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Evolutionary Dynamics of Chloroplast Genomes in Low Light: A Case Study of the Endolithic Green Alga Ostreobium quekettii ArchiMer
Marcelino, Vanessa R.; Cremen, Ma Chiela M.; Jackson, Chistopher J.; Larkum, Anthony A. W.; Verbruggen, Heroen.
Some photosynthetic organisms live in extremely low light environments. Light limitation is associated with selective forces as well as reduced exposure to mutagens, and over evolutionary timescales it can leave a footprint on species' genomes. Here, we present the chloroplast genomes of four green algae (Bryopsidales, Ulvophyceae), including the endolithic (limestone-boring) alga Ostreobium quekettii, which is a low light specialist. We use phylogenetic models and comparative genomic tools to investigate whether the chloroplast genome of Ostreobium corresponds to our expectations of how low light would affect genome evolution. Ostreobium has the smallest and most gene-dense chloroplast genome among Ulvophyceae reported to date, matching our expectation...
Tipo: Text Palavras-chave: Genome streamlining; Photosynthesis; Rates of evolution; Boring algae; Stoichiogenomics.
Ano: 2016 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00659/77094/78418.pdf
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