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Adaptabilidade e estabilidade via regressão não paramétrica em genótipos de café PAB
Nascimento,Moysés; Ferreira,Adésio; Ferrão,Romário Gava; Campana,Ana Carolina Mota; Bhering,Leonardo Lopes; Cruz,Cosme Damião; Ferrão,Maria Amélia Gava; Fonseca,Aymbiré Francisco Almeida da.
O objetivo deste trabalho foi avaliar uma metodologia de análise de adaptabilidade e estabilidade fenotípica de genótipos de café baseada em regressão não paramétrica. A técnica utilizada difere das demais, pois reduz a influência na estimação do parâmetro de adaptabilidade de algum ponto extremo, ocasionado pela presença de genótipos com respostas demasiadamente diferenciadas a determinado ambiente. Foram utilizados dados provenientes de um experimento sobre produtividade média de grãos de 40 genótipos de café (Coffea canephora), com delineamento em blocos ao acaso, com seis repetições. Os genótipos foram avaliados em cinco anos (1996, 1998, 1999, 2000 e 2001), em dois locais (Sooretama e Marilândia, ES) no total de dez ambientes. A metodologia proposta...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Coffea canephora; Análise estatística; Interação genótipo x ambiente; Melhoramento genético; Pontos extremos.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2010000100006
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Agrupamento de modelos de regressão da análise de adaptabilidade e estabilidade de genótipos PAB
Vasconcelos,Edmar Soares de; Cruz,Cosme Damião; Regazzi,Adair José; Bhering,Leonardo Lopes; Rosado,Tatiana Barbosa; Vasconcelos,Fernando Soares de.
O objetivo deste trabalho foi evidenciar diferenças entre modelos de regressão, obtidos pelo método de Eberhart & Russell, na análise de adaptabilidade e estabilidade de comportamento de genótipos, e propor uma metodologia de agrupamento dos modelos similares. O teste para verificar a identidade de modelos foi empregado em dados de avaliação de 14 genótipos de milho em oito ambientes. Uma vez rejeitada a hipótese de igualdade dos modelos de regressão, realizou-se o agrupamento desses modelos com base no cálculo do quadrado médio da redução (QMRed) entre pares dos modelos de regressão. Após a obtenção desses valores, foi selecionado o de menor magnitude e verificada sua significância pelo teste F. NA hipótese de esse QMRed não ser significativo, o...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Zea mays Eberhart & Russell avaliação de genótipos identidade de modelos.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2010001200004
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Brief history of Eucalyptus breeding in Brazil under perspective of biometric advances Ciência Rural
Castro,Carla Aparecida de Oliveira; Resende,Rafael Tassinari; Bhering,Leonardo Lopes; Cruz,Cosme Damião.
ABSTRACT: Forest breeding is a science that has been developing in Brazil since 1941 being the Eucalyptus a highlighted genus in this scenario. In a global scene, Brazil is displayed prominently in productivity of Eucalyptus planting, due to favorable environmental conditions to cultivation development, and the incentive in research for improvement of traits of interest t observed in it species and hybrids. This research included a historical review of Eucalyptus breeding over the years under genetic biometric perspective in Brazil, from reports describing the pioneer planting up to the current genome wide selection (GWS) that came as a complement of forest breeding success. This review showed some of the tracks performed by researchers aiming to improve...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genetics; Crossing; History; Current scenario; Biometry; Genomic.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782016000901585
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Caracterização morfofisiológica de clones precoces e tardiosde batata visando à adaptação a condições tropicais Bragantia
Silva,Felipe Lopes da; Pinto,César Augusto Brasil Pereira; Alves,José Donizeti; Benites,Flávio Rodrigo Gandolfi; Andrade,Cristiana Moura; Rodrigues,Gabriel Belfort; Lepre,André Luiz; Bhering,Leonardo Lopes.
