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Phylogénie moléculaire de bactéries pathogènes de bivalves marins, Vibrio spendidus, à partir du gène gyrB ArchiMer
Magne, Fabien.
La production d'huîtres creuse, Crassostrea gigas, est aujourd'hui la principale production française de coquillages. Depuis 1991, des épisodes de mortalité estivale sur le naissain sont observés sur le littoral français. Les causes de ces épisodes de mortalité n'ont pas été clairement identifiées et semblent faire intervenir un ensemble de facteurs. Le seul moyen de lutte contre ces maladies infectieuses chez les mollusques d'élevages est l'identification et la détection des pathogènes pour contrôler les risques d'infection. De nombreuses études ont établi le caractère pathogène de certaines souches de Vibrio splendidus chez l'huître creuse. Aucun critère phénotypique ne permet de discriminer ces souches entre elles. Les méthodes moléculaires sont donc...
Tipo: Text Palavras-chave: Vibrio splendidus; GyrB; Phylogénie; PCR RFLP.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14341/11625.pdf
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Structuration génétique d'une collection de souches de Vibrio. Contribution à la mise au point d'outils de typage moléculaire pour l'aide au diagnostic ArchiMer
Jaffres, Emmanuel.
Les bactéries du genre Vibrio représentent le groupe le plus fréquemment associé à des maladies infectieuses chez les mollusques marins. Ainsi chez l'huître creuse Crassostrea gigas, la majorité des Vibrios isolés d'animaux sains ou malades sont phénotypiquement classés dans un groupe de souches apparentées à Vibrio splendidus. Les récentes études phylogénétiques pars séquençage du gène gyrB, ont permis de distinguer plusieurs espèces au sein de ce groupe (V. splendidus, V. chagasii, V. cyclitrophicus, V. crassostreae, V. gigantis). Toutefois, il subsiste toujours des imprécisions dans l'arbre phylogénétique gyrB. En effet, un groupe polyphylétique de 4 espèces reste jusqu'à présent on distinguables (V. tasmaniensis, V. kanaloae, V. pomeroyi, V. lentus)....
Tipo: Text Palavras-chave: Mortalités estivales; Huître creuse; Crassostrea gigas; Vibrio spendidus; PCR-RFLP; Séquençage; Gène ADNr-16S; GyrB; Macroarrays.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00034/14479/11779.pdf
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Variabilidad genética de Xanthomonas fragariae y su severidad en genotipos de fresa (Fragaria×ananassa Duch) Agrociencia
Rivera-Zabala,Noemí; Ochoa-Martínez,Daniel L.; Rojas-Martínez,Reyna I.; Rodríguez-Martínez,Douglas; Aranda-Ocampo,Sergio; Zapién-Macías,José M..
Resumen Xanthomonas fragariae es el agente causal de la mancha angular de la hoja en fresa (Fragaria×ananassa Duch) y es un microorganismo sujeto a cuarentena para la movilización y transporte de material vegetal de propagación en varios países. En México, la información sobre la diversidad genética del patógeno y su severidad en variedades comerciales es desconocida. Este estudio tuvo como objetivo conocer la variabilidad genética de X. fragariae y evaluar su severidad en diferentes materiales genéticos de fresa. Para ello se realizó un análisis filogenético con secuencias parciales de los genes hrp y gyrB de 14 aislamientos de X. fragariae recolectados en localidades productoras de los estados de Michoacán, Jalisco y Puebla, México. El árbol filogenético...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Xanthomonas fragariae; Fragaria×ananassa; Hrp; GyrB; Escala diagramática de severidad.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-31952017000300329
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