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A microsatellite-based consensus linkage map for species of Eucalyptus and a novel set of 230 microsatellite markers for the genus. Repositório Alice
BRONDANI, R. P. V.; WILLIAMS, E. R.; BRONDANI, C.; GRATTAPAGLIA, D..
Eucalypts are the most widely planted hardwood trees in the world occupying globally more than 18 million hectares as an important source of carbon neutral renewable energy and raw material for pulp, paper and solid wood. Quantitative Trait Loci (QTLs) in Eucalyptus have been localized on pedigree-specific RAPD or AFLP maps seriously limiting the value of such QTL mapping efforts for molecular breeding. The availability of a genus-wide genetic map with transferable microsatellite markers has become a must for the effective advancement of genomic undertakings. This report describes the development of a novel set of 230 EMBRA microsatellites, the construction of the first comprehensive microsatellite-based consensus linkage map for Eucalyptus and the...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Marcadores microssatélites; Genômica comparativa; QTL; Eucalyptus.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/207201
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A microsatellite-based consensus linkage map for species of Eucalyptus and a novel set of 230 microsatellite markers for the genus. Repositório Alice
BRONDANI, R. P. V.; WILLIAMS, E. R.; BRONDANI, C.; GRATTAPAGLIA, D..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Marcadores microssatélites; Genômica comparativa; QTL; Eucalyptus.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/188047
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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear; Arroz; Oryza sativa; Recurso genético; Variedade; Genótipo.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/923298
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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/938894
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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/923169
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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear; Arroz; Oryza sativa; Recurso genético; Variedade; Genótipo.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/922956
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Alchemy Web: uma proposta de interface gráfica para o Sistema Alchemy. Infoteca-e
NARCISO, M. G.; VALDISSER, P. A. M. R.; BENÍCIO, C. G.; BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
A Embrapa Arroz e Feijão utiliza a plataforma de genotipagem BeadXpress Reader (Illumina), que utiliza a fluorescência como método de detecção. A interface gráfica foi construída utilizando-se a linguagem JavaScript. Para exemplificar o acesso e o uso do Alchemy Web, foram utilizados dados obtidos em feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.), no Laboratório de Biotecnologia da Embrapa Arroz e Feijão, através da plataforma BeadXpress (Illumina).
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Software; Interface gráfica; Marcador molecular.
Ano: 2014 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/984524
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An improved method for RNA extraction from common bean seeds and validation of reference genes for qPCR. Repositório Alice
PEREIRA, W. J.; BASSINELLO, P. Z.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
An RNA extraction method with high integrity and purity as well as the selection of adequate reference genes are prerequisites for gene expression analysis. For common bean seeds, there is no well-defined protocol that can be used in a laboratory routine for gene expression analysis. In this study, an extraction protocol for RNA from common bean seeds, which produced material with good integrity for qPCR (RIN ≥ 6.5), was optimized. In addition, 10 reference genes were evaluated under qPCR standard conditions using different tissue samples of common beans. Gene stabilities were analyzed using the delta-CT method, Bestkeeper, NormFinder and geNorm approaches. The genes β-tubulin and T197 were ranked as the most stable among the sample sets...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Gene normalization; Molecular breeding; Grain RNA extraction; Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento; RNA; Beans; Gene expression..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076282
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Análise ampla do genoma funcional de feijoeiro em condições de deficiência hídrica. Repositório Alice
PEREIRA, W. J.; MELO, A. T. de O.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; COELHO, A. S. G.; VIANELLO, R. P..
Esse estudo teve como objetivo desenvolver e sequenciar bibliotecas de cDNA a partir de diferentes tecidos e genótipos de feijão e analisar em resposta aos tratamentos específicos os níveis diferenciais de expressão gênica. Foram avaliados os genótipos fenotipicamente divergentes BAT477, caracterizado como tolerante à seca, e Pérola, como suscetível.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Deficiência hídrica; Genoma.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1039617
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Análise comparativa para a produtividade em arroz por populações segregantes de Epagri 108 x Irat 122 avançadas por Bulk e SSD. Repositório Alice
RAMOS, M. R. F.; MENDONÇA, J. A.; MOURA NETO, F. P.; BRONDANI, C..