Os objetivos do trabalho foram avaliar os processos de crescimento, de tuberização e de partição de matéria seca em tubérculos de clones de batata precoces e tardios ao longo do ciclo vegetativo. Avaliou-se, ainda, a viabilidade do uso desses caracteres morfofisiológicos para a seleção de clones mais adaptados às condições tropicais. O trabalho foi desenvolvido em Lavras (MG), na safra das águas (agosto a dezembro de 2005). Os clones tardios foram mais produtivos que os precoces, devido ao crescimento mais vigoroso, à maior longevidade da área foliar fotossinteticamente ativa, à maior taxa de tuberização e ao período mais longo para enchimento de tubérculos. Os teores de clorofila a, b e total, a área foliar, a duração da área foliar, a taxa de crescimento...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Solanum tuberosum; Análise de crescimento; Partição de matéria seca; Stay-green.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052009000200002
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Diallel analysis and inbreeding depression in agronomic and technological traits of cotton genotypes Bragantia
Carvalho,Luiz Paulo de; Teodoro,Paulo Eduardo; Rodrigues,Josiane Isabela da Silva; Farias,Francisco José Correia; Bhering,Leonardo Lopes.
ABSTRACT Cotton provides about 90% of the world textile fiber, and is one of the crops of greater industrial relevance. The objectives of this study were to estimate the inbreeding depressionand the genetic effects involved in the control of the agronomic andfiber quality traits in F1 and F2 generations and to identify promising hybrids for obtaining superior cotton genotypes. Two cultivars of upland cotton and two moco (Brazilian endemic) cotton were crossed using a half-diallel scheme. The following traits were evaluated: percentage of fibers and weight of one boll, fiber length, fiber uniformity, short fiber index, fiber strength, and micronaire index. The additive genetic effects are predominant in the evaluated agronomic and fiber quality traits....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Gossypium hirsutum L. r. latifolium Hutch; Gossypium hirsutum L. r. marie galante Hutch; Combining ability; Parents selection.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052018000400527
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Estimativa de freqüência de recombinação no mapeamento genético de famílias de irmãos completos PAB
Bhering,Leonardo Lopes; Cruz,Cosme Damião; God,Pedro Ivo Vieira Good.
O objetivo deste trabalho foi obter as estimativas de freqüência de recombinação, por meio de simulação, para diferentes situações do mapeamento genético de famílias de irmãos completos. Foi simulado um genoma constituído de três grupos de ligação, em que cada um apresentava 11 marcas moleculares multialélicas, codominantes, distribuídas a cada 10 cM. A partir desse genoma, foram simulados dois cenários: um com genitores completamente informativos e outro com genitores formados aleatoriamente. Após a obtenção de todas as estimativas das freqüências de recombinação, concluiu-se que, para locos completamente informativos, pode-se calcular a freqüência de recombinação entre pares de locos, a partir da freqüência gamética de cada genitor ou a partir da...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genômica; Máxima verossimilhança; Populações exogâmicas.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008000300011
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Estratégias de amostragem e estabelecimento de coleções nucleares PAB
Vasconcelos,Edmar Soares de; Cruz,Cosme Damião; Bhering,Leonardo Lopes; Ferreira,Adésio.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência da intensidade de amostragem, do tamanho da coleção de germoplasma inicial e da variância da amostragem sobre a qualidade das respectivas coleções nucleares, quanto à representatividade das coleções iniciais. Foram simulados sete tamanhos de coleções iniciais e utilizadas seis intensidades de amostragem para estabelecimento de coleções nucleares, utilizando caracteres morfoagronômicos. Determinaram-se o número de grupos formados, o coeficiente de coincidência entre a coleção nuclear e a coleção inicial e o coeficiente de determinação dos acessos amostrados para comporem a coleção nuclear. Também foi proposto o uso de uma estratégia alternativa para estabelecer coleções nucleares, de forma a maximizar a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Coleção de germoplasma; Coleção nuclear; Intensidade de amostragem; Coeficiente de coincidência; Método de Tocher.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2007000400008
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Ganhos genéticos preditos por diferentes métodos de seleção em progênies de Eucalyptus urophylla PAB
Rosado,Antônio Marcos; Rosado,Tatiana Barbosa; Resende Júnior,Márcio Fernando Ribeiro; Bhering,Leonardo Lopes; Cruz,Cosme Damião.
