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Analysing nonsynonymous mutations between two Mycobacterium bovis strains with contrasting pathogenic profiles. Repositório Alice
BIGI, M.; VAZQUEZ, C. L.; CASTELÃO, A. B. C.; GARCÍA, E. A.; CATALDI, A. A.; JACKSON, M.; MAcNEIL, M.; SORIA, M.; ZUMÁRRAGA, M. J.; MATIAS, C.; GAGO, G.; BLANCO, F. C.; NISHIBEF, C.; ALMEIDA, N. F.; ARAUJO, F. R.; BIGI, F..
Mycobacterium bovis (M. bovis) is the causative agent of bovine tuberculosis, a chronic infectious disease that can affect cattle, other domesticated species, wild animals and humans. This disease produces important economic losses worldwide. Two M. bovis strains (04-303 and 534) have been isolated in Argentina. Whereas the 04-303 strain was isolated from a wild boar, the 534 strain was obtained from cattle. In a previous study, six weeks after infection, the 04-303 strain induced 100% mortality in mice. By contrast, mice infected with the 534 strain survived, with limited tissue damage, after four months. In this study we compared all predictive proteins encoded in both M. bovis genomes. The comparative analysis revealed 141 polymorphic proteins between...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Mutations; Gene; Mycobacterium bovis BCG; Genome; Virulence.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1117921
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Comparação de genes de virulência de dois isolados de Mycobacterium Bovis sequenciados por plataforma de nova geração. Repositório Alice
CASTELÃO, A. B. C.; NISHIBE, C.; ZUMÁRRAGA, M. J; CATALDI, A. A.; BIGGI, F; FONSECA JR, A. A.; HODON, M. A; ALMEIDA, N. F.; ARAUJO, F. R..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mycobacterium bovis; Tuberculose bovina.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1015924
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De novo RNA sequencing and analysis of the transcriptome of signalgrass (Urochloa decumbens) roots exposed to aluminum. Repositório Alice
SALGADO, L. R.; LIMA, R.; SANTOS, B. F. dos; SHIRAKAWA, K. T.; VILELA, M. de M.; ALMEIDA, N. F.; PEREIRA, R. M..
Acidic soils occupy a vast area in the world, and the aluminum (Al) in these soils can directly interact with plant cells and tissues to inhibit their growth and reduce yields. The signalgrass Urochloa decumbens cv. Basilisk (syn. Brachiaria decumbens cv. Basilisk), a widely sown tropical forage grass, is recognized for its high productivity under intensive use, vigorous growth, ease of establishment, and good forage value throughout the year, as well as its exceptional adaptation to infertile acid soils. We sequenced the transcriptome from roots of U. decumbens cv. Basilisk under two conditions, with and without Al, using Illumina paired-end sequencing technology and performed de novo assembly of those reads, which yielded 164,920 transcripts. Of these...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: RNA sequencing; Urochloa genus; Aluminum; Brachiaria decumbens; Molecular markers.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1079489
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De novo RNA sequencing and analysis of the transcriptome of signalgrass (Urochloa decumbens) roots exposed to aluminum. Repositório Alice
SALGADO, L. R.; LIMA, R.; SANTOS, B. F. dos; SHIRAKAWA, K. T.; VILELA, M. de A.; ALMEIDA, N. F.; PEREIRA. R. M.; NEPOMUCENO, A. L.; CHIARI, L..
bitstream/item/166628/1/Nepomuceno-plant-2017.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Marcador molecular; Brachiaria decumbens; Graminea forrageira; Sequence analysis; Genetic markers; Urochloa decumbens.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1079563
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Detection of Mycobacterium bovis in Bovine and Bubaline Tissues Using Nested-PCR for TbD1. Repositório Alice
ARAUJO, C. P.; OSÓRIO, A. L. A. R.; JORGE, K. S. G.; RAMOS, C. A. N.; S. FILHO, A. F.; VIDAL, C. E. S.; ROXO, E.; NISHIBE, c.; ALMEIDA, N. F.; F. JUNIOR, A. A.; SILVA, M. R.; B. NETO, J. D.; CERQUEIRA, V. D.; ZUMÁRRAGA, M.; ARAUJO, F. R..
2014
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Nested-PCR system; Bovine and bubaline tuberculosis; Mycobacterium abscessus.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1010358
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Detection of Mycobacterium bovis in Bovine and Bubaline Tissues Using Nested-PCR for TbD1 Repositório Alice
ARAUJO, C. P.; OSÓRIO, A. L. A. R.; JORGE, K. S. G.; RAMOS, C. A. N.; S. FILHO, A. F.; VIDAL, C. E. S.; ROXO, E.; NISHIBE, c.; ALMEIDA, N. F.; F. JUNIOR, A. A.; SILVA, M. R.; B. NETO, J. D.; CERQUEIRA, V. D.; ZUMÁRRAGA, M.; ARAUJO, F. R..
2014
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Mycobacterium abscessus.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/982473
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Diagnostic tools to detect pathogens causing tuberculosis in cattle and prevent their transmission through dairy products to humans. Repositório Alice
ARAUJO, F. R.; ALMEIDA, N. F.; ZUMÁRRAGA, M. J..
2016
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Leite; Tuberculose; Cattle; Tuberculosis; Dairy.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066274
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Draft Genome Sequence of Mycobacterium bovis 04-303, a Highly Virulent Strain from Argentina. Repositório Alice
NISHIBE, C.; CASTELÃO, A. B. C.; COSTA, R. D.; PINTO, B. J.; VARUZZA, L.; CATALDI, A. A.; BERNARDELLI, A.; BIGI, F.; BLANCO, F. C.; ZUMÁRRAGA, M. J.; ALMEIDA, N. F.; ARAUJO, F. R..
2013
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Mycobacterium bovis.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/980151
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Patterns and Processes of Mycobacterium bovis Evolution Revealed by Phylogenomic Analyses. Repositório Alice
PATANE, J. S. L.; MARTINS JUNIOR, J.; CASTELÃO, A. B.; NISHIBE, C.; MONTERA, L.; BIGI, F.; ZUMÁRRAGA, M. J.; CATALDI, A. A.; FONSECA JUNIOR, A.; ROXO, E.; OSÓRIO, A. L. A. R.; JORNGE, K. S.; THACKER, T. C.; ALMEIDA, N. F.; ARAUJO, F. R.; SETUBAL, J. C..
Mycobacterium bovis is an important animal pathogen worldwide that parasitizes wild and domesticated vertebrate livestock as well as humans. A comparison of the five M. bovis complete genomes from the United Kingdom, South Korea, Brazil, and the United States revealed four novel large-scale structural variations of at least 2,000 bp.Acomparative phylogenomic study including 2,483 core genes of 38 taxa from eight countries showed conflicting phylogenetic signal among sites. By minimizing this effect,we obtained a tree that better agreeswith sampling locality. Results supported a relatively basal position of African strains (all isolated from Homo sapiens), confirming that Africa was an important region for early diversification and that humans were one of...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Phylogenomics; Tuberculose bovina; Filogenômica; Família PE / PPE; Mycobacterium bovis; Epidemiologia; Mycobacterium bovis; Bovine tuberculosis.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1077365
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