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Aceleração do melhoramento do cafeeiro via seleção genômica: agilidade e eficácia no lançamento de novas cultivares. Infoteca-e
CAIXETA, E. T.; RESENDE, M. D. V. de; ALKIMIM, E. R.; SOUSA, T. V.; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; ALVES, R. S..
Neste documento, foram demonstrados os usos da seleção assistida por marcadores moleculares e da seleção genômica nas espécies Coffea arabica e Coffea canephora. O uso dessas técnicas seletivas possibilitou o aumento na eficiência nos programas de melhoramento dessas espécies. Além disso, evidencia a importância da utilização de diferentes metodologias de seleção, sendo explorado os benefícios de cada técnica seletiva, tornando os programas de melhoramento mais eficientes e competitivos.
Tipo: Livros Palavras-chave: Melhoramento Genético Vegetal; Seleção Genótipa; Variedade; Café; Coffea Arábica; Coffea Canephora; Hemileia Vastatrix; Marcador Molecular.
Ano: 2022 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1145724
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Correlação de diferentes metodologias de avaliação da ferrugem asiática em linhagens de soja. Repositório Alice
SUSSEL, A. A. B.; SILVA NETO, S. P. da; MOREIRA, C. T.; ALVES, R. S.; ALMEIDA, N. J..
A expansão do cultivo da soja para áreas irrigadas no Cerrado com semeadura ao final do período da janela de plantio favorece a ocorrência de epidemias de ferrugem asiática devido à alta quantidade de inoculo presente no ar produzido pelas áreas onde o cultivo teve inicio antecipado. As lesões formadas nas folhas podem ser classificadas como do tipo castanho clara com muitos soros urediniais e abundante esporulação (TAN) ou castanho avermelhada com poucos soros urediniais e com pouca ou nenhuma esporulação (RB ? Reddish Brown). Lesões do tipo RB são típicas de materiais com genes dominantes de resistência ou de efeito principal a essa doença. Este tipo de lesão pode ser descrito como uma reação de hipersensibilidade. Dessa forma, objetivou-se neste...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Ferrugem asiática.; Cerrado; Phakopsora Pachyrhizi; Soja..
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/929367
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Designing the best breeding strategy for Coffea canephora: Genetic evaluation of pure and hybrid individuals aiming to select for productivity and disease resistance traits. Repositório Alice
ALKIMIM, E. R.; CAIXETA, E. T.; SOUSA, T. V.; GOIS, I. B.; SILVA, F. L. da; SAKIYAMA, N. S.; ZAMBOLIM, L.; ALVES, R. S.; RESENDE, M. D. V. de.
Breeding programs of the species Coffea canephora rely heavily on the significant genetic variability between and within its two varietal groups (conilon and robusta). The use of hybrid families and individuals has been less common. The objectives of this study were to evaluate parents and families from the populations of conilon, robusta, and its hybrids and to define the best breeding and selection strategies for productivity and disease resistance traits. As such, 71 conilon clones, 56 robusta clones, and 20 hybrid families were evaluated over several years for the following traits: vegetative vigor, incidence of rust and cercosporiosis, fruit ripening time, fruit size, plant height, canopy diameter, and yield per plant. Components of variance and...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Melhoramento Genético Vegetal; Café Robusta; Plant breeding; Coffea.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1139243
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Diagnostic et zanage agricole municipal: le cas de Juazeiro. Infoteca-e
SABOURIN, E.; CARON, P.; OLIVEIRA, J. S.; ALVES, R. S..
bitstream/item/196699/1/Diagnostic-et-zonage-le-cas-Juazeiro.pdf
Tipo: Capítulo em livro técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Bahia; Juazeiro; Familiar farms; Diagnosis; Production; Agricultura Familiar; Diagnostico; Produção; Brazil.
Ano: 2001 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/134415
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Diagnóstico e zoneamento agrícola municipal: o caso de Juazeiro. Infoteca-e
SABOURIN, E.; CARON, P.; OLIVEIRA, J. S.; ALVES, R. S..
