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Visual selection of Urochloa ruziziensis genotypes for green biomass yield Agronomy
Teixeira, Davi Henrique Lima; Gonçalves, Flávia Maria Avelar; Nunes, José Airton Rodrigues; Souza Sobrinho, Fausto; Benites, Flávio Rodrigo Gandolfi; Dias, Kaio Olímpio das Graças.
The breeding program of Urochloa ruziziensis evaluates many genotypes in initial phases. Evaluations through grades might make the selection less costly. The aim of this study was to verify the efficiency of visual selection for green biomass yield in relation to different selection strategies, such as mass selection by phenotypic mean, BLUP (Best Linear Unbiased Prediction) and at random. For this purpose, 2,309 regular genotypes were evaluated in an augmented block design in two cuts. The evaluators gave grades for plant vigor, and later, the plots were measured for green biomass yield. The coincidences of the selected genotypes were estimated by different selection strategies. Then, 254 clones of the genotypes selected in different strategies were...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Mass selection; Realized heritability; BLUP; Brachiaria..
Ano: 2019 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/42444
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Parental selection in diallel crosses of Jatropha curcas using mixed models Agronomy
Laviola, Bruno Galvêas; Teodoro, Paulo Eduardo; Peixoto, Leonardo de Azevedo; Bhering, Leonardo Lopes.
Diallel crosses in an unbalanced scheme were carried out in Jatropha to (i) evaluate the additive and non-additive genetic components; (ii) select parents through the general combining ability; (iii) estimate the specific combining ability used in the crosses; and (iv) verify the existence of the maternal effect and inbreeding depression. The experiment was carried out in a complete diallel scheme with four progenitors, unbalanced for the number of crosses. The experimental design consisted of a randomized block, with 5 replications and 3 plants per plot. The following characteristics were evaluated: stem diameter (SD), number of branches (NB), plant height (PH), canopy projection on the row (CPR), canopy projection between rows (CPB), mass of hundred...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Combining ability; REML; BLUP; Plant breeding.; Melhoramento vegetal.
Ano: 2018 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/35008
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Parental selection in diallel crosses of Jatropha curcas using mixed models Agronomy
Laviola, Bruno Galvêas; Teodoro, Paulo Eduardo; Peixoto, Leonardo de Azevedo; Bhering, Leonardo Lopes.
Diallel crosses in an unbalanced scheme were carried out in Jatropha to (i) evaluate the additive and non-additive genetic components; (ii) select parents through the general combining ability; (iii) estimate the specific combining ability used in the crosses; and (iv) verify the existence of the maternal effect and inbreeding depression. The experiment was carried out in a complete diallel scheme with four progenitors, unbalanced for the number of crosses. The experimental design consisted of a randomized block, with 5 replications and 3 plants per plot. The following characteristics were evaluated: stem diameter (SD), number of branches (NB), plant height (PH), canopy projection on the row (CPR), canopy projection between rows (CPB), mass of hundred...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Ciências Agrárias combining ability; REML; BLUP; Plant breeding. Melhoramento vegetal.
Ano: 2018 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/35008
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El valor genotípico en la selección de líneas de frijol Agrociencia
Bertoldo,Juliano Garcia; Coutinho,Gilberto de Lima; Pelisser,Amanda; Favreto,Rodrigo; Silva,Raquel Paz da.
El mejorador puede usar diferentes procedimientos para identificar los genotipos superiores en los experimentos preliminares de líneas (EPLs); lo más común es la observación del fenotipo en campo (denominado de valor fenotípico) y se usan las medias obtenidas para estimar el rendimiento de grano. Una alternativa es predecir el valor genotipico por medio del predictor lineal e insesgado (BLUP), por lo cual el objetivo del presente estudio fue identificar líneas de frijol (Phaseolus vulgaris L.) superiores en un EPL para usar en pruebas de valor de cultivo y uso (VCU), a partir de la estimación de los valores fenotípicos y la predicción de los valores genotípicos. El experimento se realizó en campo en el año agrícola de 2012/2013 (1° y 2° ciclos de cultivo),...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Phaseolus vulgaris L.; Mejoramiento de plantas; BLUP.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-31952015000500007
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Efeito da violação de pressuposições da metodologia de modelos mistos na avaliação genética animal Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Fonseca,R.; Euclydes,R.F.; Torres,R.A.; Ribeiro Júnior,J.I.; Lopes,P.S.; Silva,M.A..
