variable. Therefore,... |
Tipo: Journal article |
Palavras-chave: Genetic diversity; AFLP; Pomegranate. |
Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0716-97602011000400005 |
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Paterniani,Maria Elisa Ayres Guidetti Zagatto; Guimarães,Paula de Souza; Lüders,Reginaldo Roberto; Gallo,Paulo Boller; Souza,Anete Pereira de; Laborda,Prianda Rios; Oliveira,Karine Miranda. |
Objetivou-se avaliar o desempenho de híbridos simples de milho (Zea mays L.), obtidos de cruzamentos dialélicos entre linhagens divergentes, estimar a capacidade de combinação das linhagens e verificar se a divergência genética entre as linhagens, obtida por marcadores moleculares, é correlacionada com a heterose dos híbridos simples no campo. Trinta e seis híbridos resultantes de um dialelo parcial foram avaliados em Campinas e em Mococa e as 12 linhagens parentais somente em Campinas, a fim de se calcular a heterose dos híbridos. O delineamento experimental empregado foi o de blocos ao acaso, com três repetições e 2 testemunhas comerciais. Avaliaram-se os caracteres: altura da planta (AP), altura da espiga (AE) e massa de grãos (MG). Análises de... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Zea mays; Dialelo parcial; Produtividade; AFLP; SSR. |
Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052008000300012 |
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Vieira,Eduardo Alano; Carvalho,Fernando Irajá Félix de; Oliveira,Antônio Costa de; Benin,Giovani; Zimmer,Paulo Dejalma; Silva,José Antônio Gonzalez da; Martins,Andreza Figueirola; Bertan,Ivandro; Silva,Giovani Olegário da; Schmidt,Douglas André Mallman. |
A estimativa da divergência genética entre cultivares pode ser útil em um programa de melhoramento para o direcionamento de hibridações e o conhecimento do germoplasma disponível. O objetivo do trabalho foi estimar a dissimilaridade genética entre genótipos de aveia (Avena sativa), por meio de marcadores AFLP e do coeficiente de parentesco, e correlacionar essas estimativas entre si e com a estimativa da dissimilaridade genética a partir de caracteres agronômicos em experimentos com e sem a aplicação de fungicida. Onze cultivares de aveia foram utilizadas na estimativa da distância genética a partir de marcadores AFLP. Desses 11 genótipos, nove foram avaliados no campo em experimento com e sem fungicida, para a estimativa da divergência genética a partir... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Aveia-branca; Divergência genética; AFLP; Coeficiente de parentesco; Distância fenotípica. |
Ano: 2005 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052005000100006 |
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Sousa,Cristina Soares de; Bonetti,Ana Maria; Goulart Filho,Luiz Ricardo; Machado,Jane Rodrigues de Assis; Londe,Luciana Nogueira; Baffi,Milla Alves; Ramos,Renato Graciliano; Vieira,Carlos Ueira; Kerr,Warwick Estevam. |
Considerando a restrita diversidade de espécies disponíveis para nutrir a carência de vitaminas no Brasil, Kerr e colaboradores, desde 1981, vêm desenvolvendo pesquisas para melhoramento genético de hortaliças ricas em vitamina A. Dentre elas, obtiveram uma cultivar de alface, denominada Uberlândia 10.000 com 10.200 UI de vitamina A em 100 gramas de folha fresca. Este trabalho objetivou comparar o grau de divergência genética entre a cultivar Uberlândia 10.000 e seus parentais para avaliar a eficiência da seleção utilizada, por meio da técnica AFLP. Foram utilizados os seguintes genótipos de alface: Maioba, Salad Bowl-Mimosa, Moreninha-de-Uberlândia, Vitória de Santo Antão, Uberlândia 10.000 lisa 8.ª e 9.ª geração e Uberlândia 10.000 crespa 8.ª e 9.ª... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Divergência genética; AFLP; Alface. |
Ano: 2007 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052007000100002 |
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Shinya,Luciane Tieko; Baccaro,Maria Regina; Moreno,Andrea Micke. |
Clostridium perfringens is an important pathogen in human and veterinary medicine. In swine, the agent is responsible for necrotic enteritis and enterotoxemia characterized by diarrhea, weight loss, delayed development and, in some cases, death. In the present study amplified fragment length polymorphism analyses (AFLP) was used to characterize 54 C. perfringens strains isolated from swine presenting diarrhea. Analysis of the results showed 29 distinct profiles with discriminatory index equal to 0.97. Partial correlation between the origin of the isolates and groups was drawn, and correlation was possible in only 18.5% of the samples. Characterization of the strains in biotypes (A, B, C, D and E), production of beta-2 toxin and enterotoxin were performed... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: AFLP; Diarrhea; Piglets; Clostridium perfringens. |