Após uma fase de investimento da pesquisa em escala local, o desafio proposto, a partir de 1991, é experimentar métodos de apoio ao planejamento municipal (Caron et al., 1996). O município é a menor entidade político-administrativa brasileira dotada de poderes executivos e legislativos. No Nordeste semi-árido, freqüentemente, ele tem um tamanho significativo, vários milhares de quilômetros quadrados por conta da fraca densidade demográfica. Desde 1990, a equipe do projeto está engajada em uma intervenção de pesquisa-ação no Município de Juazeiro, no Estado da Bahia. Este capítulo apresenta as bases e os princípios dessa intervenção. A ênfase é dada à experiência de uma metodologia de zoneamente, sob a ótica dos atores, que visa produzir informação...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Zoneamento agrícola municipal; Unidade espacial; Bahia; Juazeiro; Agricultura Familiar; Family farms.
Ano: 2003 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/153311
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Diferentes parâmetros patométricos para avaliação da ferrugem asiática em linhagens transgênicas de soja. Repositório Alice
SUSSEL, A. A. B.; SILVA NETO, S. P. da; MOREIRA, C. T.; ALVES, R. S.; ALMEIDA, N. J..
A ferrugem asiática está disseminada em todas regiões produtoras de soja do Brasil. Os sintomas iniciais da doença são pequenas pústulas foliares, de cor castanha a marromescura, podem ser classificadas como do tipo castanho clara com muitos soros urediniais e abundante esporulação (TAN) ou castanho avermelhada com poucos soros urediniais e com pouca ou nenhuma esporulação (RB).Observou-se diferença estatística entre as médias de severidade e de desfolha causadas pela ferrugem asiática, nos diferentes tratamentos com fungicidas nos três estratos avaliados. Tratamentos com apenas uma pulverização não apresentaram diferenças significativas em relação aos tratamentos com três pulverizações. Houve diferença estatística entre as médias de número de esporos...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Ferrugem asiática.; Soja..
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/929377
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Estimates of genetic parameters and repeatability coefficients in S2 peach genotypes grown in a subtropical environment. Repositório Alice
SILVA, J. O. da C. e; BRUCKNER, C. H.; CARNEIRO, P. C. S.; RESENDE, M. D. V. de; ALVES, R. S.; MATIAS, R. G. P..
Estimates of genetic parameters and repeatability coefficients in peach breeding are scarce. In view of this, the present study was carried out to estimate genetic parameters for plant and fruit traits and repeatability coefficients for fruit traits in S2 peach genotypes grown in a subtropical environment. A total of 434 individuals from 55 full-sib families of five populations were used in the study. The following plant traits were evaluated: trunk diameter at 10 cm above soil level (TD10), trunk diameter at 130 cm above soil level (TD130), plant height (PH), rate of budding on mixed branches (RB), rate of blind nodes on mixed branches (RBN), fruit number (FN) and harvest time (HT). In the fruit, the following traits were measured: weight (FW), diameter...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Melhoramento Genético Vegetal; Pêssego; Prunus persica var. nucipersica; Fruits; Selection methods; Peaches.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1129617
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Estimates of genetic parameters, genetic variability, and selection in the S1 generation of peach. Repositório Alice
SILVA, J. O. da C. e; BRUCKNER, C. H.; CARNEIRO, P. C. S.; RESENDE, M. D. V. de; ALVES, R. S.; SILVA, D. F. P. da.
The growing of peach in mild winter regions is made viable through the use of genotypes that have low need for cold conditions, and this is one of the main aims of breeding for these regions. Thus, the aims of this study were to estimate genetic parameters, evaluate genetic variability, and select families adapted to mild winter regions in the S1 generation of peach through mixed model methodology (REML/BLUP). For that purpose, 22 populations, 84 families, and 2090 individuals were evaluated for the following traits: bud burst rate (BR), node density (ND), plant height (PH), and trunk diameter (TD). Genetic variability was found for all the traits. Individual heritability in the broad sense was of low and medium magnitudes. The PH trait had positive...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Prunus Persica; Melhoramento Vegetal; Fruta; Pêssego; Fruit trees; Plant breeding; Peaches.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1129623
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Estimates of repeatability coefficients and the number of the optimum measure to select superior genotypes in Annona muricata L. Repositório Alice
SANCHÉZ, C. F. B.; ALVES, R. S.; GARCIA, A. d. P.; TEODORO, P. E.; PEIXOTO, L. A.; SILVA, L. A.; BHERING, L. L.; RESENDE, M. D. V. de.
