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Análise dos coeficientes de endogamia e de parentesco para qualquer nível de ploidia usando o pacote estatístico R Bragantia
Peternelli,Luiz Alexandre; Ferreira,Fábio Medeiros; Rocha,Rodrigo Barros; Barros,Willian Silva; Barbosa,Márcio Henrique Pereira.
São poucos os softwares disponíveis para a análise de parentesco e, até a presente data, nenhum pode realizar a análise de parentesco para organismos poliplóides, com número par (2k) de cromossomos. Implementou-se junto ao programa R uma rotina capaz de executar a análise de parentesco para qualquer nível 2k de ploidia, número de indivíduos (ou populações) e número de gerações envolvidas na árvore genealógica. A função principal, calc.rxy() calcula o coeficiente de endogamia (F X) de cada indivíduo; coeficientes de parentesco (rXY) entre dois indivíduos quaisquer; e coeficiente de parentesco médio, variância, mínimo e máximo, para cada indivíduo. Ela pode mostrar a matriz completa de parentesco ou uma submatriz pré-definida de indivíduos selecionados....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genética de populações; Poliplóides; Análise de pedigree.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052009000400004
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