SABIIA - Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura (Sabiia)

CARDOSO, F. F.; SOLLERO, B. P.; GULIAS-GOMES, C. C.; COMIN, H. B.; ROSO, V. M.; HIGA, R. H.; YOKOO, M. J. I.; CAETANO, A. R.; AGUILAR, I..

2014

Accuracy of genomic prediction for tick resistance in Braford and Hereford cattle.

Palavras-chave: Gado de corte.

Ano: 2014

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/993903

CARDOSO, F. F.; SOLLERO, B. P.; GOMES, C. C. G.; COMIN, H. B.; ROSO, V. M.; HIGA, R. H.; YOKOO, M. J.; CAETANO, A. R.; AGUILAR, I..

This work aimed to determine the accuracy and bias of genomic predictions of Braford (BO) and Hereford (HH) cattle genetic resistance to ticks.

Application of single step genomic BLUP under different uncertain paternity scenarios using simulated data.

Palavras-chave: Seleção genômica; Resistência a carrapatos; Tick resistance; Gado de corte; Beef cattle; Marker-assisted selection.

Ano: 2014

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1003697

TONUSSI, R. L.; SILVA, R. M. de O.; MAGALHAES, A. F. B.; ESPIGOLAN, R.; PERIPOLLI, E.; OLIVIERI, B. F.; FEITOSA, F. L. B.; LEMOS, M. V. A.; BERTON, M. P.; CHIAIA, H. L. J.; PEREIRA, A. S. C.; LOBO, R. B.; BEZERRA, L. A. F.; MAGNABOSCO, C. de U.; LOURENÇO, D. A. L.; AGUILAR, I.; BALDI REY, F. S..

The objective of this study was to investigate the application of BLUP and single step genomic BLUP (ssGBLUP) models in different scenarios of paternity uncertainty with different strategies of scaling the G matrix to match the A22 matrix, using simulated data for beef cattle. Genotypes, pedigree, and phenotypes for age at first calving (AFC) and weight at 550 days (W550) were simulated using heritabilities based on real data (0.12 for AFC and 0.34 for W550). Paternity uncertainty scenarios using 0, 25, 50, 75, and 100% of multiple sires (MS) were studied. The simulated genome had a total length of 2,333 cM, containing 735,293 biallelic markers and 7,000 QTLs randomly distributed over the 29 BTA. It was assumed that QTLs explained 100% of the genetic...

Avaliação genômica de touros Hereford e Braford.

Palavras-chave: Best Linear Unbiased Prediction; Seleção Fenótipa; Citogenética Animal; Hereditariedade; Gado de Corte.

Ano: 2017

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1083177

Avaliação genômica para resistência ao carrapato de touros Hereford e Braford: edição dezembro/2013.

CARDOSO, F. F.; YOKOO, M. J. I.; GULIAS-GOMES, C. C.; OLIVEIRA, M. M. de; TEIXEIRA, B. B. M.; ROSO, V. M.; BRITO, F. V.; CAETANO, A. R.; AGUILAR, I..

Seleção genômica; Metodologia unificada para predizer os valores genéticos genômicos; Características apresentadas neste sumário; Como interpretar o sumário; Tabela de touros Braford; Tabela de touros Hereford; Estâncias que participaram do presente trabalho; Equipe participante do projeto.

Tipo: Documentos (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Gado de corte.

Ano: 2012

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/942669

Caracterização do desequilíbrio de ligação em uma população de bovinos da raça Nelore.

CARDOSO, F. F.; YOKOO, M. J. I.; GULIAS-GOMES, C. C.; SOLLERO, B. P.; COSTA, R. F. da; ROSO, V. M.; BRITO, F. V.; CAETANO, A. R.; AGUILAR, I..

Seleção genômica; Metodologia unificada para predizer os valores genéticos genômicos; Resistência genética ao carrapato; Como interpretar o sumário; Tabela de touros Braford; Tabela de touros líderes Braford; Tabela de touros Hereford; Tabela de touros líderes Hereford; Estâncias que participaram do presente trabalho; Equipe participante do projeto.

Tipo: Documentos (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Genética quantitativa; Bovino.