The aim of this study was to evaluate repeated measures over the years to estimate repeatability coefficient and the number of the optimum measure to select superior genotypes in Annona muricata L. The fruit production was evaluated over 16 years in 71 genotypes without an experimental design. The estimation of variance components and the prediction of the permanent phenotypic value were performed using REML/BLUP proceedings. The coefficient of determination, accuracy, and selective efficiency increased when measures increased. The coefficient of determination of 80% was reached beyond 8 crop seasons with high accuracy and selective efficiency. Thus, the evaluation of 8 crop seasons can be suitable to select superior genotypes in the A. muricata L....
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: REML.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1085408
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Evaluation of a new additive-dominance genomic model and implications for quantitative genetics and genomic selection. Repositório Alice
MIRANDA, T. L. R.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; NUNES, A. C. P.; TAKAHASHI, E. K.; SIMIQUELI, G. F.; SILVA, F. F. e; ALVES, R. S..
The Fisher?s infinitesimal model is traditionally used in quantitative genetics and genomic selection, and it attributes most genetic variance to additive variance. Recently, the dominance maximization model was proposed and it prioritizes the dominance variance based on alternative parameterizations. In this model, the additive effects at the locus level are introduced into the model after the dominance variance is maximized. In this study, the new parameterizations of additive and dominance effects on quantitative genetics and genomic selection were evaluated and compared with the parameterizations traditionally applied using the genomic best linear unbiased prediction method. As the parametric relative magnitude of the additive and dominance effects...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Melhoramento Genético Vegetal; Seleção Genética; Molecular models; Plant selection guides; Plant breeding.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1139183
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Evaluation of different selection indices combining Pilodyn penetration and growth performance in Eucalyptus clones. Repositório Alice
NUNES, A. C. P.; RESENDE, M. D. V. de; SANTOS, G. A. dos; ALVES, R. S..
The present study aimed to evaluate the selection indices efficiency for Pilodyn penetration combined with growth traits in Eucalyptus clones. It was carried out experiments in a randomized block design, with single tree plots and 30 replications. Diameter at breast height (DBH), total height (TH), and Pilodyn penetration as an indicator of basic density (BD) were measured. The volume was estimated. Based on predicted genotypic values, three indices presented the highest accuracies: I8 (based on partial correlation), I7 (based on the concept of multivariate BLUP) and I3 (based on two variables as ratio, which uses a third heritability estimate associated to the ratio DBH/BD, besides the two heritabilities of DBH and BD). Thus, it is possible to optimize...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Partial correlation; Path analysis; Selection criteria; Accuracy; Wood quality.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1082823
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Evaluation of genotype x environment interactions in cotton using the method proposed by Eberhart and Russell and reaction norm models. Repositório Alice
ALVES, R. S.; TEODORO, P. E.; FARIAS, F. C.; FARIAS, F. J. C.; CARVALHO, L. P. de; RODRIGUES, J. I. S.; BHERING, L. L.; RESENDE, M. D. V. de.
Cotton produces one of the most important textile fibers of the world and has great relevance in the world economy. It is an economically important crop in Brazil, which is the world?s fifth largest producer. However, studies evaluating the genotype x environment (G x E) interactions in cotton are scarce in this country. Therefore, the goal of this study was to evaluate the G x E interactions in two important traits in cotton (fiber yield and fiber length) using the method proposed by Eberhart and Russell (simple linear regression) and reaction norm models (random regression). Eight trials with sixteen upland cotton genotypes, conducted in a randomized block design, were used. It was possible to identify a genotype with wide adaptability and stability for...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Genetic selection; Stability and adaptability; Mixed model methodology; Random regression; Gossypium hirsutum; Seleção genética; Natural selection.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1083385
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Genética: estratégias de melhoramento e métodos de seleção. Repositório Alice
RESENDE, M. D. V. de; ALVES, R. S..