O objetivo desse trabalho, portanto, foi comparar a produtividade das linhagens avançadas por SSD (F8) com a produtividade das linhagens avançadas por Bulk (F7: 8). Adicionalmente, todas as linhagens estão sendo analisadas por marcadores SNPs, obtidos pela técnica de DArTseq, o que possibilitará inferir a distância genética entre elas e comparar o percentual da variação fenotípica explicada pelos QTLs para produtividade identificados nos dois conjuntos de linhagens (derivadas dos métodos Bulk e SSD).
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Melhoramento genético vegetal; Marcador molecular.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084439
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Análise da diversidade genética de variedades tradicionais de feijoeiro comum utilizando marcadores microssatélites. Repositório Alice
PRADO, G. S.; COELHO, G. R. C.; MENEZES, I. P. P. de; OLIVEIRA, J. P. de; COSTA, J. G. C. da; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
No Brasil, foi estabelecida, a partir da década de 70, uma rede de pesquisa com ênfase na conservação e uso dos recursos genéticos do feijoeiro comum. O banco de germoplasma da Embrapa Arroz e Feijão detém aproximadamente 17.345 acessos, dos quais 4.325 são variedades tradicionais (VTs). Esses acessos representam uma rica fonte de genes que conferem adaptação a diferentes ambientes, resistência a doenças e propriedades agronômicas diferenciadas que podem ser exploradas por meio de técnicas moleculares que fornecem medidas bastante eficientes e diretas da variabilidade genética existente dentro e entre os acessos. Esse estudo teve como objetivo a avaliação da variabilidade genética de VTs de feijoeiro comum utilizando marcadores microssatélites (SSRs).
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Marcador molecular.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/984476
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Análise da diversidade genética e estruturação populacional entre marcadores SSRs e SNPs em germoplasma de feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.). Repositório Alice
FARIA, B. M. S. de; MENEZES, I. P. P. de; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; VALDISSER, P. A. M. R.; COELHO, G. R. C.; BORBA, T. C. de O.; ABREU, A. G. de; BRONDANI, C.; BARROS, E. G. de; VIANELLO, R. P..
O objetivo desse estudo foi avaliar o poder de informação genética dos marcadores SSRs e SNPs para aplicações no melhoramento genético do feijoeiro comum.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento genético vegetal; Germoplasma; Marcador molecular.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/964150
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Análise da variabilidade genética de variedades tradicionais de arroz (Oryza sativa L.) através de marcadores moleculares microssatélites. Repositório Alice
BORBA, T. C. de O.; ZUCCHI, M. I.; BRONDANI, R. V.; RANGEL, P. H. N.; MAGALHÃES, M. R.; BRONDANI, C..
Este trabalho teve como objetivo avaliar a variabilidade genética através de marcadores moleculares SSR em uma amostra de variedades tradicionais oriundas de coletas, conduzidas entre os anos de 1978 e 1996, em lavouras de pequenos agricultores no Brasil.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Coleção nuclear; Arroz; Oryza sativa; Recurso genético; Marcador molecular.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/936126
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Análise das proteínas de reserva do arroz silvestre Oryza glumaepatula e de linhagens interespecíficas Oryza sativa x O. glumaepatula. Repositório Alice
SARTORI, D. E. L.; SANTOS, K. F. D'E. N.; MARTIN, C. C. G.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
Este trabalho teve como objetivo quantificar e determinar os perfis proteicos totais e das frações proteicas no endosperma do grão de 70 linhagens desenvolvidas a partir dos cruzamentos interespecíficos.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Oryza glumaepatula; Proteína de reserva; Cruzamento interespecífico; Arroz Silvestre; Arroz; Oryza Sativa; Proteína; Cruzamento.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1104202
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Análise das proteínas de reserva do grão dos 550 acessos da coleção nuclear de arroz da Embrapa (CNAE). Repositório Alice
SILVEIRA, R. D. D.; SANTOS, K. F. E. N.; CRUZEIRO, G. A. V.; BORBA, T. C. O.; DIDONET, C. G. M.; BRONDANI, C..