O objetivo deste trabalho foi avaliar parâmetros genéticos e comparar os ganhos preditos por meio de diferentes métodos de seleção em famílias de meios-irmãos de Eucalyptus urophylla. Foi utilizada seleção entre e dentro, seleção combinada e seleção com base em modelos mistos (REML/BLUP) para os caracteres diâmetro à altura do peito, altura total e volume total com casca. Foi utilizado o teste de progênie constituído de 100 famílias de meios-irmãos com 55 meses de idade, em espaçamento de 3x2 m, em delineamento de blocos ao acaso, com cinco repetições. As progênies apresentaram variabilidade genética significativa e elevada magnitude de herdabilidade para os caracteres estudados, o que evidencia alto controle genético e condições favoráveis para seleção....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Eucalipto; Ganhos de seleção; Melhoramento florestal; Modelos mistos.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2009001200014
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Genetic gains in agronomic and technological traits of elite cotton genotypes Bragantia
Ribeiro,Larissa Pereira; Carvalho,Luiz Paulo de; Farias,Francisco José Correia; Rodrigues,Josiane Isabela da Silva; Teodoro,Paulo Eduardo; Bhering,Leonardo Lopes.
ABSTRACT The objective of this work was to estimate the predicted genetic gains with the simultaneous selection of agronomic and technological traits from elite cotton lines using selection indexes. Data from the evaluation of 36 elite lines were evaluated in three trials located in Apodi-RN in 2013 and 2014 and Santa Helena, GO, Brazil in 2013, in a randomized block design with two replicates. The agronomic traits evaluated were: plant height (PH), average boll weight (ABW), percentage of fibers (PF) and seed cotton yield (YIE). In 20 bolls from each experimental unit, the following technological fiber traits were evaluated: fiber length (UHM), fiber uniformity (UNIF), short fiber index (SFI), fiber strength (FS), elongation (ELON), micronaire (MIC),...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Gossypium hirssutum; Selection index; Simultaneous selection.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052018000300466
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Genetic gains in physic nut using selection indexes PAB
Bhering,Leonardo Lopes; Laviola,Bruno Galvêas; Salgado,Caio Césio; Sanchez,Carlos Felipe Barrera; Rosado,Tatiana Barbosa; Alves,Alexandre Alonso.
The objective of this work was to estimate genetic gains in physic nut (Jatropha curcas) using selection indexes and to establish the best selection strategy for the species. Direct and indirect selection was carried out using different selection indexes, totalizing 14 strategies. One hundred and seventy five families from the active germplasm bank of Embrapa Agroenergy, Brasília, Brazil, were analyzed in a randomized complete block design with two replicates. The evaluated traits were: grain yield; seeds per fruit; endosperm/seed ratio; seed weight, length, width, and thickness; branches per plant at 0.5, 1.0, and 1.5 m; plant height; stem diameter; canopy projection on rows and between lines; canopy volume; juvenility (days to the first flowering); and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Jatropha curcas; Biodiesel; Canopy volume; Cerrado; Juvenility; Seed size.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2012000300012
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Genetic parameters and variability in physic nut accessions during early developmental stages PAB
Laviola,Bruno Galvêas; Rosado,Tatiana Barbosa; Bhering,Leonardo Lopes; Kobayashi,Adilson Kenji; Resende,Marcos Deon Vilela de.
The objective of this work was to estimate the genetic parameters and variability among accessions (half-sib families) of physic nut (Jatropha curcas) during the early stages of development. For this study, 110 accessions in the first year of development of the physic nut germplasm bank, maintained at Embrapa Cerrados, DF, Brazil, were evaluated in situ. The experiment was established in a randomized complete block design, with two replicates and five plants per plot arranged in rows at 4x2 m spacing. Grain yield, total number of branches per plant, plant height, stem diameter, canopy projection on the row, canopy projection between rows, canopy volume, number of days until first flowering and height of the first inflorescence were evaluated. Estimates of...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Jatropha curcas; Germplasm bank; Plant breeding.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2010001000010
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Joint analysis of phenotypic and molecular diversity provides new insights on the genetic variability of the brazilian physic nut germplasm bank Genet. Mol. Biol.
Alves,Alexandre Alonso; Bhering,Leonardo Lopes; Rosado,Tatiana Barbosa; Laviola,Bruno Galvêas; Formighieri,Eduardo Fernandes; Cruz,Cosme Damião.
The genetic variability of the Brazilian physic nut (Jatropha curcas) germplasm bank (117 accessions) was assessed using a combination of phenotypic and molecular data. The joint dissimilarity matrix showed moderate correlation with the original matrices of phenotypic and molecular data. However, the correlation between the phenotypic dissimilarity matrix and the genotypic dissimilarity matrix was low. This finding indicated that molecular markers (RAPD and SSR) did not adequately sample the genomic regions that were relevant for phenotypic differentiation of the accessions. The dissimilarity values of the joint dissimilarity matrix were used to measure phenotypic + molecular diversity. This diversity varied from 0 to 1.29 among the 117 accessions, with an...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Molecular variability; Jatropha curcas L.; Phenotypic variability.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572013000300012
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Linkage analysis between dominant and co-dominant makers in full-sib families of out-breeding species Genet. Mol. Biol.