RESUMO. Este capítulo aborda, de forma sucinta, tópicos que a Embrapa Florestas concentra esforços e contribui com resultados de pesquisa científica, visando principalmente o melhoramento de eucalipto, tais como: germoplasma; objetivos do melhoramento; estrutura da população de melhoramento; delineamentos de cruzamento; estratégias de melhoramento (métodos de seleção recorrente); experimentação adequada; métodos de predição de valores genéticos e seleção; acurácia, confiabilidade e eficiência seletiva; heterogeneidade genética e número adequado de clones em plantios comerciais. Além disto, uma visão de futuro sobre avaliação genética e genômica é apresentada. Em geral, ênfase foi dada à evolução dos métodos de predição de valores genéticos e seleção e...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Embrapa Florestas; Eucalipto; Pesquisa Florestal; Historia; Melhoramento Genético Vegetal; Germoplasma; Seleção; Eucalyptus.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1131863
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Genomic selection in tropical forage grasses: current status and future applications. Repositório Alice
SIMEÃO, R. M.; RESENDE, M. D. V. de; ALVES, R. S.; PESSOA-FILHO, M.; AZEVEDO, A. L. S.; JONES, C. S.; PEREIRA, J. F.; MACHADO, J. C..
The world population is expected to be larger and wealthier over the next few decades and will require more animal products, such as milk and beef. Tropical regions have great potential to meet this growing global demand, where pasturelands play a major role in supporting increased animal production. Better forage is required in consonance with improved sustainability as the planted area should not increase and larger areas cultivated with one or a few forage species should be avoided. Although, conventional tropical forage breeding has successfully released well-adapted and high-yielding cultivars over the last few decades, genetic gains from these programs have been low in view of the growing food demand worldwide. To guarantee their future impact on...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Seleção assistida; Seleção genômica; Brachiaria; Apomixia; Poliploidia; Gramínea; Apomixis; Marker-assisted selection; Polyploidy.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1133333
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Linear, generalized, hierarchical, bayesian and random regression mixed models in genetics/genomics in plant breeding. Repositório Alice
RESENDE, M. D. V. de; ALVES, R. S..
This paper presents the state of the art of the statistical modelling as applied to plant breeding. Classes of inference, statistical models, estimation methods and model selection are emphasized in a practical way. Restricted Maximum Likelihood (REML), Hierarchical Maximum Likelihood (HIML) and Bayesian (BAYES) are highlighted. Distributions of data and effects, and dimension and structure of the models are considered for model selection and parameters estimation. Theory and practical examples referring to selection between models with different fixed effects factors are given using the Full Maximum Likelihood (FML). An analytical FML way of defining random or fixed effects is presented to avoid the subjective or conceptual usual definitions. Examples of...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Método Estatístico; Melhoramento Genético Vegetal; Plant breeding; Statistical models.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1129637
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Models for optimizing selection based on adaptability and stability of cotton genotypes. Repositório Alice
PEIXOTO, M. A.; EVANGELISTA, J. S. P. C.; ALVES, R. S.; FARIAS, F. J. C.; CARVALHO, L. P.; TEODORO, L. P. R.; TEODORO, P. E.; BHERING, L. L..
In multi-environment trials (MET), large networks are assessed for results improvement. However, genotype by environment interaction plays an important role in the selection of the most adaptable and stable genotypes in MET framework. In this study, we tested different residual variances and measure the selection gain of cotton genotypes accounting for adaptability and stability, simultaneously. Twelve genotypes of cotton were bred in 10 environments, and fiber length (FL), fiber strength (FS), micronaire (MIC), and fiber yield (FY) were determined. Model selection for different residual variance structures (homogeneous and heterogeneous) was tested using the Akaike Information Criterion (AIC) and Bayesian Information Criterion (BIC). The variance...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Algodão.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1139988
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Multi-trait multi-environment models in the genetic selection of segregating soybean progeny. Repositório Alice
VOLPATO, L.; ALVES, R. S.; TEODORO, P. E.; RESENDE, M. D. V. de; NASCIMENTO, M.; NASCIMENTO, A. C. C.; LUDKE, W. H.; SILVA, F. L. da; BORÉM, A..
