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A new closterovirus found in arracacia xanthorrhiza by next generation sequencing. Repositório Alice
COSTA, G. A.; GOMES, S. S. V. S. F.; BLAWID, R.; NAGATA, T.; INOUE-NAGATA, A. K.; RESENDE, R. O.; ORÍLIO, A. F..
Resumo PIV208
Tipo: Separatas Palavras-chave: Mandioquinha-salsa.; Virus; Arracacia xanthorrhiza..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1066095
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A novel cythorhabdorivirus in arracacha (Arracacia Xanthorrhiza). Repositório Alice
GOMES, S. S. V. S. F.; BLAWID, R.; COSTA, G. A.; NAGATA, T.; MADEIRA, N. R.; INOUE-NAGATA, A. K. I.; RESENDE, R. O.; ORÍLIO, A. F..
Resumo PIV226.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Mandioquinha-salsa.; Virus; Arracacia Xanthorrhiza..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1064995
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Análise da expressão gênica pela técnica de PCR quantitativa em tempo real: princípios e fundamentos. Infoteca-e
MORGANTE, C. V.; BLAWID, R..
Neste trabalho são apresentados os conceitos fundamentos da análise da expressão gênica pela técnica de PCR e reúne informações importantes para aqueles que se dedicam ao estudo da genética vegetal. Sumário: Introdução; Rermos básicos utilizados na qPCR; Sistemas para a detecção da fluorescência; Etapas anteriores à reação de qPCR; Parâmetros para a padronização da qPCR; Métodos de quantificação gênica; Referências; Glossário.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: PCR; Metodologia de análise; Biologia molecular; Genética vegetal; Biotecnologia; Biotechnology.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1066218
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Busca de fontes de resistência ao vetor Bemísia tabaci e ao Tomato chlorotic mottle vírus (ToCMoV) em germoplasma de Solanum melongena. Repositório Alice
PINHEIRO-LIMA, B.; BRANT, P. M.; CALAÇA, M. M.; BEZERRA, B. M.; BOITEUX, L. S.; BLAWID, R.; RESENDE, R. O.; PEREIRA-CARVALHO, R. C..
O objetivo desse trabalho foi buscar fontes de resistência à mosca branca e ao ToCMoV em berinjela (S. melongena).
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Tomate; Mosca branca; Variedade resistente; Virus; Solanum lycopersicum; Begomovirus..
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1009777
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Complete genome sequence of mimosa mosaic virus, a new sobemovirus infecting Mimosa sensitiva L. Repositório Alice
KAUFFMANN, C. M.; BOARI, A. de J.; SILVA, J. M. F.; BLAWID, R.; NAGATA, T..
A new sobemovirus, which we have named "mimosa mosaic virus" (MimMV), was found by high-throughput sequencing and isolated from a mimosa (Mimosa sensitiva L.) plant. The genome sequence was confirmed by Sanger sequencing and comprises 4595 nucleotides. Phylogenetic analysis based on the predicted amino acid (aa) sequences of the P2b protein (encoded by ORF2b) and the coat protein showed 52.7% and 31.8% aa sequence identity, respectively, to those of blueberry shoestring virus. The complete genome sequence of MimMV was less than 47% identical to those of other sobemoviruses. These data suggest that MimMV is a member of a new species in the genus Sobemovirus, for which the binomial name ?Sobemovirus mimosae? is proposed.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Vírus do mosaico; Mimosa; Doença de Planta; Vírus; Filogenia; Phylogeny; Plant diseases and disorders; Plant viruses; RNA viruses.
Ano: 2023 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1150958
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Detecção de uma nova espécie de Fabavirus em pimenteira-do-reino por sequenciamento de alto desempenho. Repositório Alice
KAUFFMANN, C. M.; BOARI, A. de J.; KITAJIMA, E. W.; BLAWID, R.; NAGATA, R..