Alves,Alexandre Alonso; Bhering,Leonardo Lopes; Cruz,Cosme Damião; Alfenas,Acelino Couto.
As high-throughput genomic tools, such as the DNA microarray platform, have lead to the development of novel genotyping procedures, such as Diversity Arrays Technology (DArT) and Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), it is likely that, in the future, high density linkage maps will be constructed from both dominant and co-dominant markers. Recently, a strictly genetic approach was described for estimating recombination frequency (r) between co-dominant markers in full-sib families. The complete set of maximum likelihood estimators for r in full-sib families was almost obtained, but unfortunately, one particular configuration involving dominant markers, segregating in a 3:1 ratio and co-dominant markers, was not considered. Here we add nine further...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Statistical genomics; Exogamic populations; Recombination frequency and maximum likelihood.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572010000300021
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Método alternativo para análise de agrupamento PAB
Vasconcelos,Edmar Soares de; Cruz,Cosme Damião; Bhering,Leonardo Lopes; Resende Júnior,Márcio Fernando Ribeiro.
O objetivo deste trabalho foi propor uma alteração no procedimento de agrupamento realizado pelo método de Tocher, passando-o de método simultâneo (original) para seqüencial. Para ilustrar e comparar os métodos, foram realizadas simulações de coleções de acessos com diferentes características, tanto para avaliação individual quanto para avaliação de experimentos com repetições. As simulações e as análises estatísticas foram realizadas com auxílio do programa GENES. O número de grupos formados com o método de Tocher seqüencial foi menor que o número de grupos formados pelo método de Tocher original. No método de Tocher seqüencial, não foi verificada influência dos genótipos já agrupados, no agrupamento dos genótipos mais distantes. O limite de acréscimo na...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Método de Tocher original; Método de Tocher seqüencial; Formação de grupos; Genótipos.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2007001000008
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Metodologia para análise de adaptabilidade e estabilidade por meio de regressão quantílica PAB
Barroso,Laís Mayara Azevedo; Nascimento,Moysés; Nascimento,Ana Carolina Campana; Silva,Fabyano Fonseca e; Cruz,Cosme Damião; Bhering,Leonardo Lopes; Ferreira,Reinaldo de Paula.
O objetivo deste trabalho foi desenvolver e validar uma metodologia de análise da adaptabilidade e da estabilidade fenotípica baseada em regressão quantílica (RQ). Para tanto, foram simulados valores fenotípicos com distribuição simétrica e com distribuição assimétrica à direita e à esquerda, com ou sem a presença de "outliers". A metodologia proposta foi aplicada a um conjunto de dados provenientes de um experimento com 92 genótipos de alfafa (Medicago sativa), avaliados em 20 ambientes, e comparada às metodologias de Eberhart & Russell e de regressão não paramétrica. A metodologia da RQ proporcionou resultados iguais ou superiores aos obtidos com as metodologias alternativas avaliadas. No entanto, a ocorrência de resultados discordantes entre as...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Medicago sativa; Distribuição assimétrica; Interação genótipo x ambiente; Melhoramento vegetal; Outliers; Regressão não paramétrica..
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2015000400290
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Neural networks for predicting breeding values and genetic gains Scientia Agricola
Silva,Gabi Nunes; Tomaz,Rafael Simões; Sant'Anna,Isabela de Castro; Nascimento,Moysés; Bhering,Leonardo Lopes; Cruz,Cosme Damião.
Analysis using Artificial Neural Networks has been described as an approach in the decision-making process that, although incipient, has been reported as presenting high potential for use in animal and plant breeding. In this study, we introduce the procedure of using the expanded data set for training the network. Wealso proposed using statistical parameters to estimate the breeding value of genotypes in simulated scenarios, in addition to the mean phenotypic value in a feed-forward back propagation multilayer perceptron network. After evaluating artificial neural network configurations, our results showed its superiority to estimates based on linear models, as well as its applicability in the genetic value prediction process. The results further...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genetic value; Statistics; Simulation; Artificial intelligence; Training strategy.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162014000600008
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Seleção assistida por marcadores para teor de matéria seca e açúcares redutores em tubérculos de batata Ciência Rural
Bhering,Leonardo Lopes; Pinto,César Augusto Brasil Pereira; Benites,Flávio Rodrigo Gandolfi; Leite,Monik Evelin; Silva,Felipe Lopes da.