Ano: 2013

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/979678

KLUSKA, S.; TONUSSI, R. L.; SILVA, R. M. de O.; OLIVERI, B. F.; FEITOSA, F. L. B.; PERIPOLLI, E.; LEMOS, M. V. A.; BERTON, M. P.; CHIAIA, H. L. J.; PEREIRA, A. S. C.; LOBO, R. B.; BEZERRA, L. A.; MAGNABOSCO, C. de U.; AGUILAR, I.; DI CROCE, F.; OSTERSTOCK, J.; BALDI REY, F. S..

Resumo: Tendo em vista a importância da estimação do desequilíbrio de ligação para a seleção genômica, o objetivo deste estudo foi estimar o desequilíbrio de ligação de uma população de bovinos da raça Nelore participantes do programa de melhoramento da ANCP. Foram utilizadas informações de 9.459 animais genotipados com um painel de alta densidade, totalizando 735.044 SNP?s, antes do controle de qualidade. A estimação do desequilíbrio de ligação foi realizada através do programa SNP1101. Os valores de LD observados para os cromossomos autossômicos variaram de 0,18 a 0,25. Para marcadores distanciados até 1 Kb a média de r² foi de 0,53 e para marcadores distanciados entre 90 e 100 Kb 0,14. Para MAF a média variou de 0,23 a 0,25, considerando MAF mínimo de...

Frequentist p-values for large-scale-single step genome-wide association, with an application to birth weight in American Angus cattle.

Palavras-chave: Densidade de Marcadores; Marcador Genético; Seleção Genótipa; Cromossoma.

Ano: 2017

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1083353

AGUILAR, I.; LEGARRA, A.; CARDOSO, F. F.; MASUDA, Y.; LOURENCO, D.; MISZTAL, I..

Background: Single-step genomic best linear unbiased prediction (SSGBLUP) is a comprehensive method for genomic prediction. Point estimates of marker effects from SSGBLUP are often used for genome-wide association studies (GWAS) without a formal framework of hypothesis testing. Our objective was to implement p-values for singlemarker GWAS studies within the single-step GWAS (SSGWAS) framework by deriving computational algorithms and procedures, and by applying these to a large beef cattle population. Methods: P-values were obtained based on the prediction error (co)variances for single nucleotide polymorphisms (SNPs), which were obtained from the prediction error (co)variances of genomic predictions based on the inverse of the coefficient matrix and...

Genomic selection for tick resistance in Braford and Hereford cattle using single-step methodology.

Palavras-chave: Gado Angus; Predição Genômica; Bovino; Marcador Genético; Melhoramento Genético Animal.

Ano: 2019

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1118159

Genotype by environment interaction for tick resistance of Hereford and Braford beef cattle using reaction norm model.

CARDOSO, F. F.; GULIAS-GOMES, C. C.; OLIVEIRA, M. M.; ROSO, V. M.; PICCOLI, M. L.; BRITO, F. V.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R.; SILVA, M. V. G. B.; REGITANO, L. C. de A.; YOKOO, M. J.; CAETANO, A. R.; MISZTAL, I.; AGUILAR, I..

The Rhipicephalus microplus tick is one of the main sources of losses in tropical cattle production, causing decreased performance, hide devaluation, and increased costs with treatments and transmission of infectious agents. The aim of this work was to evaluate the utility of genomic evaluation of Braford and Hereford cattle for genetic resistance to ticks.

Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE)

Palavras-chave: Gado de corte; Rhipicephalus microplus; Boophilus microplus; Beef cattle.

Ano: 2012

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/946764

MOTA, R. R.; TEMPELMAN, R. J.; LOPES, P. S.; AGUILAR, I.; SILVA, F. F.; CARDOSO, F. F..

The cattle tick is a parasite that adversely affects livestock performance in tropical areas. Although countries such as Australia and Brazil have developed genetic evaluations for tick resistance, these evaluations have not considered genotype by environment (G*E) interactions. Genetic gains could be adversely affected, since breed-stock comparisons are environmentally dependent on the presence of G*E interactions, particularly if residual vari-ability is also heterogeneous across environments. The objective of this study was to infer upon the existence of G*E interactions for tick resistance of cattle based on various models with different assumptions of genetic and residual variability.

Global meliponiculture: challenges and opportunities.