Este trabalho teve como objetivo quantificar as proteínas totais dos 550 acessos da CNAE, a fim de conhecer a influência do tipo de cultivo e da origem de cada acesso nos seus teores de proteínas.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Qualidade do grão; Proteômica; Coleção nuclear; Conpeex.; Arroz; Banco de Germoplasma; Oryza Sativa; Proteína; Recurso Genético.; Rice..
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/217547
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Análise de associação genômica ampla (GWAS) da produtividade em arroz sob déficit hídrico. Repositório Alice
PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; GUIMARÃES, C. M.; NARCISO, M. G.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
Esse trabalho objetivou detectar, via genotipagem por sequenciamento (GBS), marcadores SNPs polimórficos em 175 acessos de arroz de terras altas componentes da CNAE (Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa) e associá-los à produtividade sob déficit hídrico, identificando regiões genômicas que poderiam estar relacionadas a esse caráter.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Mapeamento associativo; Genotipagem por sequenciamento; Arroz; Oryza sativa; Deficiência hídrica; Melhoramento genético vegetal.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1022477
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Análise de associação genômica ampla (GWAS) para tolerância à seca em feijoeiro comum. Repositório Alice
VALDISSER, P. A. M. R.; PEREIRA, W. J.; MORAIS JUNIOR, O. P. de; MENDONÇA, J. A.; SARTORI, D. E. L.; LIMA, LUANN V. V. O.; BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, C.; ZUCCHI, M. I.; VIANELLO, R. P..
O objetivo deste estudo foi identificar locos genéticos associados à tolerância à seca através da análise de associação genômica ampla (GWAS).
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Feijão; Resistência a seca; Deficiencia hídrica; Phaseolus vulgaris.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078828
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Análise de diversidade genética em acessos de variedades asiáticas de arroz (Oryza sativa L.) do banco ativo de germoplasma da Embrapa Arroz e Feijão. Repositório Alice
BENICIO, C. G.; BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, R. P. V.; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi o de caracterizar acessos asiáticos de arroz do Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Arroz e Feijão para o aperfeiçoamento da CNAE (Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa).
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Diversidade genética; Arroz; Oryza sativa; Banco de germoplasma; Rice.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/428081
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Análise de genes diferencialmente expressos em Phaseolus vulgaris sob condições de déficit hídrico. Repositório Alice
MÜLLER, B. S. F.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; PEREIRA, M.; GUIMARÃES, C. M.; ZAMBUZZI-CARVALHO, P. F.; SILVEIRA, R. D. D.; BRONDANI, C.; BRONDANI, R. P. V..
Com o intuito de ampliar o conhecimento dos mecanismos genéticos envolvidos na tolerância à seca, esse estudo prevê a criação de um banco de sequencias gênicas e a identificação de genes-candidatos envolvidos na resposta ao déficit-hídrico, utilizando as cultivares BAT-477, como genitor tolerante, e Pérola, como susceptível.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Resistência a seca; Genoma; Deficiência hídrica.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/866756
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Análise de pureza genética de sementes de feijoeiro comum utilizando marcadores microssatélites em sistema de genotipagem multiplex. Infoteca-e
CHEDIAK, G. L. de C.; BRONDANI, R. P. V.; DEL PELOSO, M. J.; MELO, L. C.; BRONDANI, C..
Esse estudo teve como objetivo avaliar quanto a pureza genética um conjunto de sementes de feijão comum resultantes do processo de multiplicação da cultivar BRS Campeiro, incluindo as sementes genéticas, sementes básicas e sementes com tipo diferenciado de grãos, quando comparados com a cultivar padrão, utilizando um sistema de genotipagem semiautomatizado baseado em marcadores microssatélites.
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Pureza varietal.; Feijão; Marcador Molecular; Melhoramento Genético Vegetal; Phaseolus Vulgaris; Qualidade; Semente..
Ano: 2007 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/202837
Registros recuperados: 187
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