Estudos de simulação foram conduzidos para verificar o efeito da violação de pressuposições da metodologia de modelos mistos, variâncias genéticas conhecidas sem erro e distribuição normal dos erros aleatórios sobre os ganhos genéticos obtidos durante 10 gerações de seleção. Outros parâmetros, como valor fenotípico e acurácia, também foram avaliados. Inicialmente, foi simulado um genoma constituído de uma única característica quantitativa governada por 500 locos. O genoma foi utilizado na construção de uma população-base, na qual a característica quantitativa possuía herdabilidade inicial de 0,10. Para se obter uma estrutura de parentesco a partir das populações-base, foi gerada uma população inicial a partir da qual o processo de seleção teve início e os...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: BLUP; Metodologia de modelos mistos; Pressuposições; Variância genética aditiva; Distribuição dos erros aleatórios.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352001000100020
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Comparação de metodologias de seleção sob oscilação genética Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Carneiro,P.L.S.; Malhado,C.H.M.; Affonso,P.R.A.M.; Euclydes,R.F.; Carneiro,A.P.S.; Cunha,E.E.; Souza,L.G.R..
Determinou-se o número adequado de repetições na comparação de métodos de seleção tradicionais e associados a marcadores moleculares, com diferentes tamanhos efetivos e sob diferentes sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados, usando simulação com o programa GENESYS. Para comparar os diferentes métodos de seleção utilizaram-se populações com tamanhos efetivos de 18,18 (TE1) e de 66,66 (TE2) e uma, 10 e 30 repetições por geração, avaliando-se os valores fenotípicos médios. Para as situações com apenas uma repetição, os resultados apresentaram incoerências, independentemente do tamanho efetivo (TE1 ou TE2) ou do sistema de acasalamento (RAA - reprodutores acasalados aleatoriamente, EIC - exclusão de irmãos completos ou EICMI - exclusão de irmãos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: BLUP; Marcador molecular; Tamanho efetivo de população; Sistema de acasalamento.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352008000400024
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Estabilidade de cultivares e linhagens de feijoeiro em diferentes ambientes no estado de São Paulo Bragantia
Carbonell,Sérgio Augusto Morais; Chiorato,Alisson Fernando; Resende,Marcos Deon Vilela de; Dias,Luiz Antônio dos Santos; Beraldo,Ana Luiza Ahern; Perina,Eliana Francischinelli.
O presente trabalho teve como objetivos realizar a avaliação genotípica de linhagens de feijoeiro no Estado de São Paulo pela estimativa dos valores genotípicos das linhagens para cada local e também para o ambiente médio de todos os locais. Estudos da adaptabilidade e estabilidade dos valores genotípicos preditos foram realizados pelo procedimento BLUP. A cultivar Graúna e a linhagem GEN 96A31 apresentaram superioridade média de 10% sobre a média geral dos 15 ambientes. Os valores foram computados já penalizando as linhagens pela instabilidade através dos locais e ao mesmo tempo capitalizando a capacidade de resposta (adaptabilidade) à melhoria do ambiente, usando propriedades intrínsecas ao método MHPRVG (Média Harmônica da Performance Relativa dos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: BLUP; MHPRVG; Phaseolus vulgaris; Melhoramento; Adaptabilidade.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052007000200003
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Desempenho genotípico de linhagens de arroz de terras altas utilizando metodologia de modelos mistos Bragantia
Borges,Vanderley; Soares,Antonio Alves; Reis,Moizés Souza; Resende,Marcos Deon Vilela; Cornélio,Vanda Maria Oliveira; Leite,Natália Alves; Vieira,Antonio Rodrigues.
