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| Registros recuperados: 10 | |
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| BAZIOLI, J. M.; GUIMARÃES, P. de S.; STRAZZA, B. A.; SCHENK, J. C. M.; PADILHA, L.; GUERREIRO-FILHO, O.; MALUF, M. P.. |
| O objetivo deste estudo é o desenvolvimento de marcadores do tipo SNPs associados com a resistência ao bicho-mineiro em café. A estratégia principal utilizou as análises genômicas de microarranjo, para caracterização de expressão diferencial de genes-candidatos em plantas resistentes infestadas com o bicho-mineiro. Inicialmente, análises in silico de 2137 destes genes identificaram aqueles potencialmente relacionados com a especificidade da resposta de defesa da planta. Uma vez selecionados, o perfil de expressão de 22 genes foi confirmado por qRT-PCR em experimentos utilizando plantas resistentes e suscetíveis, infectadas pelo bicho-mineiro. Para busca de polimorfismos do tipo SNPs, que poderão ser utilizados como marcadores para seleção-assistida,... |
| Tipo: Anais e Proceedings de eventos |
Palavras-chave: Seleção-assistida; Estresse biótico; Melhoramento molecular; Molecular breeding; Marker-assisted selection; Biotic stress. |
| Ano: 2019 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1113382 |
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| GUIMARÃES, P. de S.; SCHENK, J. C. M.; GIACHETTO, P. F.; PADILHA, L.; SILVAROLLA, M. B.; MALUF, M. P.. |
| RESUMO: A identificação de perfis de expressão gênica diferenciais e redes metabólicas é uma ferramenta valiosa para a caracterização genética de caracteres agronômicos. Neste estudo, utilizamos análises de expressão em larga-escala para identificar processos biológicos alterados em plantas com teores reduzidos de cafeína. A expressão diferencial de genes selecionados observada in silico foi então validada em experimentos in vivo. O primeiro passo foi o sequenciamento em larga-escala de RNA extraído de tecidos jovens e em desenvolvimento, de plantas sem cafeína e de plantas com concentrações normais do composto. As sequências obtidas foram agrupadas, a partir de análises in silico, para identificação de genes com expressão diferencial entre os tratamentos... |
| Tipo: Anais e Proceedings de eventos |
Palavras-chave: Seleção-assistida; Melhoramento molecular; Sequenciamento de RNA; Expressão gênica; Plantas sem cafeína; Assisted-selection; Sequenciamento de transcriptoma; RNAseq; Molecular breeding; Gene expression. |
| Ano: 2019 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1114189 |
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| PANDEY, M. K.; MONYO, E.; OZIAS AKINS, P.; LIANG, X.; GUIMARAES, P. M.; NIGAM, S. N.; UPADHYAYA, H. D.; JANILA, P.; ZHANG, X.; GUO, B.; COOK, D. R.; BERTIOLI, D. J.; MICHELMORE, R.; VARSHNEY, R. K.. |
| Tipo: Artigo de periódico |
Palavras-chave: Groundnut; Molecular markers; Molecular breeding; Genomic resources; Genetic improvement. |
| Ano: 2012 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/937831 |
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| PEREIRA, J. F.; AZEVEDO, A. L. S.; PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; ROMANEL, E. A. da C.; PEREIRA, A. V.; VIGNA, B. B. Z.; SOUZA SOBRINHO, F. de; BENITES, F. R. G.; LEDO, F. J. da S.; BRITO, G. G. de; MEIRELES, K. G. X.; CAVALLARI, M. M.; RESENDE, R. M. S.; MACHADO, J. C.. |
| ABSTRACT: Pasture is the main food source for more than 200 million cattle heads in Brazil. Although Brazilian forage breeding programs have successfully released well-adapted, high-yielding cultivars over the years, the use of genomic tools in these programs is currently limited. These tools are required to tackle the main challenges for tropical forage breeding in Brazil. In this context, this notes lists the main research priorities raised at the workshop ?Breeding Forages in the Genomic Era?, which are necessary to accelerate the use of genomic tools for next-generation breeding of tropical forages and allow breeders to increase genetic gains. Additionally, an online discussion forum (hosted at http://www.cnpgl.embrapa.br/genfor) has been launched to... |
| Tipo: Artigo de periódico |
Palavras-chave: Discussion forum; Genomic tools; Molecular breeding; Planta Forrageira; Melhoramento Genético Vegetal; Marcador Molecular; Genoma; Pesquisa; Brazil. |
| Ano: 2018 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1101770 |
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| PEREIRA, W. J.; BASSINELLO, P. Z.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P.. |
| An RNA extraction method with high integrity and purity as well as the selection of adequate reference genes are prerequisites for gene expression analysis. For common bean seeds, there is no well-defined protocol that can be used in a laboratory routine for gene expression analysis. In this study, an extraction protocol for RNA from common bean seeds, which produced material with good integrity for qPCR (RIN ≥ 6.5), was optimized. In addition, 10 reference genes were evaluated under qPCR standard conditions using different tissue samples of common beans. Gene stabilities were analyzed using the delta-CT method, Bestkeeper, NormFinder and geNorm approaches. The genes β-tubulin and T197 were ranked as the most stable among the sample sets... |
| Tipo: Artigo de periódico |
Palavras-chave: Gene normalization; Molecular breeding; Grain RNA extraction; Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento; RNA; Beans; Gene expression.. |
| Ano: 2017 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076282 |
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| RAMOS M. R. F.; MENDONÇA, J. A.; VIANELLO, R. P.; MORAIS JÚNIOR, O. P. de; COLOMBARI FILHO, J. M.; BORBA, T. C. de O.; CASTRO, A. P. de; BRONDANI, C.. |
| Rice has extensive collections of germplasm, but a small fraction of genotypes are used in breeding programs worldwide. This aimed to assess the heterosis and the combining ability for higher grain yield and earliness, and their correlations to genetic distance among accessions belonging to the Embrapa ́s Rice Core Collection. Crosses were made in complete diallel, without the reciprocals, being phenotyped in generations F2 and F7 for grain yield (GY) and days to flowering (DTF). It were estimated the varietal effect, mean heterosis, varietal heterosis, specific combining abilityand general combining ability (GCA) of the parents in each generation. For the selection of new lines, the combinations involving the genitors with the highest magnitudes... |
| Tipo: Artigo de periódico |
Palavras-chave: SSR markers; Molecular breeding; Genetic divergence; Arroz; Oryza Sativa; Variação Genética; Marcador Molecular; Genética Molecular; Rice; Diallel analysis; Genetic markers; Molecular genetics. |
| Ano: 2019 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1130389 |
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| SOUSA, T. V.; CAIXETA, E. T.; ALKIMIM, E. R.; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; SAKIYAMA, N. S.; RESENDE JÚNIOR, M. F. R. de; ZAMBOLIM, L.. |
| The use of single nucleotide polymorphism (SNP) molecular markers has provided advances in selection methodologies used in breeding programs of different crops, reducing cost and time of cultivar release. Despite the great economic and social importance of Coffea arabica, studies with SNP markers are scarce and a small number of SNP are available for this species, when compared with other crops of agronomic mportance. Thus, the objective of this study was to identify and validate SNP molecular markers for the species Coffea arabica and to introduce these markers to genetic breeding by means of an accurate analysis of the diversity and genetic structure of breeding populations of this species. After quality filtering, 11,187 SNP markers were selected from... |
| Tipo: Artigo de periódico |
Palavras-chave: Next-generation sequence; Molecular breeding; Coffea arabica; Introgression; Genetic relationships; Teachers. |
| Ano: 2017 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1081931 |
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| Registros recuperados: 10 | |
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