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Pimenta do Reino; Piper Nigrum; Virose Vegetal; Fabavirus.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1115645
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Discovery and molecular characterization of a novel enamovirus, Grapevine enamovirus-1. Repositório Alice
SILVA, J. M. F; RWAHNIH, M. A.; BLAWID, R.; NAGATA, T.; FAJARDO, T. V. M..
In this study, we describe a novel putative Enamovirus member, Grapevine enamovirus-1 (GEV-1), discovered by high-throughput sequencing (HTS). A limited survey using HTS of 17 grapevines (Vitis spp.) from the south, southeast, and northeast regions of Brazil led to the detection of GEV-1 exclusively on southern plants, infecting four grapevine cultivars (Cabernet Sauvignon, Semillon, CG 90450, and Cabernet franc) with a remark-able identity of around 99% at the nucleotide level. This novel virus was only detected in multiple-virus infected plants exhibiting viral-like symptoms. GEV-1 was also detected on a cv. Malvasia Longa by RT-PCR. We performed graft-transmissibility assays on GEV-1. The organization, products, and cis-acting regulatory elements of...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: High-throughput sequencing; Grapevine enamovirus-1; GEV-1.; Luteoviridae..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1071596
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Discovery and partial characterization of a novel virus, tentatively named Grapevine virgalike virus. Repositório Alice
SILVA, J. M. F.; PEREIRA, B. R. de M.; AI RWAHNÍH, M.; BLAWID, R.; NAGATA, T.; FAJARDO, T. V. M..
The families Bromoviridae and Virgaviridae are composed of viruses with a single-stranded positive sense RNA genome possessing an alpha-like replication complex and a 3'-t-RNA-like structure.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Grapevine virgalike virus; Phylogenetic analysis; High-throughput sequencing (HTS); Bromoviridae; Virgaviridae; Nucleotides; Viruses.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1090655
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Diversidade de endossimbiontes em Bemisia tabaci coletadadas no tomateiro e diferentes hospedeiras em localidades do Centro Oeste. Repositório Alice
NOGUEIRA, I.; FONSECA, M. E. de N.; RESENDE, R. O.; BLAWID, R.; INOUE=NAGATA, A. K.; PEREIRA-CARVALHO, R. C..
O objetivo do trabalho foi identificar endossimbiontes em populações de B. tabaci de vários locais e plantas hospedeiras.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Praga de planta; Inseto; Mosca branca; Bemisia tabaci.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/943671
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Fluorescence in situ hybridization analysis of endosymbiont genera reveals novel infection patterns in a tomato-infesting Bemisia tabaci population from Brazil. Repositório Alice
BLAWID, R.; MORGADO, F. S.; SOUZA, C. A.; BOITEUX, L. S.; PEREIRA-CARVALHO, R. C..
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Tomato.; Bemisia tabaci; Tomate.; Endosymbionts; Solanum lycopersicum..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1030368
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Immunostaining of root tissue of nicotiana benthamiana infected with pepper risngpot virus. Repositório Alice
TAVARES, M. L.; BLAWID, R.; NAGATA, T.; NAGATA, A. K. I..
Na publicação: Inoue Nagata, A. K. Resumo PIV 223.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Tobacco rattle virus; Tobravirus..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1066090
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In silico detection of a defective genomic RNA of Grapevine leafroll-associated virus 4 strain 5 in High-Throughput Sequencing data. Repositório Alice
SILVA, J. M. F.; BLAWID, R.; NAGATA, T.; FAJARDO, T. V. M..
Grapevine leafroll disease (GLRD) is one of the most economically important viral diseases affecting grapevines (Maliogka et aI., 2015).
Tipo: Separatas Palavras-chave: Grapevine; Genomic; Grapevine leafroll disease (GLRD); Family Closteroviridae; Positive-sense ssRNA genome; Viruses.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1090663
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Metagenomic analysis of viral species in native plants from the cerrado biome. Repositório Alice
SANTOS, E. M. B.; BRANT, P. M.; BLAWID, R.; MELO, F. L.; ORÍLIO, A.; RESENDE, R. O.; LIMA, M. F.; RIBEIRO, S.; PEREIRA-CARVALHO, R. C..