Avaliou-se o desempenho de genótipos de arroz de terras altas utilizando metodologia de modelos mistos. Foram utilizados dados de produtividade de grãos dos ensaios de valor de cultivo e uso (VCU) do programa cooperativo de melhoramento de arroz de terras altas, desenvolvido em Minas Gerais, no período de 1997/1998 a 2007/2008. Realizou-se análise de deviance para verificar a significância dos efeitos de genótipos e suas interações com locais e anos, obtendo-se a estabilidade e a adaptabilidade genotípicas, com os métodos da média harmônica dos valores genotípicos. Os efeitos de genótipos, genótipos x locais e genótipos x anos foram estatisticamente significativos (p<0,05). As linhagens e cultivares mais estáveis foram: Curinga-3, CNA 8983, Guarani,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oryza sativa; REML; BLUP; Estabilidade genotípica; Adaptabilidade.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052010000400008
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Prediction of genotypic values and estimation of genetic parameters in common bean BABT
Chiorato,Alisson Fernando; Carbonell,Sérgio Augusto Morais; Dias,Luiz Antônio dos Santos; Resende,Marcos Deon Vilela de.
Eighteen common bean (Phaseolus vulgaris L.) genotypes were evaluated in 25 environments of the state of São Paulo in 2001 and 2002. The estimation of genetic parameters by the Restricted Maximum Likelihood (REML) and the prediction of genotypic values via Best Linear Unbiased Prediction (BLUP) were obtained by software Selegen-REML/BLUP. The estimate of the broad-sense heritability was low for the grain yield (0.03), since it took individual plots into consideration and was free of the effects of interaction with years, cultivation periods and site. Nevertheless, the heritability at the level of line means across the various environments was high (0.75), allowing a high accuracy (0.87) in the selection of lines for planting in the environment mean. Among...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: REML; BLUP; Phaseolus vulgaris; Mixed Models.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132008000300005
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Evaluation of Top-Cross Popcorn Hybrids Using Mixed Linear Model Methodology Chilean J. Agric. Res.
Arnhold,Emmanuel; Mora,Freddy; G. Silva,Ricardo; I.V. Good-God,Pedro; Rodovalho,Marcos A.
The market for popcorn (Zea mays L.) has been continuously growing in Brazil fact has required the development of cultivars adapted to local environmental conditions. For this reason, the analytical objectives of this study were to evaluate top-cross popcorn hybrids in relation to popping expansion and grain yield in three different eco-geographic regions of Brazil, in order to estimate variance components using Restricted Maximum Likelihood (REML) and predict breeding values using Best Linear Unbiased Prediction (BLUP). Genetic evaluation considered a linear model with heterogeneous residual (environmental) variances. The Restricted Likelihood Ratio Test (RLRT) evidenced significant differences (p < 0.01) for the genotypic effect. Grain yield showed a...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Popping expansion; REML; BLUP; Improvement.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0718-58392009000100006
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Predicción del efecto de cultivares de algodón en la presencia de interacción genotipo-ambiente Ciencia e Investigación Agraria
Mora,Freddy; Osmério,Pupim-Junior; Scapim,Carlos Alberto.
Se analizó la predicción del efecto de cultivar vía mejor predicción lineal no sesgada (BLUP), de 14 cultivares de algodón (Gossypium hirsutum) establecidos en diferentes localidades de Brasil y Paraguay, en la temporada 2003-2004. BLUP, del rendimiento de cultivares, se comparó con el análisis clásico de estabilidad de los modelos desarrollados por Plaisted y Peterson, Wricke, Annicchiarico y Lin y Binns. Un abordaje Bayesiano a través del algoritmo de cadena independiente (IC), se utilizó como otra medida de comparación. La razón de verosimilitud evidenció diferencias significativas para los efectos de cultivar e interacción genotipo-ambiente. Los criterios de información de Akaike y Bayesiano confirmaron estos resultados. La mayoría de las correlaciones...
Tipo: Journal article Palavras-chave: BLUP; Estabilidad de cultivares; Interacción genotipo-ambiente; Mejoramiento; Modelos mixtos; Verosimilitud.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0718-16202007000100002
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Mineração da interação genótipo x ambiente em Phaseolus vulgaris L. para o Estado de Santa Catarina Ciência Rural
Coimbra,Jefferson Luís Meirelles; Bertoldo,Juliano Garcia; Elias,Haroldo Tavares; Hemp,Silmar; Vale,Naine Martins do; Toaldo,Diego; Rocha,Fabiani da; Barili,Leiri Daine; Garcia,Soraya Helena; Guidolin,Altamir Frederico; Kopp,Mauricio Marini.