Palavras-chave: Bovino; Gado de corte; Gado Hereford; Carrapato.

Ano: 2016

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039996

CORTOPASSI-LAURINO, M.; IMPERATRIZ-FONSECA, V. L.; ROUBIK, D. W.; DOLLIN, A.; HEARD, T.; AGUILAR, I.; VENTURIERI, G. C.; EARDLEY, C.; NOGUEIRA-NETO, P..

Stingless bees are social bees that live in tropical and subtropical areas of the world. All species produce honey, which has been appreciated by humans since ancient times. Here, the general panorama of meliponiculture is presented. Deforestation and poor management are the main problems faced by this incipient industry. For a profitable meliponiculture, much more biological information is needed, as well as field studies in natural conditions. In the near future, we suggest that the successful use of these pollinators will promote the development of new breeding techniques and commercialization possibilities, which must be designed to be sustainable.

Impacto nas acurácias dos valores genéticos para idade ao primeiro parto em diferentes cenários com paternidade incerta.

Palavras-chave: Meliponicultura; Mel.

Ano: 2006

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/578451

TONUSSI, R. L.; SILVA, R. M. de O.; OLIVERI, B. F.; FEITOSA, F. L. B.; PERIPOLLI, E.; LEMOS, M. V. A.; BERTON, M. P.; PEREIRA, A. S. C.; LOBO, R. B.; BEZERRA, L. A. F.; MAGNABOSCO, C. de U.; AGUILAR, I.; DI CROCE, F. A.; BALDI REY, F. S..

Resumo: O objetivo deste estudo foi investigar o impacto nas acurácias de predição utilizando os métodos BLUP e ssGBLUP em diferentes cenários considerando paternidade incerta utilizando dados de uma população de bovinos Nelore. Foram estudados dados de 18.526 registros de idade ao primeiro parto (IPP). Os componentes de variância foram estimados usando os métodos BLUP e ssGBLUP. A matriz de parentesco (A) foi criada com diferentes proporções de animais com pais desconhecidos (0, 25, 50, 75 e 100%). Todos os modelos incluíram grupos contemporâneos como efeitos fixos. Os valores genéticos e genômicos (EBV / GEBV) foram avaliados em cada cenário para quatro grupos: ALL = todos os animais da população, BULL = somente touros com dez ou mais progênies; GEN =...

Predição da resistência genética ao carrapato de bovinos Braford e Hereford a partir de um painel denso de marcadores moleculares.

Palavras-chave: Best Linear Unbiased Prediction; Paternidade incerta; Avaliação genética; Parâmetro Genético; Gado Nelore.

Ano: 2017

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1083359

Predição da resistência genética ao carrapato de bovinos Braford e Hereford a partir de um painel denso de marcadores moleculares.

CARDOSO, F. F.; GOMES, C. C. G.; OLIVEIRA, M. M. de; ROSO, V. M.; PICCOLI, M. L.; BRITO, F. V.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R.; SILVA, M. V. G. B. da; REGITANO, L. C. de A.; CAETANO, A. R.; AGUILAR, I..

O problema do carrapato bovino. A alternativa da seleção genômica. Resultados experimentais. Procedimentos para aplicação prática. Considerações finais.

Tipo: Circular Técnica (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Carrapato bovino; Rhipicephalus; Boophilus microplus.

Ano: 2011

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/945515

Seleção genômica para resistência a carrapatos em bovinos Braford e Hereford.

CARDOSO, F. F.; GULIAS GOMES, C. C.; OLIVEIRA, M. M. de; ROSO, V. M.; PICCOLI, M. L.; BRITO, F. V.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R.; SILVA, M. V. G. B.; REGITANO, L. de A.; CAETANO, A. R.; AGUILAR, I..

O problema do carrapato bovino; A alternativa da seleção genômica; Resultados experimentais; Procedimentos para aplicação prática; Considerações finais.

Tipo: Circular Técnica (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Boophilus microplus; Gado de corte.

Ano: 2011

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/950709

OLIVEIRA, M. M. de; GULIAS-GOMES, C. C.; ROSO, V. M.; CAETANO, A. R.; AGUILAR, I.; CARDOSO, F. F..

2012