The main objective of this work is to detect novel viral species infecting native plants from Cerrado with the aid of metagenomics.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Cerrado.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1033036
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Molecular and biological characterization of corchorus mottle virus, a new begomovirus from Brazil. Repositório Alice
BLAWID, R.; FONTENELE, R. S.; LACORTE, C. C.; RIBEIRO, S. da G..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Corchorus hirtus; Orinoco jute; Begomovirus.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/974850
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Molecular characterization of grapevine enamo-like virus, a novel putative member of the genus enamovirus. Repositório Alice
SILVA, J. M. F.; FAJARDO, T. V. M.; AL RWAHNIH, M.; BLAWID, R.; NAGATA, T..
Annals of the XXVII Brazilian Congress of Virology & XI Mercosur Meeting of Virology, Pirienópolis, GO, 2016.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Grapevine.; Doença de Planta; Vírus..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1053686
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Molecular characterization of Grapevine enamolike virus, a novel putative member of the genus Enamovirus. Repositório Alice
SILVA, J. M. F.; FAJARDO, T. V. M.; AL RWAHNIN, M.; BLAWID, R.; NAGATA, T..
Annals of the XXVII Brazilian Congress of Virology & X Mercosur Meeting of Virology, Pirenópolis, GO, 2016.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Family Luteoviridae; Pea enation mosaic virus 1 (PEMV1); Alfalfa enamovirus1 (AEV1); Citrus vein enation virus (CVEV); Virus ENAMO-LIKE; Caracterização molecular; Virus; Doenca de planta.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1053684
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Reference gene selection for qPCR analysis in tomato-bipartite begomovirus interaction and validation in additional tomato-virus pathosystems. Repositório Alice
LACERDA, A. L. M.; FONSECA, L. N.; BLAWID, R.; BOITEUX, L. S.; RIBEIRO, S. G.; BRASILEIRO, A. C. M..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Solanum lycopersicum L; Tomato.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1030840
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Resposta ao tomato chlorotic mottle virus (ToCMoV) e a Bemísia tabaci de espécies do bioma 'Cerrado'. Repositório Alice
SANTOS, F. M. B.; SOUZA, C. A.; BRITO, S. M.; OLIVEIRA, D. V. V.; BEZERRA, M. B.; ALMEIDA, N. N.; BLAWID, R.; RESENDE, R. O.; BOITEUX, L. S.; PEREIRA-CARVALHO, R. C..
Resumo
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Espécies florestais; ToCMoV; Doença de planta; Bemisia tabaci; Floresta; Virus.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1009709
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Resposta de espécies florestais do Cerrado à espécies virais dos gêneros Repositório Alice
FARIAS, P. C.; BATISTA, J. G.; CALAÇA, M. M.; DIANESE, E. C.; BOITEUX, L. S.; LIMA, M. F.; RESENDE, R. O.; BLAWID, R.; PEREIRA-CARVALHO, R. de C..
Este trabalho objetivou a avaliação do potencial de espécies florestais como hospedeiras de vírus economicamente importantes. Espécies de Potyvirus (Potato virus Y - PVY) e de Tospovirus (Groundnut ringspot virus - GRSV e Tomato spotted wilt virus -? TSWV) foram inoculadas mecanicamente via extrato vegetal tamponado em 22 espécies em plantas nativas do Bioma Cerrado.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Cerrado; Doença de planta; Virus; Potyvirus; Tospovirus..
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1009755
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The complete genome sequence of melon yellowingassociated virus determined by nextgeration sequencing. Repositório Alice
COSTA, T. M.; COSTA JUNIOR, A. C.; MORIYA, N. M. N.; ARAGÃO, F. A. S.; LIMA, M. F.; NAGATA, A. K. I.; BLAWID, R.; NAGATA, T..
Na publicação: Inoue Nagata, A. K. Resumo PIV 82.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Melon.; Melão; Virus.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1066094
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