Genótipos de feijão (Phaseolus vulgaris L.) dos grupos preto (testados em seis ambientes) e carioca (testados em cinco ambientes) foram avaliados para rendimento de grãos na safra agrícola de 2006/07, no Estado de Santa Catarina. Desse modo, o objetivo deste trabalho foi avaliar a sensibilidade genotípica, por meio de funções preditas entre a diferença do potencial rendimento de grãos médio (kg ha-1), considerando todas as combinações possíveis entre os ambientes estudados. Ausência de significância para todos os genótipos testados de feijão preto indica um comportamento insensível destes genótipos frente às variações do par de ambiente Chapecó versus Lages. Por outro lado, o ambiente de Ponte Serrada, independentemente do grupo (preto ou carioca) e do...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Variância fenotípica; BLUP; Sensibilidade; Rendimento de grãos de feijão.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782009000200007
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Prediction of hybrid means from a partial circulant diallel table using the ordinary least square and the mixed model methods Genet. Mol. Biol.
Reis,Américo José dos Santos; Chaves,Lázaro José; Duarte,João Batista; Brasil,Edward Madureira.
By definition, the genetic effects obtained from a circulant diallel table are random. However, because of the methods of analysis, those effects have been considered as fixed. Two different statistical approaches were applied. One assumed the model to be fixed and obtained solutions through the ordinary least square (OLS) method. The other assumed a mixed model and estimated the fixed effects (BLUE) by generalized least squares (GLS) and the best linear unbiased predictor (BLUP) of the random effects. The goal of this study was to evaluate the consequences when considering these effects as fixed or random, using the coefficient of correlation between the responses of observed and non-observed hybrids. Crossings were made between S1 inbred lines from two...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Diallel analysis; BLUP; Prediction; Cross-validation.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572005000200023
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Inclusion of genetic relationship information in the pedigree selection method using mixed models Genet. Mol. Biol.
Nunes,José Airton Rodrigues; Ramalho,Magno Antonio Patto; Ferreira,Daniel Furtado.
We used a mixed model approach and computer simulation to evaluate the inclusion of parentage information as determined by the genealogy established in the pedigree method. The simulations were based on a purely additive genetic model for one quantitative trait of 20 unlinked segregating loci with equal effects and an allelic frequency of 0.5 for heritability values of 10%, 25%, 50% and 75% for selection based on an F4:5 progeny mean. We simulated 1000 experiments for each heritability value, corresponding to the evaluation of 256 F4:5 progenies. The phenotypic values of the progenies were analyzed according to two models, one ignoring and one considering the additive genetic parentage among the progenies. The additive relationship coefficients among F4:5...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Autogamous crops; BLUP; Computer simulation; Plant breeding.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572008000100015
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Multivariate spatial statistical analysis of multiple experiments and longitudinal data. Infoteca-e
RESENDE, M. D. V. de; THOMPSON, R..
Tipo: Livros Palavras-chave: REML; BLUP; Melhoramento genético; Genética; Análise Estatística; Método; Melhoramento; Planta; Seleção.
Ano: 2003 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/309230
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Predicción del rendimiento de híbridos de maíz (Zea mays L.) en ambientes de siembra tardía JBAG
Biasutti,C.A; Balzarini,M.B.
La predicción precisa del comportamiento de híbridos de maíz no evaluados a campo permitirá un mayor progreso genético y menores costos en programas de mejoramiento genético. Datos de rendimiento de híbridos evaluados a campo se emplearon para predecir el comportamiento de nuevos híbridos en ambientes de siembra tardía. Se conformaron grupos de híbridos predictores de manera de maximizar y minimizar las relaciones de parentesco entre los híbridos predictores y aquellos a predecir y, por otra parte, utilizar valores de predicción obtenidos en ambientes de alto rendimiento y bajo rendimiento a fin de investigar la influencia de estos factores sobre la eficiencia de las predicciones. A fin de validar las predicciones se tomó un grupo de híbridos cuyo...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Maíz; Parentesco; Rendimiento; BLUP.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332017000100002
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Comparação de métodos de seleção em populações simuladas de frangos de corte PAB
Oliveira,Claudine Gonçalves de; Cunha,Elizângela Emídio; Carneiro,Paulo Luiz Souza; Euclydes,Ricardo Frederico; Malhado,Carlos Henrique Mendes.