Ano: 2006 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822006000300034 |
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Peres,Ângela Pimenta; Silva-Mann,Renata; Vieira,Maria das Graças G. C.; Machado,José da Cruz. |
Objetivou-se, com este trabalho, verificar a variabilidade morfocultural e genética de fungos associados à podridão peduncular do mamão (Carica papaya L.). As avaliações morfoculturais foram feitas pelo índice de crescimento micelial e características das colônias, como coloração e tipo de micélio, quando os isolados foram crescidos em diferentes meios de cultura (BDA, MDA e Czapek). A variabilidade genética foi verificada por meio de análises de AFLP. Os isolamentos foram feitos em frutos obtidos de diferentes regiões produtoras do Brasil. Foram estudados oito isolados de cada uma das três espécies mais incidentes (Colletotrichum gloeosporioides, Phoma caricae-papayae e Fusarium solani). Foi verificado que os meios BDA e MDA promoveram um maior e mais... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Colletotrichum gloeosporioides; Phoma caricae-papayae; Fusarium solani; AFLP; Carica papaya. |
Ano: 2003 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542003000500012 |
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Borba,Regina da Silva; Loeck,Alci Enimar; Branco,Juliana Severo Castelo; Bonow,Juliane; Oliveira,Antônio Costa de. |
Este trabalho teve por objetivo estudar a possível ocorrência de heterocariose por meio do pareamento de fungos provenientes de diferentes espécies de formigas cortadeiras coletados em diferentes regiões do Estado do Rio Grande do Sul, utilizando a técnica AFLP. Dez grupos de pareamentos foram realizados, sendo que em dois não ocorreu a fusão das colônias. Após ocorrerem os pareamentos, foram coletados discos de micélio da área de intersecção das colônias e das áreas extremas de pareamento, para a realização da extração do DNA e padronização. Para as reações de PCR, utilizaram-se 21 combinações de primers AFLP, dos quais foram selecionados três que apresentaram maior polimorfismo e consistência. Os dados moleculares foram transformados em matriz binária e... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Compatibilidade vegetativa; Marcadores moleculares; Variabilidade; AFLP. |
Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782008000500002 |
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Borba,Regina da Silva; Loeck,Alci Enimar; Branco,Juliana Severo Castelo; Kopp,Maurício Marini; Oliveira,Antônio Costa de. |
O presente trabalho teve por objetivo verificar o efeito de diferentes períodos de luz ultravioleta sobre a similaridade genética do fungo simbionte de formigas cortadeiras pertencentes às espécies Acromyrmex ambiguus, Acromyrmex crassispinus e Acromyrmex lundi, através da técnica AFLP. Os fungos foram inoculados em meio de cultura Pagnocca e mantidos em câmaras climatizadas à temperatura de 25 + 1°C e escotofase de 24h, por um período de 15 dias. Posteriormente, foram expostos à luz ultravioleta por períodos de: 0, 5, 10, 15, 20, 25 e 30 minutos. Aos 45 dias após o tratamento, foi realizada a extração do DNA e padronização, realizando-se as reações de PCR por meio de 24 combinações de primers AFLP, das quais quatro foram selecionadas por apresentarem... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: AFLP; Marcadores moleculares; Simbiose. |
Ano: 2007 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782007000500001 |
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Mega,Nicolás Oliveira; Revers,Luís Fernando. |
Here, it is presented a rapid and efficient method to obtain good quality DNA from small samples of arthropod tissues generating low quantities of hazardous wastes. This new method was compared with another homemade protocol using phenol and other two commercial kits. The quality of DNA obtained was checked by spectrophotometer and evaluated by an AFLP assay. Low shearing DNA was obtained from all samples and the best readings were observed to DNA recollected with the new method. The AFLP assay indicated that DNA obtained with all methods were suitable for use in molecular biology techniques sensitive to contaminants. However, homemade protocols were more efficient in recollect DNA than commercial kits, without lose any quality of samples. Also, they were... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Arthropod DNA; High quality DNA; Molecular biology; AFLP. |
Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782011000900012 |
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