At present, single-trait best linear unbiased prediction (BLUP) is the standard method for genetic selection in soybean. However, when genetic selection is performed based on two or more genetically correlated traits and these are analyzed individually, selection bias may arise. Under these conditions, considering the correlation structure between the evaluated traits may provide more-accurate genetic estimates for the evaluated parameters, even under environmental influences. The present study was thus developed to examine the efficiency and applicability of multi-trait multi-environment (MTME) models by the residual maximum likelihood (REML/BLUP) and Bayesian approaches in the genetic selection of segregating soybean progeny. The study involved data...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Bayesian-inference; Genomic selection; Breeding values; Seed protein; Mixed models; Inferência Bayesian; Modelo misto; Seleção genômica; Soja; Soybeans; Agronomic traits; Prediction.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110400
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Quantifying individual variation in reaction norms using random regression models fitted through Legendre polynomials: application in eucalyptus breeding. Repositório Alice
ALVES, R. S.; RESENDE, M. D. V. de; ROCHA, J. R. do A. S. de C.; PEIXOTO, M. A.; TEODORO, P. E.; SILVA, F. F. e; BHERING, L. L.; SANTOS, G. A. dos.
An accurate, efficient and informative statistical method for analyses of genotype × environment (G × E) interactions is a key requirement for progress in any breeding program. Thus, the objective of this study was to quantify individual variation in reaction norms using random regression models fitted through Legendre polynomials in eucalyptus (Eucalyptus spp.) breeding. To this end, a data set with 215 eucalyptus clones of different species and hybrids evaluated in four environments for diameter at breast height (DBH) and Pilodyn penetration (PP) was used. Variance components were estimated by restricted maximum likelihood, and genetic values were predicted by best linear unbiased prediction. The best-fitted model for DBH and PP was indicated by the...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Método Estatístico; Melhoramento Genético Vegetal; Interação Genética; Eucalipto; Statistical models; Genotype-environment interaction; Forest trees; Plant breeding; Eucalyptus.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1129653
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Resistência de acessos de maracujazeiro-doce ao vírus do endurecimento dos frutos em condições de campo e casa de vegetação. Repositório Alice
BELLON, G.; ANJOS, J. R. N.; JUNQUEIRA, N. T. V.; JUNQUEIRA, K. P.; FALEIRO, F. G.; PEIXOTO, J. R.; BRAGA, M. F.; SANTOS, E. C.; ALVES, R. S..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Melhoramento genético.; Doença de Planta; Maracujá..
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/570497
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Selection of Jatropha genotypes for bioenergy purpose: an approach with multitrait, multiharvest and effective population size. Repositório Alice
RODRIGUES, E. V.; ROCHA, J. R. do A. S. de C.  ; ALVES, R. S.; TEODORO, P. E.; LAVIOLA, B. G.; RESENDE, M. D. V. de; CARNEIRO, P. C. S.  ; BHERING, L. L..
Jatropha curcas L. is a perennial plant with great potential for biodiesel production. Thus, the aim of this study was to select J. curcas genotypes for bioenergy purpose considering multitrait, multiharvest and effective population size. To this end, a data set with 70 J. curcas families, obtained through controlled crosses, evaluated in a randomized block design, with six replications, three plants per plot, spaced at 4 × 2 m was used. The following traits were evaluated: plant height in the 2014 and 2015 crop seasons; canopy projection in the row (2015 crop season); canopy projection between rows (2015 crop season); and grain yield (2015, 2016, and 2017 harvests). The mixed model methodology was used to estimate the variance components and to predict...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Genetic diversity; Mixed models; Genética Vegetal; Melhoramento Genético Vegetal; Plant breeding; Plant genetics; Jatropha.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1126809
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