Populações de frangos de corte foram simuladas utilizando-se o programa GENESYS, com o objetivo de avaliar a seleção com base no método da melhor predição linear não-viesada (BLUP - best linear unbiased prediction), a seleção individual para três tamanhos efetivos de população e três sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados. Simulou-se um genoma constituído de uma característica quantitativa, com valor de herdabilidade igual a 0,30, em seleção praticada durante 15 gerações consecutivas, com 30 repetições por geração. Para um mesmo tamanho efetivo e sistema de acasalamento, o BLUP foi sempre superior à seleção individual nas 15 gerações de seleção avaliadas.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: BLUP; Seleção individual; Sistemas de acasalamento; Tamanho efetivo de população.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2005001000004
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Seleção tradicional e associada a marcadores moleculares na avaliação genética animal PAB
Carneiro,Paulo Luiz Souza; Malhado,Carlos Henrique Mendes; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Carneiro,Antonio Policarpo Souza; Cunha,Elizângela Emídio.
O objetivo deste trabalho foi comparar a seleção, utilizando valores genéticos preditos pelo BLUP clássico (BLUP), BLUP marcadores (BLUPM) e pela seleção individual (SI), usando simulação com o programa Genesys. Para obter a matriz de similaridade genética utilizada no BLUPM, foram simulados cem marcadores moleculares do tipo microssatélite (SSR - Simple Sequence Repeat), por meio de um coeficiente de similaridade correspondente à distância euclideana média para dados quantitativos. A fim de comparar os diferentes métodos, utilizaram-se populações com tamanho efetivo de 66,66 e média de 30 repetições, avaliando-se os valores fenotípicos médios. Os ganhos ao longo das 20 gerações de seleção foram maiores para o BLUP em relação ao BLUPM, e este foi superior...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: BLUP; Seleção fenotípica; Simulação; Sistemas de acasalamento.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006000400010
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Alternativas de análise de ensaios em látice no melhoramento vegetal PAB
BUENO FILHO,JÚLIO SÍLVIO DE SOUSA; VENCOVSKY,ROLAND.
Compararam-se diferentes formas de análise de experimentos em blocos incompletos, abordadas como casos particulares de modelos mistos, quais sejam: (a) análise intrablocos, em que apenas o efeito do erro experimental é suposto aleatório; (b) análise interblocos (látice), com efeitos de blocos supostos aleatórios; (c) análise BLUP, com os efeitos de tratamentos supostos aleatórios, e (d) modelo aleatório. Além disso, montou-se a ANAVA, considerando duas alternativas: (e) usando o quadrado médio de tratamentos ajustados para blocos e o quadrado médio do erro efetivo do látice; (f) tomando as repetições como blocos completos. Um exemplo de análise de um teste de progênies de Eucalyptus grandis (Hill) Maiden ilustra as implicações da escolha dos modelos para...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Modelos lineares; Delineamentos experimentais; Blocos incompletos parcialmente balanceados; Modelos mistos; BLUP.
Ano: 2000 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2000000200004
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Regressão via componentes independentes aplicada à seleção genômica para características de carcaça em suínos PAB
Azevedo,Camila Ferreira; Resende,Marcos Deon Vilela de; Silva,Fabyano Fonseca e; Lopes,Paulo Sávio; Guimarães,Simone Eliza Facioni.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência do método de regressão via componentes independentes (ICR) na estimação de valores genéticos genômicos e dos efeitos de marcadores SNP para características de carcaça de uma população F2 de suínos (Piau x linhagem comercial). Os métodos foram avaliados por meio da concordância entre os valores genéticos preditos e os fenótipos corrigidos, observados por validação cruzada, e também foram comparados com outros métodos geralmente utilizados para os mesmos propósitos, tais como RR-BLUP, PCR e PLS. Os métodos ICR e PCR apresentam resultados similares, mas o método ICR apresenta maiores valores de acurácia.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Sus scrofa; BLUP; Marcadores SNP; Regressão aleatória; Redução dimensional.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2013000600007
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