A seleção precoce de clones que possuam níveis elevados de matéria seca e baixos teores de açúcares redutores é uma necessidade nos programas de melhoramento para a qualidade de processamento da batata (Solanum tuberosum L.) na forma de palitos fritos ou chips. A seleção precoce tornou-se possível com a utilização de marcadores genéticos, visto que permitem a identificação precisa de indivíduos superiores. Assim, procura-se cada vez mais encontrar marcadores capazes de caracterizar tais indivíduos e utilizá-los via seleção assistida. O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência da seleção assistida, utilizando os marcadores identificados por ANDREU (2004) que estariam associados ao teor de matéria seca e açúcares redutores em tubérculos de batata....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Solanum tuberosum L.; Seleção precoce; Qualidades de tubérculos.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782009000100007
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Seleção simultânea de clones de eucalipto de acordo com produtividade, estabilidade e adaptabilidade PAB
Rosado,Antônio Marcos; Rosado,Tatiana Barbosa; Alves,Alexandre Alonso; Laviola,Bruno Galvêas; Bhering,Leonardo Lopes.
O objetivo deste trabalho foi estimar os parâmetros genéticos e determinar a eficiência da seleção simultânea de clones de eucalipto baseada em produtividade, estabilidade e adaptabilidade. Foram utilizados 21 clones, com 36 meses de idade, pertencentes ao programa de melhoramento genético da empresa Cenibra. O experimento foi instalado em delineamento de blocos ao acaso, em quatro ambientes, com 21 repetições de uma planta por parcela. Os clones foram avaliados quanto às variáveis: diâmetro à altura do peito, altura da planta e volume total com casca. Os parâmetros genéticos foram estimados pela metodologia de modelos mistos (REML/BLUP), e a seleção baseou-se no método da média harmônica do desempenho relativo dos valores genéticos (MHPRVG), em três...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Eucalyptus; Interação genótipo x ambiente; MHPRVG; REML; BLUP.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2012000700013
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Selection and genetic parameters for interpopulation hybrids between kouilou and robusta coffee Bragantia
Carvalho,Humberto Fanelli; Silva,Felipe Lopes da; Resende,Marcos Deon Vilela de; Bhering,Leonardo Lopes.
ABSTRACT Selection of hybrid coffee plants coming from crosses between divergent populations is particularly relevant for the success of breeding programs. This study aimed to outline the best selection strategy in a hybrid population of Coffea canephora var. kouilou and robusta by estimating intrapopulation genetic parameters. Twenty full-sib progenies obtained by North Caroline II were installed in a randomized complete blocks design, with one plant per elementary plot. The following traits were evaluated: vegetative vigor, reaction to rust, plant height, diameter of canopy projection, maturity time, and bean yield. Significant individual genotypic variance and heritability estimates lead to an effective selection. The multi-trait selection index carried...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Mixed models; Multi-trait index; Intrapopulation selection; Coffea canephora.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052019000100052
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Selection of maize top-crosses for different nitrogen levels through specific combining ability Bragantia
Heinz,Rafael; Ribeiro,Larissa Pereira; Gonçalves,Manoel Carlos; Bhering,Leonardo Lopes; Teodoro,Paulo Eduardo.
ABSTRACT An alternative to increase yield without raising the production costs and minimizing the dependence of agricultural inputs is the development of maize genotypes presenting high nitrogen (N) use efficiency under low N level conditions. Thus, the objective of this study was to estimate the specific combining ability of maize top-crosses under high and low nitrogen (N) conditions and to select high-yielding hybrids for both conditions. The grain yield of 110 top-cross hybrids was evaluated in 2012 in two locations in the Brazilian Midwest. Partial diallel analysis was performed with the adjusted means of each of the individual top-cross analyses. Specific combining ability (SCA) of the hybrids and their interaction with N levels was estimated for...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Zea mays L.; Diallel; Hybrid combination; Nitrogen use efficiency.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052019000200208
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